build/run-tests.sh

   1 #!/bin/bash
   2 # Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
   3 #
   4 # SPDX-License-Identifier: AGPL-3.0
   5
   6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin.sh
   7
   8 COLUMNS=80
   9 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
  10
  11 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
  12 $(basename $0): Install and test Arvados components.
  13
  14 Exit non-zero if any tests fail.
  15
  16 Syntax:
  17         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
  18
  19 Options:
  20
  21 --skip FOO     Do not test the FOO component.
  22 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
  23 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
  24                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
  25 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
  26                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
  27                subsequent invocations.
  28 --repeat N     Repeat each install/test step until it succeeds N times.
  29 --retry        Prompt to retry if an install or test suite fails.
  30 --skip-install Do not run any install steps. Just run tests.
  31                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
  32                from a previous invocation if you use this option.
  33 --only-install Run specific install step
  34 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
  35 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
  36 CONFIGSRC=path Dir with api server config files to copy into source tree.
  37                (If none given, leave config files alone in source tree.)
  38 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
  39                Restrict apiserver tests to the given file
  40 sdk/python_test="--test-suite test.test_keep_locator"
  41                Restrict Python SDK tests to the given class
  42 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
  43                Restrict Workbench tests to the given file
  44 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
  45                Show all log messages, even when tests pass (also works
  46                with services/keepstore_test etc.)
  47 ARVADOS_DEBUG=1
  48                Print more debug messages
  49 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
  50                *_test, and other examples shown above.
  51
  52 Assuming --skip-install is not given, all components are installed
  53 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
  54 test suites depend on other components being installed, and installing
  55 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
  56
  57 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
  58 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
  59
  60 More information and background:
  61
  62 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
  63
  64 Available tests:
  65
  66 apps/workbench (*)
  67 apps/workbench_units (*)
  68 apps/workbench_functionals (*)
  69 apps/workbench_integration (*)
  70 apps/workbench_benchmark
  71 apps/workbench_profile
  72 doc
  73 services/api
  74 services/arv-git-httpd
  75 services/crunchstat
  76 services/dockercleaner
  77 services/fuse
  78 services/health
  79 services/keep-web
  80 services/keepproxy
  81 services/keepstore
  82 services/keep-balance
  83 services/login-sync
  84 services/nodemanager
  85 services/nodemanager_integration
  86 services/crunch-run
  87 services/crunch-dispatch-local
  88 services/crunch-dispatch-slurm
  89 services/ws
  90 sdk/cli
  91 sdk/pam
  92 sdk/python
  93 sdk/python:py3
  94 sdk/ruby
  95 sdk/go/arvados
  96 sdk/go/arvadosclient
  97 sdk/go/dispatch
  98 sdk/go/keepclient
  99 sdk/go/health
 100 sdk/go/httpserver
 101 sdk/go/manifest
 102 sdk/go/blockdigest
 103 sdk/go/asyncbuf
 104 sdk/go/stats
 105 sdk/go/crunchrunner
 106 sdk/cwl
 107 tools/arv-sync-groups
 108 tools/crunchstat-summary
 109 tools/keep-exercise
 110 tools/keep-rsync
 111 tools/keep-block-check
 112
 113 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
 114     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
 115
 116 EOF
 117
 118 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
 119 # environment that could interfere with the tests.
 120 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
 121
 122 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
 123 # accident.
 124 GITDIR=
 125 GOPATH=
 126 VENVDIR=
 127 VENV3DIR=
 128 PYTHONPATH=
 129 GEMHOME=
 130 PERLINSTALLBASE=
 131
 132 short=
 133 only_install=
 134 temp=
 135 temp_preserve=
 136
 137 clear_temp() {
 138     if [[ -z "$temp" ]]; then
 139         # we didn't even get as far as making a temp dir
 140         :
 141     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
 142         rm -rf "$temp"
 143     else
 144         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
 145     fi
 146 }
 147
 148 fatal() {
 149     clear_temp
 150     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
 151     exit 1
 152 }
 153
 154 exit_cleanly() {
 155     trap - INT
 156     create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
 157     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 158     stop_services
 159     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 160     report_outcomes
 161     clear_temp
 162     exit ${#failures}
 163 }
 164
 165 sanity_checks() {
 166     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
 167         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
 168     echo Checking dependencies:
 169     echo -n 'virtualenv: '
 170     virtualenv --version \
 171         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
 172     echo -n 'ruby: '
 173     ruby -v \
 174         || fatal "No ruby. Install >=2.1.9 (using rbenv, rvm, or source)"
 175     echo -n 'go: '
 176     go version \
 177         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
 178     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 8 ]] \
 179         || fatal "Go >= 1.8 required. See http://golang.org/doc/install"
 180     echo -n 'gcc: '
 181     gcc --version | egrep ^gcc \
 182         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
 183     echo -n 'fuse.h: '
 184     find /usr/include -path '*fuse/fuse.h' | egrep --max-count=1 . \
 185         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
 186     echo -n 'gnutls.h: '
 187     find /usr/include -path '*gnutls/gnutls.h' | egrep --max-count=1 . \
 188         || fatal "No gnutls/gnutls.h. Try: apt-get install libgnutls28-dev"
 189     echo -n 'Python2 pyconfig.h: '
 190     find /usr/include -path '*/python2*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 191         || fatal "No Python2 pyconfig.h. Try: apt-get install python2.7-dev"
 192     echo -n 'Python3 pyconfig.h: '
 193     find /usr/include -path '*/python3*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 194         || fatal "No Python3 pyconfig.h. Try: apt-get install python3-dev"
 195     echo -n 'nginx: '
 196     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
 197         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
 198     echo -n 'perl: '
 199     perl -v | grep version \
 200         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
 201     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
 202         echo -n "perl $mod: "
 203         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
 204             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
 205     done
 206     echo -n 'gitolite: '
 207     which gitolite \
 208         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
 209     echo -n 'npm: '
 210     npm --version \
 211         || fatal "No npm. Try: wget -O- https://nodejs.org/dist/v6.11.2/node-v6.11.2-linux-x64.tar.xz | sudo tar -C /usr/local -xJf - && sudo ln -s ../node-v6.11.2-linux-x64/bin/{node,npm} /usr/local/bin/"
 212     echo -n 'cadaver: '
 213     cadaver --version | grep -w cadaver \
 214           || fatal "No cadaver. Try: apt-get install cadaver"
 215     echo -n 'libattr1 xattr.h: '
 216     find /usr/include -path '*/attr/xattr.h' | egrep --max-count=1 . \
 217         || fatal "No libattr1 xattr.h. Try: apt-get install libattr1-dev"
 218     echo -n 'libcurl curl.h: '
 219     find /usr/include -path '*/curl/curl.h' | egrep --max-count=1 . \
 220         || fatal "No libcurl curl.h. Try: apt-get install libcurl4-gnutls-dev"
 221     echo -n 'libpq libpq-fe.h: '
 222     find /usr/include -path '*/postgresql/libpq-fe.h' | egrep --max-count=1 . \
 223         || fatal "No libpq libpq-fe.h. Try: apt-get install libpq-dev"
 224     echo -n 'services/api/config/database.yml: '
 225     if [[ ! -f "$WORKSPACE/services/api/config/database.yml" ]]; then
 226             fatal "Please provide a database.yml file for the test suite"
 227     else
 228             echo "OK"
 229     fi
 230     echo -n 'postgresql: '
 231     psql --version || fatal "No postgresql. Try: apt-get install postgresql postgresql-client-common"
 232     echo -n 'phantomjs: '
 233     phantomjs --version || fatal "No phantomjs. Try: apt-get install phantomjs"
 234     echo -n 'xvfb: '
 235     which Xvfb || fatal "No xvfb. Try: apt-get install xvfb"
 236     echo -n 'graphviz: '
 237     dot -V || fatal "No graphviz. Try: apt-get install graphviz"
 238 }
 239
 240 rotate_logfile() {
 241   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 242   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
 243   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
 244     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
 245     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 246     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 247   fi
 248 }
 249
 250 declare -a failures
 251 declare -A skip
 252 declare -A testargs
 253 skip[apps/workbench_profile]=1
 254
 255 while [[ -n "$1" ]]
 256 do
 257     arg="$1"; shift
 258     case "$arg" in
 259         --help)
 260             echo >&2 "$helpmessage"
 261             echo >&2
 262             exit 1
 263             ;;
 264         --skip)
 265             skip[$1]=1; shift
 266             ;;
 267         --only)
 268             only="$1"; skip[$1]=""; shift
 269             ;;
 270         --short)
 271             short=1
 272             ;;
 273         --skip-install)
 274             only_install=nothing
 275             ;;
 276         --only-install)
 277             only_install="$1"; shift
 278             ;;
 279         --temp)
 280             temp="$1"; shift
 281             temp_preserve=1
 282             ;;
 283         --leave-temp)
 284             temp_preserve=1
 285             ;;
 286         --repeat)
 287             repeat=$((${1}+0)); shift
 288             ;;
 289         --retry)
 290             retry=1
 291             ;;
 292         *_test=*)
 293             suite="${arg%%_test=*}"
 294             args="${arg#*=}"
 295             testargs["$suite"]="$args"
 296             ;;
 297         *=*)
 298             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
 299             ;;
 300         *)
 301             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
 302             exit 1
 303             ;;
 304     esac
 305 done
 306
 307 start_api() {
 308     echo 'Starting API server...'
 309     if [[ ! -d "$WORKSPACE/services/api/log" ]]; then
 310         mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/log"
 311     fi
 312     # Remove empty api.pid file if it exists
 313     if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/api.pid" && ! -s "$WORKSPACE/tmp/api.pid" ]]; then
 314         rm -f "$WORKSPACE/tmp/api.pid"
 315     fi
 316     cd "$WORKSPACE" \
 317         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
 318         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
 319         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
 320         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 321         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
 322         && (env | egrep ^ARVADOS)
 323 }
 324
 325 start_nginx_proxy_services() {
 326     echo 'Starting keepproxy, keep-web, ws, arv-git-httpd, and nginx ssl proxy...'
 327     cd "$WORKSPACE" \
 328         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
 329         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
 330         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
 331         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 332         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
 333         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1
 334 }
 335
 336 stop_services() {
 337     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES" ]]; then
 338         unset ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
 339         cd "$WORKSPACE" \
 340             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 341             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
 342             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 343             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
 344             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy
 345     fi
 346     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
 347         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
 348         cd "$WORKSPACE" \
 349             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 350             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 351             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop
 352     fi
 353 }
 354
 355 interrupt() {
 356     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
 357     exit_cleanly
 358 }
 359 trap interrupt INT
 360
 361 sanity_checks
 362
 363 echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
 364
 365 if [[ -z "$CONFIGSRC" ]] && [[ -d "$HOME/arvados-api-server" ]]; then
 366     # Jenkins expects us to use this by default.
 367     CONFIGSRC="$HOME/arvados-api-server"
 368 fi
 369
 370 # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
 371 cd "$WORKSPACE"
 372 find -name '*.pyc' -delete
 373
 374 if [[ -z "$temp" ]]; then
 375     temp="$(mktemp -d)"
 376 fi
 377
 378 # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
 379 for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE
 380 do
 381     if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
 382         eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
 383     fi
 384     if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
 385         mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
 386     fi
 387 done
 388
 389 setup_ruby_environment() {
 390     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 391         source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
 392         using_rvm=true
 393     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 394         source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
 395         using_rvm=true
 396     else
 397         using_rvm=false
 398     fi
 399
 400     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 401         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
 402         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
 403         # the environment to the "current gemset", which would lose
 404         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
 405         # programs (for example, the Workbench test suite could not
 406         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
 407         # rvm gemset and use it for everything.
 408
 409         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
 410             || fatal 'rvm check'
 411
 412         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
 413         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
 414         # complaint about not being in first place already.
 415         rvm use @default 2>/dev/null
 416
 417         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
 418         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
 419         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
 420         # ruby to the caller.
 421         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
 422         rvm use "@${gemset}" --create \
 423             || fatal 'rvm gemset setup'
 424
 425         rvm env
 426     else
 427         # When our "bundle install"s need to install new gems to
 428         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
 429         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
 430         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
 431         # should be installed, and we should leave it alone.)
 432
 433         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
 434             user_gempath="$(gem env gempath)"
 435             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
 436         fi
 437         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
 438
 439         # When we build and install our own gems, we install them in our
 440         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
 441         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
 442         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
 443
 444         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
 445         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
 446         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home"
 447
 448         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
 449         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
 450         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
 451     fi
 452     bundle config || gem install bundler \
 453         || fatal 'install bundler'
 454 }
 455
 456 with_test_gemset() {
 457     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 458         "$@"
 459     else
 460         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
 461     fi
 462 }
 463
 464 gem_uninstall_if_exists() {
 465     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
 466         gem uninstall --force --all --executables "$1"
 467     fi
 468 }
 469
 470 setup_virtualenv() {
 471     local venvdest="$1"; shift
 472     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
 473         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
 474     fi
 475     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
 476         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
 477         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
 478     else
 479         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
 480     fi
 481     # ubuntu1404 can't seem to install mock via tests_require, but it can do this.
 482     "$venvdest/bin/pip" install 'mock>=1.0' 'pbr<1.7.0'
 483 }
 484
 485 export PERLINSTALLBASE
 486 export PERLLIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5:${PERLLIB:+$PERLLIB}"
 487
 488 export GOPATH
 489 mkdir -p "$GOPATH/src/git.curoverse.com"
 490 rmdir --parents "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/tmp/GOPATH"
 491 ln -sfT "$WORKSPACE" "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" \
 492     || fatal "symlink failed"
 493 go get -v github.com/kardianos/govendor \
 494     || fatal "govendor install failed"
 495
 496 setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
 497 . "$VENVDIR/bin/activate"
 498
 499 # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
 500 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^PyYAML= \
 501     || pip install PyYAML >/dev/null \
 502     || fatal "pip install PyYAML failed"
 503
 504 # Preinstall forked version of libcloud, because nodemanager "pip install"
 505 # won't pick it up by default.
 506 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
 507     || pip install --pre --ignore-installed https://github.com/curoverse/libcloud/archive/apache-libcloud-$LIBCLOUD_PIN.zip >/dev/null \
 508     || fatal "pip install apache-libcloud failed"
 509
 510 # We need an unreleased (as of 2017-08-17) llfuse bugfix, otherwise our fuse test suite deadlocks.
 511 pip freeze | grep -x llfuse==1.2.0 || (
 512     set -e
 513     yes | pip uninstall llfuse || true
 514     cython --version || fatal "no cython; try sudo apt-get install cython"
 515     cd "$temp"
 516     (cd python-llfuse 2>/dev/null || git clone https://github.com/curoverse/python-llfuse)
 517     cd python-llfuse
 518     git checkout 620722fd990ea642ddb8e7412676af482c090c0c
 519     git checkout setup.py
 520     sed -i -e "s:'1\\.2':'1.2.0':" setup.py
 521     python setup.py build_cython
 522     python setup.py install --force
 523 ) || fatal "llfuse fork failed"
 524 pip freeze | grep -x llfuse==1.2.0 || fatal "error: installed llfuse 1.2.0 but '$(pip freeze | grep llfuse)' ???"
 525
 526 # Deactivate Python 2 virtualenv
 527 deactivate
 528
 529 declare -a pythonstuff
 530 pythonstuff=(
 531     sdk/pam
 532     sdk/python
 533     sdk/python:py3
 534     sdk/cwl
 535     services/dockercleaner:py3
 536     services/fuse
 537     services/nodemanager
 538     tools/crunchstat-summary
 539     )
 540
 541 # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
 542 # Otherwise, skip dependent tests.
 543 PYTHON3=$(which python3)
 544 if [[ ${?} = 0 ]]; then
 545     setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
 546 else
 547     PYTHON3=
 548     cat >&2 <<EOF
 549
 550 Warning: python3 could not be found. Python 3 tests will be skipped.
 551
 552 EOF
 553 fi
 554
 555 # Reactivate Python 2 virtualenv
 556 . "$VENVDIR/bin/activate"
 557
 558 # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
 559 # whine a lot.
 560 setup_ruby_environment
 561
 562 echo "PATH is $PATH"
 563
 564 if ! which bundler >/dev/null
 565 then
 566     gem install --user-install bundler || fatal 'Could not install bundler'
 567 fi
 568
 569 retry() {
 570     remain="${repeat}"
 571     while :
 572     do
 573         if ${@}; then
 574             if [[ "$remain" -gt 1 ]]; then
 575                 remain=$((${remain}-1))
 576                 title "Repeating ${remain} more times"
 577             else
 578                 break
 579             fi
 580         elif [[ "$retry" == 1 ]]; then
 581             read -p 'Try again? [Y/n] ' x
 582             if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
 583             then
 584                 break
 585             fi
 586         else
 587             break
 588         fi
 589     done
 590 }
 591
 592 do_test() {
 593     case "${1}" in
 594         apps/workbench_units | apps/workbench_functionals | apps/workbench_integration)
 595             suite=apps/workbench
 596             ;;
 597         services/nodemanager | services/nodemanager_integration)
 598             suite=services/nodemanager_suite
 599             ;;
 600         *)
 601             suite="${1}"
 602             ;;
 603     esac
 604     if [[ -z "${skip[$suite]}" && -z "${skip[$1]}" && \
 605                 (-z "${only}" || "${only}" == "${suite}" || \
 606                  "${only}" == "${1}") ]]; then
 607         retry do_test_once ${@}
 608     else
 609         title "Skipping ${1} tests"
 610     fi
 611 }
 612
 613 do_test_once() {
 614     unset result
 615
 616     title "Running $1 tests"
 617     timer_reset
 618     if [[ "$2" == "go" ]]
 619     then
 620         covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
 621         coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
 622         # We do "go get -t" here to catch compilation errors
 623         # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
 624         # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
 625         # compilation errors.
 626         go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 627             cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 628             [[ -z "$(gofmt -e -d . | tee /dev/stderr)" ]] && \
 629             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
 630         then
 631             # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
 632             # does:
 633             go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
 634         else
 635             # The above form gets verbose even when testargs is
 636             # empty, so use this form in such cases:
 637             go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 638         fi
 639         result=${result:-$?}
 640         if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
 641         then
 642             go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
 643             rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
 644         fi
 645     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 646     then
 647         tries=0
 648         cd "$WORKSPACE/$1" && while :
 649         do
 650             tries=$((${tries}+1))
 651             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 652             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 653             "${3}python" setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
 654             result=$?
 655             if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
 656             then
 657                 printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
 658                 continue
 659             else
 660                 break
 661             fi
 662         done
 663     elif [[ "$2" != "" ]]
 664     then
 665         "test_$2"
 666     else
 667         "test_$1"
 668     fi
 669     result=${result:-$?}
 670     checkexit $result "$1 tests"
 671     title "End of $1 tests (`timer`)"
 672     return $result
 673 }
 674
 675 do_install() {
 676     if [[ -z "${only_install}" || "${only_install}" == "${1}" ]]; then
 677         retry do_install_once ${@}
 678     else
 679         title "Skipping $1 install"
 680     fi
 681 }
 682
 683 do_install_once() {
 684     title "Running $1 install"
 685     timer_reset
 686     if [[ "$2" == "go" ]]
 687     then
 688         go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 689     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 690     then
 691         # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 692         # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 693
 694         # Need to change to a different directory after creating
 695         # the source dist package to avoid a pip bug.
 696         # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
 697
 698         # Also need to install twice, because if it believes the package is
 699         # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
 700         # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
 701         # install" ensures that we've actually installed the local package
 702         # we just built.
 703         cd "$WORKSPACE/$1" \
 704             && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
 705             && cd "$WORKSPACE" \
 706             && "${3}pip" install --quiet "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
 707             && "${3}pip" install --quiet --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
 708     elif [[ "$2" != "" ]]
 709     then
 710         "install_$2"
 711     else
 712         "install_$1"
 713     fi
 714     result=$?
 715     checkexit $result "$1 install"
 716     title "End of $1 install (`timer`)"
 717     return $result
 718 }
 719
 720 bundle_install_trylocal() {
 721     (
 722         set -e
 723         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
 724         if ! bundle install --local --no-deployment; then
 725             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
 726             bundle install --no-deployment
 727         fi
 728         bundle package --all
 729     )
 730 }
 731
 732 install_doc() {
 733     cd "$WORKSPACE/doc" \
 734         && bundle_install_trylocal \
 735         && rm -rf .site
 736 }
 737 do_install doc
 738
 739 install_gem() {
 740     gemname=$1
 741     srcpath=$2
 742     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
 743         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
 744         && bundle_install_trylocal \
 745         && gem build "$gemname.gemspec" \
 746         && with_test_gemset gem install --no-ri --no-rdoc $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
 747 }
 748
 749 install_ruby_sdk() {
 750     install_gem arvados sdk/ruby
 751 }
 752 do_install sdk/ruby ruby_sdk
 753
 754 install_perl_sdk() {
 755     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
 756         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
 757         && make install INSTALLDIRS=perl
 758 }
 759 do_install sdk/perl perl_sdk
 760
 761 install_cli() {
 762     install_gem arvados-cli sdk/cli
 763 }
 764 do_install sdk/cli cli
 765
 766 install_login-sync() {
 767     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
 768 }
 769 do_install services/login-sync login-sync
 770
 771 # Install the Python SDK early. Various other test suites (like
 772 # keepproxy) bring up run_test_server.py, which imports the arvados
 773 # module. We can't actually *test* the Python SDK yet though, because
 774 # its own test suite brings up some of those other programs (like
 775 # keepproxy).
 776 for p in "${pythonstuff[@]}"
 777 do
 778     dir=${p%:py3}
 779     if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
 780         if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
 781             do_install ${dir} pip
 782         fi
 783     elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
 784         if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
 785             do_install ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
 786         fi
 787     fi
 788 done
 789
 790 install_apiserver() {
 791     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 792         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 793
 794     rm -f config/environments/test.rb
 795     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
 796
 797     if [ -n "$CONFIGSRC" ]
 798     then
 799         for f in database.yml
 800         do
 801             cp "$CONFIGSRC/$f" config/ || fatal "$f"
 802         done
 803     fi
 804
 805     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
 806     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
 807     # is a postgresql superuser.
 808     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 809         && test_database=$(python -c "import yaml; print yaml.load(file('config/database.yml'))['test']['database']") \
 810         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.procpid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
 811
 812     mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/tmp/pids"
 813
 814     cert="$WORKSPACE/services/api/tmp/self-signed"
 815     if ! [[ -e "$cert.pem" ]]; then
 816         (
 817             dir="$WORKSPACE/services/api/tmp"
 818             set -ex
 819             openssl req -newkey rsa:2048 -nodes -subj '/C=US/ST=State/L=City/CN=0.0.0.0' -out "$cert.csr" -keyout "$cert.key" </dev/null
 820             openssl x509 -req -in "$cert.csr" -signkey "$cert.key" -out "$cert.pem" -days 3650 -extfile <(printf 'subjectAltName=DNS:127.0.0.1,DNS:localhost,DNS:::1')
 821         ) || return 1
 822     fi
 823
 824     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 825         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:drop \
 826         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:setup \
 827         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:fixtures:load
 828 }
 829 do_install services/api apiserver
 830
 831 cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" && \
 832     "$GOPATH/bin/govendor" sync -v || \
 833         fatal "govendor sync failed"
 834 declare -a gostuff
 835 gostuff=(
 836     sdk/go/arvados
 837     sdk/go/arvadosclient
 838     sdk/go/blockdigest
 839     sdk/go/dispatch
 840     sdk/go/health
 841     sdk/go/httpserver
 842     sdk/go/manifest
 843     sdk/go/asyncbuf
 844     sdk/go/crunchrunner
 845     sdk/go/stats
 846     lib/crunchstat
 847     services/arv-git-httpd
 848     services/crunchstat
 849     services/health
 850     services/keep-web
 851     services/keepstore
 852     sdk/go/keepclient
 853     services/keep-balance
 854     services/keepproxy
 855     services/crunch-dispatch-local
 856     services/crunch-dispatch-slurm
 857     services/crunch-run
 858     services/ws
 859     tools/keep-block-check
 860     tools/keep-exercise
 861     tools/keep-rsync
 862     tools/arv-sync-groups
 863 )
 864 for g in "${gostuff[@]}"
 865 do
 866     do_install "$g" go
 867 done
 868
 869 install_workbench() {
 870     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 871         && mkdir -p tmp/cache \
 872         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal \
 873         && RAILS_ENV=test RAILS_GROUPS=assets bundle exec rake npm:install
 874 }
 875 do_install apps/workbench workbench
 876
 877 unset http_proxy https_proxy no_proxy
 878
 879 test_doclinkchecker() {
 880     (
 881         set -e
 882         cd "$WORKSPACE/doc"
 883         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
 884         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
 885         # do much good!
 886         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ bundle exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
 887     )
 888 }
 889 do_test doc doclinkchecker
 890
 891 stop_services
 892
 893 test_apiserver() {
 894     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
 895     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 896         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/api]}
 897 }
 898 do_test services/api apiserver
 899
 900 # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
 901 # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
 902 if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
 903   rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 904   exit_cleanly
 905 fi
 906
 907 start_api || { stop_services; fatal "start_api"; }
 908
 909 test_ruby_sdk() {
 910     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
 911         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
 912 }
 913 do_test sdk/ruby ruby_sdk
 914
 915 test_cli() {
 916     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
 917         && mkdir -p /tmp/keep \
 918         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
 919 }
 920 do_test sdk/cli cli
 921
 922 test_login-sync() {
 923     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
 924         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
 925 }
 926 do_test services/login-sync login-sync
 927
 928 test_nodemanager_integration() {
 929     cd "$WORKSPACE/services/nodemanager" \
 930         && tests/integration_test.py ${testargs[services/nodemanager_integration]}
 931 }
 932 do_test services/nodemanager_integration nodemanager_integration
 933
 934 for p in "${pythonstuff[@]}"
 935 do
 936     dir=${p%:py3}
 937     if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
 938         if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
 939             do_test ${dir} pip
 940         fi
 941     elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
 942         if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
 943             do_test ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
 944         fi
 945     fi
 946 done
 947
 948 for g in "${gostuff[@]}"
 949 do
 950     do_test "$g" go
 951 done
 952
 953 test_workbench_units() {
 954     start_nginx_proxy_services \
 955         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 956         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:units TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 957 }
 958 do_test apps/workbench_units workbench_units
 959
 960 test_workbench_functionals() {
 961     start_nginx_proxy_services \
 962         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 963         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:functionals TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 964 }
 965 do_test apps/workbench_functionals workbench_functionals
 966
 967 test_workbench_integration() {
 968     start_nginx_proxy_services \
 969         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 970         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:integration TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 971 }
 972 do_test apps/workbench_integration workbench_integration
 973
 974
 975 test_workbench_benchmark() {
 976     start_nginx_proxy_services \
 977         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 978         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:benchmark ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
 979 }
 980 do_test apps/workbench_benchmark workbench_benchmark
 981
 982 test_workbench_profile() {
 983     start_nginx_proxy_services \
 984         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 985         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:profile ${testargs[apps/workbench_profile]}
 986 }
 987 do_test apps/workbench_profile workbench_profile
 988
 989 exit_cleanly