docker/api/setup.sh.in

   1 #!/bin/bash
   2
   3 set -x
   4
   5 if test -f /root/finished_arvados_setup ; then
   6    exit
   7 fi
   8
   9 . /etc/profile.d/rvm.sh
  10
  11 export ARVADOS_API_HOST=api
  12 export ARVADOS_API_HOST_INSECURE=yes
  13 export ARVADOS_API_TOKEN=@@API_SUPERUSER_SECRET@@
  14 export HOME=/root
  15
  16 # Wait for API server to come up.
  17 while ! arv user current ; do sleep 1 ; done
  18
  19 # Arvados repository object
  20 all_users_group_uuid="@@API_HOSTNAME@@-j7d0g-fffffffffffffff"
  21
  22 arv user update --uuid @@API_HOSTNAME@@-tpzed-000000000000000 --user '{"username":"root"}'
  23 repo_uuid=`arv --format=uuid repository create --repository '{"owner_uuid":"@@API_HOSTNAME@@-tpzed-000000000000000", "name":"arvados"}'`
  24 echo "Arvados repository uuid is $repo_uuid"
  25
  26 read -rd $'\000' newlink <<EOF; arv link create --link "$newlink"
  27 {
  28  "tail_uuid":"$all_users_group_uuid",
  29  "head_uuid":"$repo_uuid",
  30  "link_class":"permission",
  31  "name":"can_read"
  32 }
  33 EOF
  34
  35 # Make sure the necessary keep_service objects exist
  36 arv keep_service list > /tmp/keep_service.list
  37
  38 grep -q keep_server_0 /tmp/keep_service.list
  39 if [[ "$?" != "0" ]]; then
  40   arv keep_service create --keep-service "$(cat /root/keep_server_0.json)"
  41 fi
  42
  43 grep -q keep_server_1 /tmp/keep_service.list
  44 if [[ "$?" != "0" ]]; then
  45   arv keep_service create --keep-service "$(cat /root/keep_server_1.json)"
  46 fi
  47
  48 grep -q keep_proxy /tmp/keep_service.list
  49 if [[ "$?" != "0" ]]; then
  50   arv keep_service create --keep-service "$(cat /root/keep_proxy.json)"
  51 fi
  52
  53 # User repository object
  54 # user_uuid=`arv --format=uuid user current`
  55 # repo_uuid=`arv --format=uuid repository create --repository '{"name":"@@ARVADOS_USER_NAME@@","fetch_url":"git@api.dev.arvados:@@ARVADOS_USER_NAME@@.git","push_url":"git@api.dev.arvados:@@ARVADOS_USER_NAME@@.git"}'`
  56
  57 # echo "User repository uuid is $repo_uuid"
  58
  59 # read -rd $'\000' newlink <<EOF; arv link create --link "$newlink"
  60 # {
  61 #  "tail_uuid":"$user_uuid",
  62 #  "head_uuid":"$repo_uuid",
  63 #  "link_class":"permission",
  64 #  "name":"can_write"
  65 # }
  66 # EOF
  67
  68 # # Shell machine object
  69 shell_uuid=`arv --format=uuid virtual_machine create --virtual-machine '{"hostname":"shell"}'`
  70 arv virtual_machine create --virtual-machine '{"hostname":"shell.dev", "uuid": "@@API_HOSTNAME@@-2x53u-csbtkecoa669vkz"}'
  71
  72 # read -rd $'\000' newlink <<EOF; arv link create --link "$newlink"
  73 # {
  74 #  "tail_uuid":"$user_uuid",
  75 #  "head_uuid":"$shell_uuid",
  76 #  "link_class":"permission",
  77 #  "name":"can_login",
  78 #  "properties": {"username": "@@ARVADOS_USER_NAME@@"}
  79 # }
  80 # EOF
  81
  82 touch /root/finished_arvados_setup