build/run-tests.sh

   1 #!/bin/bash
   2
   3 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin
   4
   5 COLUMNS=80
   6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
   7
   8 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
   9 $(basename $0): Install and test Arvados components.
  10
  11 Exit non-zero if any tests fail.
  12
  13 Syntax:
  14         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
  15
  16 Options:
  17
  18 --skip FOO     Do not test the FOO component.
  19 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
  20 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
  21                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
  22 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
  23                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
  24                subsequent invocations.
  25 --repeat N     Repeat each install/test step until it succeeds N times.
  26 --retry        Prompt to retry if an install or test suite fails.
  27 --skip-install Do not run any install steps. Just run tests.
  28                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
  29                from a previous invocation if you use this option.
  30 --only-install Run specific install step
  31 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
  32 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
  33 CONFIGSRC=path Dir with api server config files to copy into source tree.
  34                (If none given, leave config files alone in source tree.)
  35 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
  36                Restrict apiserver tests to the given file
  37 sdk/python_test="--test-suite test.test_keep_locator"
  38                Restrict Python SDK tests to the given class
  39 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
  40                Restrict Workbench tests to the given file
  41 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
  42                Show all log messages, even when tests pass (also works
  43                with services/keepstore_test etc.)
  44 ARVADOS_DEBUG=1
  45                Print more debug messages
  46 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
  47                *_test, and other examples shown above.
  48
  49 Assuming --skip-install is not given, all components are installed
  50 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
  51 test suites depend on other components being installed, and installing
  52 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
  53
  54 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
  55 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
  56
  57 More information and background:
  58
  59 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
  60
  61 Available tests:
  62
  63 apps/workbench (*)
  64 apps/workbench_units (*)
  65 apps/workbench_functionals (*)
  66 apps/workbench_integration (*)
  67 apps/workbench_benchmark
  68 apps/workbench_profile
  69 doc
  70 services/api
  71 services/arv-git-httpd
  72 services/crunchstat
  73 services/dockercleaner
  74 services/fuse
  75 services/keep-web
  76 services/keepproxy
  77 services/keepstore
  78 services/keep-balance
  79 services/login-sync
  80 services/nodemanager
  81 services/crunch-run
  82 services/crunch-dispatch-local
  83 services/crunch-dispatch-slurm
  84 services/ws
  85 sdk/cli
  86 sdk/pam
  87 sdk/python
  88 sdk/ruby
  89 sdk/go/arvados
  90 sdk/go/arvadosclient
  91 sdk/go/keepclient
  92 sdk/go/httpserver
  93 sdk/go/manifest
  94 sdk/go/blockdigest
  95 sdk/go/streamer
  96 sdk/go/stats
  97 sdk/go/crunchrunner
  98 sdk/cwl
  99 tools/crunchstat-summary
 100 tools/keep-exercise
 101 tools/keep-rsync
 102 tools/keep-block-check
 103
 104 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
 105     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
 106
 107 EOF
 108
 109 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
 110 # environment that could interfere with the tests.
 111 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
 112
 113 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
 114 # accident.
 115 GITDIR=
 116 GOPATH=
 117 VENVDIR=
 118 VENV3DIR=
 119 PYTHONPATH=
 120 GEMHOME=
 121 PERLINSTALLBASE=
 122
 123 short=
 124 only_install=
 125 temp=
 126 temp_preserve=
 127
 128 clear_temp() {
 129     if [[ -z "$temp" ]]; then
 130         # we didn't even get as far as making a temp dir
 131         :
 132     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
 133         rm -rf "$temp"
 134     else
 135         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
 136     fi
 137 }
 138
 139 fatal() {
 140     clear_temp
 141     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
 142     exit 1
 143 }
 144
 145 exit_cleanly() {
 146     trap - INT
 147     create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
 148     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 149     stop_services
 150     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 151     report_outcomes
 152     clear_temp
 153     exit ${#failures}
 154 }
 155
 156 sanity_checks() {
 157     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
 158         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
 159     echo Checking dependencies:
 160     echo -n 'virtualenv: '
 161     virtualenv --version \
 162         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
 163     echo -n 'ruby: '
 164     ruby -v \
 165         || fatal "No ruby. Install >=2.1.9 (using rbenv, rvm, or source)"
 166     echo -n 'bundler: '
 167     bundle version \
 168         || fatal "No bundler. Try: gem install bundler"
 169     echo -n 'go: '
 170     go version \
 171         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
 172     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 7 ]] \
 173         || fatal "Go >= 1.7 required. See http://golang.org/doc/install"
 174     echo -n 'gcc: '
 175     gcc --version | egrep ^gcc \
 176         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
 177     echo -n 'fuse.h: '
 178     find /usr/include -wholename '*fuse/fuse.h' \
 179         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
 180     echo -n 'pyconfig.h: '
 181     find /usr/include -name pyconfig.h | egrep --max-count=1 . \
 182         || fatal "No pyconfig.h. Try: apt-get install python-dev"
 183     echo -n 'nginx: '
 184     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
 185         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
 186     echo -n 'perl: '
 187     perl -v | grep version \
 188         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
 189     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
 190         echo -n "perl $mod: "
 191         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
 192             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
 193     done
 194     echo -n 'gitolite: '
 195     which gitolite \
 196         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
 197 }
 198
 199 rotate_logfile() {
 200   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 201   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
 202   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
 203     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
 204     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 205     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 206   fi
 207 }
 208
 209 declare -a failures
 210 declare -A skip
 211 declare -A testargs
 212 skip[apps/workbench_profile]=1
 213
 214 while [[ -n "$1" ]]
 215 do
 216     arg="$1"; shift
 217     case "$arg" in
 218         --help)
 219             echo >&2 "$helpmessage"
 220             echo >&2
 221             exit 1
 222             ;;
 223         --skip)
 224             skip[$1]=1; shift
 225             ;;
 226         --only)
 227             only="$1"; skip[$1]=""; shift
 228             ;;
 229         --short)
 230             short=1
 231             ;;
 232         --skip-install)
 233             only_install=nothing
 234             ;;
 235         --only-install)
 236             only_install="$1"; shift
 237             ;;
 238         --temp)
 239             temp="$1"; shift
 240             temp_preserve=1
 241             ;;
 242         --leave-temp)
 243             temp_preserve=1
 244             ;;
 245         --repeat)
 246             repeat=$((${1}+0)); shift
 247             ;;
 248         --retry)
 249             retry=1
 250             ;;
 251         *_test=*)
 252             suite="${arg%%_test=*}"
 253             args="${arg#*=}"
 254             testargs["$suite"]="$args"
 255             ;;
 256         *=*)
 257             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
 258             ;;
 259         *)
 260             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
 261             exit 1
 262             ;;
 263     esac
 264 done
 265
 266 start_api() {
 267     echo 'Starting API server...'
 268     cd "$WORKSPACE" \
 269         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
 270         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
 271         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
 272         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 273         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
 274         && (env | egrep ^ARVADOS)
 275 }
 276
 277 start_nginx_proxy_services() {
 278     echo 'Starting keepproxy, keep-web, ws, arv-git-httpd, and nginx ssl proxy...'
 279     cd "$WORKSPACE" \
 280         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
 281         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
 282         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
 283         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 284         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
 285         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1
 286 }
 287
 288 stop_services() {
 289     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES" ]]; then
 290         unset ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
 291         cd "$WORKSPACE" \
 292             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 293             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
 294             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 295             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
 296             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy
 297     fi
 298     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
 299         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
 300         cd "$WORKSPACE" \
 301             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 302             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 303             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop
 304     fi
 305 }
 306
 307 interrupt() {
 308     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
 309     exit_cleanly
 310 }
 311 trap interrupt INT
 312
 313 sanity_checks
 314
 315 echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
 316
 317 if [[ -z "$CONFIGSRC" ]] && [[ -d "$HOME/arvados-api-server" ]]; then
 318     # Jenkins expects us to use this by default.
 319     CONFIGSRC="$HOME/arvados-api-server"
 320 fi
 321
 322 # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
 323 cd "$WORKSPACE"
 324 find -name '*.pyc' -delete
 325
 326 if [[ -z "$temp" ]]; then
 327     temp="$(mktemp -d)"
 328 fi
 329
 330 # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
 331 for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE
 332 do
 333     if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
 334         eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
 335     fi
 336     if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
 337         mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
 338     fi
 339 done
 340
 341 setup_ruby_environment() {
 342     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 343       source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
 344       using_rvm=true
 345     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 346       source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
 347       using_rvm=true
 348     else
 349       using_rvm=false
 350     fi
 351
 352     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 353         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
 354         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
 355         # the environment to the "current gemset", which would lose
 356         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
 357         # programs (for example, the Workbench test suite could not
 358         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
 359         # rvm gemset and use it for everything.
 360
 361         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
 362             || fatal 'rvm check'
 363
 364         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
 365         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
 366         # complaint about not being in first place already.
 367         rvm use @default 2>/dev/null
 368
 369         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
 370         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
 371         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
 372         # ruby to the caller.
 373         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
 374         rvm use "@${gemset}" --create \
 375             || fatal 'rvm gemset setup'
 376
 377         rvm env
 378     else
 379         # When our "bundle install"s need to install new gems to
 380         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
 381         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
 382         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
 383         # should be installed, and we should leave it alone.)
 384
 385         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
 386             user_gempath="$(gem env gempath)"
 387             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
 388         fi
 389         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
 390
 391         # When we build and install our own gems, we install them in our
 392         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
 393         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
 394         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
 395
 396         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
 397         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
 398         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home:$(gem env gempath)"
 399
 400         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
 401         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
 402         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
 403     fi
 404 }
 405
 406 with_test_gemset() {
 407     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 408         "$@"
 409     else
 410         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
 411     fi
 412 }
 413
 414 gem_uninstall_if_exists() {
 415     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
 416         gem uninstall --force --all --executables "$1"
 417     fi
 418 }
 419
 420 setup_virtualenv() {
 421     local venvdest="$1"; shift
 422     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
 423         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
 424     fi
 425     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
 426         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
 427         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
 428     else
 429         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
 430     fi
 431     # ubuntu1404 can't seem to install mock via tests_require, but it can do this.
 432     "$venvdest/bin/pip" install 'mock>=1.0' 'pbr<1.7.0'
 433 }
 434
 435 export PERLINSTALLBASE
 436 export PERLLIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5:${PERLLIB:+$PERLLIB}"
 437
 438 export GOPATH
 439 mkdir -p "$GOPATH/src/git.curoverse.com"
 440 ln -sfn "$WORKSPACE" "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" \
 441     || fatal "symlink failed"
 442
 443 setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
 444 . "$VENVDIR/bin/activate"
 445
 446 # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
 447 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^PyYAML= \
 448     || pip install PyYAML >/dev/null \
 449     || fatal "pip install PyYAML failed"
 450
 451 # Preinstall forked version of libcloud, because nodemanager "pip install"
 452 # won't pick it up by default.
 453 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
 454     || pip install --pre --ignore-installed https://github.com/curoverse/libcloud/archive/apache-libcloud-$LIBCLOUD_PIN.zip >/dev/null \
 455     || fatal "pip install apache-libcloud failed"
 456
 457 # Uninstall old llfuse (<1.0), because services/fuse "pip install"
 458 # won't upgrade it by default.
 459 if pip freeze | egrep '^llfuse==0'; then
 460     yes | pip uninstall 'llfuse<1.0'
 461 fi
 462
 463 # Deactivate Python 2 virtualenv
 464 deactivate
 465
 466 # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
 467 # Otherwise, skip dependent tests.
 468 PYTHON3=$(which python3)
 469 if [ "0" = "$?" ]; then
 470     setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
 471 else
 472     PYTHON3=
 473     skip[services/dockercleaner]=1
 474     cat >&2 <<EOF
 475
 476 Warning: python3 could not be found
 477 services/dockercleaner install and tests will be skipped
 478
 479 EOF
 480 fi
 481
 482 # Reactivate Python 2 virtualenv
 483 . "$VENVDIR/bin/activate"
 484
 485 # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
 486 # whine a lot.
 487 setup_ruby_environment
 488
 489 echo "PATH is $PATH"
 490
 491 if ! which bundler >/dev/null
 492 then
 493     gem install --user-install bundler || fatal 'Could not install bundler'
 494 fi
 495
 496 retry() {
 497     remain="${repeat}"
 498     while :
 499     do
 500         if ${@}; then
 501             if [[ "$remain" -gt 1 ]]; then
 502                 remain=$((${remain}-1))
 503                 title "Repeating ${remain} more times"
 504             else
 505                 break
 506             fi
 507         elif [[ "$retry" == 1 ]]; then
 508             read -p 'Try again? [Y/n] ' x
 509             if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
 510             then
 511                 break
 512             fi
 513         else
 514             break
 515         fi
 516     done
 517 }
 518
 519 do_test() {
 520     case "${1}" in
 521         apps/workbench_units | apps/workbench_functional | apps/workbench_integration)
 522             suite=apps/workbench
 523             ;;
 524         *)
 525             suite="${1}"
 526             ;;
 527     esac
 528     if [[ -z "${skip[$suite]}" && -z "${skip[$1]}" && \
 529                 (-z "${only}" || "${only}" == "${suite}" || \
 530                  "${only}" == "${1}") ]]; then
 531         retry do_test_once ${@}
 532     else
 533         title "Skipping ${1} tests"
 534     fi
 535 }
 536
 537 do_test_once() {
 538     unset result
 539
 540     title "Running $1 tests"
 541     timer_reset
 542     if [[ "$2" == "go" ]]
 543     then
 544         covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
 545         coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
 546         # We do "go get -t" here to catch compilation errors
 547         # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
 548         # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
 549         # compilation errors.
 550         go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1" || return 1
 551         cd "$WORKSPACE/$1" || return 1
 552         gofmt -e -d . | egrep . && result=1
 553         if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
 554         then
 555             # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
 556             # does:
 557             cd "$WORKSPACE/$1" && go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
 558         else
 559             # The above form gets verbose even when testargs is
 560             # empty, so use this form in such cases:
 561             go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 562         fi
 563         result=${result:-$?}
 564         if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
 565         then
 566             go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
 567             rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
 568         fi
 569     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 570     then
 571         tries=0
 572         cd "$WORKSPACE/$1" && while :
 573         do
 574             tries=$((${tries}+1))
 575             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 576             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 577             "${3}python" setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
 578             result=$?
 579             if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
 580             then
 581                 printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
 582                 continue
 583             else
 584                 break
 585             fi
 586         done
 587     elif [[ "$2" != "" ]]
 588     then
 589         "test_$2"
 590     else
 591         "test_$1"
 592     fi
 593     result=${result:-$?}
 594     checkexit $result "$1 tests"
 595     title "End of $1 tests (`timer`)"
 596     return $result
 597 }
 598
 599 do_install() {
 600     if [[ -z "${only_install}" || "${only_install}" == "${1}" ]]; then
 601         retry do_install_once ${@}
 602     else
 603         title "Skipping $1 install"
 604     fi
 605 }
 606
 607 do_install_once() {
 608     title "Running $1 install"
 609     timer_reset
 610     if [[ "$2" == "go" ]]
 611     then
 612         go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 613     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 614     then
 615         # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 616         # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 617
 618         # Need to change to a different directory after creating
 619         # the source dist package to avoid a pip bug.
 620         # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
 621
 622         # Also need to install twice, because if it believes the package is
 623         # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
 624         # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
 625         # install" ensures that we've actually installed the local package
 626         # we just built.
 627         cd "$WORKSPACE/$1" \
 628             && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
 629             && cd "$WORKSPACE" \
 630             && "${3}pip" install --quiet "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
 631             && "${3}pip" install --quiet --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
 632     elif [[ "$2" != "" ]]
 633     then
 634         "install_$2"
 635     else
 636         "install_$1"
 637     fi
 638     result=$?
 639     checkexit $result "$1 install"
 640     title "End of $1 install (`timer`)"
 641     return $result
 642 }
 643
 644 bundle_install_trylocal() {
 645     (
 646         set -e
 647         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
 648         if ! bundle install --local --no-deployment; then
 649             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
 650             bundle install --no-deployment
 651         fi
 652         bundle package --all
 653     )
 654 }
 655
 656 install_doc() {
 657     cd "$WORKSPACE/doc" \
 658         && bundle_install_trylocal \
 659         && rm -rf .site
 660 }
 661 do_install doc
 662
 663 install_gem() {
 664     gemname=$1
 665     srcpath=$2
 666     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
 667         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
 668         && bundle_install_trylocal \
 669         && gem build "$gemname.gemspec" \
 670         && with_test_gemset gem install --no-ri --no-rdoc $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
 671 }
 672
 673 install_ruby_sdk() {
 674     install_gem arvados sdk/ruby
 675 }
 676 do_install sdk/ruby ruby_sdk
 677
 678 install_perl_sdk() {
 679     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
 680         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
 681         && make install INSTALLDIRS=perl
 682 }
 683 do_install sdk/perl perl_sdk
 684
 685 install_cli() {
 686     install_gem arvados-cli sdk/cli
 687 }
 688 do_install sdk/cli cli
 689
 690 install_login-sync() {
 691     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
 692 }
 693 do_install services/login-sync login-sync
 694
 695 # Install the Python SDK early. Various other test suites (like
 696 # keepproxy) bring up run_test_server.py, which imports the arvados
 697 # module. We can't actually *test* the Python SDK yet though, because
 698 # its own test suite brings up some of those other programs (like
 699 # keepproxy).
 700 declare -a pythonstuff
 701 pythonstuff=(
 702     sdk/pam
 703     sdk/python
 704     sdk/cwl
 705     services/fuse
 706     services/nodemanager
 707     tools/crunchstat-summary
 708     )
 709 for p in "${pythonstuff[@]}"
 710 do
 711     do_install "$p" pip
 712 done
 713 if [ -n "$PYTHON3" ]; then
 714     do_install services/dockercleaner pip "$VENV3DIR/bin/"
 715 fi
 716
 717 install_apiserver() {
 718     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 719         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 720
 721     rm -f config/environments/test.rb
 722     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
 723
 724     if [ -n "$CONFIGSRC" ]
 725     then
 726         for f in database.yml application.yml
 727         do
 728             cp "$CONFIGSRC/$f" config/ || fatal "$f"
 729         done
 730     fi
 731
 732     # Fill in a random secret_token and blob_signing_key for testing
 733     SECRET_TOKEN=`echo 'puts rand(2**512).to_s(36)' |ruby`
 734     BLOB_SIGNING_KEY=`echo 'puts rand(2**512).to_s(36)' |ruby`
 735
 736     sed -i'' -e "s:SECRET_TOKEN:$SECRET_TOKEN:" config/application.yml
 737     sed -i'' -e "s:BLOB_SIGNING_KEY:$BLOB_SIGNING_KEY:" config/application.yml
 738
 739     # Set up empty git repo (for git tests)
 740     GITDIR=$(mktemp -d)
 741     sed -i'' -e "s:/var/cache/git:$GITDIR:" config/application.default.yml
 742
 743     rm -rf $GITDIR
 744     mkdir -p $GITDIR/test
 745     cd $GITDIR/test \
 746         && git init \
 747         && git config user.email "jenkins@ci.curoverse.com" \
 748         && git config user.name "Jenkins, CI" \
 749         && touch tmp \
 750         && git add tmp \
 751         && git commit -m 'initial commit'
 752
 753     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
 754     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
 755     # is a postgresql superuser.
 756     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 757         && test_database=$(python -c "import yaml; print yaml.load(file('config/database.yml'))['test']['database']") \
 758         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.procpid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
 759
 760     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 761         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:drop \
 762         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:setup \
 763         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:fixtures:load
 764 }
 765 do_install services/api apiserver
 766
 767 declare -a gostuff
 768 gostuff=(
 769     sdk/go/arvados
 770     sdk/go/arvadosclient
 771     sdk/go/blockdigest
 772     sdk/go/httpserver
 773     sdk/go/manifest
 774     sdk/go/streamer
 775     sdk/go/crunchrunner
 776     sdk/go/stats
 777     lib/crunchstat
 778     services/arv-git-httpd
 779     services/crunchstat
 780     services/keep-web
 781     services/keepstore
 782     sdk/go/keepclient
 783     services/keep-balance
 784     services/keepproxy
 785     services/crunch-dispatch-local
 786     services/crunch-dispatch-slurm
 787     services/crunch-run
 788     services/ws
 789     tools/keep-block-check
 790     tools/keep-exercise
 791     tools/keep-rsync
 792     )
 793 for g in "${gostuff[@]}"
 794 do
 795     do_install "$g" go
 796 done
 797
 798 install_workbench() {
 799     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 800         && mkdir -p tmp/cache \
 801         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 802 }
 803 do_install apps/workbench workbench
 804
 805 test_doclinkchecker() {
 806     (
 807         set -e
 808         cd "$WORKSPACE/doc"
 809         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
 810         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
 811         # do much good!
 812         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ bundle exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
 813     )
 814 }
 815 do_test doc doclinkchecker
 816
 817 stop_services
 818
 819 test_apiserver() {
 820     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
 821     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 822         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/api]}
 823 }
 824 do_test services/api apiserver
 825
 826 # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
 827 # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
 828 if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
 829   rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 830   exit_cleanly
 831 fi
 832
 833 start_api
 834
 835 test_ruby_sdk() {
 836     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
 837         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
 838 }
 839 do_test sdk/ruby ruby_sdk
 840
 841 test_cli() {
 842     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
 843         && mkdir -p /tmp/keep \
 844         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
 845 }
 846 do_test sdk/cli cli
 847
 848 test_login-sync() {
 849     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
 850         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
 851 }
 852 do_test services/login-sync login-sync
 853
 854 for p in "${pythonstuff[@]}"
 855 do
 856     do_test "$p" pip
 857 done
 858 do_test services/dockercleaner pip "$VENV3DIR/bin/"
 859
 860 for g in "${gostuff[@]}"
 861 do
 862     do_test "$g" go
 863 done
 864
 865 test_workbench_units() {
 866     start_nginx_proxy_services \
 867         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 868         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:units TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 869 }
 870 do_test apps/workbench_units workbench_units
 871
 872 test_workbench_functionals() {
 873     start_nginx_proxy_services \
 874         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 875         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:functionals TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 876 }
 877 do_test apps/workbench_functionals workbench_functionals
 878
 879 test_workbench_integration() {
 880     start_nginx_proxy_services \
 881         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 882         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:integration TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 883 }
 884 do_test apps/workbench_integration workbench_integration
 885
 886
 887 test_workbench_benchmark() {
 888     start_nginx_proxy_services \
 889         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 890         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:benchmark ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
 891 }
 892 do_test apps/workbench_benchmark workbench_benchmark
 893
 894 test_workbench_profile() {
 895     start_nginx_proxy_services \
 896         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 897         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:profile ${testargs[apps/workbench_profile]}
 898 }
 899 do_test apps/workbench_profile workbench_profile
 900
 901 exit_cleanly