build/run-tests.sh

   1 #!/bin/bash
   2 # Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
   3 #
   4 # SPDX-License-Identifier: AGPL-3.0
   5
   6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin.sh
   7
   8 COLUMNS=80
   9 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
  10
  11 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
  12 $(basename $0): Install and test Arvados components.
  13
  14 Exit non-zero if any tests fail.
  15
  16 Syntax:
  17         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
  18
  19 Options:
  20
  21 --skip FOO     Do not test the FOO component.
  22 --skip sanity  Skip initial dev environment sanity checks.
  23 --skip install Do not run any install steps. Just run tests.
  24                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
  25                from a previous invocation if you use this option.
  26 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
  27 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
  28                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
  29 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
  30                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
  31                subsequent invocations.
  32 --repeat N     Repeat each install/test step until it succeeds N times.
  33 --retry        Prompt to retry if an install or test suite fails.
  34 --only-install Run specific install step
  35 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
  36 --interactive  Set up, then prompt for test/install steps to perform.
  37 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
  38 CONFIGSRC=path Dir with api server config files to copy into source tree.
  39                (If none given, leave config files alone in source tree.)
  40 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
  41                Restrict apiserver tests to the given file
  42 sdk/python_test="--test-suite tests.test_keep_locator"
  43                Restrict Python SDK tests to the given class
  44 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
  45                Restrict Workbench tests to the given file
  46 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
  47                Show all log messages, even when tests pass (also works
  48                with services/keepstore_test etc.)
  49 ARVADOS_DEBUG=1
  50                Print more debug messages
  51 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
  52                *_test, and other examples shown above.
  53
  54 Assuming "--skip install" is not given, all components are installed
  55 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
  56 test suites depend on other components being installed, and installing
  57 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
  58
  59 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
  60 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
  61
  62 More information and background:
  63
  64 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
  65
  66 Available tests:
  67
  68 apps/workbench (*)
  69 apps/workbench_units (*)
  70 apps/workbench_functionals (*)
  71 apps/workbench_integration (*)
  72 apps/workbench_benchmark
  73 apps/workbench_profile
  74 cmd/arvados-client
  75 cmd/arvados-server
  76 doc
  77 lib/cli
  78 lib/cmd
  79 lib/controller
  80 lib/crunchstat
  81 lib/cloud
  82 lib/cloud/azure
  83 lib/dispatchcloud
  84 lib/dispatchcloud/container
  85 lib/dispatchcloud/scheduler
  86 lib/dispatchcloud/ssh_executor
  87 lib/dispatchcloud/worker
  88 lib/service
  89 services/api
  90 services/arv-git-httpd
  91 services/crunchstat
  92 services/dockercleaner
  93 services/fuse
  94 services/health
  95 services/keep-web
  96 services/keepproxy
  97 services/keepstore
  98 services/keep-balance
  99 services/login-sync
 100 services/nodemanager
 101 services/nodemanager_integration
 102 services/crunch-run
 103 services/crunch-dispatch-local
 104 services/crunch-dispatch-slurm
 105 services/ws
 106 sdk/cli
 107 sdk/pam
 108 sdk/python
 109 sdk/python:py3
 110 sdk/ruby
 111 sdk/go/arvados
 112 sdk/go/arvadosclient
 113 sdk/go/auth
 114 sdk/go/dispatch
 115 sdk/go/keepclient
 116 sdk/go/health
 117 sdk/go/httpserver
 118 sdk/go/manifest
 119 sdk/go/blockdigest
 120 sdk/go/asyncbuf
 121 sdk/go/stats
 122 sdk/go/crunchrunner
 123 sdk/cwl
 124 sdk/R
 125 tools/sync-groups
 126 tools/crunchstat-summary
 127 tools/crunchstat-summary:py3
 128 tools/keep-exercise
 129 tools/keep-rsync
 130 tools/keep-block-check
 131
 132 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
 133     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
 134
 135 EOF
 136
 137 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
 138 # environment that could interfere with the tests.
 139 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
 140
 141 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
 142 # accident.
 143 GITDIR=
 144 GOPATH=
 145 VENVDIR=
 146 VENV3DIR=
 147 PYTHONPATH=
 148 GEMHOME=
 149 PERLINSTALLBASE=
 150 R_LIBS=
 151 export LANG=en_US.UTF-8
 152
 153 short=
 154 only_install=
 155 temp=
 156 temp_preserve=
 157
 158 clear_temp() {
 159     if [[ -z "$temp" ]]; then
 160         # we didn't even get as far as making a temp dir
 161         :
 162     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
 163         rm -rf "$temp"
 164     else
 165         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
 166     fi
 167 }
 168
 169 fatal() {
 170     clear_temp
 171     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
 172     exit 1
 173 }
 174
 175 exit_cleanly() {
 176     trap - INT
 177     if which create-plot-data-from-log.sh >/dev/null; then
 178         create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
 179     fi
 180     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 181     stop_services
 182     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 183     report_outcomes
 184     clear_temp
 185     exit ${#failures}
 186 }
 187
 188 sanity_checks() {
 189     [[ -n "${skip[sanity]}" ]] && return 0
 190     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
 191         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
 192     echo Checking dependencies:
 193     echo "locale: ${LANG}"
 194     [[ "$(locale charmap)" = "UTF-8" ]] \
 195         || fatal "Locale '${LANG}' is broken/missing. Try: echo ${LANG} | sudo tee -a /etc/locale.gen && sudo locale-gen"
 196     echo -n 'virtualenv: '
 197     virtualenv --version \
 198         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
 199     echo -n 'ruby: '
 200     ruby -v \
 201         || fatal "No ruby. Install >=2.1.9 (using rbenv, rvm, or source)"
 202     echo -n 'go: '
 203     go version \
 204         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
 205     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 10 ]] \
 206         || fatal "Go >= 1.10 required. See http://golang.org/doc/install"
 207     echo -n 'gcc: '
 208     gcc --version | egrep ^gcc \
 209         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
 210     echo -n 'fuse.h: '
 211     find /usr/include -path '*fuse/fuse.h' | egrep --max-count=1 . \
 212         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
 213     echo -n 'gnutls.h: '
 214     find /usr/include -path '*gnutls/gnutls.h' | egrep --max-count=1 . \
 215         || fatal "No gnutls/gnutls.h. Try: apt-get install libgnutls28-dev"
 216     echo -n 'Python2 pyconfig.h: '
 217     find /usr/include -path '*/python2*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 218         || fatal "No Python2 pyconfig.h. Try: apt-get install python2.7-dev"
 219     echo -n 'Python3 pyconfig.h: '
 220     find /usr/include -path '*/python3*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 221         || fatal "No Python3 pyconfig.h. Try: apt-get install python3-dev"
 222     echo -n 'nginx: '
 223     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
 224         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
 225     echo -n 'perl: '
 226     perl -v | grep version \
 227         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
 228     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
 229         echo -n "perl $mod: "
 230         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
 231             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
 232     done
 233     echo -n 'gitolite: '
 234     which gitolite \
 235         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
 236     echo -n 'npm: '
 237     npm --version \
 238         || fatal "No npm. Try: wget -O- https://nodejs.org/dist/v6.11.2/node-v6.11.2-linux-x64.tar.xz | sudo tar -C /usr/local -xJf - && sudo ln -s ../node-v6.11.2-linux-x64/bin/{node,npm} /usr/local/bin/"
 239     echo -n 'cadaver: '
 240     cadaver --version | grep -w cadaver \
 241           || fatal "No cadaver. Try: apt-get install cadaver"
 242     echo -n 'libattr1 xattr.h: '
 243     find /usr/include -path '*/attr/xattr.h' | egrep --max-count=1 . \
 244         || fatal "No libattr1 xattr.h. Try: apt-get install libattr1-dev"
 245     echo -n 'libcurl curl.h: '
 246     find /usr/include -path '*/curl/curl.h' | egrep --max-count=1 . \
 247         || fatal "No libcurl curl.h. Try: apt-get install libcurl4-gnutls-dev"
 248     echo -n 'libpq libpq-fe.h: '
 249     find /usr/include -path '*/postgresql/libpq-fe.h' | egrep --max-count=1 . \
 250         || fatal "No libpq libpq-fe.h. Try: apt-get install libpq-dev"
 251     echo -n 'services/api/config/database.yml: '
 252     if [[ ! -f "$WORKSPACE/services/api/config/database.yml" ]]; then
 253             fatal "Please provide a database.yml file for the test suite"
 254     else
 255             echo "OK"
 256     fi
 257     echo -n 'postgresql: '
 258     psql --version || fatal "No postgresql. Try: apt-get install postgresql postgresql-client-common"
 259     echo -n 'phantomjs: '
 260     phantomjs --version || fatal "No phantomjs. Try: apt-get install phantomjs"
 261     echo -n 'xvfb: '
 262     which Xvfb || fatal "No xvfb. Try: apt-get install xvfb"
 263     echo -n 'graphviz: '
 264     dot -V || fatal "No graphviz. Try: apt-get install graphviz"
 265     echo -n 'geckodriver: '
 266     geckodriver --version | grep ^geckodriver || echo "No geckodriver. Try: wget -O- https://github.com/mozilla/geckodriver/releases/download/v0.23.0/geckodriver-v0.23.0-linux64.tar.gz | sudo tar -C /usr/local/bin -xzf - geckodriver"
 267
 268     if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
 269       # R SDK stuff
 270       echo -n 'R: '
 271       which Rscript || fatal "No Rscript. Try: apt-get install r-base"
 272       echo -n 'testthat: '
 273       Rscript -e "library('testthat')" || fatal "No testthat. Try: apt-get install r-cran-testthat"
 274       # needed for roxygen2, needed for devtools, needed for R sdk
 275       pkg-config --exists libxml-2.0 || fatal "No libxml2. Try: apt-get install libxml2-dev"
 276       # needed for pkgdown, builds R SDK doc pages
 277       which pandoc || fatal "No pandoc. Try: apt-get install pandoc"
 278     fi
 279 }
 280
 281 rotate_logfile() {
 282   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 283   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
 284   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
 285     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
 286     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 287     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 288   fi
 289 }
 290
 291 declare -a failures
 292 declare -A skip
 293 declare -A only
 294 declare -A testargs
 295 skip[apps/workbench_profile]=1
 296 # nodemanager_integration tests are not reliable, see #12061.
 297 skip[services/nodemanager_integration]=1
 298
 299 while [[ -n "$1" ]]
 300 do
 301     arg="$1"; shift
 302     case "$arg" in
 303         --help)
 304             echo >&2 "$helpmessage"
 305             echo >&2
 306             exit 1
 307             ;;
 308         --skip)
 309             skip[$1]=1; shift
 310             ;;
 311         --only)
 312             only[$1]=1; skip[$1]=""; shift
 313             ;;
 314         --short)
 315             short=1
 316             ;;
 317         --interactive)
 318             interactive=1
 319             ;;
 320         --skip-install)
 321             skip[install]=1
 322             ;;
 323         --only-install)
 324             only_install="$1"; shift
 325             ;;
 326         --temp)
 327             temp="$1"; shift
 328             temp_preserve=1
 329             ;;
 330         --leave-temp)
 331             temp_preserve=1
 332             ;;
 333         --repeat)
 334             repeat=$((${1}+0)); shift
 335             ;;
 336         --retry)
 337             retry=1
 338             ;;
 339         *_test=*)
 340             suite="${arg%%_test=*}"
 341             args="${arg#*=}"
 342             testargs["$suite"]="$args"
 343             ;;
 344         *=*)
 345             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
 346             ;;
 347         *)
 348             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
 349             exit 1
 350             ;;
 351     esac
 352 done
 353
 354 # R SDK installation is very slow (~360s in a clean environment) and only
 355 # required when testing it. Skip that step if it is not needed.
 356 NEED_SDK_R=true
 357
 358 if [[ ${#only[@]} -ne 0 ]] &&
 359    [[ -z "${only['sdk/R']}" && -z "${only['doc']}" ]]; then
 360   NEED_SDK_R=false
 361 fi
 362
 363 if [[ ${skip["sdk/R"]} == 1 && ${skip["doc"]} == 1 ]]; then
 364   NEED_SDK_R=false
 365 fi
 366
 367 if [[ $NEED_SDK_R == false ]]; then
 368         echo "R SDK not needed, it will not be installed."
 369 fi
 370
 371 checkpidfile() {
 372     svc="$1"
 373     pid="$(cat "$WORKSPACE/tmp/${svc}.pid")"
 374     if [[ -z "$pid" ]] || ! kill -0 "$pid"; then
 375         tail $WORKSPACE/tmp/${1}*.log
 376         echo "${svc} pid ${pid} not running"
 377         return 1
 378     fi
 379     echo "${svc} pid ${pid} ok"
 380 }
 381
 382 checkhealth() {
 383     svc="$1"
 384     port="$(cat "$WORKSPACE/tmp/${svc}.port")"
 385     scheme=http
 386     if [[ ${svc} =~ -ssl$ || ${svc} = wss ]]; then
 387         scheme=https
 388     fi
 389     url="$scheme://localhost:${port}/_health/ping"
 390     if ! curl -Ss -H "Authorization: Bearer e687950a23c3a9bceec28c6223a06c79" "${url}" | tee -a /dev/stderr | grep '"OK"'; then
 391         echo "${url} failed"
 392         return 1
 393     fi
 394 }
 395
 396 checkdiscoverydoc() {
 397     dd="https://${1}/discovery/v1/apis/arvados/v1/rest"
 398     if ! (set -o pipefail; curl -fsk "$dd" | grep -q ^{ ); then
 399         echo >&2 "ERROR: could not retrieve discovery doc from RailsAPI at $dd"
 400         tail -v $WORKSPACE/services/api/log/test.log
 401         return 1
 402     fi
 403     echo "${dd} ok"
 404 }
 405
 406 start_services() {
 407     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
 408         return 0
 409     fi
 410     . "$VENVDIR/bin/activate"
 411     echo 'Starting API, controller, keepproxy, keep-web, arv-git-httpd, ws, and nginx ssl proxy...'
 412     if [[ ! -d "$WORKSPACE/services/api/log" ]]; then
 413         mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/log"
 414     fi
 415     # Remove empty api.pid file if it exists
 416     if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/api.pid" && ! -s "$WORKSPACE/tmp/api.pid" ]]; then
 417         rm -f "$WORKSPACE/tmp/api.pid"
 418     fi
 419     all_services_stopped=
 420     fail=1
 421     cd "$WORKSPACE" \
 422         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
 423         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
 424         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
 425         && checkpidfile api \
 426         && checkdiscoverydoc $ARVADOS_API_HOST \
 427         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_controller \
 428         && checkpidfile controller \
 429         && checkhealth controller \
 430         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
 431         && checkpidfile keepproxy \
 432         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
 433         && checkpidfile keep-web \
 434         && checkhealth keep-web \
 435         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
 436         && checkpidfile arv-git-httpd \
 437         && checkhealth arv-git-httpd \
 438         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 439         && checkpidfile ws \
 440         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx) \
 441         && checkdiscoverydoc $ARVADOS_API_HOST \
 442         && checkpidfile nginx \
 443         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1 \
 444         && (env | egrep ^ARVADOS) \
 445         && fail=0
 446     deactivate
 447     if [[ $fail != 0 ]]; then
 448         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
 449     fi
 450     return $fail
 451 }
 452
 453 stop_services() {
 454     if [[ -n "$all_services_stopped" ]]; then
 455         return
 456     fi
 457     unset ARVADOS_TEST_API_HOST ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
 458     . "$VENVDIR/bin/activate" || return
 459     cd "$WORKSPACE" \
 460         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 461         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
 462         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 463         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
 464         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy \
 465         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_controller \
 466         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop \
 467         && all_services_stopped=1
 468     deactivate
 469 }
 470
 471 interrupt() {
 472     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
 473     exit_cleanly
 474 }
 475 trap interrupt INT
 476
 477 setup_ruby_environment() {
 478     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 479         source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
 480         using_rvm=true
 481     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 482         source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
 483         using_rvm=true
 484     else
 485         using_rvm=false
 486     fi
 487
 488     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 489         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
 490         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
 491         # the environment to the "current gemset", which would lose
 492         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
 493         # programs (for example, the Workbench test suite could not
 494         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
 495         # rvm gemset and use it for everything.
 496
 497         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
 498             || fatal 'rvm check'
 499
 500         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
 501         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
 502         # complaint about not being in first place already.
 503         rvm use @default 2>/dev/null
 504
 505         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
 506         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
 507         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
 508         # ruby to the caller.
 509         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
 510         rvm use "@${gemset}" --create \
 511             || fatal 'rvm gemset setup'
 512
 513         rvm env
 514     else
 515         # When our "bundle install"s need to install new gems to
 516         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
 517         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
 518         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
 519         # should be installed, and we should leave it alone.)
 520
 521         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
 522             user_gempath="$(gem env gempath)"
 523             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
 524         fi
 525         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
 526
 527         # When we build and install our own gems, we install them in our
 528         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
 529         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
 530         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
 531
 532         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
 533         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
 534         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home"
 535
 536         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
 537         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
 538         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
 539     fi
 540     bundle config || gem install bundler \
 541         || fatal 'install bundler'
 542 }
 543
 544 with_test_gemset() {
 545     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 546         "$@"
 547     else
 548         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
 549     fi
 550 }
 551
 552 gem_uninstall_if_exists() {
 553     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
 554         gem uninstall --force --all --executables "$1"
 555     fi
 556 }
 557
 558 setup_virtualenv() {
 559     local venvdest="$1"; shift
 560     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
 561         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
 562     elif [[ -n "$short" ]]; then
 563         return
 564     fi
 565     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
 566         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
 567         "$venvdest/bin/pip" install --no-cache-dir 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
 568     else
 569         "$venvdest/bin/pip" install --no-cache-dir 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
 570     fi
 571     # ubuntu1404 can't seem to install mock via tests_require, but it can do this.
 572     "$venvdest/bin/pip" install --no-cache-dir 'mock>=1.0' 'pbr<1.7.0'
 573 }
 574
 575 initialize() {
 576     sanity_checks
 577
 578     echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
 579
 580     if [[ -z "$CONFIGSRC" ]] && [[ -d "$HOME/arvados-api-server" ]]; then
 581         # Jenkins expects us to use this by default.
 582         CONFIGSRC="$HOME/arvados-api-server"
 583     fi
 584
 585     # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
 586     cd "$WORKSPACE"
 587     find -name '*.pyc' -delete
 588
 589     if [[ -z "$temp" ]]; then
 590         temp="$(mktemp -d)"
 591     fi
 592
 593     # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
 594     for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE R_LIBS
 595     do
 596         if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
 597             eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
 598         fi
 599         if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
 600             mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
 601         fi
 602     done
 603
 604     rm -vf "${WORKSPACE}/tmp/*.log"
 605
 606     export PERLINSTALLBASE
 607     export PERL5LIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5${PERL5LIB:+:$PERL5LIB}"
 608
 609     export R_LIBS
 610
 611     export GOPATH
 612
 613     # Jenkins config requires that glob tmp/*.log match something. Ensure
 614     # that happens even if we don't end up running services that set up
 615     # logging.
 616     mkdir -p "${WORKSPACE}/tmp/" || fatal "could not mkdir ${WORKSPACE}/tmp"
 617     touch "${WORKSPACE}/tmp/controller.log" || fatal "could not touch ${WORKSPACE}/tmp/controller.log"
 618
 619     unset http_proxy https_proxy no_proxy
 620
 621
 622     # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
 623     # whine a lot.
 624     setup_ruby_environment
 625
 626     echo "PATH is $PATH"
 627 }
 628
 629 install_env() {
 630     (
 631         set -e
 632         mkdir -p "$GOPATH/src/git.curoverse.com"
 633         if [[ ! -h "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" ]]; then
 634             for d in \
 635                 "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/tmp/GOPATH" \
 636                     "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/tmp" \
 637                     "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"; do
 638                 [[ -d "$d" ]] && rmdir "$d"
 639             done
 640         fi
 641         for d in \
 642             "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/arvados" \
 643                 "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"; do
 644             [[ -h "$d" ]] && rm "$d"
 645         done
 646         ln -vsfT "$WORKSPACE" "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"
 647         go get -v github.com/kardianos/govendor
 648         cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"
 649         if [[ -n "$short" ]]; then
 650             go get -v -d ...
 651             "$GOPATH/bin/govendor" sync
 652         else
 653             # Remove cached source dirs in workdir. Otherwise, they will
 654             # not qualify as +missing or +external below, and we won't be
 655             # able to detect that they're missing from vendor/vendor.json.
 656             rm -rf vendor/*/
 657             go get -v -d ...
 658             "$GOPATH/bin/govendor" sync
 659             [[ -z $("$GOPATH/bin/govendor" list +unused +missing +external | tee /dev/stderr) ]] \
 660                 || fatal "vendor/vendor.json has unused or missing dependencies -- try:
 661
 662 (export GOPATH=\"${GOPATH}\"; cd \$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git && \$GOPATH/bin/govendor add +missing +external && \$GOPATH/bin/govendor remove +unused)
 663
 664 ";
 665         fi
 666     ) || fatal "Go setup failed"
 667
 668     setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
 669     . "$VENVDIR/bin/activate"
 670
 671     # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
 672     pip install --no-cache-dir PyYAML \
 673         || fatal "pip install PyYAML failed"
 674
 675     # Preinstall libcloud if using a fork; otherwise nodemanager "pip
 676     # install" won't pick it up by default.
 677     if [[ -n "$LIBCLOUD_PIN_SRC" ]]; then
 678         pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
 679             || pip install --pre --ignore-installed --no-cache-dir "$LIBCLOUD_PIN_SRC" >/dev/null \
 680             || fatal "pip install apache-libcloud failed"
 681     fi
 682
 683     # Deactivate Python 2 virtualenv
 684     deactivate
 685
 686     # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
 687     # Otherwise, skip dependent tests.
 688     PYTHON3=$(which python3)
 689     if [[ ${?} = 0 ]]; then
 690         setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
 691     else
 692         PYTHON3=
 693         cat >&2 <<EOF
 694
 695 Warning: python3 could not be found. Python 3 tests will be skipped.
 696
 697 EOF
 698     fi
 699
 700     if ! which bundler >/dev/null
 701     then
 702         gem install --user-install bundler || fatal 'Could not install bundler'
 703     fi
 704 }
 705
 706 retry() {
 707     remain="${repeat}"
 708     while :
 709     do
 710         if ${@}; then
 711             if [[ "$remain" -gt 1 ]]; then
 712                 remain=$((${remain}-1))
 713                 title "(repeating ${remain} more times)"
 714             else
 715                 break
 716             fi
 717         elif [[ "$retry" == 1 ]]; then
 718             read -p 'Try again? [Y/n] ' x
 719             if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
 720             then
 721                 break
 722             fi
 723         else
 724             break
 725         fi
 726     done
 727 }
 728
 729 do_test() {
 730     case "${1}" in
 731         apps/workbench_units | apps/workbench_functionals | apps/workbench_integration)
 732             suite=apps/workbench
 733             ;;
 734         services/nodemanager | services/nodemanager_integration)
 735             suite=services/nodemanager_suite
 736             ;;
 737         *)
 738             suite="${1}"
 739             ;;
 740     esac
 741     if [[ -n "${skip[$suite]}" || \
 742               -n "${skip[$1]}" || \
 743               (${#only[@]} -ne 0 && ${only[$suite]} -eq 0 && ${only[$1]} -eq 0) ]]; then
 744         return 0
 745     fi
 746     case "${1}" in
 747         services/api)
 748             stop_services
 749             ;;
 750         gofmt | doc | lib/cli | lib/cloud/azure | lib/cloud/ec2 | lib/cmd | lib/dispatchcloud/ssh_executor | lib/dispatchcloud/worker)
 751             # don't care whether services are running
 752             ;;
 753         *)
 754             if ! start_services; then
 755                 title "test $1 -- failed to start services"
 756                 return 1
 757             fi
 758             ;;
 759     esac
 760     retry do_test_once ${@}
 761 }
 762
 763 do_test_once() {
 764     unset result
 765
 766     title "test $1"
 767     timer_reset
 768
 769     result=
 770     if which deactivate >/dev/null; then deactivate; fi
 771     if ! . "$VENVDIR/bin/activate"
 772     then
 773         result=1
 774     elif [[ "$2" == "go" ]]
 775     then
 776         covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
 777         coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
 778         # We do "go get -t" here to catch compilation errors
 779         # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
 780         # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
 781         # compilation errors.
 782         go get -ldflags "-X main.version=${ARVADOS_VERSION:-$(git log -n1 --format=%H)-dev}" -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 783             cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 784             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
 785         then
 786             # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
 787             # does:
 788             go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
 789         else
 790             # The above form gets verbose even when testargs is
 791             # empty, so use this form in such cases:
 792             go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 793         fi
 794         result=${result:-$?}
 795         if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
 796         then
 797             go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
 798             rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
 799         fi
 800         [[ $result = 0 ]] && gofmt -e -d *.go
 801     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 802     then
 803         tries=0
 804         cd "$WORKSPACE/$1" && while :
 805         do
 806             tries=$((${tries}+1))
 807             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 808             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 809             "${3}python" setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
 810             result=$?
 811             if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
 812             then
 813                 printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
 814                 continue
 815             else
 816                 break
 817             fi
 818         done
 819     elif [[ "$2" != "" ]]
 820     then
 821         "test_$2"
 822     else
 823         "test_$1"
 824     fi
 825     result=${result:-$?}
 826     checkexit $result "$1 tests"
 827     title "test $1 -- `timer`"
 828     return $result
 829 }
 830
 831 do_install() {
 832     if [[ -n "${skip[install]}" || ( -n "${only_install}" && "${only_install}" != "${1}" && "${only_install}" != "${2}" ) ]]; then
 833         return 0
 834     fi
 835     retry do_install_once ${@}
 836 }
 837
 838 do_install_once() {
 839     title "install $1"
 840     timer_reset
 841
 842     result=
 843     if which deactivate >/dev/null; then deactivate; fi
 844     if [[ "$1" != "env" ]] && ! . "$VENVDIR/bin/activate"; then
 845         result=1
 846     elif [[ "$2" == "go" ]]
 847     then
 848         go get -ldflags "-X main.version=${ARVADOS_VERSION:-$(git log -n1 --format=%H)-dev}" -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 849     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 850     then
 851         # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 852         # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 853
 854         # Need to change to a different directory after creating
 855         # the source dist package to avoid a pip bug.
 856         # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
 857
 858         # Also need to install twice, because if it believes the package is
 859         # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
 860         # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
 861         # install" ensures that we've actually installed the local package
 862         # we just built.
 863         cd "$WORKSPACE/$1" \
 864             && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
 865             && cd "$WORKSPACE" \
 866             && "${3}pip" install --no-cache-dir --quiet "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
 867             && "${3}pip" install --no-cache-dir --quiet --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
 868     elif [[ "$2" != "" ]]
 869     then
 870         "install_$2"
 871     else
 872         "install_$1"
 873     fi
 874     result=${result:-$?}
 875     checkexit $result "$1 install"
 876     title "install $1 -- `timer`"
 877     return $result
 878 }
 879
 880 bundle_install_trylocal() {
 881     (
 882         set -e
 883         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
 884         if ! bundle install --local --no-deployment; then
 885             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
 886             bundle install --no-deployment
 887         fi
 888         bundle package --all
 889     )
 890 }
 891
 892 install_doc() {
 893     cd "$WORKSPACE/doc" \
 894         && bundle_install_trylocal \
 895         && rm -rf .site
 896 }
 897
 898 install_gem() {
 899     gemname=$1
 900     srcpath=$2
 901     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
 902         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
 903         && bundle_install_trylocal \
 904         && gem build "$gemname.gemspec" \
 905         && with_test_gemset gem install --no-ri --no-rdoc $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
 906 }
 907
 908 install_sdk/ruby() {
 909     install_gem arvados sdk/ruby
 910 }
 911
 912 install_sdk/R() {
 913   if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
 914     cd "$WORKSPACE/sdk/R" \
 915        && Rscript --vanilla install_deps.R
 916   fi
 917 }
 918
 919 install_sdk/perl() {
 920     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
 921         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
 922         && make install INSTALLDIRS=perl
 923 }
 924
 925 install_sdk/cli() {
 926     install_gem arvados-cli sdk/cli
 927 }
 928
 929 install_services/login-sync() {
 930     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
 931 }
 932
 933 install_services/api() {
 934     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 935         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 936
 937     rm -f config/environments/test.rb
 938     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
 939
 940     if [ -n "$CONFIGSRC" ]
 941     then
 942         for f in database.yml
 943         do
 944             cp "$CONFIGSRC/$f" config/ || fatal "$f"
 945         done
 946     fi
 947
 948     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
 949     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
 950     # is a postgresql superuser.
 951     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 952         && test_database=$(python -c "import yaml; print yaml.safe_load(file('config/database.yml'))['test']['database']") \
 953         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.pid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
 954
 955     mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/tmp/pids"
 956
 957     cert="$WORKSPACE/services/api/tmp/self-signed"
 958     if [[ ! -e "$cert.pem" || "$(date -r "$cert.pem" +%s)" -lt 1512659226 ]]; then
 959         (
 960             dir="$WORKSPACE/services/api/tmp"
 961             set -ex
 962             openssl req -newkey rsa:2048 -nodes -subj '/C=US/ST=State/L=City/CN=localhost' -out "$cert.csr" -keyout "$cert.key" </dev/null
 963             openssl x509 -req -in "$cert.csr" -signkey "$cert.key" -out "$cert.pem" -days 3650 -extfile <(printf 'subjectAltName=DNS:localhost,DNS:::1,DNS:0.0.0.0,DNS:127.0.0.1,IP:::1,IP:0.0.0.0,IP:127.0.0.1')
 964         ) || return 1
 965     fi
 966
 967     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 968         && rm -rf tmp/git \
 969         && mkdir -p tmp/git \
 970         && cd tmp/git \
 971         && tar xf ../../test/test.git.tar \
 972         && mkdir -p internal.git \
 973         && git --git-dir internal.git init \
 974             || return 1
 975
 976     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 977         && RAILS_ENV=test bundle exec rails db:environment:set \
 978         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:drop \
 979         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:setup \
 980         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:fixtures:load
 981 }
 982
 983 declare -a pythonstuff
 984 pythonstuff=(
 985     sdk/pam
 986     sdk/python
 987     sdk/python:py3
 988     sdk/cwl
 989     sdk/cwl:py3
 990     services/dockercleaner:py3
 991     services/fuse
 992     services/nodemanager
 993     tools/crunchstat-summary
 994 )
 995
 996 declare -a gostuff
 997 gostuff=(
 998     cmd/arvados-client
 999     cmd/arvados-server
1000     lib/cli
1001     lib/cmd
1002     lib/controller
1003     lib/crunchstat
1004     lib/cloud
1005     lib/cloud/azure
1006     lib/cloud/ec2
1007     lib/config
1008     lib/dispatchcloud
1009     lib/dispatchcloud/container
1010     lib/dispatchcloud/scheduler
1011     lib/dispatchcloud/ssh_executor
1012     lib/dispatchcloud/worker
1013     lib/service
1014     sdk/go/arvados
1015     sdk/go/arvadosclient
1016     sdk/go/auth
1017     sdk/go/blockdigest
1018     sdk/go/dispatch
1019     sdk/go/health
1020     sdk/go/httpserver
1021     sdk/go/manifest
1022     sdk/go/asyncbuf
1023     sdk/go/crunchrunner
1024     sdk/go/stats
1025     services/arv-git-httpd
1026     services/crunchstat
1027     services/health
1028     services/keep-web
1029     services/keepstore
1030     sdk/go/keepclient
1031     services/keep-balance
1032     services/keepproxy
1033     services/crunch-dispatch-local
1034     services/crunch-dispatch-slurm
1035     services/crunch-run
1036     services/ws
1037     tools/keep-block-check
1038     tools/keep-exercise
1039     tools/keep-rsync
1040     tools/sync-groups
1041 )
1042
1043 install_apps/workbench() {
1044     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1045         && mkdir -p tmp/cache \
1046         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal \
1047         && RAILS_ENV=test RAILS_GROUPS=assets bundle exec rake npm:install
1048 }
1049
1050 test_doc() {
1051     (
1052         set -e
1053         cd "$WORKSPACE/doc"
1054         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
1055         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
1056         # do much good!
1057         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ bundle exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
1058     )
1059 }
1060
1061 test_gofmt() {
1062     cd "$WORKSPACE" || return 1
1063     dirs=$(ls -d */ | egrep -v 'vendor|tmp')
1064     [[ -z "$(gofmt -e -d $dirs | tee -a /dev/stderr)" ]]
1065 }
1066
1067 test_services/api() {
1068     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
1069     cd "$WORKSPACE/services/api" \
1070         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/api]}
1071 }
1072
1073 test_sdk/ruby() {
1074     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
1075         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
1076 }
1077
1078 test_sdk/R() {
1079   if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
1080     cd "$WORKSPACE/sdk/R" \
1081         && Rscript --vanilla run_test.R
1082   fi
1083 }
1084
1085 test_sdk/cli() {
1086     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
1087         && mkdir -p /tmp/keep \
1088         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
1089 }
1090
1091 test_services/login-sync() {
1092     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
1093         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
1094 }
1095
1096 test_services/nodemanager_integration() {
1097     cd "$WORKSPACE/services/nodemanager" \
1098         && tests/integration_test.py ${testargs[services/nodemanager_integration]}
1099 }
1100
1101 test_apps/workbench_units() {
1102     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1103         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:units TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_units]}
1104 }
1105
1106 test_apps/workbench_functionals() {
1107     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1108         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:functionals TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_functionals]}
1109 }
1110
1111 test_apps/workbench_integration() {
1112     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1113         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:integration TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_integration]}
1114 }
1115
1116 test_apps/workbench_benchmark() {
1117     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1118         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:benchmark ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
1119 }
1120
1121 test_apps/workbench_profile() {
1122     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1123         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:profile ${testargs[apps/workbench_profile]}
1124 }
1125
1126 install_deps() {
1127     # Install parts needed by test suites
1128     do_install env
1129     do_install cmd/arvados-server go
1130     do_install sdk/cli
1131     do_install sdk/perl
1132     do_install sdk/python pip
1133     do_install sdk/ruby
1134     do_install services/api
1135     do_install services/arv-git-httpd go
1136     do_install services/keepproxy go
1137     do_install services/keepstore go
1138     do_install services/keep-web go
1139     do_install services/ws go
1140 }
1141
1142 install_all() {
1143     do_install env
1144     do_install doc
1145     do_install sdk/ruby
1146     do_install sdk/R
1147     do_install sdk/perl
1148     do_install sdk/cli
1149     do_install services/login-sync
1150     for p in "${pythonstuff[@]}"
1151     do
1152         dir=${p%:py3}
1153         if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
1154             if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
1155                 do_install ${dir} pip
1156             fi
1157         elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
1158             if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
1159                 do_install ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
1160             fi
1161         fi
1162     done
1163     do_install services/api
1164     for g in "${gostuff[@]}"
1165     do
1166         do_install "$g" go
1167     done
1168     do_install apps/workbench
1169 }
1170
1171 test_all() {
1172     stop_services
1173     do_test services/api
1174
1175     # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
1176     # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
1177     if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
1178         rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
1179         exit_cleanly
1180     fi
1181
1182     do_test gofmt
1183     do_test doc
1184     do_test sdk/ruby
1185     do_test sdk/R
1186     do_test sdk/cli
1187     do_test services/login-sync
1188     do_test services/nodemanager_integration
1189     for p in "${pythonstuff[@]}"
1190     do
1191         dir=${p%:py3}
1192         if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
1193             if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
1194                 do_test ${dir} pip
1195             fi
1196         elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
1197             if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
1198                 do_test ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
1199             fi
1200         fi
1201     done
1202
1203     for g in "${gostuff[@]}"
1204     do
1205         do_test "$g" go
1206     done
1207     do_test apps/workbench_units
1208     do_test apps/workbench_functionals
1209     do_test apps/workbench_integration
1210     do_test apps/workbench_benchmark
1211     do_test apps/workbench_profile
1212 }
1213
1214 help_interactive() {
1215     echo "== Interactive commands:"
1216     echo "TARGET                 (short for 'test DIR')"
1217     echo "test TARGET"
1218     echo "test TARGET:py3        (test with python3)"
1219     echo "test TARGET -check.vv  (pass arguments to test)"
1220     echo "install TARGET"
1221     echo "install env            (go/python libs)"
1222     echo "install deps           (go/python libs + arvados components needed for integration tests)"
1223     echo "reset                  (...services used by integration tests)"
1224     echo "exit"
1225     echo "== Test targets:"
1226     echo "${!testfuncargs[@]}" | tr ' ' '\n' | sort | column
1227 }
1228
1229 initialize
1230
1231 declare -A testfuncargs=()
1232 for g in "${gostuff[@]}"; do
1233     testfuncargs[$g]="$g go"
1234 done
1235 for p in "${pythonstuff[@]}"; do
1236     dir=${p%:py3}
1237     testfuncargs[$dir]="$dir pip $VENVDIR/bin/"
1238     testfuncargs[$dir:py3]="$dir pip $VENV3DIR/bin/"
1239 done
1240
1241 if [[ -z ${interactive} ]]; then
1242     install_all
1243     test_all
1244 else
1245     skip=()
1246     only=()
1247     only_install=()
1248     if [[ -e "$VENVDIR/bin/activate" ]]; then stop_services; fi
1249     setnextcmd() {
1250         if [[ "$TERM" = dumb ]]; then
1251             # assume emacs, or something, is offering a history buffer
1252             # and pre-populating the command will only cause trouble
1253             nextcmd=
1254         elif [[ "$nextcmd" != "install deps" ]]; then
1255             :
1256         elif [[ -e "$VENVDIR/bin/activate" ]]; then
1257             nextcmd="test lib/cmd"
1258         else
1259             nextcmd="install deps"
1260         fi
1261     }
1262     echo
1263     help_interactive
1264     nextcmd="install deps"
1265     setnextcmd
1266     while read -p 'What next? ' -e -i "${nextcmd}" nextcmd; do
1267         read verb target opts <<<"${nextcmd}"
1268         target="${target%/}"
1269         target="${target/\/:/:}"
1270         case "${verb}" in
1271             "exit" | "quit")
1272                 exit_cleanly
1273                 ;;
1274             "reset")
1275                 stop_services
1276                 ;;
1277             "test" | "install")
1278                 case "$target" in
1279                     "")
1280                         help_interactive
1281                         ;;
1282                     all | deps)
1283                         ${verb}_${target}
1284                         ;;
1285                     *)
1286                         testargs["$target"]="${opts}"
1287                         tt="${testfuncargs[${target}]}"
1288                         tt="${tt:-$target}"
1289                         do_$verb $tt
1290                         ;;
1291                 esac
1292                 ;;
1293             "" | "help" | *)
1294                 help_interactive
1295                 ;;
1296         esac
1297         if [[ ${#successes[@]} -gt 0 || ${#failures[@]} -gt 0 ]]; then
1298             report_outcomes
1299             successes=()
1300             failures=()
1301         fi
1302         cd "$WORKSPACE"
1303         setnextcmd
1304     done
1305     echo
1306 fi
1307 exit_cleanly