apps/workbench/app/views/collections/show.html.erb

   1 <%= content_for :head do %>
   2 <style>
   3 <%# https://github.com/mbostock/d3/wiki/Ordinal-Scales %>
   4 <% n=-1; %w(#1f77b4 #ff7f0e #2ca02c #d62728 #9467bd #8c564b #e377c2 #7f7f7f #bcbd22 #17becf).each do |color| %>
   5 .colorseries-10-<%= n += 1 %>, .btn.colorseries-10-<%= n %>:hover, .label.colorseries-10-<%= n %>:hover {
   6   *background-color: <%= color %>;
   7   background-color: <%= color %>;
   8   background-image: none;
   9 }
  10 <% end %>
  11 .colorseries-nil { }
  12 .label a {
  13   color: inherit;
  14 }
  15 </style>
  16 <% end %>
  17
  18 <%#= render :partial => 'nav' %>
  19
  20 <ul class="nav nav-tabs">
  21   <li class="active"><a href="#files" data-toggle="tab">Files (<%= @object.files ? @object.files.size : 0 %>)</a></li>
  22   <li><a href="#provenance" data-toggle="tab">Provenance (<%= @provenance.size %>)</a></li>
  23   <li><a href="#jobs" data-toggle="tab">Jobs (<%= @provenance.size %>)</a></li>
  24   <li><a href="#sourcedata" data-toggle="tab">Source data (<%= @sourcedata.size %>)</a></li>
  25   <li><a href="#owner-groups-resources" data-toggle="tab">Owner, groups, resources</a></li>
  26 </ul>
  27
  28 <div class="tab-content">
  29   <div id="files" class="tab-pane fade in active">
  30     <table class="table table-bordered" style="table-layout: fixed">
  31       <thead>
  32         <tr>
  33           <th>path</th>
  34           <th>file</th>
  35           <th style="width:1.5em">d/l</th>
  36           <th style="width: 7em; text-align:right">size</th>
  37         </tr>
  38       </thead><tbody>
  39         <% if @object then @object.files.sort_by{|f|f[1]}.each do |file| %>
  40         <% file_path = "#{file[0]}/#{file[1]}" %>
  41         <tr>
  42           <td>
  43             <%= file[0] %>
  44           </td>
  45
  46           <td>
  47             <%= link_to file[1], {controller: 'collections', action: 'show_file', uuid: @object.uuid, file: file_path, size: file[2], disposition: 'inline'}, {title: 'View in browser'} %>
  48           </td>
  49
  50           <td>
  51             <div style="display:inline-block">
  52             <%= link_to raw('<i class="icon-download"></i>'), {controller: 'collections', action: 'show_file', uuid: @object.uuid, file: file_path, size: file[2], disposition: 'attachment'}, {class: 'label label-info', title: 'Download'} %>
  53             </div>
  54           </td>
  55
  56           <td style="text-align:right">
  57             <%= raw(human_readable_bytes_html(file[2])) %>
  58           </td>
  59
  60         </tr>
  61         <% end; end %>
  62       </tbody>
  63     </table>
  64   </div>
  65   <div id="provenance" class="tab-pane fade">
  66     <table class="topalign table table-bordered">
  67       <thead>
  68       </thead>
  69       <tbody>
  70
  71         <% @provenance.reverse.each do |p| %>
  72         <% j = p[:job] %>
  73
  74         <% if j %>
  75
  76         <tr class="job">
  77           <td style="padding-bottom: 3em">
  78             <table class="table" style="margin-bottom: 0; background: #f0f0ff">
  79               <% j.script_parameters.each do |k,v| %>
  80               <tr>
  81                 <td style="width: 20%">
  82                   <%= k.to_s %>
  83                 </td><td style="width: 60%">
  84                   <% if v and @output2job.has_key? v %>
  85                   <tt class="label colorseries-10-<%= @output2colorindex[v] %>"><%= link_to_if_arvados_object v %></tt>
  86                   <% else %>
  87                   <span class="deemphasize"><%= link_to_if_arvados_object v %></span>
  88                   <% end %>
  89                 </td><td style="text-align: center; width: 20%">
  90                   <% if v
  91                        if @protected[v]
  92                          labelclass = 'success'
  93                          labeltext = 'keep'
  94                        else
  95                          labelclass = @output2job.has_key?(v) ? 'warning' : 'danger'
  96                          labeltext = 'cache'
  97                        end %>
  98
  99                   <tt class="label label-<%= labelclass %>"><%= labeltext %></tt>
 100                   <% end %>
 101                 </td>
 102               </tr>
 103               <% end %>
 104             </table>
 105             <div style="text-align: center">
 106               &darr;
 107               <br />
 108               <span class="label"><%= j.script %><br /><tt><%= link_to_if j.script_version.match(/[0-9a-f]{40}/), j.script_version, "https://arvados.org/projects/arvados/repository/revisions/#{j.script_version}/entry/crunch_scripts/#{j.script}" if j.script_version %></tt></span>
 109               <br />
 110               &darr;
 111               <br />
 112               <tt class="label colorseries-10-<%= @output2colorindex[p[:output]] %>"><%= link_to_if_arvados_object p[:output] %></tt>
 113             </div>
 114           </td>
 115           <td>
 116             <tt><span class="deemphasize">job:</span><br /><%= link_to_if_arvados_object j %><br /><span class="deemphasize"><%= j.submit_id %></span></tt>
 117           </td>
 118         </tr>
 119
 120         <% else %>
 121         <tr>
 122           <td>
 123             <span class="label label-danger">lookup fail</span>
 124             <br />
 125             <tt class="deemphasize"><%= p[:target] %></tt>
 126           </td><td colspan="5">
 127           </td>
 128         </tr>
 129         <% end %>
 130
 131         <% end %>
 132
 133       </tbody>
 134     </table>
 135   </div>
 136   <div id="jobs" class="tab-pane fade">
 137     <table class="topalign table table-bordered">
 138       <thead>
 139         <tr class="contain-align-left">
 140           <th>
 141             job
 142           </th><th>
 143             version
 144           </th><th>
 145             status
 146           </th><th>
 147             start
 148           </th><th>
 149             finish
 150           </th><th>
 151             clock time
 152           </th>
 153         </tr>
 154       </thead>
 155       <tbody>
 156
 157         <% @provenance.reverse.each do |p| %>
 158         <% j = p[:job] %>
 159
 160         <% if j %>
 161
 162         <tr class="job">
 163           <td>
 164             <tt><%= j.uuid %></tt>
 165             <br />
 166             <tt class="deemphasize"><%= j.submit_id %></tt>
 167           </td><td>
 168             <%= j.script_version %>
 169           </td><td>
 170             <span class="label <%= if j.success then 'label-success'; elsif j.active then 'label-primary'; else 'label-warning'; end %>">
 171               <%= j.success || j.active ? 'ok' : 'failed' %>
 172             </span>
 173           </td><td>
 174             <%= j.started_at %>
 175           </td><td>
 176             <%= j.finished_at %>
 177           </td><td>
 178             <% if j.started_at and j.finished_at %>
 179             <%= raw(distance_of_time_in_words(j.started_at, j.finished_at).sub('about ','~').sub(' ','&nbsp;')) %>
 180             <% elsif j.started_at and j.running %>
 181             <%= raw(distance_of_time_in_words(j.started_at, Time.now).sub('about ','~').sub(' ','&nbsp;')) %> (running)
 182             <% end %>
 183           </td>
 184         </tr>
 185
 186         <% else %>
 187         <tr>
 188           <td>
 189             <span class="label label-danger">lookup fail</span>
 190             <br />
 191             <tt class="deemphasize"><%= p[:target] %></tt>
 192           </td><td colspan="4">
 193           </td>
 194         </tr>
 195         <% end %>
 196
 197         <% end %>
 198
 199       </tbody>
 200     </table>
 201   </div>
 202   <div id="sourcedata" class="tab-pane fade">
 203     <table class="table table-bordered table-striped">
 204       <thead>
 205         <tr class="contain-align-left">
 206           <th>
 207             collection
 208           </th><th class="data-size">
 209             data size
 210           </th><th>
 211             storage
 212           </th><th>
 213             origin
 214           </th>
 215         </tr>
 216       </thead>
 217       <tbody>
 218
 219         <% @sourcedata.values.each do |sourcedata| %>
 220
 221         <tr class="collection">
 222           <td>
 223             <tt class="label"><%= sourcedata[:uuid] %></tt>
 224           </td><td class="data-size">
 225             <%= raw(human_readable_bytes_html(sourcedata[:collection].data_size)) if sourcedata[:collection] and sourcedata[:collection].data_size %>
 226           </td><td>
 227             <% if @protected[sourcedata[:uuid]] %>
 228             <span class="label label-success">keep</span>
 229             <% else %>
 230             <span class="label label-danger">cache</span>
 231             <% end %>
 232           </td><td>
 233             <% if sourcedata[:data_origins] %>
 234             <% sourcedata[:data_origins].each do |data_origin| %>
 235             <span class="deemphasize"><%= data_origin[0] %></span>
 236             <%= data_origin[2] %>
 237             <br />
 238             <% end %>
 239             <% end %>
 240           </td>
 241         </tr>
 242
 243         <% end %>
 244
 245       </tbody>
 246     </table>
 247   </div>
 248   <div id="owner-groups-resources" class="tab-pane fade">
 249     <%= render :partial => 'application/arvados_object' %>
 250   </div>
 251 </div>