sdk/cwl/tests/federation/arvbox/arvbox-fed.cwl

   1 # Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
   2 #
   3 # SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
   4
   5 cwlVersion: v1.0
   6 class: Workflow
   7 $namespaces:
   8   arv: "http://arvados.org/cwl#"
   9   cwltool: "http://commonwl.org/cwltool#"
  10 requirements:
  11   ScatterFeatureRequirement: {}
  12   StepInputExpressionRequirement: {}
  13   cwltool:LoadListingRequirement:
  14     loadListing: no_listing
  15   InlineJavascriptRequirement: {}
  16 inputs:
  17   containers:
  18     type: string[]
  19     default: [fedbox1, fedbox2, fedbox3]
  20   arvbox_base: Directory
  21   in_acr: string?
  22   insecure:
  23     type: boolean
  24     default: true
  25 outputs:
  26   arvados_api_token:
  27     type: string
  28     outputSource: setup-user/test_user_token
  29   arvados_api_hosts:
  30     type: string[]
  31     outputSource: start/container_host
  32   arvados_cluster_ids:
  33     type: string[]
  34     outputSource: start/cluster_id
  35   acr:
  36     type: string?
  37     outputSource: in_acr
  38   arvado_api_host_insecure:
  39     type: boolean
  40     outputSource: insecure
  41 steps:
  42   mkdir:
  43     in:
  44       containers: containers
  45       arvbox_base: arvbox_base
  46     out: [arvbox_data]
  47     run: arvbox-mkdir.cwl
  48   start:
  49     in:
  50       container_name: containers
  51       arvbox_data: mkdir/arvbox_data
  52     out: [cluster_id, container_host, arvbox_data_out, superuser_token]
  53     scatter: [container_name, arvbox_data]
  54     scatterMethod: dotproduct
  55     run: arvbox-start.cwl
  56   fed-config:
  57     in:
  58       container_name: containers
  59       this_cluster_id: start/cluster_id
  60       cluster_ids: start/cluster_id
  61       cluster_hosts: start/container_host
  62       arvbox_data: start/arvbox_data_out
  63     out: []
  64     scatter: [container_name, this_cluster_id, arvbox_data]
  65     scatterMethod: dotproduct
  66     run: arvbox-fed-config.cwl
  67   setup-user:
  68     in:
  69       container_host: {source: start/container_host, valueFrom: "$(self[0])"}
  70       superuser_token: {source: start/superuser_token, valueFrom: "$(self[0])"}
  71     out: [test_user_uuid, test_user_token]
  72     run: arvbox-setup-user.cwl