doc/start/getting_started/publicproject.html.textile.liquid

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   2 layout: default
   3 navsection: start
   4 title: Visit an Arvados Public Project
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   7 h2. <a href="https://workbench.qr1hi.arvadosapi.com/projects/qr1hi-j7d0g-662ij1pcw6bj8uj">Mason Lab - Pathomap / Ancestry Mapper (Public)</a>
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   9 You can see Arvados in action by accessing the <a href="https://workbench.qr1hi.arvadosapi.com/projects/qr1hi-j7d0g-662ij1pcw6bj8uj">Mason Lab - Pathomap / Ancestry Mapper (Public) project</a>. By visiting this project, you can see what an Arvados project is, access data collections in this project, and click through a pipeline instance's contents.
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  11 You will be accessing this project in read-only mode and will not be able to make any modifications such as running a new pipeline instance.
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  13 <div id="carousel-publicproject" class="carousel slide" data-interval="false">
  14   <!-- Indicators -->
  15   <ol class="carousel-indicators">
  16     <li data-target="#carousel-publicproject" data-slide-to="0" class="active"></li>
  17     <li data-target="#carousel-publicproject" data-slide-to="1"></li>
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  20     <li data-target="#carousel-publicproject" data-slide-to="4"></li>
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  27     <li data-target="#carousel-publicproject" data-slide-to="11"></li>
  28   </ol>
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  30   <!-- Wrapper for slides -->
  31   <div class="carousel-inner" role="listbox">
  32     <div class="item active">
  33       <img src="{{ site.baseurl }}/images/publicproject/description.png" alt="Step 1. The project's first tab, *Description*, describes what this project is all about.">
  34       <div class="carousel-caption">
  35         Step 1. The project's first tab, *Description*, describes what this project is all about.
  36       </div>
  37     </div>
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  39     <div class="item">
  40       <img src="{{ site.baseurl }}/images/publicproject/collections.png" alt="The *Data collections* tab contains the various pipeline inputs, logs, and outputs.">
  41       <div class="carousel-caption">
  42         The *Data collections* tab contains the various pipeline inputs, logs, and outputs.
  43       </div>
  44     </div>
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  46     <div class="item">
  47       <img src="{{ site.baseurl }}/images/publicproject/instances.png" alt="You can see the jobs and pipelines in this project by accessing the *Jobs and pipelines* tab.">
  48       <div class="carousel-caption">
  49         You can see the jobs and pipelines in this project by accessing the *Jobs and pipelines* tab.
  50       </div>
  51     </div>
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  53     <div class="item">
  54       <img src="{{ site.baseurl }}/images/publicproject/collection-show.png" alt="In the *Data collections* tab, click on the *Show* icon to the left of a collection to see the collection contents.">
  55       <div class="carousel-caption">
  56         In the *Data collections* tab, click on the *Show* icon to the left of a collection to see the collection contents.
  57       </div>
  58     </div>
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  60     <div class="item">
  61       <img src="{{ site.baseurl }}/images/publicproject/collection-files.png" alt="The collection page lists the details about it. The *Files* tab can be used to view and download individual files in it.">
  62       <div class="carousel-caption">
  63         The collection page lists the details about it. The *Files* tab can be used to view and download individual files in it.
  64       </div>
  65     </div>
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  67     <div class="item">
  68       <img src="{{ site.baseurl }}/images/publicproject/collection-graph.png" alt="The collection *Provenance graph* tab gives a visual representation of this collection's provenance.">
  69       <div class="carousel-caption">
  70         The collection *Provenance graph* tab gives a visual representation of this collection's provenance.
  71       </div>
  72     </div>
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  74     <div class="item">
  75       <img src="{{ site.baseurl }}/images/publicproject/instance-show.png" alt="In the project *Jobs and pipelines* tab, click on the *Show* icon to the left of a pipeline to access the pipeline contents.">
  76       <div class="carousel-caption">
  77         In the project *Jobs and pipelines* tab, click on the *Show* icon to the left of a pipeline to access the pipeline contents.
  78       </div>
  79     </div>
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  81     <div class="item">
  82       <img src="{{ site.baseurl }}/images/publicproject/instance-components.png" alt="The pipeline *Components* tab details the various jobs in it and how long it took to run it.">
  83       <div class="carousel-caption">
  84         The pipeline *Components* tab details the various jobs in it and how long it took to run it.
  85       </div>
  86     </div>
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  88     <div class="item">
  89       <img src="{{ site.baseurl }}/images/publicproject/instance-job.png" alt="Click on the down arrow in one of the job rows to see the job details. You can also click on the job's output.">
  90       <div class="carousel-caption">
  91         Click on the down arrow <i class="fa fa-lg fa-fw fa-caret-down"></i> in one of the job rows to see the job details. You can also click on the job's output.
  92       </div>
  93     </div>
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  95     <div class="item">
  96       <img src="{{ site.baseurl }}/images/publicproject/instance-log.png" alt="The *Log* tab can be used to see the log for the pipeline instance.">
  97       <div class="carousel-caption">
  98         The *Log* tab can be used to see the log for the pipeline instance.
  99       </div>
 100     </div>
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 102     <div class="item">
 103       <img src="{{ site.baseurl }}/images/publicproject/instance-graph.png" alt="The *Graph* tab provides a visual representation of the pipeline run.">
 104       <div class="carousel-caption">
 105         The *Graph* tab provides a visual representation of the pipeline run.
 106       </div>
 107     </div>
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 109     <div class="item">
 110       <img src="{{ site.baseurl }}/images/publicproject/instance-advanced.png" alt="The *Advanced* tab can be used to access metadata about the pipeline. [END]">
 111       <div class="carousel-caption">
 112         The *Advanced* tab can be used to access metadata about the pipeline. [END]
 113       </div>
 114     </div>
 115   </div>
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 117   <!-- Controls -->
 118   <a class="left carousel-control" href="#carousel-publicproject" role="button" data-slide="prev">
 119     <span class="glyphicon glyphicon-chevron-left" aria-hidden="true"></span>
 120     <span class="sr-only">Previous</span>
 121   </a>
 122   <a class="right carousel-control" href="#carousel-publicproject" role="button" data-slide="next">
 123     <span class="glyphicon glyphicon-chevron-right" aria-hidden="true"></span>
 124     <span class="sr-only">Next</span>
 125   </a>
 126 </div>
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 128 Tip: You may need to make your browser window bigger to see full-size images in the gallery above.