build/run-tests.sh

   1 #!/bin/bash
   2 # Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
   3 #
   4 # SPDX-License-Identifier: AGPL-3.0
   5
   6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin.sh
   7
   8 COLUMNS=80
   9 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
  10
  11 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
  12 $(basename $0): Install and test Arvados components.
  13
  14 Exit non-zero if any tests fail.
  15
  16 Syntax:
  17         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
  18
  19 Options:
  20
  21 --skip FOO     Do not test the FOO component.
  22 --skip sanity  Skip initial dev environment sanity checks.
  23 --skip install Do not run any install steps. Just run tests.
  24                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
  25                from a previous invocation if you use this option.
  26 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
  27 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
  28                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
  29 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
  30                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
  31                subsequent invocations.
  32 --repeat N     Repeat each install/test step until it succeeds N times.
  33 --retry        Prompt to retry if an install or test suite fails.
  34 --only-install Run specific install step
  35 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
  36 --interactive  Set up, then prompt for test/install steps to perform.
  37 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
  38 CONFIGSRC=path Dir with config.yml file containing PostgreSQL section for use by tests. (required)
  39 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
  40                Restrict apiserver tests to the given file
  41 sdk/python_test="--test-suite tests.test_keep_locator"
  42                Restrict Python SDK tests to the given class
  43 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
  44                Restrict Workbench tests to the given file
  45 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
  46                Show all log messages, even when tests pass (also works
  47                with services/keepstore_test etc.)
  48 ARVADOS_DEBUG=1
  49                Print more debug messages
  50 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
  51                *_test, and other examples shown above.
  52
  53 Assuming "--skip install" is not given, all components are installed
  54 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
  55 test suites depend on other components being installed, and installing
  56 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
  57
  58 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
  59 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
  60
  61 More information and background:
  62
  63 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
  64
  65 Available tests:
  66
  67 apps/workbench (*)
  68 apps/workbench_units (*)
  69 apps/workbench_functionals (*)
  70 apps/workbench_integration (*)
  71 apps/workbench_benchmark
  72 apps/workbench_profile
  73 cmd/arvados-client
  74 cmd/arvados-server
  75 doc
  76 lib/cli
  77 lib/cmd
  78 lib/controller
  79 lib/controller/federation
  80 lib/controller/railsproxy
  81 lib/controller/router
  82 lib/controller/rpc
  83 lib/crunchstat
  84 lib/cloud
  85 lib/cloud/azure
  86 lib/cloud/cloudtest
  87 lib/dispatchcloud
  88 lib/dispatchcloud/container
  89 lib/dispatchcloud/scheduler
  90 lib/dispatchcloud/ssh_executor
  91 lib/dispatchcloud/worker
  92 lib/service
  93 services/api
  94 services/arv-git-httpd
  95 services/crunchstat
  96 services/dockercleaner
  97 services/fuse
  98 services/fuse:py3
  99 services/health
 100 services/keep-web
 101 services/keepproxy
 102 services/keepstore
 103 services/keep-balance
 104 services/login-sync
 105 services/nodemanager
 106 services/nodemanager_integration
 107 services/crunch-run
 108 services/crunch-dispatch-local
 109 services/crunch-dispatch-slurm
 110 services/ws
 111 sdk/cli
 112 sdk/pam
 113 sdk/pam:py3
 114 sdk/python
 115 sdk/python:py3
 116 sdk/ruby
 117 sdk/go/arvados
 118 sdk/go/arvadosclient
 119 sdk/go/auth
 120 sdk/go/dispatch
 121 sdk/go/keepclient
 122 sdk/go/health
 123 sdk/go/httpserver
 124 sdk/go/manifest
 125 sdk/go/blockdigest
 126 sdk/go/asyncbuf
 127 sdk/go/stats
 128 sdk/go/crunchrunner
 129 sdk/cwl
 130 sdk/R
 131 sdk/java-v2
 132 tools/sync-groups
 133 tools/crunchstat-summary
 134 tools/crunchstat-summary:py3
 135 tools/keep-exercise
 136 tools/keep-rsync
 137 tools/keep-block-check
 138
 139 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
 140     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
 141
 142 EOF
 143
 144 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
 145 # environment that could interfere with the tests.
 146 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
 147
 148 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
 149 # accident.
 150 GITDIR=
 151 GOPATH=
 152 VENVDIR=
 153 VENV3DIR=
 154 PYTHONPATH=
 155 GEMHOME=
 156 PERLINSTALLBASE=
 157 R_LIBS=
 158 export LANG=en_US.UTF-8
 159
 160 short=
 161 only_install=
 162 temp=
 163 temp_preserve=
 164
 165 clear_temp() {
 166     if [[ -z "$temp" ]]; then
 167         # we didn't even get as far as making a temp dir
 168         :
 169     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
 170         rm -rf "$temp"
 171     else
 172         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
 173     fi
 174 }
 175
 176 fatal() {
 177     clear_temp
 178     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
 179     exit 1
 180 }
 181
 182 exit_cleanly() {
 183     trap - INT
 184     if which create-plot-data-from-log.sh >/dev/null; then
 185         create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
 186     fi
 187     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 188     stop_services
 189     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 190     report_outcomes
 191     clear_temp
 192     exit ${#failures}
 193 }
 194
 195 sanity_checks() {
 196     [[ -n "${skip[sanity]}" ]] && return 0
 197     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
 198         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
 199     [[ -n "$CONFIGSRC" ]] \
 200         || fatal "CONFIGSRC environment not set (see: $0 --help)"
 201     [[ -s "$CONFIGSRC/config.yml" ]] \
 202         || fatal "'$CONFIGSRC/config.yml' is empty or not found (see: $0 --help)"
 203     echo Checking dependencies:
 204     echo "locale: ${LANG}"
 205     [[ "$(locale charmap)" = "UTF-8" ]] \
 206         || fatal "Locale '${LANG}' is broken/missing. Try: echo ${LANG} | sudo tee -a /etc/locale.gen && sudo locale-gen"
 207     echo -n 'virtualenv: '
 208     virtualenv --version \
 209         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
 210     echo -n 'ruby: '
 211     ruby -v \
 212         || fatal "No ruby. Install >=2.1.9 (using rbenv, rvm, or source)"
 213     echo -n 'go: '
 214     go version \
 215         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
 216     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 12 ]] \
 217         || fatal "Go >= 1.12 required. See http://golang.org/doc/install"
 218     echo -n 'gcc: '
 219     gcc --version | egrep ^gcc \
 220         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
 221     echo -n 'fuse.h: '
 222     find /usr/include -path '*fuse/fuse.h' | egrep --max-count=1 . \
 223         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
 224     echo -n 'gnutls.h: '
 225     find /usr/include -path '*gnutls/gnutls.h' | egrep --max-count=1 . \
 226         || fatal "No gnutls/gnutls.h. Try: apt-get install libgnutls28-dev"
 227     echo -n 'Python2 pyconfig.h: '
 228     find /usr/include -path '*/python2*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 229         || fatal "No Python2 pyconfig.h. Try: apt-get install python2.7-dev"
 230     echo -n 'Python3 pyconfig.h: '
 231     find /usr/include -path '*/python3*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 232         || fatal "No Python3 pyconfig.h. Try: apt-get install python3-dev"
 233     which netstat \
 234         || fatal "No netstat. Try: apt-get install net-tools"
 235     echo -n 'nginx: '
 236     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
 237         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
 238     echo -n 'perl: '
 239     perl -v | grep version \
 240         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
 241     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
 242         echo -n "perl $mod: "
 243         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
 244             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
 245     done
 246     echo -n 'gitolite: '
 247     which gitolite \
 248         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
 249     echo -n 'npm: '
 250     npm --version \
 251         || fatal "No npm. Try: wget -O- https://nodejs.org/dist/v6.11.2/node-v6.11.2-linux-x64.tar.xz | sudo tar -C /usr/local -xJf - && sudo ln -s ../node-v6.11.2-linux-x64/bin/{node,npm} /usr/local/bin/"
 252     echo -n 'cadaver: '
 253     cadaver --version | grep -w cadaver \
 254           || fatal "No cadaver. Try: apt-get install cadaver"
 255     echo -n 'libattr1 xattr.h: '
 256     find /usr/include -path '*/attr/xattr.h' | egrep --max-count=1 . \
 257         || fatal "No libattr1 xattr.h. Try: apt-get install libattr1-dev"
 258     echo -n 'libcurl curl.h: '
 259     find /usr/include -path '*/curl/curl.h' | egrep --max-count=1 . \
 260         || fatal "No libcurl curl.h. Try: apt-get install libcurl4-gnutls-dev"
 261     echo -n 'libpq libpq-fe.h: '
 262     find /usr/include -path '*/postgresql/libpq-fe.h' | egrep --max-count=1 . \
 263         || fatal "No libpq libpq-fe.h. Try: apt-get install libpq-dev"
 264     echo -n 'postgresql: '
 265     psql --version || fatal "No postgresql. Try: apt-get install postgresql postgresql-client-common"
 266     echo -n 'phantomjs: '
 267     phantomjs --version || fatal "No phantomjs. Try: apt-get install phantomjs"
 268     echo -n 'xvfb: '
 269     which Xvfb || fatal "No xvfb. Try: apt-get install xvfb"
 270     echo -n 'graphviz: '
 271     dot -V || fatal "No graphviz. Try: apt-get install graphviz"
 272     echo -n 'geckodriver: '
 273     geckodriver --version | grep ^geckodriver || echo "No geckodriver. Try: wget -O- https://github.com/mozilla/geckodriver/releases/download/v0.23.0/geckodriver-v0.23.0-linux64.tar.gz | sudo tar -C /usr/local/bin -xzf - geckodriver"
 274
 275     if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
 276       # R SDK stuff
 277       echo -n 'R: '
 278       which Rscript || fatal "No Rscript. Try: apt-get install r-base"
 279       echo -n 'testthat: '
 280       Rscript -e "library('testthat')" || fatal "No testthat. Try: apt-get install r-cran-testthat"
 281       # needed for roxygen2, needed for devtools, needed for R sdk
 282       pkg-config --exists libxml-2.0 || fatal "No libxml2. Try: apt-get install libxml2-dev"
 283       # needed for pkgdown, builds R SDK doc pages
 284       which pandoc || fatal "No pandoc. Try: apt-get install pandoc"
 285     fi
 286 }
 287
 288 rotate_logfile() {
 289   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 290   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
 291   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
 292     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
 293     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 294     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 295   fi
 296 }
 297
 298 declare -a failures
 299 declare -A skip
 300 declare -A only
 301 declare -A testargs
 302 skip[apps/workbench_profile]=1
 303 # nodemanager_integration tests are not reliable, see #12061.
 304 skip[services/nodemanager_integration]=1
 305
 306 while [[ -n "$1" ]]
 307 do
 308     arg="$1"; shift
 309     case "$arg" in
 310         --help)
 311             echo >&2 "$helpmessage"
 312             echo >&2
 313             exit 1
 314             ;;
 315         --skip)
 316             skip[$1]=1; shift
 317             ;;
 318         --only)
 319             only[$1]=1; skip[$1]=""; shift
 320             ;;
 321         --short)
 322             short=1
 323             ;;
 324         --interactive)
 325             interactive=1
 326             ;;
 327         --skip-install)
 328             skip[install]=1
 329             ;;
 330         --only-install)
 331             only_install="$1"; shift
 332             ;;
 333         --temp)
 334             temp="$1"; shift
 335             temp_preserve=1
 336             ;;
 337         --leave-temp)
 338             temp_preserve=1
 339             ;;
 340         --repeat)
 341             repeat=$((${1}+0)); shift
 342             ;;
 343         --retry)
 344             retry=1
 345             ;;
 346         *_test=*)
 347             suite="${arg%%_test=*}"
 348             args="${arg#*=}"
 349             testargs["$suite"]="$args"
 350             ;;
 351         *=*)
 352             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
 353             ;;
 354         *)
 355             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
 356             exit 1
 357             ;;
 358     esac
 359 done
 360
 361 # R SDK installation is very slow (~360s in a clean environment) and only
 362 # required when testing it. Skip that step if it is not needed.
 363 NEED_SDK_R=true
 364
 365 if [[ ${#only[@]} -ne 0 ]] &&
 366    [[ -z "${only['sdk/R']}" && -z "${only['doc']}" ]]; then
 367   NEED_SDK_R=false
 368 fi
 369
 370 if [[ ${skip["sdk/R"]} == 1 && ${skip["doc"]} == 1 ]]; then
 371   NEED_SDK_R=false
 372 fi
 373
 374 if [[ $NEED_SDK_R == false ]]; then
 375         echo "R SDK not needed, it will not be installed."
 376 fi
 377
 378 checkpidfile() {
 379     svc="$1"
 380     pid="$(cat "$WORKSPACE/tmp/${svc}.pid")"
 381     if [[ -z "$pid" ]] || ! kill -0 "$pid"; then
 382         tail $WORKSPACE/tmp/${1}*.log
 383         echo "${svc} pid ${pid} not running"
 384         return 1
 385     fi
 386     echo "${svc} pid ${pid} ok"
 387 }
 388
 389 checkhealth() {
 390     svc="$1"
 391     base=$(python -c "import yaml; print list(yaml.safe_load(file('$ARVADOS_CONFIG'))['Clusters']['zzzzz']['Services']['$1']['InternalURLs'].keys())[0]")
 392     url="$base/_health/ping"
 393     if ! curl -Ss -H "Authorization: Bearer e687950a23c3a9bceec28c6223a06c79" "${url}" | tee -a /dev/stderr | grep '"OK"'; then
 394         echo "${url} failed"
 395         return 1
 396     fi
 397 }
 398
 399 checkdiscoverydoc() {
 400     dd="https://${1}/discovery/v1/apis/arvados/v1/rest"
 401     if ! (set -o pipefail; curl -fsk "$dd" | grep -q ^{ ); then
 402         echo >&2 "ERROR: could not retrieve discovery doc from RailsAPI at $dd"
 403         tail -v $WORKSPACE/services/api/log/test.log
 404         return 1
 405     fi
 406     echo "${dd} ok"
 407 }
 408
 409 start_services() {
 410     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
 411         return 0
 412     fi
 413     . "$VENVDIR/bin/activate"
 414     echo 'Starting API, controller, keepproxy, keep-web, arv-git-httpd, ws, and nginx ssl proxy...'
 415     if [[ ! -d "$WORKSPACE/services/api/log" ]]; then
 416         mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/log"
 417     fi
 418     # Remove empty api.pid file if it exists
 419     if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/api.pid" && ! -s "$WORKSPACE/tmp/api.pid" ]]; then
 420         rm -f "$WORKSPACE/tmp/api.pid"
 421     fi
 422     all_services_stopped=
 423     fail=1
 424
 425     cd "$WORKSPACE" \
 426         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
 427         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
 428         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
 429         && checkpidfile api \
 430         && checkdiscoverydoc $ARVADOS_API_HOST \
 431         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx) \
 432         && checkpidfile nginx \
 433         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_controller \
 434         && checkpidfile controller \
 435         && checkhealth Controller \
 436         && checkdiscoverydoc $ARVADOS_API_HOST \
 437         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
 438         && checkpidfile keepproxy \
 439         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
 440         && checkpidfile keep-web \
 441         && checkhealth WebDAV \
 442         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
 443         && checkpidfile arv-git-httpd \
 444         && checkhealth GitHTTP \
 445         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 446         && checkpidfile ws \
 447         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1 \
 448         && (env | egrep ^ARVADOS) \
 449         && fail=0
 450     deactivate
 451     if [[ $fail != 0 ]]; then
 452         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
 453     fi
 454     return $fail
 455 }
 456
 457 stop_services() {
 458     if [[ -n "$all_services_stopped" ]]; then
 459         return
 460     fi
 461     unset ARVADOS_TEST_API_HOST ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
 462     . "$VENVDIR/bin/activate" || return
 463     cd "$WORKSPACE" \
 464         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 465         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
 466         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 467         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
 468         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy \
 469         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_controller \
 470         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop \
 471         && all_services_stopped=1
 472     deactivate
 473 }
 474
 475 interrupt() {
 476     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
 477     exit_cleanly
 478 }
 479 trap interrupt INT
 480
 481 setup_ruby_environment() {
 482     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 483         source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
 484         using_rvm=true
 485     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 486         source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
 487         using_rvm=true
 488     else
 489         using_rvm=false
 490     fi
 491
 492     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 493         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
 494         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
 495         # the environment to the "current gemset", which would lose
 496         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
 497         # programs (for example, the Workbench test suite could not
 498         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
 499         # rvm gemset and use it for everything.
 500
 501         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
 502             || fatal 'rvm check'
 503
 504         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
 505         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
 506         # complaint about not being in first place already.
 507         rvm use @default 2>/dev/null
 508
 509         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
 510         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
 511         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
 512         # ruby to the caller.
 513         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
 514         rvm use "@${gemset}" --create \
 515             || fatal 'rvm gemset setup'
 516
 517         rvm env
 518     else
 519         # When our "bundle install"s need to install new gems to
 520         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
 521         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
 522         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
 523         # should be installed, and we should leave it alone.)
 524
 525         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
 526             user_gempath="$(gem env gempath)"
 527             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
 528         fi
 529         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
 530
 531         # When we build and install our own gems, we install them in our
 532         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
 533         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
 534         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
 535
 536         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
 537         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
 538         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home"
 539
 540         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
 541         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
 542         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
 543     fi
 544     bundle config || gem install bundler \
 545         || fatal 'install bundler'
 546 }
 547
 548 with_test_gemset() {
 549     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 550         "$@"
 551     else
 552         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
 553     fi
 554 }
 555
 556 gem_uninstall_if_exists() {
 557     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
 558         gem uninstall --force --all --executables "$1"
 559     fi
 560 }
 561
 562 setup_virtualenv() {
 563     local venvdest="$1"; shift
 564     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
 565         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
 566     elif [[ -n "$short" ]]; then
 567         return
 568     fi
 569     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
 570         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
 571         "$venvdest/bin/pip" install --no-cache-dir 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
 572     else
 573         "$venvdest/bin/pip" install --no-cache-dir 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
 574     fi
 575 }
 576
 577 initialize() {
 578     sanity_checks
 579
 580     echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
 581
 582     # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
 583     cd "$WORKSPACE"
 584     find -name '*.pyc' -delete
 585
 586     if [[ -z "$temp" ]]; then
 587         temp="$(mktemp -d)"
 588     fi
 589
 590     # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
 591     for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE R_LIBS
 592     do
 593         if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
 594             eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
 595         fi
 596         if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
 597             mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
 598         fi
 599     done
 600
 601     rm -vf "${WORKSPACE}/tmp/*.log"
 602
 603     export PERLINSTALLBASE
 604     export PERL5LIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5${PERL5LIB:+:$PERL5LIB}"
 605
 606     export R_LIBS
 607
 608     export GOPATH
 609     # Make sure our compiled binaries under test override anything
 610     # else that might be in the environment.
 611     export PATH=$GOPATH/bin:$PATH
 612
 613     # Jenkins config requires that glob tmp/*.log match something. Ensure
 614     # that happens even if we don't end up running services that set up
 615     # logging.
 616     mkdir -p "${WORKSPACE}/tmp/" || fatal "could not mkdir ${WORKSPACE}/tmp"
 617     touch "${WORKSPACE}/tmp/controller.log" || fatal "could not touch ${WORKSPACE}/tmp/controller.log"
 618
 619     unset http_proxy https_proxy no_proxy
 620
 621     # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
 622     # whine a lot.
 623     setup_ruby_environment
 624
 625     echo "PATH is $PATH"
 626 }
 627
 628 install_env() {
 629     (
 630         set -e
 631         mkdir -p "$GOPATH/src/git.curoverse.com"
 632         if [[ ! -h "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" ]]; then
 633             for d in \
 634                 "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/tmp/GOPATH" \
 635                     "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/tmp" \
 636                     "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"; do
 637                 [[ -d "$d" ]] && rmdir "$d"
 638             done
 639         fi
 640         for d in \
 641             "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/arvados" \
 642                 "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"; do
 643             [[ -h "$d" ]] && rm "$d"
 644         done
 645         ln -vsfT "$WORKSPACE" "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"
 646         go get -v github.com/kardianos/govendor
 647         cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"
 648         go get -v -d ...
 649         "$GOPATH/bin/govendor" sync
 650         which goimports >/dev/null || go get golang.org/x/tools/cmd/goimports
 651     ) || fatal "Go setup failed"
 652
 653     setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
 654     . "$VENVDIR/bin/activate"
 655
 656     # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
 657     pip install --no-cache-dir PyYAML future \
 658         || fatal "pip install PyYAML failed"
 659
 660     # Preinstall libcloud if using a fork; otherwise nodemanager "pip
 661     # install" won't pick it up by default.
 662     if [[ -n "$LIBCLOUD_PIN_SRC" ]]; then
 663         pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
 664             || pip install --pre --ignore-installed --no-cache-dir "$LIBCLOUD_PIN_SRC" >/dev/null \
 665             || fatal "pip install apache-libcloud failed"
 666     fi
 667
 668     # Deactivate Python 2 virtualenv
 669     deactivate
 670
 671     # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
 672     # Otherwise, skip dependent tests.
 673     PYTHON3=$(which python3)
 674     if [[ ${?} = 0 ]]; then
 675         setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
 676     else
 677         PYTHON3=
 678         cat >&2 <<EOF
 679
 680 Warning: python3 could not be found. Python 3 tests will be skipped.
 681
 682 EOF
 683     fi
 684
 685     if ! which bundler >/dev/null
 686     then
 687         gem install --user-install bundler || fatal 'Could not install bundler'
 688     fi
 689 }
 690
 691 retry() {
 692     remain="${repeat}"
 693     while :
 694     do
 695         if ${@}; then
 696             if [[ "$remain" -gt 1 ]]; then
 697                 remain=$((${remain}-1))
 698                 title "(repeating ${remain} more times)"
 699             else
 700                 break
 701             fi
 702         elif [[ "$retry" == 1 ]]; then
 703             read -p 'Try again? [Y/n] ' x
 704             if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
 705             then
 706                 break
 707             fi
 708         else
 709             break
 710         fi
 711     done
 712 }
 713
 714 do_test() {
 715     check_arvados_config "$1"
 716
 717     case "${1}" in
 718         apps/workbench_units | apps/workbench_functionals | apps/workbench_integration)
 719             suite=apps/workbench
 720             ;;
 721         services/nodemanager | services/nodemanager_integration)
 722             suite=services/nodemanager_suite
 723             ;;
 724         *)
 725             suite="${1}"
 726             ;;
 727     esac
 728     if [[ -n "${skip[$suite]}" || \
 729               -n "${skip[$1]}" || \
 730               (${#only[@]} -ne 0 && ${only[$suite]} -eq 0 && ${only[$1]} -eq 0) ]]; then
 731         return 0
 732     fi
 733     case "${1}" in
 734         services/api)
 735             stop_services
 736             ;;
 737         gofmt | govendor | doc | lib/cli | lib/cloud/azure | lib/cloud/ec2 | lib/cloud/cloudtest | lib/cmd | lib/dispatchcloud/ssh_executor | lib/dispatchcloud/worker)
 738             # don't care whether services are running
 739             ;;
 740         *)
 741             if ! start_services; then
 742                 title "test $1 -- failed to start services"
 743                 return 1
 744             fi
 745             ;;
 746     esac
 747     retry do_test_once ${@}
 748 }
 749
 750 do_test_once() {
 751     unset result
 752
 753     title "test $1"
 754     timer_reset
 755
 756     result=
 757     if which deactivate >/dev/null; then deactivate; fi
 758     if ! . "$VENVDIR/bin/activate"
 759     then
 760         result=1
 761     elif [[ "$2" == "go" ]]
 762     then
 763         covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
 764         coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
 765         # We do "go get -t" here to catch compilation errors
 766         # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
 767         # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
 768         # compilation errors.
 769         go get -ldflags "-X git.curoverse.com/arvados.git/lib/cmd.version=${ARVADOS_VERSION:-$(git log -n1 --format=%H)-dev}" -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 770             cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 771             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
 772         then
 773             # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
 774             # does:
 775             go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
 776         else
 777             # The above form gets verbose even when testargs is
 778             # empty, so use this form in such cases:
 779             go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 780         fi
 781         result=${result:-$?}
 782         if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
 783         then
 784             go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
 785             rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
 786         fi
 787         [[ $result = 0 ]] && gofmt -e -d *.go
 788     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 789     then
 790         tries=0
 791         cd "$WORKSPACE/$1" && while :
 792         do
 793             tries=$((${tries}+1))
 794             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 795             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 796             if [[ -e "${3}activate" ]]; then
 797                 . "${3}activate"
 798             fi
 799             python setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
 800             result=$?
 801             if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
 802             then
 803                 printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
 804                 continue
 805             else
 806                 break
 807             fi
 808         done
 809     elif [[ "$2" != "" ]]
 810     then
 811         "test_$2"
 812     else
 813         "test_$1"
 814     fi
 815     result=${result:-$?}
 816     checkexit $result "$1 tests"
 817     title "test $1 -- `timer`"
 818     return $result
 819 }
 820
 821 check_arvados_config() {
 822     if [[ "$1" = "env" ]] ; then
 823         return
 824     fi
 825     if [[ -z "$ARVADOS_CONFIG" ]] ; then
 826         # Create config file.  The run_test_server script requires PyYAML,
 827         # so virtualenv needs to be active.  Downstream steps like
 828         # workbench install which require a valid config.yml.
 829         if [[ ! -s "$VENVDIR/bin/activate" ]] ; then
 830             install_env
 831         fi
 832         . "$VENVDIR/bin/activate"
 833         eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py setup_config)
 834         deactivate
 835     fi
 836 }
 837
 838 do_install() {
 839     check_arvados_config "$1"
 840     if [[ -n "${skip[install]}" || ( -n "${only_install}" && "${only_install}" != "${1}" && "${only_install}" != "${2}" ) ]]; then
 841         return 0
 842     fi
 843     retry do_install_once ${@}
 844 }
 845
 846 do_install_once() {
 847     title "install $1"
 848     timer_reset
 849
 850     result=
 851     if which deactivate >/dev/null; then deactivate; fi
 852     if [[ "$1" != "env" ]] && ! . "$VENVDIR/bin/activate"; then
 853         result=1
 854     elif [[ "$2" == "go" ]]
 855     then
 856         go get -ldflags "-X git.curoverse.com/arvados.git/lib/cmd.version=${ARVADOS_VERSION:-$(git log -n1 --format=%H)-dev}" -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 857     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 858     then
 859         # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 860         # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 861
 862         # Need to change to a different directory after creating
 863         # the source dist package to avoid a pip bug.
 864         # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
 865
 866         # Also need to install twice, because if it believes the package is
 867         # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
 868         # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
 869         # install" ensures that we've actually installed the local package
 870         # we just built.
 871         cd "$WORKSPACE/$1" \
 872             && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
 873             && cd "$WORKSPACE" \
 874             && "${3}pip" install --no-cache-dir --quiet "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
 875             && "${3}pip" install --no-cache-dir --quiet --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
 876     elif [[ "$2" != "" ]]
 877     then
 878         "install_$2"
 879     else
 880         "install_$1"
 881     fi
 882     result=${result:-$?}
 883     checkexit $result "$1 install"
 884     title "install $1 -- `timer`"
 885     return $result
 886 }
 887
 888 bundle_install_trylocal() {
 889     (
 890         set -e
 891         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
 892         if ! bundle install --local --no-deployment; then
 893             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
 894             bundle install --no-deployment
 895         fi
 896         bundle package --all
 897     )
 898 }
 899
 900 install_doc() {
 901     cd "$WORKSPACE/doc" \
 902         && bundle_install_trylocal \
 903         && rm -rf .site
 904 }
 905
 906 install_gem() {
 907     gemname=$1
 908     srcpath=$2
 909     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
 910         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
 911         && bundle_install_trylocal \
 912         && gem build "$gemname.gemspec" \
 913         && with_test_gemset gem install --no-document $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
 914 }
 915
 916 install_sdk/ruby() {
 917     install_gem arvados sdk/ruby
 918 }
 919
 920 install_sdk/R() {
 921   if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
 922     cd "$WORKSPACE/sdk/R" \
 923        && Rscript --vanilla install_deps.R
 924   fi
 925 }
 926
 927 install_sdk/perl() {
 928     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
 929         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
 930         && make install INSTALLDIRS=perl
 931 }
 932
 933 install_sdk/cli() {
 934     install_gem arvados-cli sdk/cli
 935 }
 936
 937 install_services/login-sync() {
 938     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
 939 }
 940
 941 install_services/api() {
 942     stop_services
 943     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 944         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 945
 946     rm -f config/environments/test.rb
 947     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
 948
 949     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
 950     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
 951     # is a postgresql superuser.
 952     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 953         && test_database=$(python -c "import yaml; print yaml.safe_load(file('$ARVADOS_CONFIG'))['Clusters']['zzzzz']['PostgreSQL']['Connection']['dbname']") \
 954         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.pid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
 955
 956     mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/tmp/pids"
 957
 958     cert="$WORKSPACE/services/api/tmp/self-signed"
 959     if [[ ! -e "$cert.pem" || "$(date -r "$cert.pem" +%s)" -lt 1512659226 ]]; then
 960         (
 961             dir="$WORKSPACE/services/api/tmp"
 962             set -ex
 963             openssl req -newkey rsa:2048 -nodes -subj '/C=US/ST=State/L=City/CN=localhost' -out "$cert.csr" -keyout "$cert.key" </dev/null
 964             openssl x509 -req -in "$cert.csr" -signkey "$cert.key" -out "$cert.pem" -days 3650 -extfile <(printf 'subjectAltName=DNS:localhost,DNS:::1,DNS:0.0.0.0,DNS:127.0.0.1,IP:::1,IP:0.0.0.0,IP:127.0.0.1')
 965         ) || return 1
 966     fi
 967
 968     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 969         && rm -rf tmp/git \
 970         && mkdir -p tmp/git \
 971         && cd tmp/git \
 972         && tar xf ../../test/test.git.tar \
 973         && mkdir -p internal.git \
 974         && git --git-dir internal.git init \
 975             || return 1
 976
 977
 978     (cd "$WORKSPACE/services/api"
 979      export RAILS_ENV=test
 980      if bundle exec rails db:environment:set ; then
 981         bundle exec rake db:drop
 982      fi
 983      bundle exec rake db:setup \
 984          && bundle exec rake db:fixtures:load
 985     )
 986 }
 987
 988 declare -a pythonstuff
 989 pythonstuff=(
 990     sdk/pam
 991     sdk/python
 992     sdk/python:py3
 993     sdk/cwl
 994     sdk/cwl:py3
 995     services/dockercleaner:py3
 996     services/fuse
 997     services/fuse:py3
 998     services/nodemanager
 999     tools/crunchstat-summary
1000     tools/crunchstat-summary:py3
1001 )
1002
1003 declare -a gostuff
1004 gostuff=($(cd "$WORKSPACE" && git grep -lw func | grep \\.go | sed -e 's/\/[^\/]*$//' | sort -u))
1005
1006 install_apps/workbench() {
1007     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1008         && mkdir -p tmp/cache \
1009         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal \
1010         && RAILS_ENV=test RAILS_GROUPS=assets bundle exec rake npm:install
1011 }
1012
1013 test_doc() {
1014     (
1015         set -e
1016         cd "$WORKSPACE/doc"
1017         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
1018         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
1019         # do much good!
1020         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ bundle exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
1021     )
1022 }
1023
1024 test_gofmt() {
1025     cd "$WORKSPACE" || return 1
1026     dirs=$(ls -d */ | egrep -v 'vendor|tmp')
1027     [[ -z "$(gofmt -e -d $dirs | tee -a /dev/stderr)" ]]
1028 }
1029
1030 test_govendor() {
1031     (
1032         set -e
1033         cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"
1034         # Remove cached source dirs in workdir. Otherwise, they will
1035         # not qualify as +missing or +external below, and we won't be
1036         # able to detect that they're missing from vendor/vendor.json.
1037         rm -rf vendor/*/
1038         go get -v -d ...
1039         "$GOPATH/bin/govendor" sync
1040         if [[ -n $("$GOPATH/bin/govendor" list +unused +missing +external | tee /dev/stderr) ]]; then
1041             echo >&2 "vendor/vendor.json has unused or missing dependencies -- try:
1042
1043 (export GOPATH=\"${GOPATH}\"; cd \$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git && \$GOPATH/bin/govendor add +missing +external && \$GOPATH/bin/govendor remove +unused)
1044
1045 "
1046             return 1
1047         fi
1048     )
1049 }
1050
1051 test_services/api() {
1052     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
1053     cd "$WORKSPACE/services/api" \
1054         && eval env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test TESTOPTS=\'-v -d\' ${testargs[services/api]}
1055 }
1056
1057 test_sdk/ruby() {
1058     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
1059         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
1060 }
1061
1062 test_sdk/R() {
1063   if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
1064     cd "$WORKSPACE/sdk/R" \
1065         && Rscript --vanilla run_test.R
1066   fi
1067 }
1068
1069 test_sdk/cli() {
1070     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
1071         && mkdir -p /tmp/keep \
1072         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
1073 }
1074
1075 test_sdk/java-v2() {
1076     cd "$WORKSPACE/sdk/java-v2" && gradle test
1077 }
1078
1079 test_services/login-sync() {
1080     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
1081         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
1082 }
1083
1084 test_services/nodemanager_integration() {
1085     cd "$WORKSPACE/services/nodemanager" \
1086         && tests/integration_test.py ${testargs[services/nodemanager_integration]}
1087 }
1088
1089 test_apps/workbench_units() {
1090     local TASK="test:units"
1091     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1092         && eval env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake ${TASK} TESTOPTS=\'-v -d\' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_units]}
1093 }
1094
1095 test_apps/workbench_functionals() {
1096     local TASK="test:functionals"
1097     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1098         && eval env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake ${TASK} TESTOPTS=\'-v -d\' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_functionals]}
1099 }
1100
1101 test_apps/workbench_integration() {
1102     local TASK="test:integration"
1103     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1104         && eval env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake ${TASK} TESTOPTS=\'-v -d\' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_integration]}
1105 }
1106
1107 test_apps/workbench_benchmark() {
1108     local TASK="test:benchmark"
1109     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1110         && eval env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake ${TASK} ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
1111 }
1112
1113 test_apps/workbench_profile() {
1114     local TASK="test:profile"
1115     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1116         && eval env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake ${TASK} ${testargs[apps/workbench_profile]}
1117 }
1118
1119 install_deps() {
1120     # Install parts needed by test suites
1121     do_install env
1122     do_install cmd/arvados-server go
1123     do_install sdk/cli
1124     do_install sdk/perl
1125     do_install sdk/python pip
1126     do_install sdk/ruby
1127     do_install services/api
1128     do_install services/arv-git-httpd go
1129     do_install services/keepproxy go
1130     do_install services/keepstore go
1131     do_install services/keep-web go
1132     do_install services/ws go
1133 }
1134
1135 install_all() {
1136     do_install env
1137     do_install doc
1138     do_install sdk/ruby
1139     do_install sdk/R
1140     do_install sdk/perl
1141     do_install sdk/cli
1142     do_install services/login-sync
1143     for p in "${pythonstuff[@]}"
1144     do
1145         dir=${p%:py3}
1146         if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
1147             if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
1148                 do_install ${dir} pip
1149             fi
1150         elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
1151             if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
1152                 do_install ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
1153             fi
1154         fi
1155     done
1156     for g in "${gostuff[@]}"
1157     do
1158         do_install "$g" go
1159     done
1160     do_install services/api
1161     do_install apps/workbench
1162 }
1163
1164 test_all() {
1165     stop_services
1166     do_test services/api
1167
1168     # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
1169     # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
1170     if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
1171         rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
1172         exit_cleanly
1173     fi
1174
1175     do_test gofmt
1176     do_test govendor
1177     do_test doc
1178     do_test sdk/ruby
1179     do_test sdk/R
1180     do_test sdk/cli
1181     do_test services/login-sync
1182     do_test sdk/java-v2
1183     do_test services/nodemanager_integration
1184     for p in "${pythonstuff[@]}"
1185     do
1186         dir=${p%:py3}
1187         if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
1188             if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
1189                 do_test ${dir} pip
1190             fi
1191         elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
1192             if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
1193                 do_test ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
1194             fi
1195         fi
1196     done
1197
1198     for g in "${gostuff[@]}"
1199     do
1200         do_test "$g" go
1201     done
1202     do_test apps/workbench_units
1203     do_test apps/workbench_functionals
1204     do_test apps/workbench_integration
1205     do_test apps/workbench_benchmark
1206     do_test apps/workbench_profile
1207 }
1208
1209 help_interactive() {
1210     echo "== Interactive commands:"
1211     echo "TARGET                 (short for 'test DIR')"
1212     echo "test TARGET"
1213     echo "test TARGET:py3        (test with python3)"
1214     echo "test TARGET -check.vv  (pass arguments to test)"
1215     echo "install TARGET"
1216     echo "install env            (go/python libs)"
1217     echo "install deps           (go/python libs + arvados components needed for integration tests)"
1218     echo "reset                  (...services used by integration tests)"
1219     echo "exit"
1220     echo "== Test targets:"
1221     echo "${!testfuncargs[@]}" | tr ' ' '\n' | sort | column
1222 }
1223
1224 initialize
1225
1226 declare -A testfuncargs=()
1227 for g in "${gostuff[@]}"; do
1228     testfuncargs[$g]="$g go"
1229 done
1230 for p in "${pythonstuff[@]}"; do
1231     dir=${p%:py3}
1232     testfuncargs[$dir]="$dir pip $VENVDIR/bin/"
1233     testfuncargs[$dir:py3]="$dir pip $VENV3DIR/bin/"
1234 done
1235
1236 testfuncargs["sdk/cli"]="sdk/cli"
1237 testfuncargs["sdk/R"]="sdk/R"
1238 testfuncargs["sdk/java-v2"]="sdk/java-v2"
1239 testfuncargs["apps/workbench_units"]="apps/workbench_units"
1240 testfuncargs["apps/workbench_functionals"]="apps/workbench_functionals"
1241 testfuncargs["apps/workbench_integration"]="apps/workbench_integration"
1242 testfuncargs["apps/workbench_benchmark"]="apps/workbench_benchmark"
1243 testfuncargs["apps/workbench_profile"]="apps/workbench_profile"
1244
1245 if [[ -z ${interactive} ]]; then
1246     install_all
1247     test_all
1248 else
1249     skip=()
1250     only=()
1251     only_install=()
1252     if [[ -e "$VENVDIR/bin/activate" ]]; then stop_services; fi
1253     setnextcmd() {
1254         if [[ "$TERM" = dumb ]]; then
1255             # assume emacs, or something, is offering a history buffer
1256             # and pre-populating the command will only cause trouble
1257             nextcmd=
1258         elif [[ ! -e "$VENVDIR/bin/activate" ]]; then
1259             nextcmd="install deps"
1260         else
1261             nextcmd=""
1262         fi
1263     }
1264     echo
1265     help_interactive
1266     nextcmd="install deps"
1267     setnextcmd
1268     HISTFILE="$WORKSPACE/tmp/.history"
1269     history -r
1270     while read -p 'What next? ' -e -i "$nextcmd" nextcmd; do
1271         history -s "$nextcmd"
1272         history -w
1273         read verb target opts <<<"${nextcmd}"
1274         target="${target%/}"
1275         target="${target/\/:/:}"
1276         case "${verb}" in
1277             "exit" | "quit")
1278                 exit_cleanly
1279                 ;;
1280             "reset")
1281                 stop_services
1282                 ;;
1283             "test" | "install")
1284                 case "$target" in
1285                     "")
1286                         help_interactive
1287                         ;;
1288                     all | deps)
1289                         ${verb}_${target}
1290                         ;;
1291                     *)
1292                         testargs["$target"]="${opts}"
1293                         tt="${testfuncargs[${target}]}"
1294                         tt="${tt:-$target}"
1295                         do_$verb $tt
1296                         ;;
1297                 esac
1298                 ;;
1299             "" | "help" | *)
1300                 help_interactive
1301                 ;;
1302         esac
1303         if [[ ${#successes[@]} -gt 0 || ${#failures[@]} -gt 0 ]]; then
1304             report_outcomes
1305             successes=()
1306             failures=()
1307         fi
1308         cd "$WORKSPACE"
1309         setnextcmd
1310     done
1311     echo
1312 fi
1313 exit_cleanly