apps/workbench/app/controllers/pipeline_instances_controller.rb

   1 class PipelineInstancesController < ApplicationController
   2   skip_before_filter :find_object_by_uuid, only: :compare
   3   before_filter :find_objects_by_uuid, only: :compare
   4   include PipelineInstancesHelper
   5
   6   def graph(pipelines)
   7     count = {}
   8     provenance = {}
   9     pips = {}
  10     n = 1
  11
  12     pipelines.each do |p|
  13       collections = []
  14
  15       p.components.each do |k, v|
  16         j = v[:job] || next
  17
  18         uuid = j[:uuid].intern
  19         provenance[uuid] = j
  20         pips[uuid] = 0 unless pips[uuid] != nil
  21         pips[uuid] |= n
  22
  23         collections << j[:output]
  24         ProvenanceHelper::find_collections(j[:script_parameters]).each do |k|
  25           collections << k
  26         end
  27
  28         uuid = j[:script_version].intern
  29         provenance[uuid] = {:uuid => uuid}
  30         pips[uuid] = 0 unless pips[uuid] != nil
  31         pips[uuid] |= n
  32       end
  33
  34       Collection.where(uuid: collections.compact).each do |c|
  35         uuid = c.uuid.intern
  36         provenance[uuid] = c
  37         pips[uuid] = 0 unless pips[uuid] != nil
  38         pips[uuid] |= n
  39       end
  40
  41       n = n << 1
  42     end
  43
  44     return provenance, pips
  45   end
  46
  47   def show
  48     @pipelines = [@object]
  49
  50     if params[:compare]
  51       PipelineInstance.where(uuid: params[:compare]).each do |p|
  52         @pipelines << p
  53       end
  54     end
  55
  56     provenance, pips = graph(@pipelines)
  57
  58     @prov_svg = ProvenanceHelper::create_provenance_graph provenance, "provenance_svg", {
  59       :all_script_parameters => true,
  60       :combine_jobs => :script_and_version,
  61       :script_version_nodes => true,
  62       :pips => pips }
  63     super
  64   end
  65
  66   def compare
  67     @breadcrumb_page_name = 'compare'
  68
  69     @rows = []          # each is {name: S, components: [...]}
  70
  71     # Build a table: x=pipeline y=component
  72     @objects.each_with_index do |pi, pi_index|
  73       pipeline_jobs(pi).each do |component|
  74         # Find a cell with the same name as this component but no
  75         # entry for this pipeline
  76         target_row = nil
  77         @rows.each_with_index do |row, row_index|
  78           if row[:name] == component[:name] and !row[:components][pi_index]
  79             target_row = row
  80           end
  81         end
  82         if !target_row
  83           target_row = {name: component[:name], components: []}
  84           @rows << target_row
  85         end
  86         target_row[:components][pi_index] = component
  87       end
  88     end
  89
  90     @rows.each do |row|
  91       # Build a "normal" pseudo-component for this row by picking the
  92       # most common value for each attribute. If all values are
  93       # equally common, there is no "normal".
  94       normal = {}              # attr => most common value
  95       highscore = {}           # attr => how common "normal" is
  96       score = {}               # attr => { value => how common }
  97       row[:components].each do |pj|
  98         next if pj.nil?
  99         pj.each do |k,v|
 100           vstr = for_comparison v
 101           score[k] ||= {}
 102           score[k][vstr] = (score[k][vstr] || 0) + 1
 103           highscore[k] ||= 0
 104           if score[k][vstr] == highscore[k]
 105             # tie for first place = no "normal"
 106             normal.delete k
 107           elsif score[k][vstr] == highscore[k] + 1
 108             # more pipelines have v than anything else
 109             highscore[k] = score[k][vstr]
 110             normal[k] = vstr
 111           end
 112         end
 113       end
 114
 115       # Add a hash in component[:is_normal]: { attr => is_the_value_normal? }
 116       row[:components].each do |pj|
 117         next if pj.nil?
 118         pj[:is_normal] = {}
 119         pj.each do |k,v|
 120           pj[:is_normal][k] = (normal.has_key?(k) && normal[k] == for_comparison(v))
 121         end
 122       end
 123     end
 124
 125     provenance, pips = graph(@objects)
 126
 127     @pipelines = @objects
 128
 129     @prov_svg = ProvenanceHelper::create_provenance_graph provenance, "provenance_svg", {
 130       :all_script_parameters => true,
 131       :combine_jobs => :script_and_version,
 132       :script_version_nodes => true,
 133       :pips => pips }
 134   end
 135
 136   def show_pane_list
 137     %w(Components Graph Attributes Metadata JSON API)
 138   end
 139
 140   def compare_pane_list
 141     %w(Compare Graph)
 142   end
 143
 144   protected
 145   def for_comparison v
 146     if v.is_a? Hash or v.is_a? Array
 147       v.to_json
 148     else
 149       v.to_s
 150     end
 151   end
 152
 153   def find_objects_by_uuid
 154     @objects = model_class.where(uuid: params[:uuids])
 155   end
 156
 157 end