build/run-tests.sh

   1 #!/bin/bash
   2 # Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
   3 #
   4 # SPDX-License-Identifier: AGPL-3.0
   5
   6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin.sh
   7
   8 COLUMNS=80
   9 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
  10
  11 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
  12 $(basename $0): Install and test Arvados components.
  13
  14 Exit non-zero if any tests fail.
  15
  16 Syntax:
  17         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
  18
  19 Options:
  20
  21 --skip FOO     Do not test the FOO component.
  22 --skip sanity  Skip initial dev environment sanity checks.
  23 --skip install Do not run any install steps. Just run tests.
  24                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
  25                from a previous invocation if you use this option.
  26 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
  27 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
  28                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
  29 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
  30                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
  31                subsequent invocations.
  32 --repeat N     Repeat each install/test step until it succeeds N times.
  33 --retry        Prompt to retry if an install or test suite fails.
  34 --only-install Run specific install step
  35 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
  36 --interactive  Set up, then prompt for test/install steps to perform.
  37 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
  38 CONFIGSRC=path Dir with api server config files to copy into source tree.
  39                (If none given, leave config files alone in source tree.)
  40 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
  41                Restrict apiserver tests to the given file
  42 sdk/python_test="--test-suite tests.test_keep_locator"
  43                Restrict Python SDK tests to the given class
  44 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
  45                Restrict Workbench tests to the given file
  46 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
  47                Show all log messages, even when tests pass (also works
  48                with services/keepstore_test etc.)
  49 ARVADOS_DEBUG=1
  50                Print more debug messages
  51 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
  52                *_test, and other examples shown above.
  53
  54 Assuming "--skip install" is not given, all components are installed
  55 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
  56 test suites depend on other components being installed, and installing
  57 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
  58
  59 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
  60 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
  61
  62 More information and background:
  63
  64 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
  65
  66 Available tests:
  67
  68 apps/workbench (*)
  69 apps/workbench_units (*)
  70 apps/workbench_functionals (*)
  71 apps/workbench_integration (*)
  72 apps/workbench_benchmark
  73 apps/workbench_profile
  74 cmd/arvados-client
  75 cmd/arvados-server
  76 doc
  77 lib/cli
  78 lib/cmd
  79 lib/controller
  80 lib/controller/federation
  81 lib/controller/railsproxy
  82 lib/controller/router
  83 lib/controller/rpc
  84 lib/crunchstat
  85 lib/cloud
  86 lib/cloud/azure
  87 lib/cloud/cloudtest
  88 lib/dispatchcloud
  89 lib/dispatchcloud/container
  90 lib/dispatchcloud/scheduler
  91 lib/dispatchcloud/ssh_executor
  92 lib/dispatchcloud/worker
  93 lib/service
  94 services/api
  95 services/arv-git-httpd
  96 services/crunchstat
  97 services/dockercleaner
  98 services/fuse
  99 services/fuse:py3
 100 services/health
 101 services/keep-web
 102 services/keepproxy
 103 services/keepstore
 104 services/keep-balance
 105 services/login-sync
 106 services/nodemanager
 107 services/nodemanager_integration
 108 services/crunch-run
 109 services/crunch-dispatch-local
 110 services/crunch-dispatch-slurm
 111 services/ws
 112 sdk/cli
 113 sdk/pam
 114 sdk/pam:py3
 115 sdk/python
 116 sdk/python:py3
 117 sdk/ruby
 118 sdk/go/arvados
 119 sdk/go/arvadosclient
 120 sdk/go/auth
 121 sdk/go/dispatch
 122 sdk/go/keepclient
 123 sdk/go/health
 124 sdk/go/httpserver
 125 sdk/go/manifest
 126 sdk/go/blockdigest
 127 sdk/go/asyncbuf
 128 sdk/go/stats
 129 sdk/go/crunchrunner
 130 sdk/cwl
 131 sdk/R
 132 sdk/java-v2
 133 tools/sync-groups
 134 tools/crunchstat-summary
 135 tools/crunchstat-summary:py3
 136 tools/keep-exercise
 137 tools/keep-rsync
 138 tools/keep-block-check
 139
 140 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
 141     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
 142
 143 EOF
 144
 145 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
 146 # environment that could interfere with the tests.
 147 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
 148
 149 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
 150 # accident.
 151 GITDIR=
 152 GOPATH=
 153 VENVDIR=
 154 VENV3DIR=
 155 PYTHONPATH=
 156 GEMHOME=
 157 PERLINSTALLBASE=
 158 R_LIBS=
 159 export LANG=en_US.UTF-8
 160
 161 short=
 162 only_install=
 163 temp=
 164 temp_preserve=
 165
 166 clear_temp() {
 167     if [[ -z "$temp" ]]; then
 168         # we didn't even get as far as making a temp dir
 169         :
 170     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
 171         rm -rf "$temp"
 172     else
 173         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
 174     fi
 175 }
 176
 177 fatal() {
 178     clear_temp
 179     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
 180     exit 1
 181 }
 182
 183 exit_cleanly() {
 184     trap - INT
 185     if which create-plot-data-from-log.sh >/dev/null; then
 186         create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
 187     fi
 188     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 189     stop_services
 190     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 191     report_outcomes
 192     clear_temp
 193     exit ${#failures}
 194 }
 195
 196 sanity_checks() {
 197     [[ -n "${skip[sanity]}" ]] && return 0
 198     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
 199         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
 200     echo Checking dependencies:
 201     echo "locale: ${LANG}"
 202     [[ "$(locale charmap)" = "UTF-8" ]] \
 203         || fatal "Locale '${LANG}' is broken/missing. Try: echo ${LANG} | sudo tee -a /etc/locale.gen && sudo locale-gen"
 204     echo -n 'virtualenv: '
 205     virtualenv --version \
 206         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
 207     echo -n 'ruby: '
 208     ruby -v \
 209         || fatal "No ruby. Install >=2.1.9 (using rbenv, rvm, or source)"
 210     echo -n 'go: '
 211     go version \
 212         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
 213     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 12 ]] \
 214         || fatal "Go >= 1.12 required. See http://golang.org/doc/install"
 215     echo -n 'gcc: '
 216     gcc --version | egrep ^gcc \
 217         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
 218     echo -n 'fuse.h: '
 219     find /usr/include -path '*fuse/fuse.h' | egrep --max-count=1 . \
 220         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
 221     echo -n 'gnutls.h: '
 222     find /usr/include -path '*gnutls/gnutls.h' | egrep --max-count=1 . \
 223         || fatal "No gnutls/gnutls.h. Try: apt-get install libgnutls28-dev"
 224     echo -n 'Python2 pyconfig.h: '
 225     find /usr/include -path '*/python2*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 226         || fatal "No Python2 pyconfig.h. Try: apt-get install python2.7-dev"
 227     echo -n 'Python3 pyconfig.h: '
 228     find /usr/include -path '*/python3*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 229         || fatal "No Python3 pyconfig.h. Try: apt-get install python3-dev"
 230     which netstat \
 231         || fatal "No netstat. Try: apt-get install net-tools"
 232     echo -n 'nginx: '
 233     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
 234         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
 235     echo -n 'perl: '
 236     perl -v | grep version \
 237         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
 238     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
 239         echo -n "perl $mod: "
 240         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
 241             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
 242     done
 243     echo -n 'gitolite: '
 244     which gitolite \
 245         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
 246     echo -n 'npm: '
 247     npm --version \
 248         || fatal "No npm. Try: wget -O- https://nodejs.org/dist/v6.11.2/node-v6.11.2-linux-x64.tar.xz | sudo tar -C /usr/local -xJf - && sudo ln -s ../node-v6.11.2-linux-x64/bin/{node,npm} /usr/local/bin/"
 249     echo -n 'cadaver: '
 250     cadaver --version | grep -w cadaver \
 251           || fatal "No cadaver. Try: apt-get install cadaver"
 252     echo -n 'libattr1 xattr.h: '
 253     find /usr/include -path '*/attr/xattr.h' | egrep --max-count=1 . \
 254         || fatal "No libattr1 xattr.h. Try: apt-get install libattr1-dev"
 255     echo -n 'libcurl curl.h: '
 256     find /usr/include -path '*/curl/curl.h' | egrep --max-count=1 . \
 257         || fatal "No libcurl curl.h. Try: apt-get install libcurl4-gnutls-dev"
 258     echo -n 'libpq libpq-fe.h: '
 259     find /usr/include -path '*/postgresql/libpq-fe.h' | egrep --max-count=1 . \
 260         || fatal "No libpq libpq-fe.h. Try: apt-get install libpq-dev"
 261     echo -n 'postgresql: '
 262     psql --version || fatal "No postgresql. Try: apt-get install postgresql postgresql-client-common"
 263     echo -n 'phantomjs: '
 264     phantomjs --version || fatal "No phantomjs. Try: apt-get install phantomjs"
 265     echo -n 'xvfb: '
 266     which Xvfb || fatal "No xvfb. Try: apt-get install xvfb"
 267     echo -n 'graphviz: '
 268     dot -V || fatal "No graphviz. Try: apt-get install graphviz"
 269     echo -n 'geckodriver: '
 270     geckodriver --version | grep ^geckodriver || echo "No geckodriver. Try: wget -O- https://github.com/mozilla/geckodriver/releases/download/v0.23.0/geckodriver-v0.23.0-linux64.tar.gz | sudo tar -C /usr/local/bin -xzf - geckodriver"
 271
 272     if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
 273       # R SDK stuff
 274       echo -n 'R: '
 275       which Rscript || fatal "No Rscript. Try: apt-get install r-base"
 276       echo -n 'testthat: '
 277       Rscript -e "library('testthat')" || fatal "No testthat. Try: apt-get install r-cran-testthat"
 278       # needed for roxygen2, needed for devtools, needed for R sdk
 279       pkg-config --exists libxml-2.0 || fatal "No libxml2. Try: apt-get install libxml2-dev"
 280       # needed for pkgdown, builds R SDK doc pages
 281       which pandoc || fatal "No pandoc. Try: apt-get install pandoc"
 282     fi
 283 }
 284
 285 rotate_logfile() {
 286   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 287   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
 288   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
 289     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
 290     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 291     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 292   fi
 293 }
 294
 295 declare -a failures
 296 declare -A skip
 297 declare -A only
 298 declare -A testargs
 299 skip[apps/workbench_profile]=1
 300 # nodemanager_integration tests are not reliable, see #12061.
 301 skip[services/nodemanager_integration]=1
 302
 303 while [[ -n "$1" ]]
 304 do
 305     arg="$1"; shift
 306     case "$arg" in
 307         --help)
 308             echo >&2 "$helpmessage"
 309             echo >&2
 310             exit 1
 311             ;;
 312         --skip)
 313             skip[$1]=1; shift
 314             ;;
 315         --only)
 316             only[$1]=1; skip[$1]=""; shift
 317             ;;
 318         --short)
 319             short=1
 320             ;;
 321         --interactive)
 322             interactive=1
 323             ;;
 324         --skip-install)
 325             skip[install]=1
 326             ;;
 327         --only-install)
 328             only_install="$1"; shift
 329             ;;
 330         --temp)
 331             temp="$1"; shift
 332             temp_preserve=1
 333             ;;
 334         --leave-temp)
 335             temp_preserve=1
 336             ;;
 337         --repeat)
 338             repeat=$((${1}+0)); shift
 339             ;;
 340         --retry)
 341             retry=1
 342             ;;
 343         *_test=*)
 344             suite="${arg%%_test=*}"
 345             args="${arg#*=}"
 346             testargs["$suite"]="$args"
 347             ;;
 348         *=*)
 349             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
 350             ;;
 351         *)
 352             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
 353             exit 1
 354             ;;
 355     esac
 356 done
 357
 358 # R SDK installation is very slow (~360s in a clean environment) and only
 359 # required when testing it. Skip that step if it is not needed.
 360 NEED_SDK_R=true
 361
 362 if [[ ${#only[@]} -ne 0 ]] &&
 363    [[ -z "${only['sdk/R']}" && -z "${only['doc']}" ]]; then
 364   NEED_SDK_R=false
 365 fi
 366
 367 if [[ ${skip["sdk/R"]} == 1 && ${skip["doc"]} == 1 ]]; then
 368   NEED_SDK_R=false
 369 fi
 370
 371 if [[ $NEED_SDK_R == false ]]; then
 372         echo "R SDK not needed, it will not be installed."
 373 fi
 374
 375 checkpidfile() {
 376     svc="$1"
 377     pid="$(cat "$WORKSPACE/tmp/${svc}.pid")"
 378     if [[ -z "$pid" ]] || ! kill -0 "$pid"; then
 379         tail $WORKSPACE/tmp/${1}*.log
 380         echo "${svc} pid ${pid} not running"
 381         return 1
 382     fi
 383     echo "${svc} pid ${pid} ok"
 384 }
 385
 386 checkhealth() {
 387     svc="$1"
 388     base=$(python -c "import yaml; print list(yaml.safe_load(file('$ARVADOS_CONFIG'))['Clusters']['zzzzz']['Services']['$1']['InternalURLs'].keys())[0]")
 389     url="$base/_health/ping"
 390     if ! curl -Ss -H "Authorization: Bearer e687950a23c3a9bceec28c6223a06c79" "${url}" | tee -a /dev/stderr | grep '"OK"'; then
 391         echo "${url} failed"
 392         return 1
 393     fi
 394 }
 395
 396 checkdiscoverydoc() {
 397     dd="https://${1}/discovery/v1/apis/arvados/v1/rest"
 398     if ! (set -o pipefail; curl -fsk "$dd" | grep -q ^{ ); then
 399         echo >&2 "ERROR: could not retrieve discovery doc from RailsAPI at $dd"
 400         tail -v $WORKSPACE/services/api/log/test.log
 401         return 1
 402     fi
 403     echo "${dd} ok"
 404 }
 405
 406 start_services() {
 407     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
 408         return 0
 409     fi
 410     . "$VENVDIR/bin/activate"
 411     echo 'Starting API, controller, keepproxy, keep-web, arv-git-httpd, ws, and nginx ssl proxy...'
 412     if [[ ! -d "$WORKSPACE/services/api/log" ]]; then
 413         mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/log"
 414     fi
 415     # Remove empty api.pid file if it exists
 416     if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/api.pid" && ! -s "$WORKSPACE/tmp/api.pid" ]]; then
 417         rm -f "$WORKSPACE/tmp/api.pid"
 418     fi
 419     all_services_stopped=
 420     fail=1
 421     cd "$WORKSPACE" \
 422         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
 423         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
 424         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
 425         && checkpidfile api \
 426         && checkdiscoverydoc $ARVADOS_API_HOST \
 427         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx) \
 428         && checkpidfile nginx \
 429         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_controller \
 430         && checkpidfile controller \
 431         && checkhealth Controller \
 432         && checkdiscoverydoc $ARVADOS_API_HOST \
 433         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
 434         && checkpidfile keepproxy \
 435         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
 436         && checkpidfile keep-web \
 437         && checkhealth WebDAV \
 438         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
 439         && checkpidfile arv-git-httpd \
 440         && checkhealth GitHTTP \
 441         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 442         && checkpidfile ws \
 443         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1 \
 444         && (env | egrep ^ARVADOS) \
 445         && fail=0
 446     deactivate
 447     if [[ $fail != 0 ]]; then
 448         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
 449     fi
 450     return $fail
 451 }
 452
 453 stop_services() {
 454     if [[ -n "$all_services_stopped" ]]; then
 455         return
 456     fi
 457     unset ARVADOS_TEST_API_HOST ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
 458     . "$VENVDIR/bin/activate" || return
 459     cd "$WORKSPACE" \
 460         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 461         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
 462         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 463         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
 464         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy \
 465         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_controller \
 466         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop \
 467         && all_services_stopped=1
 468     deactivate
 469 }
 470
 471 interrupt() {
 472     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
 473     exit_cleanly
 474 }
 475 trap interrupt INT
 476
 477 setup_ruby_environment() {
 478     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 479         source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
 480         using_rvm=true
 481     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 482         source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
 483         using_rvm=true
 484     else
 485         using_rvm=false
 486     fi
 487
 488     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 489         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
 490         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
 491         # the environment to the "current gemset", which would lose
 492         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
 493         # programs (for example, the Workbench test suite could not
 494         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
 495         # rvm gemset and use it for everything.
 496
 497         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
 498             || fatal 'rvm check'
 499
 500         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
 501         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
 502         # complaint about not being in first place already.
 503         rvm use @default 2>/dev/null
 504
 505         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
 506         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
 507         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
 508         # ruby to the caller.
 509         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
 510         rvm use "@${gemset}" --create \
 511             || fatal 'rvm gemset setup'
 512
 513         rvm env
 514     else
 515         # When our "bundle install"s need to install new gems to
 516         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
 517         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
 518         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
 519         # should be installed, and we should leave it alone.)
 520
 521         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
 522             user_gempath="$(gem env gempath)"
 523             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
 524         fi
 525         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
 526
 527         # When we build and install our own gems, we install them in our
 528         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
 529         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
 530         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
 531
 532         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
 533         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
 534         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home"
 535
 536         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
 537         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
 538         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
 539     fi
 540     bundle config || gem install bundler \
 541         || fatal 'install bundler'
 542 }
 543
 544 with_test_gemset() {
 545     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 546         "$@"
 547     else
 548         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
 549     fi
 550 }
 551
 552 gem_uninstall_if_exists() {
 553     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
 554         gem uninstall --force --all --executables "$1"
 555     fi
 556 }
 557
 558 setup_virtualenv() {
 559     local venvdest="$1"; shift
 560     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
 561         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
 562     elif [[ -n "$short" ]]; then
 563         return
 564     fi
 565     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
 566         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
 567         "$venvdest/bin/pip" install --no-cache-dir 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
 568     else
 569         "$venvdest/bin/pip" install --no-cache-dir 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
 570     fi
 571 }
 572
 573 initialize() {
 574     sanity_checks
 575
 576     echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
 577
 578     if [[ -z "$CONFIGSRC" ]] && [[ -d "$HOME/arvados-api-server" ]]; then
 579         # Jenkins expects us to use this by default.
 580         CONFIGSRC="$HOME/arvados-api-server"
 581     fi
 582
 583     # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
 584     cd "$WORKSPACE"
 585     find -name '*.pyc' -delete
 586
 587     if [[ -z "$temp" ]]; then
 588         temp="$(mktemp -d)"
 589     fi
 590
 591     # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
 592     for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE R_LIBS
 593     do
 594         if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
 595             eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
 596         fi
 597         if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
 598             mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
 599         fi
 600     done
 601
 602     rm -vf "${WORKSPACE}/tmp/*.log"
 603
 604     export PERLINSTALLBASE
 605     export PERL5LIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5${PERL5LIB:+:$PERL5LIB}"
 606
 607     export R_LIBS
 608
 609     export GOPATH
 610     # Make sure our compiled binaries under test override anything
 611     # else that might be in the environment.
 612     export PATH=$GOPATH/bin:$PATH
 613
 614     # Jenkins config requires that glob tmp/*.log match something. Ensure
 615     # that happens even if we don't end up running services that set up
 616     # logging.
 617     mkdir -p "${WORKSPACE}/tmp/" || fatal "could not mkdir ${WORKSPACE}/tmp"
 618     touch "${WORKSPACE}/tmp/controller.log" || fatal "could not touch ${WORKSPACE}/tmp/controller.log"
 619
 620     unset http_proxy https_proxy no_proxy
 621
 622     # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
 623     # whine a lot.
 624     setup_ruby_environment
 625
 626     echo "PATH is $PATH"
 627 }
 628
 629 install_env() {
 630     (
 631         set -e
 632         mkdir -p "$GOPATH/src/git.curoverse.com"
 633         if [[ ! -h "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" ]]; then
 634             for d in \
 635                 "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/tmp/GOPATH" \
 636                     "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/tmp" \
 637                     "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"; do
 638                 [[ -d "$d" ]] && rmdir "$d"
 639             done
 640         fi
 641         for d in \
 642             "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/arvados" \
 643                 "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"; do
 644             [[ -h "$d" ]] && rm "$d"
 645         done
 646         ln -vsfT "$WORKSPACE" "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"
 647         go get -v github.com/kardianos/govendor
 648         cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"
 649         go get -v -d ...
 650         "$GOPATH/bin/govendor" sync
 651         which goimports >/dev/null || go get golang.org/x/tools/cmd/goimports
 652     ) || fatal "Go setup failed"
 653
 654     setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
 655     . "$VENVDIR/bin/activate"
 656
 657     # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
 658     pip install --no-cache-dir PyYAML \
 659         || fatal "pip install PyYAML failed"
 660
 661     eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py setup_config)
 662
 663     # Preinstall libcloud if using a fork; otherwise nodemanager "pip
 664     # install" won't pick it up by default.
 665     if [[ -n "$LIBCLOUD_PIN_SRC" ]]; then
 666         pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
 667             || pip install --pre --ignore-installed --no-cache-dir "$LIBCLOUD_PIN_SRC" >/dev/null \
 668             || fatal "pip install apache-libcloud failed"
 669     fi
 670
 671     # Deactivate Python 2 virtualenv
 672     deactivate
 673
 674     # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
 675     # Otherwise, skip dependent tests.
 676     PYTHON3=$(which python3)
 677     if [[ ${?} = 0 ]]; then
 678         setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
 679     else
 680         PYTHON3=
 681         cat >&2 <<EOF
 682
 683 Warning: python3 could not be found. Python 3 tests will be skipped.
 684
 685 EOF
 686     fi
 687
 688     if ! which bundler >/dev/null
 689     then
 690         gem install --user-install bundler || fatal 'Could not install bundler'
 691     fi
 692 }
 693
 694 retry() {
 695     remain="${repeat}"
 696     while :
 697     do
 698         if ${@}; then
 699             if [[ "$remain" -gt 1 ]]; then
 700                 remain=$((${remain}-1))
 701                 title "(repeating ${remain} more times)"
 702             else
 703                 break
 704             fi
 705         elif [[ "$retry" == 1 ]]; then
 706             read -p 'Try again? [Y/n] ' x
 707             if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
 708             then
 709                 break
 710             fi
 711         else
 712             break
 713         fi
 714     done
 715 }
 716
 717 do_test() {
 718     case "${1}" in
 719         apps/workbench_units | apps/workbench_functionals | apps/workbench_integration)
 720             suite=apps/workbench
 721             ;;
 722         services/nodemanager | services/nodemanager_integration)
 723             suite=services/nodemanager_suite
 724             ;;
 725         *)
 726             suite="${1}"
 727             ;;
 728     esac
 729     if [[ -n "${skip[$suite]}" || \
 730               -n "${skip[$1]}" || \
 731               (${#only[@]} -ne 0 && ${only[$suite]} -eq 0 && ${only[$1]} -eq 0) ]]; then
 732         return 0
 733     fi
 734     case "${1}" in
 735         services/api)
 736             stop_services
 737             ;;
 738         gofmt | govendor | doc | lib/cli | lib/cloud/azure | lib/cloud/ec2 | lib/cloud/cloudtest | lib/cmd | lib/dispatchcloud/ssh_executor | lib/dispatchcloud/worker)
 739             # don't care whether services are running
 740             ;;
 741         *)
 742             if ! start_services; then
 743                 title "test $1 -- failed to start services"
 744                 return 1
 745             fi
 746             ;;
 747     esac
 748     retry do_test_once ${@}
 749 }
 750
 751 do_test_once() {
 752     unset result
 753
 754     title "test $1"
 755     timer_reset
 756
 757     result=
 758     if which deactivate >/dev/null; then deactivate; fi
 759     if ! . "$VENVDIR/bin/activate"
 760     then
 761         result=1
 762     elif [[ "$2" == "go" ]]
 763     then
 764         covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
 765         coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
 766         # We do "go get -t" here to catch compilation errors
 767         # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
 768         # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
 769         # compilation errors.
 770         go get -ldflags "-X git.curoverse.com/arvados.git/lib/cmd.version=${ARVADOS_VERSION:-$(git log -n1 --format=%H)-dev}" -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 771             cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 772             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
 773         then
 774             # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
 775             # does:
 776             go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
 777         else
 778             # The above form gets verbose even when testargs is
 779             # empty, so use this form in such cases:
 780             go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 781         fi
 782         result=${result:-$?}
 783         if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
 784         then
 785             go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
 786             rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
 787         fi
 788         [[ $result = 0 ]] && gofmt -e -d *.go
 789     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 790     then
 791         tries=0
 792         cd "$WORKSPACE/$1" && while :
 793         do
 794             tries=$((${tries}+1))
 795             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 796             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 797             if [[ -e "${3}activate" ]]; then
 798                 . "${3}activate"
 799             fi
 800             python setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
 801             result=$?
 802             if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
 803             then
 804                 printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
 805                 continue
 806             else
 807                 break
 808             fi
 809         done
 810     elif [[ "$2" != "" ]]
 811     then
 812         "test_$2"
 813     else
 814         "test_$1"
 815     fi
 816     result=${result:-$?}
 817     checkexit $result "$1 tests"
 818     title "test $1 -- `timer`"
 819     return $result
 820 }
 821
 822 do_install() {
 823     if [[ -n "${skip[install]}" || ( -n "${only_install}" && "${only_install}" != "${1}" && "${only_install}" != "${2}" ) ]]; then
 824         return 0
 825     fi
 826     retry do_install_once ${@}
 827 }
 828
 829 do_install_once() {
 830     title "install $1"
 831     timer_reset
 832
 833     result=
 834     if which deactivate >/dev/null; then deactivate; fi
 835     if [[ "$1" != "env" ]] && ! . "$VENVDIR/bin/activate"; then
 836         result=1
 837     elif [[ "$2" == "go" ]]
 838     then
 839         go get -ldflags "-X git.curoverse.com/arvados.git/lib/cmd.version=${ARVADOS_VERSION:-$(git log -n1 --format=%H)-dev}" -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 840     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 841     then
 842         # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 843         # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 844
 845         # Need to change to a different directory after creating
 846         # the source dist package to avoid a pip bug.
 847         # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
 848
 849         # Also need to install twice, because if it believes the package is
 850         # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
 851         # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
 852         # install" ensures that we've actually installed the local package
 853         # we just built.
 854         cd "$WORKSPACE/$1" \
 855             && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
 856             && cd "$WORKSPACE" \
 857             && "${3}pip" install --no-cache-dir --quiet "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
 858             && "${3}pip" install --no-cache-dir --quiet --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
 859     elif [[ "$2" != "" ]]
 860     then
 861         "install_$2"
 862     else
 863         "install_$1"
 864     fi
 865     result=${result:-$?}
 866     checkexit $result "$1 install"
 867     title "install $1 -- `timer`"
 868     return $result
 869 }
 870
 871 bundle_install_trylocal() {
 872     (
 873         set -e
 874         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
 875         if ! bundle install --local --no-deployment; then
 876             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
 877             bundle install --no-deployment
 878         fi
 879         bundle package --all
 880     )
 881 }
 882
 883 install_doc() {
 884     cd "$WORKSPACE/doc" \
 885         && bundle_install_trylocal \
 886         && rm -rf .site
 887 }
 888
 889 install_gem() {
 890     gemname=$1
 891     srcpath=$2
 892     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
 893         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
 894         && bundle_install_trylocal \
 895         && gem build "$gemname.gemspec" \
 896         && with_test_gemset gem install --no-document $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
 897 }
 898
 899 install_sdk/ruby() {
 900     install_gem arvados sdk/ruby
 901 }
 902
 903 install_sdk/R() {
 904   if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
 905     cd "$WORKSPACE/sdk/R" \
 906        && Rscript --vanilla install_deps.R
 907   fi
 908 }
 909
 910 install_sdk/perl() {
 911     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
 912         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
 913         && make install INSTALLDIRS=perl
 914 }
 915
 916 install_sdk/cli() {
 917     install_gem arvados-cli sdk/cli
 918 }
 919
 920 install_services/login-sync() {
 921     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
 922 }
 923
 924 install_services/api() {
 925     stop_services
 926     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 927         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 928
 929     rm -f config/environments/test.rb
 930     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
 931
 932     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
 933     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
 934     # is a postgresql superuser.
 935     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 936         && test_database=$(python -c "import yaml; print yaml.safe_load(file('$ARVADOS_CONFIG'))['Clusters']['zzzzz']['PostgreSQL']['Connection']['dbname']") \
 937         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.pid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
 938
 939     mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/tmp/pids"
 940
 941     cert="$WORKSPACE/services/api/tmp/self-signed"
 942     if [[ ! -e "$cert.pem" || "$(date -r "$cert.pem" +%s)" -lt 1512659226 ]]; then
 943         (
 944             dir="$WORKSPACE/services/api/tmp"
 945             set -ex
 946             openssl req -newkey rsa:2048 -nodes -subj '/C=US/ST=State/L=City/CN=localhost' -out "$cert.csr" -keyout "$cert.key" </dev/null
 947             openssl x509 -req -in "$cert.csr" -signkey "$cert.key" -out "$cert.pem" -days 3650 -extfile <(printf 'subjectAltName=DNS:localhost,DNS:::1,DNS:0.0.0.0,DNS:127.0.0.1,IP:::1,IP:0.0.0.0,IP:127.0.0.1')
 948         ) || return 1
 949     fi
 950
 951     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 952         && rm -rf tmp/git \
 953         && mkdir -p tmp/git \
 954         && cd tmp/git \
 955         && tar xf ../../test/test.git.tar \
 956         && mkdir -p internal.git \
 957         && git --git-dir internal.git init \
 958             || return 1
 959
 960     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 961         && RAILS_ENV=test bundle exec rails db:environment:set \
 962         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:drop \
 963         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:setup \
 964         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:fixtures:load
 965 }
 966
 967 declare -a pythonstuff
 968 pythonstuff=(
 969     sdk/pam
 970     sdk/python
 971     sdk/python:py3
 972     sdk/cwl
 973     sdk/cwl:py3
 974     services/dockercleaner:py3
 975     services/fuse
 976     services/fuse:py3
 977     services/nodemanager
 978     tools/crunchstat-summary
 979     tools/crunchstat-summary:py3
 980 )
 981
 982 declare -a gostuff
 983 gostuff=($(cd "$WORKSPACE" && git grep -lw func | grep \\.go | sed -e 's/\/[^\/]*$//' | sort -u))
 984
 985 install_apps/workbench() {
 986     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 987         && mkdir -p tmp/cache \
 988         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal \
 989         && RAILS_ENV=test RAILS_GROUPS=assets bundle exec rake npm:install
 990 }
 991
 992 test_doc() {
 993     (
 994         set -e
 995         cd "$WORKSPACE/doc"
 996         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
 997         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
 998         # do much good!
 999         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ bundle exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
1000     )
1001 }
1002
1003 test_gofmt() {
1004     cd "$WORKSPACE" || return 1
1005     dirs=$(ls -d */ | egrep -v 'vendor|tmp')
1006     [[ -z "$(gofmt -e -d $dirs | tee -a /dev/stderr)" ]]
1007 }
1008
1009 test_govendor() {
1010     (
1011         set -e
1012         cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"
1013         # Remove cached source dirs in workdir. Otherwise, they will
1014         # not qualify as +missing or +external below, and we won't be
1015         # able to detect that they're missing from vendor/vendor.json.
1016         rm -rf vendor/*/
1017         go get -v -d ...
1018         "$GOPATH/bin/govendor" sync
1019         if [[ -n $("$GOPATH/bin/govendor" list +unused +missing +external | tee /dev/stderr) ]]; then
1020             echo >&2 "vendor/vendor.json has unused or missing dependencies -- try:
1021
1022 (export GOPATH=\"${GOPATH}\"; cd \$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git && \$GOPATH/bin/govendor add +missing +external && \$GOPATH/bin/govendor remove +unused)
1023
1024 "
1025             return 1
1026         fi
1027     )
1028 }
1029
1030 test_services/api() {
1031     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
1032     cd "$WORKSPACE/services/api" \
1033         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test TESTOPTS='-v -d' ${testargs[services/api]}
1034 }
1035
1036 test_sdk/ruby() {
1037     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
1038         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
1039 }
1040
1041 test_sdk/R() {
1042   if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
1043     cd "$WORKSPACE/sdk/R" \
1044         && Rscript --vanilla run_test.R
1045   fi
1046 }
1047
1048 test_sdk/cli() {
1049     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
1050         && mkdir -p /tmp/keep \
1051         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
1052 }
1053
1054 test_sdk/java-v2() {
1055     cd "$WORKSPACE/sdk/java-v2" && gradle test
1056 }
1057
1058 test_services/login-sync() {
1059     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
1060         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
1061 }
1062
1063 test_services/nodemanager_integration() {
1064     cd "$WORKSPACE/services/nodemanager" \
1065         && tests/integration_test.py ${testargs[services/nodemanager_integration]}
1066 }
1067
1068 test_apps/workbench_units() {
1069     local TASK="test:units"
1070     if [[ -n "${testargs[apps/workbench]}" ]] || [[ -n "${testargs[apps/workbench_units]}" ]]; then
1071         TASK="test"
1072     fi
1073     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1074         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake ${TASK} TESTOPTS='-v -d' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_units]}
1075 }
1076
1077 test_apps/workbench_functionals() {
1078     local TASK="test:functionals"
1079     if [[ -n "${testargs[apps/workbench]}" ]] || [[ -n "${testargs[apps/workbench_functionals]}" ]]; then
1080         TASK="test"
1081     fi
1082     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1083         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake ${TASK} TESTOPTS='-v -d' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_functionals]}
1084 }
1085
1086 test_apps/workbench_integration() {
1087     local TASK="test:integration"
1088     if [[ -n "${testargs[apps/workbench]}" ]] || [[ -n "${testargs[apps/workbench_integration]}" ]]; then
1089         TASK="test"
1090     fi
1091     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1092         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake ${TASK} TESTOPTS='-v -d' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_integration]}
1093 }
1094
1095 test_apps/workbench_benchmark() {
1096     local TASK="test:benchmark"
1097     if [[ -n "${testargs[apps/workbench]}" ]] || [[ -n "${testargs[apps/workbench_benchmark]}" ]]; then
1098         TASK="test"
1099     fi
1100     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1101         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake ${TASK} ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
1102 }
1103
1104 test_apps/workbench_profile() {
1105     local TASK="test:profile"
1106     if [[ -n "${testargs[apps/workbench]}" ]] || [[ -n "${testargs[apps/workbench_profile]}" ]]; then
1107         TASK="test"
1108     fi
1109     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1110         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake ${TASK} ${testargs[apps/workbench_profile]}
1111 }
1112
1113 install_deps() {
1114     # Install parts needed by test suites
1115     do_install env
1116     do_install cmd/arvados-server go
1117     do_install sdk/cli
1118     do_install sdk/perl
1119     do_install sdk/python pip
1120     do_install sdk/ruby
1121     do_install services/api
1122     do_install services/arv-git-httpd go
1123     do_install services/keepproxy go
1124     do_install services/keepstore go
1125     do_install services/keep-web go
1126     do_install services/ws go
1127 }
1128
1129 install_all() {
1130     do_install env
1131     do_install doc
1132     do_install sdk/ruby
1133     do_install sdk/R
1134     do_install sdk/perl
1135     do_install sdk/cli
1136     do_install services/login-sync
1137     for p in "${pythonstuff[@]}"
1138     do
1139         dir=${p%:py3}
1140         if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
1141             if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
1142                 do_install ${dir} pip
1143             fi
1144         elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
1145             if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
1146                 do_install ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
1147             fi
1148         fi
1149     done
1150     for g in "${gostuff[@]}"
1151     do
1152         do_install "$g" go
1153     done
1154     do_install services/api
1155     do_install apps/workbench
1156 }
1157
1158 test_all() {
1159     stop_services
1160     do_test services/api
1161
1162     # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
1163     # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
1164     if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
1165         rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
1166         exit_cleanly
1167     fi
1168
1169     do_test gofmt
1170     do_test govendor
1171     do_test doc
1172     do_test sdk/ruby
1173     do_test sdk/R
1174     do_test sdk/cli
1175     do_test services/login-sync
1176     do_test sdk/java-v2
1177     do_test services/nodemanager_integration
1178     for p in "${pythonstuff[@]}"
1179     do
1180         dir=${p%:py3}
1181         if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
1182             if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
1183                 do_test ${dir} pip
1184             fi
1185         elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
1186             if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
1187                 do_test ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
1188             fi
1189         fi
1190     done
1191
1192     for g in "${gostuff[@]}"
1193     do
1194         do_test "$g" go
1195     done
1196     do_test apps/workbench_units
1197     do_test apps/workbench_functionals
1198     do_test apps/workbench_integration
1199     do_test apps/workbench_benchmark
1200     do_test apps/workbench_profile
1201 }
1202
1203 help_interactive() {
1204     echo "== Interactive commands:"
1205     echo "TARGET                 (short for 'test DIR')"
1206     echo "test TARGET"
1207     echo "test TARGET:py3        (test with python3)"
1208     echo "test TARGET -check.vv  (pass arguments to test)"
1209     echo "install TARGET"
1210     echo "install env            (go/python libs)"
1211     echo "install deps           (go/python libs + arvados components needed for integration tests)"
1212     echo "reset                  (...services used by integration tests)"
1213     echo "exit"
1214     echo "== Test targets:"
1215     echo "${!testfuncargs[@]}" | tr ' ' '\n' | sort | column
1216 }
1217
1218 initialize
1219
1220 declare -A testfuncargs=()
1221 for g in "${gostuff[@]}"; do
1222     testfuncargs[$g]="$g go"
1223 done
1224 for p in "${pythonstuff[@]}"; do
1225     dir=${p%:py3}
1226     testfuncargs[$dir]="$dir pip $VENVDIR/bin/"
1227     testfuncargs[$dir:py3]="$dir pip $VENV3DIR/bin/"
1228 done
1229
1230 testfuncargs["sdk/cli"]="sdk/cli"
1231 testfuncargs["sdk/R"]="sdk/R"
1232 testfuncargs["sdk/java-v2"]="sdk/java-v2"
1233 testfuncargs["apps/workbench_units"]="apps/workbench_units"
1234 testfuncargs["apps/workbench_functionals"]="apps/workbench_functionals"
1235 testfuncargs["apps/workbench_integration"]="apps/workbench_integration"
1236 testfuncargs["apps/workbench_benchmark"]="apps/workbench_benchmark"
1237 testfuncargs["apps/workbench_profile"]="apps/workbench_profile"
1238
1239 if [[ -z ${interactive} ]]; then
1240     install_all
1241     test_all
1242 else
1243     skip=()
1244     only=()
1245     only_install=()
1246     if [[ -e "$VENVDIR/bin/activate" ]]; then stop_services; fi
1247     setnextcmd() {
1248         if [[ "$TERM" = dumb ]]; then
1249             # assume emacs, or something, is offering a history buffer
1250             # and pre-populating the command will only cause trouble
1251             nextcmd=
1252         elif [[ ! -e "$VENVDIR/bin/activate" ]]; then
1253             nextcmd="install deps"
1254         else
1255             nextcmd=""
1256         fi
1257     }
1258     echo
1259     help_interactive
1260     nextcmd="install deps"
1261     setnextcmd
1262     HISTFILE="$WORKSPACE/tmp/.history"
1263     history -r
1264     while read -p 'What next? ' -e -i "$nextcmd" nextcmd; do
1265         history -s "$nextcmd"
1266         history -w
1267         read verb target opts <<<"${nextcmd}"
1268         target="${target%/}"
1269         target="${target/\/:/:}"
1270         case "${verb}" in
1271             "exit" | "quit")
1272                 exit_cleanly
1273                 ;;
1274             "reset")
1275                 stop_services
1276                 ;;
1277             "test" | "install")
1278                 case "$target" in
1279                     "")
1280                         help_interactive
1281                         ;;
1282                     all | deps)
1283                         ${verb}_${target}
1284                         ;;
1285                     *)
1286                         testargs["$target"]="${opts}"
1287                         tt="${testfuncargs[${target}]}"
1288                         tt="${tt:-$target}"
1289                         do_$verb $tt
1290                         ;;
1291                 esac
1292                 ;;
1293             "" | "help" | *)
1294                 help_interactive
1295                 ;;
1296         esac
1297         if [[ ${#successes[@]} -gt 0 || ${#failures[@]} -gt 0 ]]; then
1298             report_outcomes
1299             successes=()
1300             failures=()
1301         fi
1302         cd "$WORKSPACE"
1303         setnextcmd
1304     done
1305     echo
1306 fi
1307 exit_cleanly