build/run-tests.sh

   1 #!/bin/bash
   2 # Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
   3 #
   4 # SPDX-License-Identifier: AGPL-3.0
   5
   6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin.sh
   7
   8 COLUMNS=80
   9 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
  10
  11 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
  12 $(basename $0): Install and test Arvados components.
  13
  14 Exit non-zero if any tests fail.
  15
  16 Syntax:
  17         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
  18
  19 Options:
  20
  21 --skip FOO     Do not test the FOO component.
  22 --skip sanity  Skip initial dev environment sanity checks.
  23 --skip install Do not run any install steps. Just run tests.
  24                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
  25                from a previous invocation if you use this option.
  26 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
  27 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
  28                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
  29 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
  30                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
  31                subsequent invocations.
  32 --repeat N     Repeat each install/test step until it succeeds N times.
  33 --retry        Prompt to retry if an install or test suite fails.
  34 --only-install Run specific install step
  35 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
  36 --interactive  Set up, then prompt for test/install steps to perform.
  37 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
  38 CONFIGSRC=path Dir with api server config files to copy into source tree.
  39                (If none given, leave config files alone in source tree.)
  40 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
  41                Restrict apiserver tests to the given file
  42 sdk/python_test="--test-suite tests.test_keep_locator"
  43                Restrict Python SDK tests to the given class
  44 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
  45                Restrict Workbench tests to the given file
  46 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
  47                Show all log messages, even when tests pass (also works
  48                with services/keepstore_test etc.)
  49 ARVADOS_DEBUG=1
  50                Print more debug messages
  51 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
  52                *_test, and other examples shown above.
  53
  54 Assuming "--skip install" is not given, all components are installed
  55 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
  56 test suites depend on other components being installed, and installing
  57 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
  58
  59 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
  60 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
  61
  62 More information and background:
  63
  64 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
  65
  66 Available tests:
  67
  68 apps/workbench (*)
  69 apps/workbench_units (*)
  70 apps/workbench_functionals (*)
  71 apps/workbench_integration (*)
  72 apps/workbench_benchmark
  73 apps/workbench_profile
  74 cmd/arvados-client
  75 cmd/arvados-server
  76 doc
  77 lib/cli
  78 lib/cmd
  79 lib/controller
  80 lib/crunchstat
  81 lib/cloud
  82 lib/cloud/azure
  83 lib/dispatchcloud
  84 lib/dispatchcloud/container
  85 lib/dispatchcloud/scheduler
  86 lib/dispatchcloud/ssh_executor
  87 lib/dispatchcloud/worker
  88 lib/service
  89 services/api
  90 services/arv-git-httpd
  91 services/crunchstat
  92 services/dockercleaner
  93 services/fuse
  94 services/health
  95 services/keep-web
  96 services/keepproxy
  97 services/keepstore
  98 services/keep-balance
  99 services/login-sync
 100 services/nodemanager
 101 services/nodemanager_integration
 102 services/crunch-run
 103 services/crunch-dispatch-local
 104 services/crunch-dispatch-slurm
 105 services/ws
 106 sdk/cli
 107 sdk/pam
 108 sdk/pam:py3
 109 sdk/python
 110 sdk/python:py3
 111 sdk/ruby
 112 sdk/go/arvados
 113 sdk/go/arvadosclient
 114 sdk/go/auth
 115 sdk/go/dispatch
 116 sdk/go/keepclient
 117 sdk/go/health
 118 sdk/go/httpserver
 119 sdk/go/manifest
 120 sdk/go/blockdigest
 121 sdk/go/asyncbuf
 122 sdk/go/stats
 123 sdk/go/crunchrunner
 124 sdk/cwl
 125 sdk/R
 126 sdk/java-v2
 127 tools/sync-groups
 128 tools/crunchstat-summary
 129 tools/crunchstat-summary:py3
 130 tools/keep-exercise
 131 tools/keep-rsync
 132 tools/keep-block-check
 133
 134 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
 135     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
 136
 137 EOF
 138
 139 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
 140 # environment that could interfere with the tests.
 141 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
 142
 143 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
 144 # accident.
 145 GITDIR=
 146 GOPATH=
 147 VENVDIR=
 148 VENV3DIR=
 149 PYTHONPATH=
 150 GEMHOME=
 151 PERLINSTALLBASE=
 152 R_LIBS=
 153 export LANG=en_US.UTF-8
 154
 155 short=
 156 only_install=
 157 temp=
 158 temp_preserve=
 159
 160 clear_temp() {
 161     if [[ -z "$temp" ]]; then
 162         # we didn't even get as far as making a temp dir
 163         :
 164     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
 165         rm -rf "$temp"
 166     else
 167         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
 168     fi
 169 }
 170
 171 fatal() {
 172     clear_temp
 173     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
 174     exit 1
 175 }
 176
 177 exit_cleanly() {
 178     trap - INT
 179     if which create-plot-data-from-log.sh >/dev/null; then
 180         create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
 181     fi
 182     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 183     stop_services
 184     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 185     report_outcomes
 186     clear_temp
 187     exit ${#failures}
 188 }
 189
 190 sanity_checks() {
 191     [[ -n "${skip[sanity]}" ]] && return 0
 192     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
 193         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
 194     echo Checking dependencies:
 195     echo "locale: ${LANG}"
 196     [[ "$(locale charmap)" = "UTF-8" ]] \
 197         || fatal "Locale '${LANG}' is broken/missing. Try: echo ${LANG} | sudo tee -a /etc/locale.gen && sudo locale-gen"
 198     echo -n 'virtualenv: '
 199     virtualenv --version \
 200         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
 201     echo -n 'ruby: '
 202     ruby -v \
 203         || fatal "No ruby. Install >=2.1.9 (using rbenv, rvm, or source)"
 204     echo -n 'go: '
 205     go version \
 206         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
 207     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 10 ]] \
 208         || fatal "Go >= 1.10 required. See http://golang.org/doc/install"
 209     echo -n 'gcc: '
 210     gcc --version | egrep ^gcc \
 211         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
 212     echo -n 'fuse.h: '
 213     find /usr/include -path '*fuse/fuse.h' | egrep --max-count=1 . \
 214         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
 215     echo -n 'gnutls.h: '
 216     find /usr/include -path '*gnutls/gnutls.h' | egrep --max-count=1 . \
 217         || fatal "No gnutls/gnutls.h. Try: apt-get install libgnutls28-dev"
 218     echo -n 'Python2 pyconfig.h: '
 219     find /usr/include -path '*/python2*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 220         || fatal "No Python2 pyconfig.h. Try: apt-get install python2.7-dev"
 221     echo -n 'Python3 pyconfig.h: '
 222     find /usr/include -path '*/python3*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 223         || fatal "No Python3 pyconfig.h. Try: apt-get install python3-dev"
 224     echo -n 'nginx: '
 225     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
 226         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
 227     echo -n 'perl: '
 228     perl -v | grep version \
 229         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
 230     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
 231         echo -n "perl $mod: "
 232         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
 233             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
 234     done
 235     echo -n 'gitolite: '
 236     which gitolite \
 237         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
 238     echo -n 'npm: '
 239     npm --version \
 240         || fatal "No npm. Try: wget -O- https://nodejs.org/dist/v6.11.2/node-v6.11.2-linux-x64.tar.xz | sudo tar -C /usr/local -xJf - && sudo ln -s ../node-v6.11.2-linux-x64/bin/{node,npm} /usr/local/bin/"
 241     echo -n 'cadaver: '
 242     cadaver --version | grep -w cadaver \
 243           || fatal "No cadaver. Try: apt-get install cadaver"
 244     echo -n 'libattr1 xattr.h: '
 245     find /usr/include -path '*/attr/xattr.h' | egrep --max-count=1 . \
 246         || fatal "No libattr1 xattr.h. Try: apt-get install libattr1-dev"
 247     echo -n 'libcurl curl.h: '
 248     find /usr/include -path '*/curl/curl.h' | egrep --max-count=1 . \
 249         || fatal "No libcurl curl.h. Try: apt-get install libcurl4-gnutls-dev"
 250     echo -n 'libpq libpq-fe.h: '
 251     find /usr/include -path '*/postgresql/libpq-fe.h' | egrep --max-count=1 . \
 252         || fatal "No libpq libpq-fe.h. Try: apt-get install libpq-dev"
 253     echo -n 'services/api/config/database.yml: '
 254     if [[ ! -f "$WORKSPACE/services/api/config/database.yml" ]]; then
 255             fatal "Please provide a database.yml file for the test suite"
 256     else
 257             echo "OK"
 258     fi
 259     echo -n 'postgresql: '
 260     psql --version || fatal "No postgresql. Try: apt-get install postgresql postgresql-client-common"
 261     echo -n 'phantomjs: '
 262     phantomjs --version || fatal "No phantomjs. Try: apt-get install phantomjs"
 263     echo -n 'xvfb: '
 264     which Xvfb || fatal "No xvfb. Try: apt-get install xvfb"
 265     echo -n 'graphviz: '
 266     dot -V || fatal "No graphviz. Try: apt-get install graphviz"
 267     echo -n 'geckodriver: '
 268     geckodriver --version | grep ^geckodriver || echo "No geckodriver. Try: wget -O- https://github.com/mozilla/geckodriver/releases/download/v0.23.0/geckodriver-v0.23.0-linux64.tar.gz | sudo tar -C /usr/local/bin -xzf - geckodriver"
 269
 270     if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
 271       # R SDK stuff
 272       echo -n 'R: '
 273       which Rscript || fatal "No Rscript. Try: apt-get install r-base"
 274       echo -n 'testthat: '
 275       Rscript -e "library('testthat')" || fatal "No testthat. Try: apt-get install r-cran-testthat"
 276       # needed for roxygen2, needed for devtools, needed for R sdk
 277       pkg-config --exists libxml-2.0 || fatal "No libxml2. Try: apt-get install libxml2-dev"
 278       # needed for pkgdown, builds R SDK doc pages
 279       which pandoc || fatal "No pandoc. Try: apt-get install pandoc"
 280     fi
 281 }
 282
 283 rotate_logfile() {
 284   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 285   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
 286   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
 287     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
 288     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 289     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 290   fi
 291 }
 292
 293 declare -a failures
 294 declare -A skip
 295 declare -A only
 296 declare -A testargs
 297 skip[apps/workbench_profile]=1
 298 # nodemanager_integration tests are not reliable, see #12061.
 299 skip[services/nodemanager_integration]=1
 300
 301 while [[ -n "$1" ]]
 302 do
 303     arg="$1"; shift
 304     case "$arg" in
 305         --help)
 306             echo >&2 "$helpmessage"
 307             echo >&2
 308             exit 1
 309             ;;
 310         --skip)
 311             skip[$1]=1; shift
 312             ;;
 313         --only)
 314             only[$1]=1; skip[$1]=""; shift
 315             ;;
 316         --short)
 317             short=1
 318             ;;
 319         --interactive)
 320             interactive=1
 321             ;;
 322         --skip-install)
 323             skip[install]=1
 324             ;;
 325         --only-install)
 326             only_install="$1"; shift
 327             ;;
 328         --temp)
 329             temp="$1"; shift
 330             temp_preserve=1
 331             ;;
 332         --leave-temp)
 333             temp_preserve=1
 334             ;;
 335         --repeat)
 336             repeat=$((${1}+0)); shift
 337             ;;
 338         --retry)
 339             retry=1
 340             ;;
 341         *_test=*)
 342             suite="${arg%%_test=*}"
 343             args="${arg#*=}"
 344             testargs["$suite"]="$args"
 345             ;;
 346         *=*)
 347             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
 348             ;;
 349         *)
 350             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
 351             exit 1
 352             ;;
 353     esac
 354 done
 355
 356 # R SDK installation is very slow (~360s in a clean environment) and only
 357 # required when testing it. Skip that step if it is not needed.
 358 NEED_SDK_R=true
 359
 360 if [[ ${#only[@]} -ne 0 ]] &&
 361    [[ -z "${only['sdk/R']}" && -z "${only['doc']}" ]]; then
 362   NEED_SDK_R=false
 363 fi
 364
 365 if [[ ${skip["sdk/R"]} == 1 && ${skip["doc"]} == 1 ]]; then
 366   NEED_SDK_R=false
 367 fi
 368
 369 if [[ $NEED_SDK_R == false ]]; then
 370         echo "R SDK not needed, it will not be installed."
 371 fi
 372
 373 checkpidfile() {
 374     svc="$1"
 375     pid="$(cat "$WORKSPACE/tmp/${svc}.pid")"
 376     if [[ -z "$pid" ]] || ! kill -0 "$pid"; then
 377         tail $WORKSPACE/tmp/${1}*.log
 378         echo "${svc} pid ${pid} not running"
 379         return 1
 380     fi
 381     echo "${svc} pid ${pid} ok"
 382 }
 383
 384 checkhealth() {
 385     svc="$1"
 386     port="$(cat "$WORKSPACE/tmp/${svc}.port")"
 387     scheme=http
 388     if [[ ${svc} =~ -ssl$ || ${svc} = wss ]]; then
 389         scheme=https
 390     fi
 391     url="$scheme://localhost:${port}/_health/ping"
 392     if ! curl -Ss -H "Authorization: Bearer e687950a23c3a9bceec28c6223a06c79" "${url}" | tee -a /dev/stderr | grep '"OK"'; then
 393         echo "${url} failed"
 394         return 1
 395     fi
 396 }
 397
 398 checkdiscoverydoc() {
 399     dd="https://${1}/discovery/v1/apis/arvados/v1/rest"
 400     if ! (set -o pipefail; curl -fsk "$dd" | grep -q ^{ ); then
 401         echo >&2 "ERROR: could not retrieve discovery doc from RailsAPI at $dd"
 402         tail -v $WORKSPACE/services/api/log/test.log
 403         return 1
 404     fi
 405     echo "${dd} ok"
 406 }
 407
 408 start_services() {
 409     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
 410         return 0
 411     fi
 412     . "$VENVDIR/bin/activate"
 413     echo 'Starting API, controller, keepproxy, keep-web, arv-git-httpd, ws, and nginx ssl proxy...'
 414     if [[ ! -d "$WORKSPACE/services/api/log" ]]; then
 415         mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/log"
 416     fi
 417     # Remove empty api.pid file if it exists
 418     if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/api.pid" && ! -s "$WORKSPACE/tmp/api.pid" ]]; then
 419         rm -f "$WORKSPACE/tmp/api.pid"
 420     fi
 421     all_services_stopped=
 422     fail=1
 423     cd "$WORKSPACE" \
 424         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
 425         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
 426         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
 427         && checkpidfile api \
 428         && checkdiscoverydoc $ARVADOS_API_HOST \
 429         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_controller \
 430         && checkpidfile controller \
 431         && checkhealth controller \
 432         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
 433         && checkpidfile keepproxy \
 434         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
 435         && checkpidfile keep-web \
 436         && checkhealth keep-web \
 437         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
 438         && checkpidfile arv-git-httpd \
 439         && checkhealth arv-git-httpd \
 440         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 441         && checkpidfile ws \
 442         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx) \
 443         && checkdiscoverydoc $ARVADOS_API_HOST \
 444         && checkpidfile nginx \
 445         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1 \
 446         && (env | egrep ^ARVADOS) \
 447         && fail=0
 448     deactivate
 449     if [[ $fail != 0 ]]; then
 450         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
 451     fi
 452     return $fail
 453 }
 454
 455 stop_services() {
 456     if [[ -n "$all_services_stopped" ]]; then
 457         return
 458     fi
 459     unset ARVADOS_TEST_API_HOST ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
 460     . "$VENVDIR/bin/activate" || return
 461     cd "$WORKSPACE" \
 462         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 463         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
 464         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 465         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
 466         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy \
 467         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_controller \
 468         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop \
 469         && all_services_stopped=1
 470     deactivate
 471 }
 472
 473 interrupt() {
 474     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
 475     exit_cleanly
 476 }
 477 trap interrupt INT
 478
 479 setup_ruby_environment() {
 480     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 481         source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
 482         using_rvm=true
 483     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 484         source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
 485         using_rvm=true
 486     else
 487         using_rvm=false
 488     fi
 489
 490     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 491         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
 492         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
 493         # the environment to the "current gemset", which would lose
 494         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
 495         # programs (for example, the Workbench test suite could not
 496         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
 497         # rvm gemset and use it for everything.
 498
 499         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
 500             || fatal 'rvm check'
 501
 502         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
 503         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
 504         # complaint about not being in first place already.
 505         rvm use @default 2>/dev/null
 506
 507         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
 508         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
 509         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
 510         # ruby to the caller.
 511         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
 512         rvm use "@${gemset}" --create \
 513             || fatal 'rvm gemset setup'
 514
 515         rvm env
 516     else
 517         # When our "bundle install"s need to install new gems to
 518         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
 519         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
 520         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
 521         # should be installed, and we should leave it alone.)
 522
 523         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
 524             user_gempath="$(gem env gempath)"
 525             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
 526         fi
 527         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
 528
 529         # When we build and install our own gems, we install them in our
 530         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
 531         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
 532         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
 533
 534         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
 535         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
 536         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home"
 537
 538         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
 539         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
 540         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
 541     fi
 542     bundle config || gem install bundler \
 543         || fatal 'install bundler'
 544 }
 545
 546 with_test_gemset() {
 547     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 548         "$@"
 549     else
 550         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
 551     fi
 552 }
 553
 554 gem_uninstall_if_exists() {
 555     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
 556         gem uninstall --force --all --executables "$1"
 557     fi
 558 }
 559
 560 setup_virtualenv() {
 561     local venvdest="$1"; shift
 562     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
 563         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
 564     elif [[ -n "$short" ]]; then
 565         return
 566     fi
 567     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
 568         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
 569         "$venvdest/bin/pip" install --no-cache-dir 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
 570     else
 571         "$venvdest/bin/pip" install --no-cache-dir 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
 572     fi
 573     # ubuntu1404 can't seem to install mock via tests_require, but it can do this.
 574     "$venvdest/bin/pip" install --no-cache-dir 'mock>=1.0' 'pbr<1.7.0'
 575 }
 576
 577 initialize() {
 578     sanity_checks
 579
 580     echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
 581
 582     if [[ -z "$CONFIGSRC" ]] && [[ -d "$HOME/arvados-api-server" ]]; then
 583         # Jenkins expects us to use this by default.
 584         CONFIGSRC="$HOME/arvados-api-server"
 585     fi
 586
 587     # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
 588     cd "$WORKSPACE"
 589     find -name '*.pyc' -delete
 590
 591     if [[ -z "$temp" ]]; then
 592         temp="$(mktemp -d)"
 593     fi
 594
 595     # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
 596     for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE R_LIBS
 597     do
 598         if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
 599             eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
 600         fi
 601         if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
 602             mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
 603         fi
 604     done
 605
 606     rm -vf "${WORKSPACE}/tmp/*.log"
 607
 608     export PERLINSTALLBASE
 609     export PERL5LIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5${PERL5LIB:+:$PERL5LIB}"
 610
 611     export R_LIBS
 612
 613     export GOPATH
 614
 615     # Jenkins config requires that glob tmp/*.log match something. Ensure
 616     # that happens even if we don't end up running services that set up
 617     # logging.
 618     mkdir -p "${WORKSPACE}/tmp/" || fatal "could not mkdir ${WORKSPACE}/tmp"
 619     touch "${WORKSPACE}/tmp/controller.log" || fatal "could not touch ${WORKSPACE}/tmp/controller.log"
 620
 621     unset http_proxy https_proxy no_proxy
 622
 623
 624     # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
 625     # whine a lot.
 626     setup_ruby_environment
 627
 628     echo "PATH is $PATH"
 629 }
 630
 631 install_env() {
 632     (
 633         set -e
 634         mkdir -p "$GOPATH/src/git.curoverse.com"
 635         if [[ ! -h "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" ]]; then
 636             for d in \
 637                 "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/tmp/GOPATH" \
 638                     "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/tmp" \
 639                     "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"; do
 640                 [[ -d "$d" ]] && rmdir "$d"
 641             done
 642         fi
 643         for d in \
 644             "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/arvados" \
 645                 "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"; do
 646             [[ -h "$d" ]] && rm "$d"
 647         done
 648         ln -vsfT "$WORKSPACE" "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"
 649         go get -v github.com/kardianos/govendor
 650         cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"
 651         go get -v -d ...
 652         "$GOPATH/bin/govendor" sync
 653     ) || fatal "Go setup failed"
 654
 655     setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
 656     . "$VENVDIR/bin/activate"
 657
 658     # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
 659     pip install --no-cache-dir PyYAML \
 660         || fatal "pip install PyYAML failed"
 661
 662     # Preinstall libcloud if using a fork; otherwise nodemanager "pip
 663     # install" won't pick it up by default.
 664     if [[ -n "$LIBCLOUD_PIN_SRC" ]]; then
 665         pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
 666             || pip install --pre --ignore-installed --no-cache-dir "$LIBCLOUD_PIN_SRC" >/dev/null \
 667             || fatal "pip install apache-libcloud failed"
 668     fi
 669
 670     # Deactivate Python 2 virtualenv
 671     deactivate
 672
 673     # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
 674     # Otherwise, skip dependent tests.
 675     PYTHON3=$(which python3)
 676     if [[ ${?} = 0 ]]; then
 677         setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
 678     else
 679         PYTHON3=
 680         cat >&2 <<EOF
 681
 682 Warning: python3 could not be found. Python 3 tests will be skipped.
 683
 684 EOF
 685     fi
 686
 687     if ! which bundler >/dev/null
 688     then
 689         gem install --user-install bundler || fatal 'Could not install bundler'
 690     fi
 691 }
 692
 693 retry() {
 694     remain="${repeat}"
 695     while :
 696     do
 697         if ${@}; then
 698             if [[ "$remain" -gt 1 ]]; then
 699                 remain=$((${remain}-1))
 700                 title "(repeating ${remain} more times)"
 701             else
 702                 break
 703             fi
 704         elif [[ "$retry" == 1 ]]; then
 705             read -p 'Try again? [Y/n] ' x
 706             if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
 707             then
 708                 break
 709             fi
 710         else
 711             break
 712         fi
 713     done
 714 }
 715
 716 do_test() {
 717     case "${1}" in
 718         apps/workbench_units | apps/workbench_functionals | apps/workbench_integration)
 719             suite=apps/workbench
 720             ;;
 721         services/nodemanager | services/nodemanager_integration)
 722             suite=services/nodemanager_suite
 723             ;;
 724         *)
 725             suite="${1}"
 726             ;;
 727     esac
 728     if [[ -n "${skip[$suite]}" || \
 729               -n "${skip[$1]}" || \
 730               (${#only[@]} -ne 0 && ${only[$suite]} -eq 0 && ${only[$1]} -eq 0) ]]; then
 731         return 0
 732     fi
 733     case "${1}" in
 734         services/api)
 735             stop_services
 736             ;;
 737         gofmt | govendor | doc | lib/cli | lib/cloud/azure | lib/cloud/ec2 | lib/cmd | lib/dispatchcloud/ssh_executor | lib/dispatchcloud/worker)
 738             # don't care whether services are running
 739             ;;
 740         *)
 741             if ! start_services; then
 742                 title "test $1 -- failed to start services"
 743                 return 1
 744             fi
 745             ;;
 746     esac
 747     retry do_test_once ${@}
 748 }
 749
 750 do_test_once() {
 751     unset result
 752
 753     title "test $1"
 754     timer_reset
 755
 756     result=
 757     if which deactivate >/dev/null; then deactivate; fi
 758     if ! . "$VENVDIR/bin/activate"
 759     then
 760         result=1
 761     elif [[ "$2" == "go" ]]
 762     then
 763         covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
 764         coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
 765         # We do "go get -t" here to catch compilation errors
 766         # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
 767         # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
 768         # compilation errors.
 769         go get -ldflags "-X main.version=${ARVADOS_VERSION:-$(git log -n1 --format=%H)-dev}" -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 770             cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 771             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
 772         then
 773             # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
 774             # does:
 775             go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
 776         else
 777             # The above form gets verbose even when testargs is
 778             # empty, so use this form in such cases:
 779             go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 780         fi
 781         result=${result:-$?}
 782         if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
 783         then
 784             go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
 785             rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
 786         fi
 787         [[ $result = 0 ]] && gofmt -e -d *.go
 788     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 789     then
 790         tries=0
 791         cd "$WORKSPACE/$1" && while :
 792         do
 793             tries=$((${tries}+1))
 794             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 795             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 796             "${3}python" setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
 797             result=$?
 798             if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
 799             then
 800                 printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
 801                 continue
 802             else
 803                 break
 804             fi
 805         done
 806     elif [[ "$2" != "" ]]
 807     then
 808         "test_$2"
 809     else
 810         "test_$1"
 811     fi
 812     result=${result:-$?}
 813     checkexit $result "$1 tests"
 814     title "test $1 -- `timer`"
 815     return $result
 816 }
 817
 818 do_install() {
 819     if [[ -n "${skip[install]}" || ( -n "${only_install}" && "${only_install}" != "${1}" && "${only_install}" != "${2}" ) ]]; then
 820         return 0
 821     fi
 822     retry do_install_once ${@}
 823 }
 824
 825 do_install_once() {
 826     title "install $1"
 827     timer_reset
 828
 829     result=
 830     if which deactivate >/dev/null; then deactivate; fi
 831     if [[ "$1" != "env" ]] && ! . "$VENVDIR/bin/activate"; then
 832         result=1
 833     elif [[ "$2" == "go" ]]
 834     then
 835         go get -ldflags "-X main.version=${ARVADOS_VERSION:-$(git log -n1 --format=%H)-dev}" -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 836     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 837     then
 838         # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 839         # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 840
 841         # Need to change to a different directory after creating
 842         # the source dist package to avoid a pip bug.
 843         # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
 844
 845         # Also need to install twice, because if it believes the package is
 846         # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
 847         # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
 848         # install" ensures that we've actually installed the local package
 849         # we just built.
 850         cd "$WORKSPACE/$1" \
 851             && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
 852             && cd "$WORKSPACE" \
 853             && "${3}pip" install --no-cache-dir --quiet "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
 854             && "${3}pip" install --no-cache-dir --quiet --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
 855     elif [[ "$2" != "" ]]
 856     then
 857         "install_$2"
 858     else
 859         "install_$1"
 860     fi
 861     result=${result:-$?}
 862     checkexit $result "$1 install"
 863     title "install $1 -- `timer`"
 864     return $result
 865 }
 866
 867 bundle_install_trylocal() {
 868     (
 869         set -e
 870         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
 871         if ! bundle install --local --no-deployment; then
 872             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
 873             bundle install --no-deployment
 874         fi
 875         bundle package --all
 876     )
 877 }
 878
 879 install_doc() {
 880     cd "$WORKSPACE/doc" \
 881         && bundle_install_trylocal \
 882         && rm -rf .site
 883 }
 884
 885 install_gem() {
 886     gemname=$1
 887     srcpath=$2
 888     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
 889         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
 890         && bundle_install_trylocal \
 891         && gem build "$gemname.gemspec" \
 892         && with_test_gemset gem install --no-document $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
 893 }
 894
 895 install_sdk/ruby() {
 896     install_gem arvados sdk/ruby
 897 }
 898
 899 install_sdk/R() {
 900   if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
 901     cd "$WORKSPACE/sdk/R" \
 902        && Rscript --vanilla install_deps.R
 903   fi
 904 }
 905
 906 install_sdk/perl() {
 907     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
 908         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
 909         && make install INSTALLDIRS=perl
 910 }
 911
 912 install_sdk/cli() {
 913     install_gem arvados-cli sdk/cli
 914 }
 915
 916 install_services/login-sync() {
 917     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
 918 }
 919
 920 install_services/api() {
 921     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 922         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 923
 924     rm -f config/environments/test.rb
 925     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
 926
 927     if [ -n "$CONFIGSRC" ]
 928     then
 929         for f in database.yml
 930         do
 931             cp "$CONFIGSRC/$f" config/ || fatal "$f"
 932         done
 933     fi
 934
 935     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
 936     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
 937     # is a postgresql superuser.
 938     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 939         && test_database=$(python -c "import yaml; print yaml.safe_load(file('config/database.yml'))['test']['database']") \
 940         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.pid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
 941
 942     mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/tmp/pids"
 943
 944     cert="$WORKSPACE/services/api/tmp/self-signed"
 945     if [[ ! -e "$cert.pem" || "$(date -r "$cert.pem" +%s)" -lt 1512659226 ]]; then
 946         (
 947             dir="$WORKSPACE/services/api/tmp"
 948             set -ex
 949             openssl req -newkey rsa:2048 -nodes -subj '/C=US/ST=State/L=City/CN=localhost' -out "$cert.csr" -keyout "$cert.key" </dev/null
 950             openssl x509 -req -in "$cert.csr" -signkey "$cert.key" -out "$cert.pem" -days 3650 -extfile <(printf 'subjectAltName=DNS:localhost,DNS:::1,DNS:0.0.0.0,DNS:127.0.0.1,IP:::1,IP:0.0.0.0,IP:127.0.0.1')
 951         ) || return 1
 952     fi
 953
 954     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 955         && rm -rf tmp/git \
 956         && mkdir -p tmp/git \
 957         && cd tmp/git \
 958         && tar xf ../../test/test.git.tar \
 959         && mkdir -p internal.git \
 960         && git --git-dir internal.git init \
 961             || return 1
 962
 963     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 964         && RAILS_ENV=test bundle exec rails db:environment:set \
 965         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:drop \
 966         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:setup \
 967         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:fixtures:load
 968 }
 969
 970 declare -a pythonstuff
 971 pythonstuff=(
 972     sdk/pam
 973     sdk/python
 974     sdk/python:py3
 975     sdk/cwl
 976     sdk/cwl:py3
 977     services/dockercleaner:py3
 978     services/fuse
 979     services/nodemanager
 980     tools/crunchstat-summary
 981     tools/crunchstat-summary:py3
 982 )
 983
 984 declare -a gostuff
 985 gostuff=(
 986     cmd/arvados-client
 987     cmd/arvados-server
 988     lib/cli
 989     lib/cmd
 990     lib/controller
 991     lib/crunchstat
 992     lib/cloud
 993     lib/cloud/azure
 994     lib/cloud/ec2
 995     lib/config
 996     lib/dispatchcloud
 997     lib/dispatchcloud/container
 998     lib/dispatchcloud/scheduler
 999     lib/dispatchcloud/ssh_executor
1000     lib/dispatchcloud/worker
1001     lib/service
1002     sdk/go/arvados
1003     sdk/go/arvadosclient
1004     sdk/go/auth
1005     sdk/go/blockdigest
1006     sdk/go/dispatch
1007     sdk/go/health
1008     sdk/go/httpserver
1009     sdk/go/manifest
1010     sdk/go/asyncbuf
1011     sdk/go/crunchrunner
1012     sdk/go/stats
1013     services/arv-git-httpd
1014     services/crunchstat
1015     services/health
1016     services/keep-web
1017     services/keepstore
1018     sdk/go/keepclient
1019     services/keep-balance
1020     services/keepproxy
1021     services/crunch-dispatch-local
1022     services/crunch-dispatch-slurm
1023     services/crunch-run
1024     services/ws
1025     tools/keep-block-check
1026     tools/keep-exercise
1027     tools/keep-rsync
1028     tools/sync-groups
1029 )
1030
1031 install_apps/workbench() {
1032     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1033         && mkdir -p tmp/cache \
1034         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal \
1035         && RAILS_ENV=test RAILS_GROUPS=assets bundle exec rake npm:install
1036 }
1037
1038 test_doc() {
1039     (
1040         set -e
1041         cd "$WORKSPACE/doc"
1042         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
1043         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
1044         # do much good!
1045         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ bundle exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
1046     )
1047 }
1048
1049 test_gofmt() {
1050     cd "$WORKSPACE" || return 1
1051     dirs=$(ls -d */ | egrep -v 'vendor|tmp')
1052     [[ -z "$(gofmt -e -d $dirs | tee -a /dev/stderr)" ]]
1053 }
1054
1055 test_govendor() {
1056     (
1057         set -e
1058         cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"
1059         # Remove cached source dirs in workdir. Otherwise, they will
1060         # not qualify as +missing or +external below, and we won't be
1061         # able to detect that they're missing from vendor/vendor.json.
1062         rm -rf vendor/*/
1063         go get -v -d ...
1064         "$GOPATH/bin/govendor" sync
1065         if [[ -n $("$GOPATH/bin/govendor" list +unused +missing +external | tee /dev/stderr) ]]; then
1066             echo >&2 "vendor/vendor.json has unused or missing dependencies -- try:
1067
1068 (export GOPATH=\"${GOPATH}\"; cd \$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git && \$GOPATH/bin/govendor add +missing +external && \$GOPATH/bin/govendor remove +unused)
1069
1070 "
1071             return 1
1072         fi
1073     )
1074 }
1075
1076 test_services/api() {
1077     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
1078     cd "$WORKSPACE/services/api" \
1079         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test TESTOPTS='-v -d' ${testargs[services/api]}
1080 }
1081
1082 test_sdk/ruby() {
1083     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
1084         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
1085 }
1086
1087 test_sdk/R() {
1088   if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
1089     cd "$WORKSPACE/sdk/R" \
1090         && Rscript --vanilla run_test.R
1091   fi
1092 }
1093
1094 test_sdk/cli() {
1095     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
1096         && mkdir -p /tmp/keep \
1097         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
1098 }
1099
1100 test_sdk/java-v2() {
1101     cd "$WORKSPACE/sdk/java-v2" && gradle test
1102 }
1103
1104 test_services/login-sync() {
1105     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
1106         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
1107 }
1108
1109 test_services/nodemanager_integration() {
1110     cd "$WORKSPACE/services/nodemanager" \
1111         && tests/integration_test.py ${testargs[services/nodemanager_integration]}
1112 }
1113
1114 test_apps/workbench_units() {
1115     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1116         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:units TESTOPTS='-v -d' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_units]}
1117 }
1118
1119 test_apps/workbench_functionals() {
1120     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1121         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:functionals TESTOPTS='-v -d' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_functionals]}
1122 }
1123
1124 test_apps/workbench_integration() {
1125     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1126         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:integration TESTOPTS='-v -d' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_integration]}
1127 }
1128
1129 test_apps/workbench_benchmark() {
1130     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1131         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:benchmark ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
1132 }
1133
1134 test_apps/workbench_profile() {
1135     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1136         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:profile ${testargs[apps/workbench_profile]}
1137 }
1138
1139 install_deps() {
1140     # Install parts needed by test suites
1141     do_install env
1142     do_install cmd/arvados-server go
1143     do_install sdk/cli
1144     do_install sdk/perl
1145     do_install sdk/python pip
1146     do_install sdk/ruby
1147     do_install services/api
1148     do_install services/arv-git-httpd go
1149     do_install services/keepproxy go
1150     do_install services/keepstore go
1151     do_install services/keep-web go
1152     do_install services/ws go
1153 }
1154
1155 install_all() {
1156     do_install env
1157     do_install doc
1158     do_install sdk/ruby
1159     do_install sdk/R
1160     do_install sdk/perl
1161     do_install sdk/cli
1162     do_install services/login-sync
1163     for p in "${pythonstuff[@]}"
1164     do
1165         dir=${p%:py3}
1166         if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
1167             if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
1168                 do_install ${dir} pip
1169             fi
1170         elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
1171             if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
1172                 do_install ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
1173             fi
1174         fi
1175     done
1176     do_install services/api
1177     for g in "${gostuff[@]}"
1178     do
1179         do_install "$g" go
1180     done
1181     do_install apps/workbench
1182 }
1183
1184 test_all() {
1185     stop_services
1186     do_test services/api
1187
1188     # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
1189     # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
1190     if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
1191         rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
1192         exit_cleanly
1193     fi
1194
1195     do_test gofmt
1196     do_test govendor
1197     do_test doc
1198     do_test sdk/ruby
1199     do_test sdk/R
1200     do_test sdk/cli
1201     do_test services/login-sync
1202     do_test sdk/java-v2
1203     do_test services/nodemanager_integration
1204     for p in "${pythonstuff[@]}"
1205     do
1206         dir=${p%:py3}
1207         if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
1208             if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
1209                 do_test ${dir} pip
1210             fi
1211         elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
1212             if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
1213                 do_test ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
1214             fi
1215         fi
1216     done
1217
1218     for g in "${gostuff[@]}"
1219     do
1220         do_test "$g" go
1221     done
1222     do_test apps/workbench_units
1223     do_test apps/workbench_functionals
1224     do_test apps/workbench_integration
1225     do_test apps/workbench_benchmark
1226     do_test apps/workbench_profile
1227 }
1228
1229 help_interactive() {
1230     echo "== Interactive commands:"
1231     echo "TARGET                 (short for 'test DIR')"
1232     echo "test TARGET"
1233     echo "test TARGET:py3        (test with python3)"
1234     echo "test TARGET -check.vv  (pass arguments to test)"
1235     echo "install TARGET"
1236     echo "install env            (go/python libs)"
1237     echo "install deps           (go/python libs + arvados components needed for integration tests)"
1238     echo "reset                  (...services used by integration tests)"
1239     echo "exit"
1240     echo "== Test targets:"
1241     echo "${!testfuncargs[@]}" | tr ' ' '\n' | sort | column
1242 }
1243
1244 initialize
1245
1246 declare -A testfuncargs=()
1247 for g in "${gostuff[@]}"; do
1248     testfuncargs[$g]="$g go"
1249 done
1250 for p in "${pythonstuff[@]}"; do
1251     dir=${p%:py3}
1252     testfuncargs[$dir]="$dir pip $VENVDIR/bin/"
1253     testfuncargs[$dir:py3]="$dir pip $VENV3DIR/bin/"
1254 done
1255
1256 testfuncargs["sdk/cli"]="sdk/cli"
1257
1258 if [[ -z ${interactive} ]]; then
1259     install_all
1260     test_all
1261 else
1262     skip=()
1263     only=()
1264     only_install=()
1265     if [[ -e "$VENVDIR/bin/activate" ]]; then stop_services; fi
1266     setnextcmd() {
1267         if [[ "$TERM" = dumb ]]; then
1268             # assume emacs, or something, is offering a history buffer
1269             # and pre-populating the command will only cause trouble
1270             nextcmd=
1271         elif [[ "$nextcmd" != "install deps" ]]; then
1272             :
1273         elif [[ -e "$VENVDIR/bin/activate" ]]; then
1274             nextcmd="test lib/cmd"
1275         else
1276             nextcmd="install deps"
1277         fi
1278     }
1279     echo
1280     help_interactive
1281     nextcmd="install deps"
1282     setnextcmd
1283     while read -p 'What next? ' -e -i "${nextcmd}" nextcmd; do
1284         read verb target opts <<<"${nextcmd}"
1285         target="${target%/}"
1286         target="${target/\/:/:}"
1287         case "${verb}" in
1288             "exit" | "quit")
1289                 exit_cleanly
1290                 ;;
1291             "reset")
1292                 stop_services
1293                 ;;
1294             "test" | "install")
1295                 case "$target" in
1296                     "")
1297                         help_interactive
1298                         ;;
1299                     all | deps)
1300                         ${verb}_${target}
1301                         ;;
1302                     *)
1303                         testargs["$target"]="${opts}"
1304                         tt="${testfuncargs[${target}]}"
1305                         tt="${tt:-$target}"
1306                         do_$verb $tt
1307                         ;;
1308                 esac
1309                 ;;
1310             "" | "help" | *)
1311                 help_interactive
1312                 ;;
1313         esac
1314         if [[ ${#successes[@]} -gt 0 || ${#failures[@]} -gt 0 ]]; then
1315             report_outcomes
1316             successes=()
1317             failures=()
1318         fi
1319         cd "$WORKSPACE"
1320         setnextcmd
1321     done
1322     echo
1323 fi
1324 exit_cleanly