docker/arvdock

   1 #!/bin/bash
   2
   3 DOCKER=`which docker.io`
   4
   5 if [[ "$DOCKER" == "" ]]; then
   6     DOCKER=`which docker`
   7 fi
   8
   9 COMPUTE_COUNTER=0
  10
  11 function usage {
  12     echo >&2
  13     echo >&2 "usage: $0 (start|stop|restart|test) [options]"
  14     echo >&2
  15     echo >&2 "$0 start/stop/restart options:"
  16     echo >&2 "  -d[port], --doc[=port]        Documentation server (default port 9898)"
  17     echo >&2 "  -w[port], --workbench[=port]  Workbench server (default port 9899)"
  18     echo >&2 "  -s[port], --sso[=port]        SSO server (default port 9901)"
  19     echo >&2 "  -a[port], --api[=port]        API server (default port 9900)"
  20     echo >&2 "  -c, --compute                 Compute nodes (starts 2)"
  21     echo >&2 "  -v, --vm                      Shell server"
  22     echo >&2 "  -n, --nameserver              Nameserver"
  23     echo >&2 "  -k, --keep                    Keep servers"
  24     echo >&2 "  -h, --help                    Display this help and exit"
  25     echo >&2
  26     echo >&2 "  If no options are given, the action is applied to all servers."
  27     echo >&2
  28     echo >&2 "$0 test [testname] [testname] ..."
  29     echo >&2 "  By default, all tests are run."
  30 }
  31
  32 function ip_address {
  33     local container=$1
  34     echo `$DOCKER inspect $container  |grep IPAddress |cut -f4 -d\"`
  35 }
  36
  37 function start_container {
  38     local args="-d -i -t"
  39     if [[ "$1" != '' ]]; then
  40       local port="$1"
  41       args="$args -p $port"
  42     fi
  43     if [[ "$2" != '' ]]; then
  44       local name="$2"
  45       if [[ "$name" == "api_server" ]]; then
  46         args="$args --dns=172.17.42.1 --dns-search=compute.dev.arvados --hostname api -P --name $name"
  47       elif [[ "$name" == "compute" ]]; then
  48         name=$name$COMPUTE_COUNTER
  49         # We need --privileged because we run docker-inside-docker on the compute nodes
  50         args="$args --dns=172.17.42.1 --dns-search=compute.dev.arvados --hostname compute$COMPUTE_COUNTER -P --privileged --name $name"
  51         let COMPUTE_COUNTER=$(($COMPUTE_COUNTER + 1))
  52       else
  53         args="$args --dns=172.17.42.1 --dns-search=dev.arvados --hostname ${name#_server} --name $name"
  54       fi
  55     fi
  56     if [[ "$3" != '' ]]; then
  57       local volume="$3"
  58       args="$args -v $volume"
  59     fi
  60     if [[ "$4" != '' ]]; then
  61       local link="$4"
  62       args="$args --link $link"
  63     fi
  64     local image=$5
  65
  66     `$DOCKER ps |grep -P "$name[^/]" -q`
  67     if [[ "$?" == "0" ]]; then
  68       echo "You have a running container with name $name -- skipping."
  69       return
  70     fi
  71
  72     # Remove any existing container by this name.
  73     $DOCKER rm "$name" 2>/dev/null
  74
  75     echo "Starting container:"
  76     #echo "  $DOCKER run --dns=127.0.0.1 $args $image"
  77     echo "  $DOCKER run $args $image"
  78     container=`$DOCKER run $args $image`
  79     if [ "$?" != "0" -o "$container" = "" ]; then
  80       echo "Unable to start container"
  81       exit 1
  82     else
  83       echo "Started container: $container"
  84     fi
  85
  86     if [[ "$name" == "doc_server" ]]; then
  87       echo
  88       echo "*****************************************************************"
  89       echo "You can access the Arvados documentation at http://localhost:${port%:*}"
  90       echo "*****************************************************************"
  91       echo
  92     fi
  93
  94     if [[ "$name" == "workbench_server" ]]; then
  95       echo
  96       echo "*****************************************************************"
  97       echo "You can access the Arvados workbench at http://localhost:${port%:*}"
  98       echo "*****************************************************************"
  99       echo
 100    fi
 101
 102
 103 }
 104
 105 declare -a keep_volumes
 106
 107 # Initialize the global `keep_volumes' array. If any keep volumes
 108 # already appear to exist (mounted volumes with a top-level "keep"
 109 # directory), use them; create temporary volumes if necessary.
 110 #
 111 function make_keep_volumes () {
 112     # Mount a keep volume if we don't already have one
 113     for mountpoint in $(cut -d ' ' -f 2 /proc/mounts); do
 114       if [[ -d "$mountpoint/keep" && "$mountpoint" != "/" ]]; then
 115         keep_volumes+=($mountpoint)
 116       fi
 117     done
 118
 119     # Create any keep volumes that do not yet exist.
 120     while [ ${#keep_volumes[*]} -lt 2 ]
 121     do
 122         new_keep=$(mktemp -d)
 123         echo >&2 "mounting 2G tmpfs keep volume in $new_keep"
 124         sudo mount -t tmpfs -o size=2G tmpfs $new_keep
 125         mkdir $new_keep/keep
 126         keep_volumes+=($new_keep)
 127     done
 128 }
 129
 130 function do_start {
 131     local start_doc=false
 132     local start_sso=false
 133     local start_api=false
 134     local start_compute=false
 135     local start_workbench=false
 136     local start_vm=false
 137     local start_nameserver=false
 138     local start_keep=false
 139
 140     # NOTE: This requires GNU getopt (part of the util-linux package on Debian-based distros).
 141     local TEMP=`getopt -o d::s::a::cw::nkvh \
 142                   --long doc::,sso::,api::,compute,workbench::,nameserver,keep,vm,help \
 143                   -n "$0" -- "$@"`
 144
 145     if [ $? != 0 ] ; then echo "Use -h for help"; exit 1 ; fi
 146
 147     # Note the quotes around `$TEMP': they are essential!
 148     eval set -- "$TEMP"
 149
 150     while [ $# -ge 1 ]
 151     do
 152         case $1 in
 153             -d | --doc)
 154                 case "$2" in
 155                     "") start_doc=9898; shift 2 ;;
 156                     *)  start_doc=$2; shift 2 ;;
 157                 esac
 158                 ;;
 159             -s | --sso)
 160                 case "$2" in
 161                     "") start_sso=9901; shift 2 ;;
 162                     *)  start_sso=$2; shift 2 ;;
 163                 esac
 164                 ;;
 165             -a | --api)
 166                 case "$2" in
 167                     "") start_api=9900; shift 2 ;;
 168                     *)  start_api=$2; shift 2 ;;
 169                 esac
 170                 ;;
 171             -c | --compute)
 172                 start_compute=2
 173                 shift
 174                 ;;
 175             -w | --workbench)
 176                 case "$2" in
 177                     "") start_workbench=9899; shift 2 ;;
 178                     *)  start_workbench=$2; shift 2 ;;
 179                 esac
 180                 ;;
 181             -v | --vm)
 182                 start_vm=true
 183                 shift
 184                 ;;
 185             -n | --nameserver)
 186                 start_nameserver=true
 187                 shift
 188                 ;;
 189             -k | --keep)
 190                 start_keep=true
 191                 shift
 192                 ;;
 193             --)
 194                 shift
 195                 break
 196                 ;;
 197             *)
 198                 usage
 199                 exit 1
 200                 ;;
 201         esac
 202     done
 203
 204     # If no options were selected, then start all servers.
 205     if [[ $start_doc == false &&
 206           $start_sso == false &&
 207           $start_api == false &&
 208           $start_compute == false &&
 209           $start_workbench == false &&
 210           $start_vm == false &&
 211           $start_nameserver == false &&
 212           $start_keep == false ]]
 213     then
 214         start_doc=9898
 215         #the sso server is currently not used by default so don't start it unless explicitly requested
 216         #start_sso=9901
 217         start_api=9900
 218         start_compute=2
 219         start_workbench=9899
 220         start_vm=true
 221         start_nameserver=true
 222         start_keep=true
 223     fi
 224
 225     if [[ $start_sso != false ]]
 226     then
 227         start_container "$start_sso:443" "sso_server" '' '' "arvados/sso"
 228     fi
 229
 230     if [[ $start_api != false ]]
 231     then
 232       if [[ $start_sso != false ]]; then
 233         start_container "$start_api:443" "api_server" '' "sso_server:sso" "arvados/api"
 234       else
 235         start_container "$start_api:443" "api_server" '' '' "arvados/api"
 236       fi
 237     fi
 238
 239     if [[ $start_nameserver != false ]]
 240     then
 241       # We rely on skydock and skydns for dns discovery between the slurm controller and compute nodes,
 242       # so make sure they are running
 243       $DOCKER ps | grep skydns >/dev/null
 244       if [[ "$?" != "0" ]]; then
 245         echo "Starting crosbymichael/skydns container..."
 246         $DOCKER rm "skydns" 2>/dev/null
 247         $DOCKER run -d -p 172.17.42.1:53:53/udp --name skydns crosbymichael/skydns -nameserver 8.8.8.8:53 -domain arvados
 248       fi
 249       $DOCKER ps | grep skydock >/dev/null
 250       if [[ "$?" != "0" ]]; then
 251         echo "Starting crosbymichael/skydock container..."
 252         $DOCKER rm "skydock" 2>/dev/null
 253         $DOCKER run -d -v /var/run/docker.sock:/docker.sock --name skydock crosbymichael/skydock -ttl 30 -environment dev -s /docker.sock -domain arvados -name skydns
 254       fi
 255     fi
 256
 257     if [[ $start_compute != false ]]
 258     then
 259         for i in `seq 0 $(($start_compute - 1))`; do
 260           start_container "" "compute" '' "api_server:api" "arvados/compute"
 261         done
 262     fi
 263
 264     if [[ $start_keep != false ]]
 265     then
 266         # create `keep_volumes' array with a list of keep mount points
 267         # remove any stale metadata from those volumes before starting them
 268         make_keep_volumes
 269         for v in ${keep_volumes[*]}
 270         do
 271             [ -f $v/keep/.metadata.yml ] && sudo rm $v/keep/.metadata.yml
 272         done
 273         start_container "25107:25107" "keep_server_0" \
 274             "${keep_volumes[0]}:/keep-data" \
 275             "api_server:api" \
 276             "arvados/keep"
 277         start_container "25108:25107" "keep_server_1" \
 278             "${keep_volumes[1]}:/keep-data" \
 279             "api_server:api" \
 280             "arvados/keep"
 281     fi
 282
 283     if [[ $start_doc != false ]]
 284     then
 285         start_container "$start_doc:80" "doc_server" '' '' "arvados/doc"
 286     fi
 287
 288     if [[ $start_vm != false ]]
 289     then
 290         start_container "" "shell" '' "api_server:api" "arvados/shell"
 291     fi
 292
 293     if [[ $start_workbench != false ]]
 294     then
 295         start_container "$start_workbench:80" "workbench_server" '' "api_server:api" "arvados/workbench"
 296     fi
 297
 298     if [[ $start_api != false ]]
 299     then
 300         if [[ -f "api/generated/superuser_token" ]]
 301         then
 302           if [ -d $HOME/.config/arvados ] || mkdir -p $HOME/.config/arvados
 303           then
 304             cat >$HOME/.config/arvados/settings.conf <<EOF
 305 ARVADOS_API_HOST=$(ip_address "api_server")
 306 ARVADOS_API_HOST_INSECURE=yes
 307 ARVADOS_API_TOKEN=$(cat api/generated/superuser_token)
 308 EOF
 309           fi
 310         fi
 311     fi
 312 }
 313
 314 function do_stop {
 315     local stop_doc=""
 316     local stop_sso=""
 317     local stop_api=""
 318     local stop_compute=""
 319     local stop_workbench=""
 320     local stop_nameserver=""
 321     local stop_vm=""
 322     local stop_keep=""
 323
 324     # NOTE: This requires GNU getopt (part of the util-linux package on Debian-based distros).
 325     local TEMP=`getopt -o dsacwnkvh \
 326                   --long doc,sso,api,compute,workbench,nameserver,keep,vm,help \
 327                   -n "$0" -- "$@"`
 328
 329     if [ $? != 0 ] ; then echo "Use -h for help"; exit 1 ; fi
 330
 331     # Note the quotes around `$TEMP': they are essential!
 332     eval set -- "$TEMP"
 333
 334     while [ $# -ge 1 ]
 335     do
 336         case $1 in
 337             -d | --doc)
 338                 stop_doc=doc_server ; shift ;;
 339             -s | --sso)
 340                 stop_sso=sso_server ; shift ;;
 341             -a | --api)
 342                 stop_api=api_server ; shift ;;
 343             -c | --compute)
 344                 stop_compute=`$DOCKER ps |grep -P "compute\d+" |grep -v api_server |cut -f1 -d ' '` ; shift ;;
 345             -w | --workbench)
 346                 stop_workbench=workbench_server ; shift ;;
 347             -n | --nameserver )
 348                 stop_nameserver="skydock skydns" ; shift ;;
 349             -v | --vm )
 350                 stop_vm="shell" ; shift ;;
 351             -k | --keep )
 352                 stop_keep="keep_server_0 keep_server_1" ; shift ;;
 353             --)
 354                 shift
 355                 break
 356                 ;;
 357             *)
 358                 usage
 359                 exit 1
 360                 ;;
 361         esac
 362     done
 363
 364     # If no options were selected, then stop all servers.
 365     if [[ $stop_doc == "" &&
 366           $stop_sso == "" &&
 367           $stop_api == "" &&
 368           $stop_compute == "" &&
 369           $stop_workbench == "" &&
 370           $stop_vm == "" &&
 371           $stop_nameserver == "" &&
 372           $stop_keep == "" ]]
 373     then
 374         stop_doc=doc_server
 375         stop_sso=sso_server
 376         stop_api=api_server
 377         stop_compute=`$DOCKER ps |grep -P "compute\d+" |grep -v api_server |cut -f1 -d ' '`
 378         stop_workbench=workbench_server
 379         stop_vm=shell
 380         stop_nameserver="skydock skydns"
 381         stop_keep="keep_server_0 keep_server_1"
 382     fi
 383
 384     $DOCKER stop $stop_doc $stop_sso $stop_api $stop_compute $stop_workbench $stop_nameserver $stop_keep $stop_vm \
 385         2>/dev/null
 386 }
 387
 388 function do_test {
 389     local alltests
 390     if [ $# -lt 1 ]
 391     then
 392         alltests="python-sdk api"
 393     else
 394         alltests="$@"
 395     fi
 396
 397     for testname in $alltests
 398     do
 399         echo "testing $testname..."
 400         case $testname in
 401             python-sdk)
 402                 do_start --api --keep --sso
 403                 export ARVADOS_API_HOST=$(ip_address "api_server")
 404                 export ARVADOS_API_HOST_INSECURE=yes
 405                 export ARVADOS_API_TOKEN=$(cat api/generated/superuser_token)
 406                 python -m unittest discover ../sdk/python
 407                 ;;
 408             api)
 409                 $DOCKER run -t -i arvados/api \
 410                     /usr/src/arvados/services/api/script/rake_test.sh
 411                 ;;
 412             *)
 413                 echo >&2 "unknown test $testname"
 414                 ;;
 415         esac
 416     done
 417 }
 418
 419 if [ $# -lt 1 ]
 420 then
 421   usage
 422   exit 1
 423 fi
 424
 425 case $1 in
 426     start)
 427         shift
 428         do_start $@
 429         ;;
 430     stop)
 431         shift
 432         do_stop $@
 433         ;;
 434     restart)
 435         shift
 436         do_stop $@
 437         do_start $@
 438         ;;
 439     test)
 440         shift
 441         do_test $@
 442         ;;
 443     *)
 444         usage
 445         exit 1
 446         ;;
 447 esac