apps/workbench/config/application.default.yml

   1 # Do not use this file for site configuration. Create application.yml
   2 # instead (see application.yml.example).
   3
   4 <%
   5 # If you change any of the code in this block, you'll probably also want
   6 # to update it in API server's application.default.yml.
   7 def info_cmd(*args, &block)
   8   IO.popen(args, "r", chdir: Rails.root, err: "/dev/null", &block)
   9 end
  10
  11 source_version = ""
  12 local_modified = false
  13 if Rails.env == "production"
  14   # Read the version from our package's git-commit.version file, if available.
  15   begin
  16     source_version = IO.read(Rails.root.join("git-commit.version")).strip
  17   rescue Errno::ENOENT
  18   end
  19 end
  20
  21 if source_version.empty?
  22   begin
  23     status_output = false
  24     info_cmd("git", "status", "-s") do |git_pipe|
  25       git_pipe.each_line do |_|
  26         status_output = true
  27         # Continue reading the pipe so git doesn't get SIGPIPE.
  28       end
  29     end
  30     if $?.success?
  31       info_cmd("git", "log", "-n1", "--format=%H") do |git_pipe|
  32         git_pipe.each_line do |line|
  33           source_version = line.chomp
  34         end
  35       end
  36       local_modified = status_output
  37     end
  38   rescue SystemCallError
  39   end
  40 end
  41 %>
  42
  43 # Below is a sample setting for diagnostics testing.
  44 # Configure workbench URL as "arvados_workbench_url"
  45 # Configure test user tokens as "user_tokens".
  46 #   At this time the tests need an "active" user token.
  47 # Also, configure the pipelines to be executed as "pipelines_to_test".
  48 # For each of the pipelines identified by the name of your choice
  49 #     ("pipeline_1" and "pipeline_2" in this sample), provide the following:
  50 #   template_uuid: is the uuid of the template to be executed
  51 #   input_paths: an array of inputs for the pipeline. Use either a collection's "uuid"
  52 #     or a file's "uuid/file_name" path in this array. If the pipeline does not require
  53 #     any inputs, this can be omitted.
  54 #   max_wait_seconds: max time in seconds to wait for the pipeline run to complete.
  55 #     Default value of 30 seconds is used when this value is not provided.
  56 diagnostics:
  57   arvados_workbench_url: https://localhost:3031
  58   user_tokens:
  59     active: eu33jurqntstmwo05h1jr3eblmi961e802703y6657s8zb14r
  60   pipelines_to_test:
  61     pipeline_1:
  62       template_uuid: zzzzz-p5p6p-rxj8d71854j9idn
  63       input_paths: [zzzzz-4zz18-nz98douzhaa3jh2]
  64       max_wait_seconds: 10
  65     pipeline_2:
  66       template_uuid: zzzzz-p5p6p-1xbobfobk94ppbv
  67       input_paths: [zzzzz-4zz18-nz98douzhaa3jh2, zzzzz-4zz18-gpw9o5wpcti3nib]
  68
  69 # Below is a sample setting for performance testing.
  70 # Configure workbench URL as "arvados_workbench_url"
  71 # Configure test user token as "user_token".
  72 performance:
  73   arvados_workbench_url: https://localhost:3031
  74   user_token: eu33jurqntstmwo05h1jr3eblmi961e802703y6657s8zb14r
  75
  76 development:
  77   cache_classes: false
  78   eager_load: true
  79   consider_all_requests_local: true
  80   action_controller.perform_caching: false
  81   action_mailer.raise_delivery_errors: false
  82   active_support.deprecation: :log
  83   action_dispatch.best_standards_support: :builtin
  84   assets.debug: true
  85   profiling_enabled: true
  86   site_name: Arvados Workbench (dev)
  87   local_modified: "<%= local_modified ? '-modified' : '' %>"
  88
  89   # API server configuration
  90   arvados_login_base: ~
  91   arvados_v1_base: ~
  92   arvados_insecure_https: ~
  93
  94 production:
  95   force_ssl: true
  96   cache_classes: true
  97   eager_load: true
  98   consider_all_requests_local: false
  99   action_controller.perform_caching: true
 100   serve_static_assets: false
 101   assets.compile: false
 102   assets.digest: true
 103   i18n.fallbacks: true
 104   active_support.deprecation: :notify
 105   profiling_enabled: false
 106
 107   arvados_insecure_https: false
 108
 109   data_import_dir: /data/arvados-workbench-upload/data
 110   data_export_dir: /data/arvados-workbench-download/data
 111
 112   # API server configuration
 113   arvados_login_base: ~
 114   arvados_v1_base: ~
 115   arvados_insecure_https: ~
 116
 117   site_name: Arvados Workbench
 118
 119 test:
 120   cache_classes: true
 121   eager_load: false
 122   serve_static_assets: true
 123   static_cache_control: public, max-age=3600
 124   consider_all_requests_local: true
 125   action_controller.perform_caching: false
 126   action_dispatch.show_exceptions: false
 127   action_controller.allow_forgery_protection: false
 128   action_mailer.delivery_method: :test
 129   active_support.deprecation: :stderr
 130   profiling_enabled: true
 131   secret_token: <%= rand(2**256).to_s(36) %>
 132   secret_key_base: <%= rand(2**256).to_s(36) %>
 133
 134   # When you run the Workbench's integration tests, it starts the API
 135   # server as a dependency.  These settings should match the API
 136   # server's Rails defaults.  If you adjust those, change these
 137   # settings in application.yml to match.
 138   arvados_login_base: https://localhost:3000/login
 139   arvados_v1_base: https://localhost:3000/arvados/v1
 140   arvados_insecure_https: true
 141
 142   site_name: Workbench:test
 143
 144   # Enable user profile with one required field
 145   user_profile_form_fields:
 146     - key: organization
 147       type: text
 148       form_field_title: Institution
 149       form_field_description: Your organization
 150       required: true
 151     - key: role
 152       type: select
 153       form_field_title: Your role
 154       form_field_description: Choose the category that best describes your role in your organization.
 155       options:
 156         - Bio-informatician
 157         - Computational biologist
 158         - Biologist or geneticist
 159         - Software developer
 160         - IT
 161         - Other
 162
 163 common:
 164   assets.js_compressor: false
 165   assets.css_compressor: false
 166   data_import_dir: /tmp/arvados-workbench-upload
 167   data_export_dir: /tmp/arvados-workbench-download
 168   arvados_login_base: https://arvados.local/login
 169   arvados_v1_base: https://arvados.local/arvados/v1
 170   arvados_insecure_https: true
 171   activation_contact_link: mailto:info@arvados.org
 172   arvados_docsite: http://doc.arvados.org
 173   arvados_public_data_doc_url: http://arvados.org/projects/arvados/wiki/Public_Pipelines_and_Datasets
 174   arvados_theme: default
 175   show_user_agreement_inline: false
 176   secret_token: ~
 177   secret_key_base: false
 178   default_openid_prefix: https://www.google.com/accounts/o8/id
 179   send_user_setup_notification_email: true
 180
 181   # Scratch directory used by the remote repository browsing
 182   # feature. If it doesn't exist, it (and any missing parents) will be
 183   # created using mkdir_p.
 184   repository_cache: <%= File.expand_path 'tmp/git', Rails.root %>
 185
 186   # Set user_profile_form_fields to enable and configure the user
 187   # profile page. Default is set to false. A commented example with
 188   # full description is provided below.
 189   user_profile_form_fields: false
 190
 191   # Below is a sample setting of user_profile_form_fields config parameter.
 192   # This configuration parameter should be set to either false (to disable) or
 193   # to an array as shown below.
 194   # Configure the list of input fields to be displayed in the profile page
 195   # using the attribute "key" for each of the input fields.
 196   # This sample shows configuration with one required and one optional form fields.
 197   # For each of these input fields:
 198   #   You can specify "type" as "text" or "select".
 199   #   List the "options" to be displayed for each of the "select" menu.
 200   #   Set "required" as "true" for any of these fields to make them required.
 201   # If any of the required fields are missing in the user's profile, the user will be
 202   # redirected to the profile page before they can access any Workbench features.
 203   #user_profile_form_fields:
 204   #  - key: organization
 205   #    type: text
 206   #    form_field_title: Institution/Company
 207   #    form_field_description: Your organization
 208   #    required: true
 209   #  - key: role
 210   #    type: select
 211   #    form_field_title: Your role
 212   #    form_field_description: Choose the category that best describes your role in your organization.
 213   #    options:
 214   #      - Bio-informatician
 215   #      - Computational biologist
 216   #      - Biologist or geneticist
 217   #      - Software developer
 218   #      - IT
 219   #      - Other
 220
 221   # Use "user_profile_form_message" to configure the message you want to display on
 222   # the profile page.
 223   user_profile_form_message: Welcome to Arvados. All <span style="color:red">required fields</span> must be completed before you can proceed.
 224
 225   # source_version
 226   source_version: "<%= source_version[0...8] %>"
 227   local_modified: false
 228
 229   # report notification to and from addresses
 230   issue_reporter_email_from: arvados@example.com
 231   issue_reporter_email_to: arvados@example.com
 232   support_email_address: arvados@example.com
 233
 234   # generic issue email from
 235   email_from: arvados@example.com
 236
 237   # Mimetypes of applications for which the view icon
 238   # would be enabled in a collection's show page.
 239   # It is sufficient to list only applications here.
 240   # No need to list text and image types.
 241   application_mimetypes_with_view_icon: [fasta, go, javascript, json, pdf, python, r, rtf, sam, sh, xml, xsl]
 242
 243   # the maximum number of bytes to load in the log viewer
 244   log_viewer_max_bytes: 1000000
 245
 246   # Set anonymous_user_token to enable anonymous user access. You can get
 247   # the token by running "bundle exec ./script/get_anonymous_user_token.rb"
 248   # in the directory where your API server is running.
 249   anonymous_user_token: false
 250
 251   # when anonymous_user_token is configured, show public projects page
 252   enable_public_projects_page: true
 253
 254   # Ask Arvados API server to compress its response payloads.
 255   api_response_compression: true
 256
 257   # ShellInABox service endpoint URL for a given VM.  If false, do not
 258   # offer web shell logins.
 259   #
 260   # E.g., using a path-based proxy server to forward connections to shell hosts:
 261   # https://webshell.uuid_prefix.arvadosapi.com/%{hostname}
 262   #
 263   # E.g., using a name-based proxy server to forward connections to shell hosts:
 264   # https://%{hostname}.webshell.uuid_prefix.arvadosapi.com/
 265   shell_in_a_box_url: false