Fix ClusterTarget document anchor, no issue #
[arvados.git] / doc / install / salt-multi-host.html.textile.liquid
1 ---
2 layout: default
3 navsection: installguide
4 title: Multi-Host Arvados
5 ...
6 {% comment %}
7 Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
8
9 SPDX-License-Identifier: CC-BY-SA-3.0
10 {% endcomment %}
11
12 # "Introduction":#introduction
13 # "Prerequisites and planning":#prerequisites
14 # "Download the installer":#download
15 # "Initialize the installer":#copy_config
16 # "Set up your infrastructure":#setup-infra
17 ## "Create AWS infrastructure with Terraform":#terraform
18 ## "Create required infrastructure manually":#inframanual
19 # "Edit local.params* files":#localparams
20 # "Configure Keep storage":#keep
21 # "Choose the SSL configuration":#certificates
22 ## "Using a Let's Encrypt certificates":#lets-encrypt
23 ## "Bring your own certificates":#bring-your-own
24 ### "Securing your TLS certificate keys":#secure-tls-keys
25 # "Create a compute image":#create_a_compute_image
26 # "Begin installation":#installation
27 # "Further customization of the installation":#further_customization
28 # "Confirm the cluster is working":#test-install
29 ## "Debugging issues":#debugging
30 ## "Iterating on config changes":#iterating
31 ## "Common problems and solutions":#common-problems
32 # "Initial user and login":#initial_user
33 # "Monitoring and Metrics":#monitoring
34 # "Load balancing controllers":#load_balancing
35 # "After the installation":#post_install
36
37 h2(#introduction). Introduction
38
39 This multi host installer is the recommendend way to set up a production Arvados cluster.  These instructions include specific details for installing on Amazon Web Services (AWS), which are marked as "AWS specific".  However with additional customization the installer can be used as a template for deployment on other cloud provider or HPC systems.
40
41 h2(#prerequisites). Prerequisites and planning
42
43 h3. Cluster ID and base domain
44
45 Choose a 5-character cluster identifier that will represent the cluster.  Here are "guidelines on choosing a cluster identifier":../architecture/federation.html#cluster_id .  Only lowercase letters and digits 0-9 are allowed.  Examples will use @xarv1@ or @${CLUSTER}@, you should substitute the cluster id you have selected.
46
47 Determine the base domain for the cluster.  This will be referred to as @${DOMAIN}@.
48
49 For example, if DOMAIN is @xarv1.example.com@, then @controller.${DOMAIN}@ means @controller.xarv1.example.com@.
50
51 h3(#DNS). DNS hostnames for each service
52
53 You will need a DNS entry for each service.  When using the "Terraform script":#terraform to set up your infrastructure, these domains will be created automatically using AWS Route 53.
54
55 In the default configuration these are:
56
57 # @controller.${DOMAIN}@
58 # @ws.${DOMAIN}@
59 # @keep0.${DOMAIN}@
60 # @keep1.${DOMAIN}@
61 # @keep.${DOMAIN}@
62 # @download.${DOMAIN}@
63 # @*.collections.${DOMAIN}@  -- important note, this must be a wildcard DNS, resolving to the @keepweb@ service
64 # @workbench.${DOMAIN}@
65 # @workbench2.${DOMAIN}@
66 # @webshell.${DOMAIN}@
67 # @shell.${DOMAIN}@
68 # @prometheus.${DOMAIN}@
69 # @grafana.${DOMAIN}@
70
71 For more information, see "DNS entries and TLS certificates":install-manual-prerequisites.html#dnstls.
72
73 h2(#download). Download the installer
74
75 {% assign local_params_src = 'multiple_hosts' %}
76 {% assign config_examples_src = 'multi_host/aws' %}
77 {% assign terraform_src = 'terraform/aws' %}
78 {% include 'download_installer' %}
79
80 h2(#setup-infra). Set up your infrastructure
81
82 ## "Create AWS infrastructure with Terraform":#terraform
83 ## "Create required infrastructure manually":#inframanual
84
85 h3(#terraform). Create AWS infrastructure with Terraform (AWS specific)
86
87 We provide a set of Terraform code files that you can run to create the necessary infrastructure on Amazon Web Services.
88
89 These files are located in the @terraform@ installer directory and are divided in three sections:
90
91 # The @terraform/vpc/@ subdirectory controls the network related infrastructure of your cluster, including firewall rules and split-horizon DNS resolution.
92 # The @terraform/data-storage/@ subdirectory controls the stateful part of your cluster, currently only sets up the S3 bucket for holding the Keep blocks and in the future it'll also manage the database service.
93 # The @terraform/services/@ subdirectory controls the hosts that will run the different services on your cluster, makes sure that they have the required software for the installer to do its job.
94
95 h4. Software requirements & considerations
96
97 {% include 'notebox_begin' %}
98 The Terraform state files (that keep crucial infrastructure information from the cloud) will be saved inside each subdirectory, under the @terraform.tfstate@ name.  These will be committed to the git repository used to coordinate deployment.  It is very important to keep this git repository secure, only sysadmins that will be responsible for maintaining your Arvados cluster should have access to it.
99 {% include 'notebox_end' %}
100
101 h4. Terraform code configuration
102
103 Each section described above contain a @terraform.tfvars@ file with some configuration values that you should set before applying each configuration. You should at least set the AWS region, cluster prefix and domain name in @terraform/vpc/terraform.tfvars@:
104
105 <pre><code>{% include 'terraform_vpc_tfvars' %}</code></pre>
106
107 If you don't set the main configuration variables at @vpc/terraform.tfvars@ file, you will be asked to re-enter these parameters every time you run Terraform.
108
109 The @data-storage/terraform.tfvars@ and @services/terraform.tfvars@ let you configure additional details, including the SSH public key for deployment, instance & volume sizes, etc. All these configurations are provided with sensible defaults:
110
111 <pre><code>{% include 'terraform_datastorage_tfvars' %}</code></pre>
112
113 <pre><code>{% include 'terraform_services_tfvars' %}</code></pre>
114
115 h4. Set credentials
116
117 You will need an AWS access key and secret key to create the infrastructure.
118
119 <pre><code class="userinput">export AWS_ACCESS_KEY_ID="anaccesskey"
120 export AWS_SECRET_ACCESS_KEY="asecretkey"</code></pre>
121
122 h4. Create the infrastructure
123
124 Build the infrastructure by running @./installer.sh terraform@.  The last stage will output the information needed to set up the cluster's domain and continue with the installer. for example:
125
126 <pre><code class="userinput">./installer.sh terraform
127 ...
128 Apply complete! Resources: 16 added, 0 changed, 0 destroyed.
129
130 Outputs:
131
132 arvados_sg_id = "sg-02f999a99973999d7"
133 arvados_subnet_id = "subnet-01234567abc"
134 cluster_int_cidr = "10.1.0.0/16"
135 cluster_name = "xarv1"
136 compute_subnet_id = "subnet-abcdef12345"
137 deploy_user = "admin"
138 domain_name = "xarv1.example.com"
139 letsencrypt_iam_access_key_id = "AKAA43MAAAWAKAADAASD"
140 loki_iam_access_key_id = "AKAABCDEFGJKLMNOP1234"
141 private_ip = {
142   "controller" = "10.1.1.1"
143   "keep0" = "10.1.1.3"
144   "keep1" = "10.1.1.4"
145   "keepproxy" = "10.1.1.2"
146   "shell" = "10.1.1.7"
147   "workbench" = "10.1.1.5"
148 }
149 public_ip = {
150   "controller" = "18.235.116.23"
151   "keep0" = "34.202.85.86"
152   "keep1" = "38.22.123.98"
153   "keepproxy" = "34.231.9.201"
154   "shell" = "44.208.155.240"
155   "workbench" = "52.204.134.136"
156 }
157 region_name = "us-east-1"
158 route53_dns_ns = tolist([
159   "ns-1119.awsdns-11.org",
160   "ns-1812.awsdns-34.co.uk",
161   "ns-437.awsdns-54.com",
162   "ns-809.awsdns-37.net",
163 ])
164 ssl_password_secret_name = "xarv1-arvados-ssl-privkey-password"
165 vpc_id = "vpc-0999994998399923a"
166 letsencrypt_iam_secret_access_key = "XXXXXSECRETACCESSKEYXXXX"
167 database_password = <not set>
168 loki_iam_secret_access_key = "YYYYYYSECRETACCESSKEYYYYYYY"
169 </code></pre>
170
171
172 h4. Additional DNS configuration
173
174 Once Terraform has completed, the infrastructure for your Arvados cluster is up and running.  One last piece of DNS configuration is required.
175
176 The domain names for your cluster (e.g.: controller.xarv1.example.com) are managed via "Route 53":https://aws.amazon.com/route53/ and the TLS certificates will be issued using "Let's Encrypt":https://letsencrypt.org/ .
177
178 You need to configure the parent domain to delegate to the newly created zone.  For example, you need to configure "example.com" to delegate the subdomain "xarv1.example.com" to the nameservers for the Arvados hostname records created by Terraform.  You do this by creating a @NS@ record on the parent domain that refers to the name servers listed in the Terraform output parameter @route53_dns_ns@.
179
180 If your parent domain is also controlled by Route 53, the process will be like this:
181
182 # Log in to the AWS Console and navigate to the service page for *Route 53*
183 # Go to the list of *Hosted zones* and click on the zone for the parent domain
184 # Click on *Create record*
185 # For *Record name* put the cluster id
186 # For *Record type* choose @NS - Name servers for a hosted zone@
187 # For *Value* add the values from Terraform output parameter @route53_dns_ns@, one hostname per line, with punctuation (quotes and commas) removed.
188 # Click *Create records*
189
190 If the parent domain is controlled by some other service, follow the guide for the the appropriate service.
191
192 h4. Other important output parameters
193
194 The certificates will be requested from Let's Encrypt when you run the installer.
195
196 * @cluster_int_cidr@ will be used to set @CLUSTER_INT_CIDR@
197
198 * You'll also need @compute_subnet_id@ and @arvados_sg_id@ to set @COMPUTE_SUBNET@ and @COMPUTE_SG@ in @local.params@ and when you "create a compute image":#create_a_compute_image.
199
200 You can now proceed to "edit local.params* files":#localparams.
201
202 h3(#inframanual). Create required infrastructure manually
203
204 If you will be setting up infrastructure without using the provided Terraform script, here are the recommendations you will need to consider.
205
206 h4. Virtual Private Cloud (AWS specific)
207
208 We recommend setting Arvados up in its own "Virtual Private Cloud (VPC)":https://docs.aws.amazon.com/vpc/latest/userguide/what-is-amazon-vpc.html
209
210 When you do so, you need to configure a couple of additional things:
211
212 # "Create a subnet for the compute nodes":https://docs.aws.amazon.com/vpc/latest/userguide/configure-subnets.html
213 # You should set up a "security group which allows SSH access (port 22)":https://docs.aws.amazon.com/vpc/latest/userguide/VPC_SecurityGroups.html
214 # Make sure to add a "VPC S3 endpoint":https://docs.aws.amazon.com/vpc/latest/privatelink/vpc-endpoints-s3.html
215
216 h4(#keep-bucket). S3 Bucket (AWS specific)
217
218 We recommend "creating an S3 bucket":https://docs.aws.amazon.com/AmazonS3/latest/userguide/Welcome.html for data storage named @${CLUSTER}-nyw5e-000000000000000-volume@.  We recommend creating an IAM role called @${CLUSTER}-keepstore-00-iam-role@ with a "policy that can read, write, list and delete objects in the bucket":configure-s3-object-storage.html#IAM .  With the example cluster id @xarv1@ the bucket would be called @xarv1-nyw5e-000000000000000-volume@ and the role would be called @xarv1-keepstore-00-iam-role@.
219
220 These names are recommended because they are default names used in the configuration template.  If you use different names, you will need to edit the configuration template later.
221
222 h4(#hosts). Required hosts
223
224 You will need to allocate several hosts (physical or virtual machines) for the fixed infrastructure of the Arvados cluster.  These machines should have at least 2 cores and 8 GiB of RAM, running a supported Linux distribution.
225
226 {% include 'supportedlinux' %}
227
228 Allocate the following hosts as appropriate for your site.  On AWS you may choose to do it manually with the AWS console, or using a DevOps tool such as CloudFormation or Terraform.  With the exception of "keep0" and "keep1", all of these hosts should have external (public) IP addresses if you intend for them to be accessible outside of the private network or VPC.
229
230 The installer will set up the Arvados services on your machines.  Here is the default assignment of services to machines:
231
232 # API node
233 ## postgresql server
234 ## arvados api server
235 ## arvados controller  (recommendend hostname @controller.${DOMAIN}@)
236 # KEEPSTORE nodes (at least 1 if using S3 as a Keep backend, else 2)
237 ## arvados keepstore   (recommendend hostnames @keep0.${DOMAIN}@ and @keep1.${DOMAIN}@)
238 # WORKBENCH node
239 ## arvados legacy workbench URLs   (recommendend hostname @workbench.${DOMAIN}@)
240 ## arvados workbench2              (recommendend hostname @workbench2.${DOMAIN}@)
241 ## arvados webshell                (recommendend hostname @webshell.${DOMAIN}@)
242 ## arvados websocket               (recommendend hostname @ws.${DOMAIN}@)
243 ## arvados cloud dispatcher
244 ## arvados keepbalance
245 ## arvados keepproxy   (recommendend hostname @keep.${DOMAIN}@)
246 ## arvados keepweb     (recommendend hostname @download.${DOMAIN}@ and @*.collections.${DOMAIN}@)
247 # SHELL node  (optional)
248 ## arvados shell       (recommended hostname @shell.${DOMAIN}@)
249
250 When using the database installed by Arvados (and not an "external database":#ext-database), the database is stored under @/var/lib/postgresql@.  Arvados logs are also kept in @/var/log@ and @/var/www/arvados-api/shared/log@.  Accordingly, you should ensure that the disk partition containing @/var@ has adequate storage for your planned usage.  We suggest starting with 50GiB of free space on the database host.
251
252 h4. Additional prerequisites when preparing machines to run the installer
253
254 # From the account where you are performing the install, passwordless @ssh@ to each machine
255 This means the client's public key should added to @~/.ssh/authorized_keys@ on each node.
256 # Passwordless @sudo@ access on the account on each machine you will @ssh@ in to
257 This usually means adding the account to the @sudo@ group and having a rule like this in @/etc/sudoers.d/arvados_passwordless@ that allows members of group @sudo@ to execute any command without entering a password.
258 <pre>%sudo ALL=(ALL:ALL) NOPASSWD:ALL</pre>
259 # @git@ installed on each machine
260 # Port 443 reachable by clients
261
262 (AWS specific) The machine that runs the arvados cloud dispatcher will need an "IAM role that allows it to manage EC2 instances.":{{site.baseurl}}/install/crunch2-cloud/install-dispatch-cloud.html#IAM
263
264 If your infrastructure differs from the setup proposed above (ie, different hostnames), you can still use the installer, but "additional customization may be necessary":#further_customization .
265
266 h2(#localparams). Edit @local.params*@ files
267
268 The cluster configuration parameters are included in two files: @local.params@ and @local.params.secrets@. These files can be found wherever you choose to initialize the installation files (e.g., @~/setup-arvados-xarv1@ in these examples).
269
270 The @local.params.secrets@ file is intended to store security-sensitive data such as passwords, private keys, tokens, etc. Depending on the security requirements of the cluster deployment, you may wish to store this file in a secrets store like AWS Secrets Manager or Jenkins credentials.
271
272 h3. Parameters from @local.params@:
273
274 # Set @CLUSTER@ to the 5-character cluster identifier. (e.g. "xarv1")
275 # Set @DOMAIN@ to the base DNS domain of the environment. (e.g. "xarv1.example.com")
276 # Set the @*_INT_IP@ variables with the internal (private) IP addresses of each host. Since services share hosts, some hosts are the same.  See "note about /etc/hosts":#etchosts
277 # Edit @CLUSTER_INT_CIDR@, this should be the CIDR of the private network that Arvados is running on, e.g. the VPC.  If you used terraform, this is emitted as @cluster_int_cidr@.
278 _CIDR stands for "Classless Inter-Domain Routing" and describes which portion of the IP address that refers to the network.  For example 192.168.3.0/24 means that the first 24 bits are the network (192.168.3) and the last 8 bits are a specific host on that network._
279 _AWS Specific: Go to the AWS console and into the VPC service, there is a column in this table view of the VPCs that gives the CIDR for the VPC (IPv4 CIDR)._
280 # Set @INITIAL_USER_EMAIL@ to your email address, as you will be the first admin user of the system.
281
282 h3. Parameters from @local.params.secrets@:
283
284 # Set each @KEY@ / @TOKEN@ / @PASSWORD@ to a random string.  You can use @installer.sh generate-tokens@
285 <pre><code class="userinput">./installer.sh generate-tokens
286 BLOB_SIGNING_KEY=XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
287 MANAGEMENT_TOKEN=XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
288 SYSTEM_ROOT_TOKEN=XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
289 ANONYMOUS_USER_TOKEN=XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
290 DATABASE_PASSWORD=XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
291 </code></pre>
292 # Set @DATABASE_PASSWORD@ to a random string (unless you "already have a database":#ext-database then you should set it to that database's password)
293    Important! If this contains any non-alphanumeric characters, in particular ampersand ('&'), it is necessary to add backslash quoting.
294    For example, if the password is @Lq&MZ<V']d?j@
295    With backslash quoting the special characters it should appear like this in local.params:
296 <pre><code>DATABASE_PASSWORD="Lq\&MZ\<V\'\]d\?j"</code></pre>
297 # Set @LE_AWS_*@ credentials to allow Let's Encrypt do authentication through Route53
298 # Set @LOKI_AWS_*@ credentials to enable the Loki service to store centralized logs on its dedicated S3 bucket.
299 # Set @DISPATCHER_SSH_PRIVKEY@ to a SSH private key that @arvados-dispatch-cloud@ will use to connect to the compute nodes:
300 <pre><code>DISPATCHER_SSH_PRIVKEY="-----BEGIN OPENSSH PRIVATE KEY-----
301 b3BlbnNzaC1rZXktdjEAAAAABG5vbmUAAAAEbm9uZQAAAAAAAAABAAABlwAAAAdzc2gtcn
302 ...
303 s4VY40kNxs6MsAAAAPbHVjYXNAaW5zdGFsbGVyAQIDBA==
304 -----END OPENSSH PRIVATE KEY-----"
305 </code></pre>You can create one by following the steps described on the "building a compute node documentation":{{site.baseurl}}/install/crunch2-cloud/install-compute-node.html#sshkeypair page.
306
307 h3(#etchosts). Note on @/etc/hosts@
308
309 Because Arvados services are typically accessed by external clients, they are likely to have both a public IP address and a internal IP address.
310
311 On cloud providers such as AWS, sending internal traffic to a service's public IP address can incur egress costs and throttling.  Thus it is very important for internal traffic to stay on the internal network.  The installer implements this by updating @/etc/hosts@ on each node to associate each service's hostname with the internal IP address, so that when Arvados services communicate with one another, they always use the internal network address.  This is NOT a substitute for DNS, you still need to set up DNS names for all of the services that have public IP addresses (it does, however, avoid a complex "split-horizon" DNS configuration).
312
313 It is important to be aware of this because if you mistype the IP address for any of the @*_INT_IP@ variables, hosts may unexpectedly fail to be able to communicate with one another.  If this happens, check and edit as necessary the file @/etc/hosts@ on the host that is failing to make an outgoing connection.
314
315 h2(#keep). Configure Keep storage
316
317 The @multi_host/aws@ template uses S3 for storage.  Arvados also supports "filesystem storage":configure-fs-storage.html and "Azure blob storage":configure-azure-blob-storage.html .  Keep storage configuration can be found in in the @arvados.cluster.Volumes@ section of @local_config_dir/pillars/arvados.sls@.
318
319 h3. Object storage in S3 (AWS Specific)
320
321 If you "followed the recommendend naming scheme":#keep-bucket for both the bucket and role (or used the provided Terraform script), you're done.
322
323 If you did not follow the recommendend naming scheme for either the bucket or role, you'll need to update these parameters in @local.params@:
324
325 # Set @KEEP_AWS_S3_BUCKET@ to the value of "keepstore bucket you created earlier":#keep-bucket
326 # Set @KEEP_AWS_IAM_ROLE@ to "keepstore role you created earlier":#keep-bucket
327
328 You can also configure a specific AWS Region for the S3 bucket by setting @KEEP_AWS_REGION@.
329
330 {% include 'ssl_config_multi' %}
331
332 h2(#authentication). Configure your authentication provider (optional, recommended)
333
334 By default, the installer will use the "Test" provider, which is a list of usernames and cleartext passwords stored in the Arvados config file.  *This is low security configuration and you are strongly advised to configure one of the other "supported authentication methods":setup-login.html* .
335
336 h2(#ext-database). Using an external database (optional)
337
338 The standard behavior of the installer is to install and configure PostgreSQL for use by Arvados.  You can optionally configure it to use a separately managed database instead.
339
340 Arvados requires a database that is compatible with PostgreSQL 9.5 or later.  For example, Arvados is known to work with Amazon Aurora (note: even idle, Arvados services will periodically poll the database, so we strongly advise using "provisioned" mode).
341
342 # In @local.params@, remove 'database' from the list of roles assigned to the controller node:
343 <pre><code>NODES=(
344   [controller.${DOMAIN}]=controller,websocket,dispatcher,keepbalance
345   ...
346 )
347 </code></pre>
348 # In @local.params@, set @DATABASE_INT_IP@ to empty string and @DATABASE_EXTERNAL_SERVICE_HOST_OR_IP@ to the database endpoint (can be a hostname, does not have to be an IP address).
349 <pre><code>DATABASE_INT_IP=""
350 ...
351 DATABASE_EXTERNAL_SERVICE_HOST_OR_IP="arvados.xxxxxxx.eu-east-1.rds.amazonaws.com"
352 </code></pre>
353 # In @local.params.secrets@, set @DATABASE_PASSWORD@ to the correct value.  "See the previous section describing correct quoting":#localparams
354 # In @local.params@ you may need to adjust the database name and user.
355
356 h2(#further_customization). Further customization of the installation (optional)
357
358 If you are installing on AWS and have followed all of the naming conventions recommend in this guide, you probably don't need to do any further customization.
359
360 If you are installing on a different cloud provider or on HPC, other changes may require editing the Saltstack pillars and states files found in @local_config_dir@.  In particular, @local_config_dir/pillars/arvados.sls@ contains the template (in the @arvados.cluster@ section) used to produce the Arvados configuration file that is distributed to all the nodes.  Consult the "Configuration reference":config.html for a comprehensive list of configuration keys.
361
362 Any extra Salt "state" files you add under @local_config_dir/states@ will be added to the Salt run and applied to the hosts.
363
364 h2(#create_a_compute_image). Configure compute nodes
365
366 {% include 'branchname' %}
367
368 If you will use fixed compute nodes with an HPC scheduler such as SLURM or LSF, you will need to "Set up your compute nodes with Docker":{{site.baseurl}}/install/crunch2/install-compute-node-docker.html or "Set up your compute nodes with Singularity":{{site.baseurl}}/install/crunch2/install-compute-node-singularity.html.
369
370 On cloud installations, containers are dispatched in Docker daemons running in the _compute instances_, which need some additional setup.
371
372 h3. Build the compute image
373
374 Follow "the instructions to build a cloud compute node image":{{site.baseurl}}/install/crunch2-cloud/install-compute-node.html using the compute image builder script found in @arvados/tools/compute-images@ in your Arvados clone from "step 3":#download.
375
376 h3. Configure the compute image
377
378 Once the image has been created, open @local.params@ and edit as follows (AWS specific settings described here, you will need to make custom changes for other cloud providers):
379
380 # Set @COMPUTE_AMI@ to the AMI produced by Packer
381 # Set @COMPUTE_AWS_REGION@ to the appropriate AWS region
382 # Set @COMPUTE_USER@ to the admin user account on the image
383 # Set the @COMPUTE_SG@ list to the VPC security group which you set up to allow SSH connections to these nodes
384 # Set @COMPUTE_SUBNET@ to the value of SubnetId of your VPC
385 # Update @arvados.cluster.InstanceTypes@ in @local_config_dir/pillars/arvados.sls@ as necessary.  The example instance types are for AWS, other cloud providers will of course have different instance types with different names and specifications.
386 (AWS specific) If m5/c5 node types are not available, replace them with m4/c4. You'll need to double check the values for Price and IncludedScratch/AddedScratch for each type that is changed.
387
388 h2(#installation). Begin installation
389
390 At this point, you are ready to run the installer script in deploy mode that will conduct all of the Arvados installation.
391
392 Run this in the @~/arvados-setup-xarv1@ directory:
393
394 <pre><code class="userinput">./installer.sh deploy</code></pre>
395
396 This will install and configure Arvados on all the nodes.  It will take a while and produce a lot of logging.  If it runs into an error, it will stop.
397
398 h2(#test-install). Confirm the cluster is working
399
400 When everything has finished, you can run the diagnostics. There's a couple ways of doing this listed below.
401
402 h3. Running diagnostics from the same system as the installer
403
404 The requirements to run diagnostics are having @arvados-client@ and @docker@ installed. If this is not possible you can run them on your Arvados shell node as explained in the next section.
405
406 Depending on where you are running the installer, you need to provide @-internal-client@ or @-external-client@. If you are running the installer from a host connected to the Arvados private network, use @-internal-client@. Otherwise, use @-external-client@.
407
408 <pre><code class="userinput">./installer.sh diagnostics (-internal-client|-external-client)</code></pre>
409
410 h3. Running diagnostics from a cluster node
411
412 You can run the diagnostics from the cluster's shell node. This has the advantage that you don't need to manage any software on your local system, but might not be a possibility if your Arvados cluster doesn't include a shell node.
413
414 <pre><code class="userinput">./installer.sh diagnostics-internal</code></pre>
415
416 h3(#debugging). Debugging issues
417
418 The installer records log files for each deployment.
419
420 Most service logs go to @/var/log/syslog@.
421
422 The logs for Rails API server can be found in @/var/www/arvados-api/current/log/production.log@ on the appropriate instance(s).
423
424 Workbench 2 is a client-side Javascript application.  If you are having trouble loading Workbench 2, check the browser's developer console (this can be found in "Tools &rarr; Developer Tools").
425
426 h3(#iterating). Iterating on config changes
427
428 You can iterate on the config and maintain the cluster by making changes to @local.params@ and @local_config_dir@ and running @installer.sh deploy@ again.
429
430 If you are debugging a configuration issue on a specific node, you can speed up the cycle a bit by deploying just one node:
431
432 <pre><code class="userinput">./installer.sh deploy keep0.xarv1.example.com</code></pre>
433
434 However, once you have a final configuration, you should run a full deploy to ensure that the configuration has been synchronized on all the nodes.
435
436 h3(#common-problems). Common problems and solutions
437
438 h4. PG::UndefinedTable: ERROR:  relation \"api_clients\" does not exist
439
440 The arvados-api-server package sets up the database as a post-install script.  If the database host or password wasn't set correctly (or quoted correctly) at the time that package is installed, it won't be able to set up the database.
441
442 This will manifest as an error like this:
443
444 <pre>
445 #<ActiveRecord::StatementInvalid: PG::UndefinedTable: ERROR:  relation \"api_clients\" does not exist
446 </pre>
447
448 If this happens, you need to
449
450 1. correct the database information
451 2. run @./installer.sh deploy xarv1.example.com@ to update the configuration on the API/controller node
452 3. Log in to the API/controller server node, then run this command to re-run the post-install script, which will set up the database:
453 <pre><code class="userinput">dpkg-reconfigure arvados-api-server</code></pre>
454 4. Re-run @./installer.sh deploy@ again to synchronize everything, and so that the install steps that need to contact the API server are run successfully.
455
456 h4. Missing ENA support (AWS Specific)
457
458 If the AMI wasn't built with ENA (extended networking) support and the instance type requires it, it'll fail to start.  You'll see an error in syslog on the node that runs @arvados-dispatch-cloud@.  The solution is to build a new AMI with --aws-ena-support true
459
460 h2(#initial_user). Initial user and login
461
462 At this point you should be able to log into the Arvados cluster. The initial URL will be
463
464 @https://workbench.${DOMAIN}@
465
466 If you did *not* "configure a different authentication provider":#authentication you will be using the "Test" provider, and the provision script creates an initial user for testing purposes. This user is configured as administrator of the newly created cluster.  It uses the values of @INITIAL_USER@ and @INITIAL_USER_PASSWORD@ from the @local.params*@ file.
467
468 If you *did* configure a different authentication provider, the first user to log in will automatically be given Arvados admin privileges.
469
470 h2(#monitoring). Monitoring and Metrics
471
472 You can monitor the health and performance of the system using the admin dashboard:
473
474 @https://grafana.${DOMAIN}@
475
476 To log in, use username "admin" and @${INITIAL_USER_PASSWORD}@ from @local.params.secrets@.
477
478 Once logged in, you will want to add the dashboards to the front page.
479
480 # On the left icon bar, click on "Browse"
481 # You should see a folder called "Arvados Cluster", click to open it
482 ## If you don't see anything, make sure the check box next to "Starred" is not selected
483 # You should see three dashboards "Arvados cluster overview", "Node exporter" and "Postgres exporter"
484 # Visit each dashboard, at the top of the page click on the star next to the title to "Mark as favorite"
485 # They should now be linked on the front page.
486
487 h2(#load_balancing). Load balancing controllers (optional)
488
489 In order to handle high loads and perform rolling upgrades, the controller service can be scaled to a number of hosts and the installer make this implementation a fairly simple task.
490
491 First, you should take care of the infrastructure deployment: if you use our Terraform code, you will need to set up the @terraform.tfvars@ in @terraform/vpc/@ so that in addition to the node named @controller@ (the load-balancer), a number of @controllerN@ nodes (backends) are defined as needed, and added to the @internal_service_hosts@ list.
492
493 We suggest that the backend nodes just hold the controller service and nothing else, so they can be easily created or destroyed as needed without other service disruption.
494
495 The following is an example @terraform/vpc/terraform.tfvars@ file that describes a cluster with a load-balancer, 2 backend nodes, a separate database node, a shell node, a keepstore node and a workbench node that will also hold other miscelaneous services:
496
497 <pre><code>region_name = "us-east-1"
498 cluster_name = "xarv1"
499 domain_name = "xarv1.example.com"
500 # Include controller nodes in this list so instances are assigned to the
501 # private subnet. Only the balancer node should be connecting to them.
502 internal_service_hosts = [ "keep0", "shell", "database", "controller1", "controller2" ]
503
504 # Assign private IPs for the controller nodes. These will be used to create
505 # internal DNS resolutions that will get used by the balancer and database nodes.
506 private_ip = {
507   controller = "10.1.1.11"
508   workbench = "10.1.1.15"
509   database = "10.1.2.12"
510   controller1 = "10.1.2.21"
511   controller2 = "10.1.2.22"
512   shell = "10.1.2.17"
513   keep0 = "10.1.2.13"
514 }</code></pre>
515
516 Once the infrastructure is deployed, you'll then need to define which node will be using the @balancer@ role and which will be the @controller@ nodes in @local.params@, as it's being shown in this partial example:
517
518 <pre><code>NODES=(
519   [controller.${DOMAIN}]=balancer
520   [controller1.${DOMAIN}]=controller
521   [controller2.${DOMAIN}]=controller
522   [database.${DOMAIN}]=database
523   ...
524 )
525 </code></pre>
526
527 Note that we also set the @database@ role to its own node instead of just leaving it in a shared controller node.
528
529 Each time you run @installer.sh deploy@, the system will automatically do rolling upgrades. This means it will make changes to one controller node at a time, after removing it from the balancer so that there's no downtime.
530
531 h2(#post_install). After the installation
532
533 As part of the operation of @installer.sh@, it automatically creates a @git@ repository with your configuration templates.  You should retain this repository but *be aware that it contains sensitive information* (passwords and tokens used by the Arvados services as well as cloud credentials if you used Terraform to create the infrastructure).
534
535 As described in "Iterating on config changes":#iterating you may use @installer.sh deploy@ to re-run the Salt to deploy configuration changes and upgrades.  However, be aware that the configuration templates created for you by @installer.sh@ are a snapshot which are not automatically kept up to date.
536
537 When deploying upgrades, consult the "Arvados upgrade notes":{{site.baseurl}}/admin/upgrading.html to see if changes need to be made to the configuration file template in @local_config_dir/pillars/arvados.sls@.  To specify the version to upgrade to, set the @VERSION@ parameter in @local.params@.
538
539 See also "Maintenance and upgrading":{{site.baseurl}}/admin/maintenance-and-upgrading.html for more information.