build/run-tests.sh

   1 #!/bin/bash
   2
   3 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin
   4
   5 COLUMNS=80
   6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
   7
   8 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
   9 $(basename $0): Install and test Arvados components.
  10
  11 Exit non-zero if any tests fail.
  12
  13 Syntax:
  14         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
  15
  16 Options:
  17
  18 --skip FOO     Do not test the FOO component.
  19 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
  20 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
  21                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
  22 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
  23                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
  24                subsequent invocations.
  25 --skip-install Do not run any install steps. Just run tests.
  26                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
  27                from a previous invocation if you use this option.
  28 --only-install Run specific install step
  29 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
  30 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
  31 CONFIGSRC=path Dir with api server config files to copy into source tree.
  32                (If none given, leave config files alone in source tree.)
  33 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
  34                Restrict apiserver tests to the given file
  35 sdk/python_test="--test-suite test.test_keep_locator"
  36                Restrict Python SDK tests to the given class
  37 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
  38                Restrict Workbench tests to the given file
  39 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
  40                Show all log messages, even when tests pass (also works
  41                with services/keepstore_test etc.)
  42 ARVADOS_DEBUG=1
  43                Print more debug messages
  44 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
  45                *_test, and other examples shown above.
  46
  47 Assuming --skip-install is not given, all components are installed
  48 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
  49 test suites depend on other components being installed, and installing
  50 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
  51
  52 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
  53 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
  54
  55 More information and background:
  56
  57 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
  58
  59 Available tests:
  60
  61 apps/workbench (*)
  62 apps/workbench_units (*)
  63 apps/workbench_functionals (*)
  64 apps/workbench_integration (*)
  65 apps/workbench_benchmark
  66 apps/workbench_profile
  67 doc
  68 services/api
  69 services/arv-git-httpd
  70 services/crunchstat
  71 services/dockercleaner
  72 services/fuse
  73 services/keep-web
  74 services/keepproxy
  75 services/keepstore
  76 services/keep-balance
  77 services/login-sync
  78 services/nodemanager
  79 services/crunch-run
  80 services/crunch-dispatch-local
  81 services/crunch-dispatch-slurm
  82 services/ws
  83 sdk/cli
  84 sdk/pam
  85 sdk/python
  86 sdk/ruby
  87 sdk/go/arvados
  88 sdk/go/arvadosclient
  89 sdk/go/keepclient
  90 sdk/go/httpserver
  91 sdk/go/manifest
  92 sdk/go/blockdigest
  93 sdk/go/streamer
  94 sdk/go/crunchrunner
  95 sdk/cwl
  96 tools/crunchstat-summary
  97 tools/keep-exercise
  98 tools/keep-rsync
  99 tools/keep-block-check
 100
 101 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
 102     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
 103
 104 EOF
 105
 106 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
 107 # environment that could interfere with the tests.
 108 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
 109
 110 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
 111 # accident.
 112 GITDIR=
 113 GOPATH=
 114 VENVDIR=
 115 VENV3DIR=
 116 PYTHONPATH=
 117 GEMHOME=
 118 PERLINSTALLBASE=
 119
 120 short=
 121 skip_install=
 122 temp=
 123 temp_preserve=
 124
 125 clear_temp() {
 126     if [[ -z "$temp" ]]; then
 127         # we didn't even get as far as making a temp dir
 128         :
 129     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
 130         rm -rf "$temp"
 131     else
 132         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
 133     fi
 134 }
 135
 136 fatal() {
 137     clear_temp
 138     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
 139     exit 1
 140 }
 141
 142 exit_cleanly() {
 143     trap - INT
 144     create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
 145     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 146     stop_services
 147     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 148     report_outcomes
 149     clear_temp
 150     exit ${#failures}
 151 }
 152
 153 sanity_checks() {
 154     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
 155         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
 156     echo Checking dependencies:
 157     echo -n 'virtualenv: '
 158     virtualenv --version \
 159         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
 160     echo -n 'go: '
 161     go version \
 162         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
 163     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 7 ]] \
 164         || fatal "Go >= 1.7 required. See http://golang.org/doc/install"
 165     echo -n 'gcc: '
 166     gcc --version | egrep ^gcc \
 167         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
 168     echo -n 'fuse.h: '
 169     find /usr/include -wholename '*fuse/fuse.h' \
 170         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
 171     echo -n 'pyconfig.h: '
 172     find /usr/include -name pyconfig.h | egrep --max-count=1 . \
 173         || fatal "No pyconfig.h. Try: apt-get install python-dev"
 174     echo -n 'nginx: '
 175     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
 176         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
 177     echo -n 'perl: '
 178     perl -v | grep version \
 179         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
 180     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
 181         echo -n "perl $mod: "
 182         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
 183             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
 184     done
 185     echo -n 'gitolite: '
 186     which gitolite \
 187         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
 188 }
 189
 190 rotate_logfile() {
 191   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 192   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
 193   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
 194     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
 195     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 196     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 197   fi
 198 }
 199
 200 declare -a failures
 201 declare -A skip
 202 declare -A testargs
 203 skip[apps/workbench_profile]=1
 204
 205 while [[ -n "$1" ]]
 206 do
 207     arg="$1"; shift
 208     case "$arg" in
 209         --help)
 210             echo >&2 "$helpmessage"
 211             echo >&2
 212             exit 1
 213             ;;
 214         --skip)
 215             skipwhat="$1"; shift
 216             if [[ "$skipwhat" == "apps/workbench" ]]; then
 217               skip["apps/workbench_units"]=1
 218               skip["apps/workbench_functionals"]=1
 219               skip["apps/workbench_integration"]=1
 220             else
 221               skip[$skipwhat]=1
 222             fi
 223             ;;
 224         --only)
 225             only="$1"; skip[$1]=""; shift
 226             ;;
 227         --short)
 228             short=1
 229             ;;
 230         --skip-install)
 231             skip_install=1
 232             ;;
 233         --only-install)
 234             skip_install=1
 235             only_install="$1"; shift
 236             ;;
 237         --temp)
 238             temp="$1"; shift
 239             temp_preserve=1
 240             ;;
 241         --leave-temp)
 242             temp_preserve=1
 243             ;;
 244         --retry)
 245             retry=1
 246             ;;
 247         *_test=*)
 248             suite="${arg%%_test=*}"
 249             args="${arg#*=}"
 250             testargs["$suite"]="$args"
 251             ;;
 252         *=*)
 253             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
 254             ;;
 255         *)
 256             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
 257             exit 1
 258             ;;
 259     esac
 260 done
 261
 262 start_api() {
 263     echo 'Starting API server...'
 264     cd "$WORKSPACE" \
 265         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
 266         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
 267         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
 268         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 269         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
 270         && (env | egrep ^ARVADOS)
 271 }
 272
 273 start_nginx_proxy_services() {
 274     echo 'Starting keepproxy, keep-web, ws, arv-git-httpd, and nginx ssl proxy...'
 275     cd "$WORKSPACE" \
 276         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
 277         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
 278         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
 279         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 280         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
 281         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1
 282 }
 283
 284 stop_services() {
 285     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES" ]]; then
 286         unset ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
 287         cd "$WORKSPACE" \
 288             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 289             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
 290             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 291             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
 292             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy
 293     fi
 294     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
 295         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
 296         cd "$WORKSPACE" \
 297             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 298             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 299             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop
 300     fi
 301 }
 302
 303 interrupt() {
 304     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
 305     exit_cleanly
 306 }
 307 trap interrupt INT
 308
 309 sanity_checks
 310
 311 echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
 312
 313 if [[ -z "$CONFIGSRC" ]] && [[ -d "$HOME/arvados-api-server" ]]; then
 314     # Jenkins expects us to use this by default.
 315     CONFIGSRC="$HOME/arvados-api-server"
 316 fi
 317
 318 # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
 319 cd "$WORKSPACE"
 320 find -name '*.pyc' -delete
 321
 322 if [[ -z "$temp" ]]; then
 323     temp="$(mktemp -d)"
 324 fi
 325
 326 # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
 327 for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE
 328 do
 329     if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
 330         eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
 331     fi
 332     if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
 333         mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
 334     fi
 335 done
 336
 337 setup_ruby_environment() {
 338     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 339       source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
 340       using_rvm=true
 341     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 342       source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
 343       using_rvm=true
 344     else
 345       using_rvm=false
 346     fi
 347
 348     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 349         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
 350         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
 351         # the environment to the "current gemset", which would lose
 352         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
 353         # programs (for example, the Workbench test suite could not
 354         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
 355         # rvm gemset and use it for everything.
 356
 357         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
 358             || fatal 'rvm check'
 359
 360         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
 361         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
 362         # complaint about not being in first place already.
 363         rvm use @default 2>/dev/null
 364
 365         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
 366         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
 367         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
 368         # ruby to the caller.
 369         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
 370         rvm use "@${gemset}" --create \
 371             || fatal 'rvm gemset setup'
 372
 373         rvm env
 374     else
 375         # When our "bundle install"s need to install new gems to
 376         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
 377         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
 378         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
 379         # should be installed, and we should leave it alone.)
 380
 381         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
 382             user_gempath="$(gem env gempath)"
 383             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
 384         fi
 385         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
 386
 387         # When we build and install our own gems, we install them in our
 388         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
 389         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
 390         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
 391
 392         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
 393         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
 394         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home:$(gem env gempath)"
 395
 396         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
 397         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
 398         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
 399     fi
 400 }
 401
 402 with_test_gemset() {
 403     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 404         "$@"
 405     else
 406         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
 407     fi
 408 }
 409
 410 gem_uninstall_if_exists() {
 411     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
 412         gem uninstall --force --all --executables "$1"
 413     fi
 414 }
 415
 416 setup_virtualenv() {
 417     local venvdest="$1"; shift
 418     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
 419         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
 420     fi
 421     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
 422         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
 423         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
 424     else
 425         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
 426     fi
 427     # ubuntu1404 can't seem to install mock via tests_require, but it can do this.
 428     "$venvdest/bin/pip" install 'mock>=1.0' 'pbr<1.7.0'
 429 }
 430
 431 export PERLINSTALLBASE
 432 export PERLLIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5:${PERLLIB:+$PERLLIB}"
 433
 434 export GOPATH
 435 mkdir -p "$GOPATH/src/git.curoverse.com"
 436 ln -sfn "$WORKSPACE" "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" \
 437     || fatal "symlink failed"
 438
 439 setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
 440 . "$VENVDIR/bin/activate"
 441
 442 # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
 443 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^PyYAML= \
 444     || pip install PyYAML >/dev/null \
 445     || fatal "pip install PyYAML failed"
 446
 447 # Preinstall forked version of libcloud, because nodemanager "pip install"
 448 # won't pick it up by default.
 449 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
 450     || pip install --pre --ignore-installed https://github.com/curoverse/libcloud/archive/apache-libcloud-$LIBCLOUD_PIN.zip >/dev/null \
 451     || fatal "pip install apache-libcloud failed"
 452
 453 # This will help people who reuse --temp dirs when we upgrade to llfuse 0.42
 454 if egrep -q 'llfuse.*>= *0\.42' "$WORKSPACE/services/fuse/setup.py"; then
 455     # Uninstall old llfuse, because services/fuse "pip install" won't
 456     # upgrade it by default.
 457     if pip freeze | egrep '^llfuse==0\.41\.'; then
 458         yes | pip uninstall 'llfuse<0.42'
 459     fi
 460 fi
 461
 462 # Deactivate Python 2 virtualenv
 463 deactivate
 464
 465 # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
 466 # Otherwise, skip dependent tests.
 467 PYTHON3=$(which python3)
 468 if [ "0" = "$?" ]; then
 469     setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
 470 else
 471     PYTHON3=
 472     skip[services/dockercleaner]=1
 473     cat >&2 <<EOF
 474
 475 Warning: python3 could not be found
 476 services/dockercleaner install and tests will be skipped
 477
 478 EOF
 479 fi
 480
 481 # Reactivate Python 2 virtualenv
 482 . "$VENVDIR/bin/activate"
 483
 484 # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
 485 # whine a lot.
 486 setup_ruby_environment
 487
 488 echo "PATH is $PATH"
 489
 490 if ! which bundler >/dev/null
 491 then
 492     gem install --user-install bundler || fatal 'Could not install bundler'
 493 fi
 494
 495 retry() {
 496     while ! ${@} && [[ "$retry" == 1 ]]
 497     do
 498         read -p 'Try again? [Y/n] ' x
 499         if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
 500         then
 501             break
 502         fi
 503     done
 504 }
 505
 506 do_test() {
 507     retry do_test_once ${@}
 508 }
 509
 510 do_test_once() {
 511     unset result
 512     to_test=$1
 513     if (( [[ "$only" == "apps/workbench" ]] ) &&
 514        ( [[ "$to_test" == "apps/workbench_units" ]] || [[ "$to_test" == "apps/workbench_functionals" ]] ||
 515          [[ "$to_test" == "apps/workbench_integration" ]])); then
 516       to_test="apps/workbench"
 517     fi
 518     if [[ -z "${skip[$1]}" ]] && ( [[ -z "$only" ]] || [[ "$only" == "$to_test" ]] )
 519     then
 520         title "Running $1 tests"
 521         timer_reset
 522         if [[ "$2" == "go" ]]
 523         then
 524             covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
 525             coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
 526             # We do "go get -t" here to catch compilation errors
 527             # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
 528             # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
 529             # compilation errors.
 530             go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1" || return 1
 531             cd "$WORKSPACE/$1" || return 1
 532             gofmt -e -d . | egrep . && result=1
 533             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
 534             then
 535                 # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
 536                 # does:
 537                 cd "$WORKSPACE/$1" && go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
 538             else
 539                 # The above form gets verbose even when testargs is
 540                 # empty, so use this form in such cases:
 541                 go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 542             fi
 543             result=${result:-$?}
 544             if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
 545             then
 546                 go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
 547                 rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
 548             fi
 549         elif [[ "$2" == "pip" ]]
 550         then
 551             tries=0
 552             cd "$WORKSPACE/$1" && while :
 553             do
 554                 tries=$((${tries}+1))
 555                 # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 556                 # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 557                 "${3}python" setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
 558                 result=$?
 559                 if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
 560                 then
 561                     printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
 562                     continue
 563                 else
 564                     break
 565                 fi
 566             done
 567         elif [[ "$2" != "" ]]
 568         then
 569             "test_$2"
 570         else
 571             "test_$1"
 572         fi
 573         result=${result:-$?}
 574         checkexit $result "$1 tests"
 575         title "End of $1 tests (`timer`)"
 576         return $result
 577     else
 578         title "Skipping $1 tests"
 579     fi
 580 }
 581
 582 do_install() {
 583     retry do_install_once ${@}
 584 }
 585
 586 do_install_once() {
 587     if [[ -z "$skip_install" || (-n "$only_install" && "$only_install" == "$1") ]]
 588     then
 589         title "Running $1 install"
 590         timer_reset
 591         if [[ "$2" == "go" ]]
 592         then
 593             go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 594         elif [[ "$2" == "pip" ]]
 595         then
 596             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 597             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 598
 599             # Need to change to a different directory after creating
 600             # the source dist package to avoid a pip bug.
 601             # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
 602
 603             # Also need to install twice, because if it believes the package is
 604             # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
 605             # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
 606             # install" ensures that we've actually installed the local package
 607             # we just built.
 608             cd "$WORKSPACE/$1" \
 609                 && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
 610                 && cd "$WORKSPACE" \
 611                 && "${3}pip" install --quiet "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
 612                 && "${3}pip" install --quiet --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
 613         elif [[ "$2" != "" ]]
 614         then
 615             "install_$2"
 616         else
 617             "install_$1"
 618         fi
 619         result=$?
 620         checkexit $result "$1 install"
 621         title "End of $1 install (`timer`)"
 622         return $result
 623     else
 624         title "Skipping $1 install"
 625     fi
 626 }
 627
 628 bundle_install_trylocal() {
 629     (
 630         set -e
 631         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
 632         if ! bundle install --local --no-deployment; then
 633             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
 634             bundle install --no-deployment
 635         fi
 636         bundle package --all
 637     )
 638 }
 639
 640 install_doc() {
 641     cd "$WORKSPACE/doc" \
 642         && bundle_install_trylocal \
 643         && rm -rf .site
 644 }
 645 do_install doc
 646
 647 install_gem() {
 648     gemname=$1
 649     srcpath=$2
 650     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
 651         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
 652         && bundle_install_trylocal \
 653         && gem build "$gemname.gemspec" \
 654         && with_test_gemset gem install --no-ri --no-rdoc $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
 655 }
 656
 657 install_ruby_sdk() {
 658     install_gem arvados sdk/ruby
 659 }
 660 do_install sdk/ruby ruby_sdk
 661
 662 install_perl_sdk() {
 663     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
 664         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
 665         && make install INSTALLDIRS=perl
 666 }
 667 do_install sdk/perl perl_sdk
 668
 669 install_cli() {
 670     install_gem arvados-cli sdk/cli
 671 }
 672 do_install sdk/cli cli
 673
 674 install_login-sync() {
 675     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
 676 }
 677 do_install services/login-sync login-sync
 678
 679 # Install the Python SDK early. Various other test suites (like
 680 # keepproxy) bring up run_test_server.py, which imports the arvados
 681 # module. We can't actually *test* the Python SDK yet though, because
 682 # its own test suite brings up some of those other programs (like
 683 # keepproxy).
 684 declare -a pythonstuff
 685 pythonstuff=(
 686     sdk/pam
 687     sdk/python
 688     sdk/cwl
 689     services/fuse
 690     services/nodemanager
 691     tools/crunchstat-summary
 692     )
 693 for p in "${pythonstuff[@]}"
 694 do
 695     do_install "$p" pip
 696 done
 697 if [ -n "$PYTHON3" ]; then
 698     do_install services/dockercleaner pip "$VENV3DIR/bin/"
 699 fi
 700
 701 install_apiserver() {
 702     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 703         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 704
 705     rm -f config/environments/test.rb
 706     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
 707
 708     if [ -n "$CONFIGSRC" ]
 709     then
 710         for f in database.yml application.yml
 711         do
 712             cp "$CONFIGSRC/$f" config/ || fatal "$f"
 713         done
 714     fi
 715
 716     # Fill in a random secret_token and blob_signing_key for testing
 717     SECRET_TOKEN=`echo 'puts rand(2**512).to_s(36)' |ruby`
 718     BLOB_SIGNING_KEY=`echo 'puts rand(2**512).to_s(36)' |ruby`
 719
 720     sed -i'' -e "s:SECRET_TOKEN:$SECRET_TOKEN:" config/application.yml
 721     sed -i'' -e "s:BLOB_SIGNING_KEY:$BLOB_SIGNING_KEY:" config/application.yml
 722
 723     # Set up empty git repo (for git tests)
 724     GITDIR=$(mktemp -d)
 725     sed -i'' -e "s:/var/cache/git:$GITDIR:" config/application.default.yml
 726
 727     rm -rf $GITDIR
 728     mkdir -p $GITDIR/test
 729     cd $GITDIR/test \
 730         && git init \
 731         && git config user.email "jenkins@ci.curoverse.com" \
 732         && git config user.name "Jenkins, CI" \
 733         && touch tmp \
 734         && git add tmp \
 735         && git commit -m 'initial commit'
 736
 737     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
 738     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
 739     # is a postgresql superuser.
 740     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 741         && test_database=$(python -c "import yaml; print yaml.load(file('config/database.yml'))['test']['database']") \
 742         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.procpid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
 743
 744     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 745         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:drop \
 746         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:setup \
 747         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:fixtures:load
 748 }
 749 do_install services/api apiserver
 750
 751 declare -a gostuff
 752 gostuff=(
 753     sdk/go/arvados
 754     sdk/go/arvadosclient
 755     sdk/go/blockdigest
 756     sdk/go/httpserver
 757     sdk/go/manifest
 758     sdk/go/streamer
 759     sdk/go/crunchrunner
 760     lib/crunchstat
 761     services/arv-git-httpd
 762     services/crunchstat
 763     services/keep-web
 764     services/keepstore
 765     sdk/go/keepclient
 766     services/keep-balance
 767     services/keepproxy
 768     services/datamanager/summary
 769     services/datamanager/collection
 770     services/datamanager/keep
 771     services/datamanager
 772     services/crunch-dispatch-local
 773     services/crunch-dispatch-slurm
 774     services/crunch-run
 775     services/ws
 776     tools/keep-block-check
 777     tools/keep-exercise
 778     tools/keep-rsync
 779     )
 780 for g in "${gostuff[@]}"
 781 do
 782     do_install "$g" go
 783 done
 784
 785 install_workbench() {
 786     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 787         && mkdir -p tmp/cache \
 788         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 789 }
 790 do_install apps/workbench workbench
 791
 792 test_doclinkchecker() {
 793     (
 794         set -e
 795         cd "$WORKSPACE/doc"
 796         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
 797         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
 798         # do much good!
 799         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ bundle exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
 800     )
 801 }
 802 do_test doc doclinkchecker
 803
 804 stop_services
 805
 806 test_apiserver() {
 807     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
 808     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 809         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/api]}
 810 }
 811 do_test services/api apiserver
 812
 813 # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
 814 # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
 815 if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
 816   rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 817   exit_cleanly
 818 fi
 819
 820 start_api
 821
 822 test_ruby_sdk() {
 823     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
 824         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
 825 }
 826 do_test sdk/ruby ruby_sdk
 827
 828 test_cli() {
 829     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
 830         && mkdir -p /tmp/keep \
 831         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
 832 }
 833 do_test sdk/cli cli
 834
 835 test_login-sync() {
 836     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
 837         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
 838 }
 839 do_test services/login-sync login-sync
 840
 841 for p in "${pythonstuff[@]}"
 842 do
 843     do_test "$p" pip
 844 done
 845 do_test services/dockercleaner pip "$VENV3DIR/bin/"
 846
 847 for g in "${gostuff[@]}"
 848 do
 849     do_test "$g" go
 850 done
 851
 852 test_workbench_units() {
 853     start_nginx_proxy_services \
 854         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 855         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:units TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 856 }
 857 do_test apps/workbench_units workbench_units
 858
 859 test_workbench_functionals() {
 860     start_nginx_proxy_services \
 861         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 862         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:functionals TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 863 }
 864 do_test apps/workbench_functionals workbench_functionals
 865
 866 test_workbench_integration() {
 867     start_nginx_proxy_services \
 868         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 869         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:integration TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 870 }
 871 do_test apps/workbench_integration workbench_integration
 872
 873
 874 test_workbench_benchmark() {
 875     start_nginx_proxy_services \
 876         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 877         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:benchmark ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
 878 }
 879 do_test apps/workbench_benchmark workbench_benchmark
 880
 881 test_workbench_profile() {
 882     start_nginx_proxy_services \
 883         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 884         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:profile ${testargs[apps/workbench_profile]}
 885 }
 886 do_test apps/workbench_profile workbench_profile
 887
 888 exit_cleanly