build/run-tests.sh

   1 #!/bin/bash
   2 # Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
   3 #
   4 # SPDX-License-Identifier: AGPL-3.0
   5
   6 COLUMNS=80
   7 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
   8
   9 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
  10 $(basename $0): Install and test Arvados components.
  11
  12 Exit non-zero if any tests fail.
  13
  14 Syntax:
  15         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
  16
  17 Options:
  18
  19 --skip FOO     Do not test the FOO component.
  20 --skip sanity  Skip initial dev environment sanity checks.
  21 --skip install Do not run any install steps. Just run tests.
  22                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
  23                from a previous invocation if you use this option.
  24 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
  25 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
  26                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
  27 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
  28                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
  29                subsequent invocations.
  30 --repeat N     Repeat each install/test step until it succeeds N times.
  31 --retry        Prompt to retry if an install or test suite fails.
  32 --only-install Run specific install step
  33 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
  34 --interactive  Set up, then prompt for test/install steps to perform.
  35 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
  36 CONFIGSRC=path Dir with config.yml file containing PostgreSQL section for use by tests.
  37 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
  38                Restrict apiserver tests to the given file
  39 sdk/python_test="--test-suite tests.test_keep_locator"
  40                Restrict Python SDK tests to the given class
  41 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
  42                Restrict Workbench tests to the given file
  43 services/githttpd_test="-check.vv"
  44                Show all log messages, even when tests pass (also works
  45                with services/keepstore_test etc.)
  46 ARVADOS_DEBUG=1
  47                Print more debug messages
  48 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
  49                *_test, and other examples shown above.
  50
  51 Assuming "--skip install" is not given, all components are installed
  52 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
  53 test suites depend on other components being installed, and installing
  54 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
  55
  56 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
  57 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
  58
  59 More information and background:
  60
  61 https://dev.arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
  62
  63 Available tests:
  64
  65 apps/workbench (*)
  66 apps/workbench_units (*)
  67 apps/workbench_functionals (*)
  68 apps/workbench_integration (*)
  69 apps/workbench_benchmark
  70 apps/workbench_profile
  71 cmd/arvados-client
  72 cmd/arvados-package
  73 cmd/arvados-server
  74 doc
  75 lib/cli
  76 lib/cmd
  77 lib/controller
  78 lib/controller/federation
  79 lib/controller/railsproxy
  80 lib/controller/router
  81 lib/controller/rpc
  82 lib/crunchstat
  83 lib/crunch-run
  84 lib/cloud
  85 lib/cloud/azure
  86 lib/cloud/cloudtest
  87 lib/dispatchcloud
  88 lib/dispatchcloud/container
  89 lib/dispatchcloud/scheduler
  90 lib/dispatchcloud/sshexecutor
  91 lib/dispatchcloud/worker
  92 lib/mount
  93 lib/pam
  94 lib/service
  95 services/api
  96 services/githttpd
  97 services/dockercleaner
  98 services/fuse
  99 services/fuse:py3
 100 services/health
 101 services/keep-web
 102 services/keepproxy
 103 services/keepstore
 104 services/keep-balance
 105 services/login-sync
 106 services/crunch-dispatch-local
 107 services/crunch-dispatch-slurm
 108 services/workbench2_units
 109 services/workbench2_integration
 110 services/ws
 111 sdk/cli
 112 sdk/python
 113 sdk/python:py3
 114 sdk/ruby-google-api-client
 115 sdk/ruby
 116 sdk/go/arvados
 117 sdk/go/arvadosclient
 118 sdk/go/auth
 119 sdk/go/dispatch
 120 sdk/go/keepclient
 121 sdk/go/health
 122 sdk/go/httpserver
 123 sdk/go/manifest
 124 sdk/go/blockdigest
 125 sdk/go/asyncbuf
 126 sdk/go/stats
 127 sdk/go/crunchrunner
 128 sdk/cwl:py3
 129 sdk/R
 130 sdk/java-v2
 131 tools/sync-groups
 132 tools/crunchstat-summary
 133 tools/crunchstat-summary:py3
 134 tools/keep-exercise
 135 tools/keep-rsync
 136 tools/keep-block-check
 137
 138 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
 139     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
 140
 141 EOF
 142
 143 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
 144 # environment that could interfere with the tests.
 145 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
 146
 147 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
 148 # accident.
 149 GITDIR=
 150 GOPATH=
 151 VENVDIR=
 152 VENV3DIR=
 153 PYTHONPATH=
 154 GEMHOME=
 155 R_LIBS=
 156 export LANG=en_US.UTF-8
 157
 158 short=
 159 only_install=
 160 temp=
 161 temp_preserve=
 162
 163 ignore_sigint=
 164
 165 clear_temp() {
 166     if [[ -z "$temp" ]]; then
 167         # we did not even get as far as making a temp dir
 168         :
 169     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
 170         # Go creates readonly dirs in the module cache, which cause
 171         # "rm -rf" to fail unless we chmod first.
 172         chmod -R u+w "$temp"
 173         rm -rf "$temp"
 174     else
 175         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
 176     fi
 177 }
 178
 179 fatal() {
 180     clear_temp
 181     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
 182     exit 1
 183 }
 184
 185 exit_cleanly() {
 186     trap - INT
 187     if which create-plot-data-from-log.sh >/dev/null; then
 188         create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
 189     fi
 190     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 191     stop_services
 192     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 193     report_outcomes
 194     clear_temp
 195     exit ${#failures}
 196 }
 197
 198 sanity_checks() {
 199     [[ -n "${skip[sanity]}" ]] && return 0
 200     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
 201         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
 202     [[ -z "$CONFIGSRC" ]] || [[ -s "$CONFIGSRC/config.yml" ]] \
 203         || fatal "CONFIGSRC is $CONFIGSRC but '$CONFIGSRC/config.yml' is empty or not found (see: $0 --help)"
 204     echo Checking dependencies:
 205     echo "locale: ${LANG}"
 206     [[ "$(locale charmap)" = "UTF-8" ]] \
 207         || fatal "Locale '${LANG}' is broken/missing. Try: echo ${LANG} | sudo tee -a /etc/locale.gen && sudo locale-gen"
 208     echo -n 'ruby: '
 209     ruby -v \
 210         || fatal "No ruby. Install >=2.1.9 (using rbenv, rvm, or source)"
 211     echo -n 'go: '
 212     go version \
 213         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
 214     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 12 ]] \
 215         || fatal "Go >= 1.12 required. See http://golang.org/doc/install"
 216     echo -n 'gcc: '
 217     gcc --version | egrep ^gcc \
 218         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
 219     echo -n 'fuse.h: '
 220     find /usr/include -path '*fuse/fuse.h' | egrep --max-count=1 . \
 221         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
 222     echo -n 'gnutls.h: '
 223     find /usr/include -path '*gnutls/gnutls.h' | egrep --max-count=1 . \
 224         || fatal "No gnutls/gnutls.h. Try: apt-get install libgnutls28-dev"
 225     echo -n 'virtualenv: '
 226     python3 -m venv -h | egrep --max-count=1 . \
 227         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install python3-venv"
 228     echo -n 'Python3 pyconfig.h: '
 229     find /usr/include -path '*/python3*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 230         || fatal "No Python3 pyconfig.h. Try: apt-get install python3-dev"
 231     which netstat \
 232         || fatal "No netstat. Try: apt-get install net-tools"
 233     echo -n 'nginx: '
 234     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
 235         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
 236     echo -n 'gitolite: '
 237     which gitolite \
 238         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
 239     echo -n 'npm: '
 240     npm --version \
 241         || fatal "No npm. Try: wget -O- https://nodejs.org/dist/v10.23.1/node-v10.23.1-linux-x64.tar.xz | sudo tar -C /usr/local -xJf - && sudo ln -s ../node-v10.23.1-linux-x64/bin/{node,npm} /usr/local/bin/"
 242     echo -n 'cadaver: '
 243     cadaver --version | grep -w cadaver \
 244           || fatal "No cadaver. Try: apt-get install cadaver"
 245     echo -n 'libattr1 xattr.h: '
 246     find /usr/include -path '*/attr/xattr.h' | egrep --max-count=1 . \
 247         || fatal "No libattr1 xattr.h. Try: apt-get install libattr1-dev"
 248     echo -n 'libcurl curl.h: '
 249     find /usr/include -path '*/curl/curl.h' | egrep --max-count=1 . \
 250         || fatal "No libcurl curl.h. Try: apt-get install libcurl4-gnutls-dev"
 251     echo -n 'libpq libpq-fe.h: '
 252     find /usr/include -path '*/postgresql/libpq-fe.h' | egrep --max-count=1 . \
 253         || fatal "No libpq libpq-fe.h. Try: apt-get install libpq-dev"
 254     echo -n 'libpam pam_appl.h: '
 255     find /usr/include -path '*/security/pam_appl.h' | egrep --max-count=1 . \
 256         || fatal "No libpam pam_appl.h. Try: apt-get install libpam0g-dev"
 257     echo -n 'postgresql: '
 258     psql --version || fatal "No postgresql. Try: apt-get install postgresql postgresql-client-common"
 259     echo -n 'phantomjs: '
 260     phantomjs --version || fatal "No phantomjs. Try: apt-get install phantomjs"
 261     echo -n 'xvfb: '
 262     which Xvfb || fatal "No xvfb. Try: apt-get install xvfb"
 263     echo -n 'graphviz: '
 264     dot -V || fatal "No graphviz. Try: apt-get install graphviz"
 265     echo -n 'geckodriver: '
 266     geckodriver --version | grep ^geckodriver || echo "No geckodriver. Try: arvados-server install"
 267     echo -n 'singularity: '
 268     singularity --version || fatal "No singularity. Try: arvados-server install"
 269     echo -n 'docker client: '
 270     docker --version || echo "No docker client. Try: arvados-server install"
 271     echo -n 'docker server: '
 272     docker info --format='{{.ServerVersion}}' || echo "No docker server. Try: arvados-server install"
 273
 274     if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
 275       # R SDK stuff
 276       echo -n 'R: '
 277       which Rscript || fatal "No Rscript. Try: apt-get install r-base"
 278       echo -n 'testthat: '
 279       Rscript -e "library('testthat')" || fatal "No testthat. Try: apt-get install r-cran-testthat"
 280       # needed for roxygen2, needed for devtools, needed for R sdk
 281       pkg-config --exists libxml-2.0 || fatal "No libxml2. Try: apt-get install libxml2-dev"
 282       # needed for pkgdown, builds R SDK doc pages
 283       which pandoc || fatal "No pandoc. Try: apt-get install pandoc"
 284     fi
 285     echo 'procs with /dev/fuse open:'
 286     find /proc/*/fd -lname /dev/fuse 2>/dev/null | cut -d/ -f3 | xargs --no-run-if-empty ps -lywww
 287     echo 'grep fuse /proc/self/mountinfo:'
 288     grep fuse /proc/self/mountinfo
 289 }
 290
 291 rotate_logfile() {
 292   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 293   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
 294   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
 295     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
 296     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 297     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 298   fi
 299 }
 300
 301 declare -a failures
 302 declare -A skip
 303 declare -A only
 304 declare -A testargs
 305 skip[apps/workbench_profile]=1
 306
 307 while [[ -n "$1" ]]
 308 do
 309     arg="$1"; shift
 310     case "$arg" in
 311         --help)
 312             echo >&2 "$helpmessage"
 313             echo >&2
 314             exit 1
 315             ;;
 316         --skip)
 317             skip[$1]=1; shift
 318             ;;
 319         --only)
 320             only[$1]=1; skip[$1]=""; shift
 321             ;;
 322         --short)
 323             short=1
 324             ;;
 325         --interactive)
 326             interactive=1
 327             ;;
 328         --skip-install)
 329             skip[install]=1
 330             ;;
 331         --only-install)
 332             only_install="$1"; shift
 333             ;;
 334         --temp)
 335             temp="$1"; shift
 336             temp_preserve=1
 337             ;;
 338         --leave-temp)
 339             temp_preserve=1
 340             ;;
 341         --repeat)
 342             repeat=$((${1}+0)); shift
 343             ;;
 344         --retry)
 345             retry=1
 346             ;;
 347         *_test=*)
 348             suite="${arg%%_test=*}"
 349             args="${arg#*=}"
 350             testargs["$suite"]="$args"
 351             ;;
 352         *=*)
 353             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
 354             ;;
 355         *)
 356             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
 357             exit 1
 358             ;;
 359     esac
 360 done
 361
 362 # R SDK installation is very slow (~360s in a clean environment) and only
 363 # required when testing it. Skip that step if it is not needed.
 364 NEED_SDK_R=true
 365
 366 if [[ ${#only[@]} -ne 0 ]] &&
 367    [[ -z "${only['sdk/R']}" && -z "${only['doc']}" ]]; then
 368   NEED_SDK_R=false
 369 fi
 370
 371 if [[ ${skip["sdk/R"]} == 1 && ${skip["doc"]} == 1 ]]; then
 372   NEED_SDK_R=false
 373 fi
 374
 375 if [[ $NEED_SDK_R == false ]]; then
 376         echo "R SDK not needed, it will not be installed."
 377 fi
 378
 379 checkpidfile() {
 380     svc="$1"
 381     pid="$(cat "$WORKSPACE/tmp/${svc}.pid")"
 382     if [[ -z "$pid" ]] || ! kill -0 "$pid"; then
 383         tail $WORKSPACE/tmp/${1}*.log
 384         echo "${svc} pid ${pid} not running"
 385         return 1
 386     fi
 387     echo "${svc} pid ${pid} ok"
 388 }
 389
 390 checkhealth() {
 391     svc="$1"
 392     base=$("${VENV3DIR}/bin/python3" -c "import yaml; print(list(yaml.safe_load(open('$ARVADOS_CONFIG','r'))['Clusters']['zzzzz']['Services']['$1']['InternalURLs'].keys())[0])")
 393     url="$base/_health/ping"
 394     if ! curl -Ss -H "Authorization: Bearer e687950a23c3a9bceec28c6223a06c79" "${url}" | tee -a /dev/stderr | grep '"OK"'; then
 395         echo "${url} failed"
 396         return 1
 397     fi
 398 }
 399
 400 checkdiscoverydoc() {
 401     dd="https://${1}/discovery/v1/apis/arvados/v1/rest"
 402     if ! (set -o pipefail; curl -fsk "$dd" | grep -q ^{ ); then
 403         echo >&2 "ERROR: could not retrieve discovery doc from RailsAPI at $dd"
 404         tail -v $WORKSPACE/tmp/railsapi.log
 405         return 1
 406     fi
 407     echo "${dd} ok"
 408 }
 409
 410 start_services() {
 411     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
 412         return 0
 413     fi
 414     . "$VENV3DIR/bin/activate"
 415     echo 'Starting API, controller, keepproxy, keep-web, githttpd, ws, and nginx ssl proxy...'
 416     if [[ ! -d "$WORKSPACE/services/api/log" ]]; then
 417         mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/log"
 418     fi
 419     # Remove empty api.pid file if it exists
 420     if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/api.pid" && ! -s "$WORKSPACE/tmp/api.pid" ]]; then
 421         rm -f "$WORKSPACE/tmp/api.pid"
 422     fi
 423     all_services_stopped=
 424     fail=1
 425
 426     cd "$WORKSPACE" \
 427         && eval $(python3 sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
 428         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
 429         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
 430         && checkpidfile api \
 431         && checkdiscoverydoc $ARVADOS_API_HOST \
 432         && eval $(python3 sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx) \
 433         && checkpidfile nginx \
 434         && python3 sdk/python/tests/run_test_server.py start_controller \
 435         && checkpidfile controller \
 436         && checkhealth Controller \
 437         && checkdiscoverydoc $ARVADOS_API_HOST \
 438         && python3 sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
 439         && checkpidfile keepproxy \
 440         && python3 sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
 441         && checkpidfile keep-web \
 442         && checkhealth WebDAV \
 443         && python3 sdk/python/tests/run_test_server.py start_githttpd \
 444         && checkpidfile githttpd \
 445         && checkhealth GitHTTP \
 446         && python3 sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 447         && checkpidfile ws \
 448         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1 \
 449         && (env | egrep ^ARVADOS) \
 450         && fail=0
 451     deactivate
 452     if [[ $fail != 0 ]]; then
 453         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
 454     fi
 455     return $fail
 456 }
 457
 458 stop_services() {
 459     if [[ -n "$all_services_stopped" ]]; then
 460         return
 461     fi
 462     unset ARVADOS_TEST_API_HOST ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
 463     . "$VENV3DIR/bin/activate" || return
 464     cd "$WORKSPACE" \
 465         && python3 sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 466         && python3 sdk/python/tests/run_test_server.py stop_githttpd \
 467         && python3 sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 468         && python3 sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
 469         && python3 sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy \
 470         && python3 sdk/python/tests/run_test_server.py stop_controller \
 471         && python3 sdk/python/tests/run_test_server.py stop \
 472         && all_services_stopped=1
 473     deactivate
 474     unset ARVADOS_CONFIG
 475 }
 476
 477 interrupt() {
 478     if [[ -n "$ignore_sigint" ]]; then
 479         echo >&2 "ignored SIGINT"
 480         return
 481     fi
 482     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
 483     exit_cleanly
 484 }
 485 trap interrupt INT
 486
 487 setup_ruby_environment() {
 488     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 489         source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
 490         using_rvm=true
 491     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 492         source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
 493         using_rvm=true
 494     else
 495         using_rvm=false
 496     fi
 497
 498     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 499         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
 500         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
 501         # the environment to the "current gemset", which would lose
 502         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
 503         # programs (for example, the Workbench test suite could not
 504         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
 505         # rvm gemset and use it for everything.
 506
 507         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
 508             || fatal 'rvm check'
 509
 510         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
 511         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
 512         # complaint about not being in first place already.
 513         rvm use @default 2>/dev/null
 514
 515         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
 516         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
 517         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
 518         # ruby to the caller.
 519         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
 520         rvm use "@${gemset}" --create \
 521             || fatal 'rvm gemset setup'
 522
 523         rvm env
 524         (bundle version | grep -q 2.2.19) || gem install --no-document bundler -v 2.2.19
 525         bundle="$(which bundle)"
 526         echo "$bundle"
 527         "$bundle" version | grep 2.2.19 || fatal 'install bundler'
 528     else
 529         # When our "bundle install"s need to install new gems to
 530         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
 531         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
 532         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
 533         # should be installed, and we should leave it alone.)
 534
 535         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
 536             user_gempath="$(gem env gempath)"
 537             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
 538         fi
 539         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
 540
 541         # When we build and install our own gems, we install them in our
 542         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
 543         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
 544         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
 545
 546         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
 547         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
 548         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home:$(gem env gempath)"
 549
 550         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
 551         echo "Will install bundler and arvados gems to $tmpdir_gem_home"
 552         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
 553         bundle="bundle"
 554         (
 555             export HOME=$GEMHOME
 556             versions=(2.2.19)
 557             for v in ${versions[@]}; do
 558                 if ! gem list --installed --version "${v}" bundler >/dev/null; then
 559                     gem install --no-document --user $(for v in ${versions[@]}; do echo bundler:${v}; done)
 560                     break
 561                 fi
 562             done
 563             "$bundle" version | tee /dev/stderr | grep -q 'version 2'
 564         ) || fatal 'install bundler'
 565         if test -d /var/lib/arvados-arvbox/ ; then
 566             # Inside arvbox, use bundler-installed binstubs.  The
 567             # system bundler and rail's own bin/bundle refuse to work.
 568             # I don't know why.
 569             bundle=binstubs/bundle
 570         fi
 571     fi
 572 }
 573
 574 with_test_gemset() {
 575     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 576         "$@"
 577     else
 578         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
 579     fi
 580 }
 581
 582 gem_uninstall_if_exists() {
 583     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
 584         gem uninstall --force --all --executables "$1"
 585     fi
 586 }
 587
 588 setup_virtualenv() {
 589     local venvdest="$1"; shift
 590     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip3" ]]; then
 591         python3 -m venv "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
 592     elif [[ -n "$short" ]]; then
 593         return
 594     fi
 595     "$venvdest/bin/pip3" install --no-cache-dir 'setuptools>=68' 'pip>=20'
 596 }
 597
 598 initialize() {
 599     # If dependencies like ruby, go, etc. are installed in
 600     # /var/lib/arvados -- presumably by "arvados-server install" --
 601     # then we want to use those versions, instead of whatever happens
 602     # to be installed in /usr.
 603     PATH="/var/lib/arvados/bin:${PATH}"
 604     sanity_checks
 605
 606     echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
 607
 608     # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
 609     cd "$WORKSPACE"
 610     find -name '*.pyc' -delete
 611
 612     if [[ -z "$temp" ]]; then
 613         temp="$(mktemp -d)"
 614     fi
 615
 616     # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
 617     for tmpdir in VENV3DIR GOPATH GEMHOME R_LIBS
 618     do
 619         if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
 620             eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
 621         fi
 622         if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
 623             mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
 624         fi
 625     done
 626
 627     rm -vf "${WORKSPACE}/tmp/*.log"
 628
 629     export R_LIBS
 630
 631     export GOPATH
 632     # Make sure our compiled binaries under test override anything
 633     # else that might be in the environment.
 634     export PATH=$GOPATH/bin:$PATH
 635
 636     # Jenkins config requires that glob tmp/*.log match something. Ensure
 637     # that happens even if we don't end up running services that set up
 638     # logging.
 639     mkdir -p "${WORKSPACE}/tmp/" || fatal "could not mkdir ${WORKSPACE}/tmp"
 640     touch "${WORKSPACE}/tmp/controller.log" || fatal "could not touch ${WORKSPACE}/tmp/controller.log"
 641
 642     unset http_proxy https_proxy no_proxy
 643
 644     # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
 645     # whine a lot.
 646     setup_ruby_environment
 647
 648     echo "PATH is $PATH"
 649 }
 650
 651 install_env() {
 652     go mod download || fatal "Go deps failed"
 653     which goimports >/dev/null || go install golang.org/x/tools/cmd/goimports@latest || fatal "Go setup failed"
 654
 655     setup_virtualenv "$VENV3DIR"
 656     . "$VENV3DIR/bin/activate"
 657
 658     # PyYAML is a test requirement used by run_test_server.py and needed for
 659     # other, non-Python tests.
 660     # pdoc is needed to build PySDK documentation.
 661     # We run `setup.py build` first to generate _version.py.
 662     env -C "$WORKSPACE/sdk/python" python3 setup.py build \
 663         && python3 -m pip install "$WORKSPACE/sdk/python" \
 664         && python3 -m pip install PyYAML pdoc \
 665         || fatal "installing Python SDK and related dependencies failed"
 666 }
 667
 668 retry() {
 669     remain="${repeat}"
 670     while :
 671     do
 672         if ${@}; then
 673             if [[ "$remain" -gt 1 ]]; then
 674                 remain=$((${remain}-1))
 675                 title "(repeating ${remain} more times)"
 676             else
 677                 break
 678             fi
 679         elif [[ "$retry" == 1 ]]; then
 680             read -p 'Try again? [Y/n] ' x
 681             if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
 682             then
 683                 break
 684             fi
 685         else
 686             break
 687         fi
 688     done
 689 }
 690
 691 do_test() {
 692     case "${1}" in
 693         apps/workbench_units | apps/workbench_functionals | apps/workbench_integration)
 694             suite=apps/workbench
 695             ;;
 696         services/workbench2_units | services/workbench2_integration)
 697             suite=services/workbench2
 698             ;;
 699         *)
 700             suite="${1}"
 701             ;;
 702     esac
 703     if [[ -n "${skip[$suite]}" || \
 704               -n "${skip[$1]}" || \
 705               (${#only[@]} -ne 0 && ${only[$suite]} -eq 0 && ${only[$1]} -eq 0) ]]; then
 706         return 0
 707     fi
 708     case "${1}" in
 709         services/api)
 710             stop_services
 711             check_arvados_config "$1"
 712             ;;
 713         gofmt \
 714             | cmd/arvados-package \
 715             | doc \
 716             | lib/boot \
 717             | lib/cli \
 718             | lib/cloud/azure \
 719             | lib/cloud/cloudtest \
 720             | lib/cloud/ec2 \
 721             | lib/cmd \
 722             | lib/dispatchcloud/sshexecutor \
 723             | lib/dispatchcloud/worker \
 724             | lib/install \
 725             | services/workbench2_integration \
 726             | services/workbench2_units \
 727             )
 728             check_arvados_config "$1"
 729             # don't care whether services are running
 730             ;;
 731         *)
 732             check_arvados_config "$1"
 733             if ! start_services; then
 734                 checkexit 1 "$1 tests"
 735                 title "test $1 -- failed to start services"
 736                 return 1
 737             fi
 738             ;;
 739     esac
 740     retry do_test_once ${@}
 741 }
 742
 743 go_ldflags() {
 744     version=${ARVADOS_VERSION:-$(git log -n1 --format=%H)-dev}
 745     echo "-X git.arvados.org/arvados.git/lib/cmd.version=${version} -X main.version=${version} -s -w"
 746 }
 747
 748 do_test_once() {
 749     unset result
 750
 751     title "test $1"
 752     timer_reset
 753
 754     result=
 755     if which deactivate >/dev/null; then deactivate; fi
 756     if ! . "$VENV3DIR/bin/activate"
 757     then
 758         result=1
 759     elif [[ "$2" == "go" ]]
 760     then
 761         covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
 762         coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
 763         testflags=()
 764         if [[ "$1" == "cmd/arvados-package" ]]; then
 765             testflags+=("-timeout" "20m")
 766         fi
 767         # We do "go install" here to catch compilation errors
 768         # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
 769         # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
 770         # compilation errors.
 771         go install -ldflags "$(go_ldflags)" "$WORKSPACE/$1" && \
 772             cd "$WORKSPACE/$1" && \
 773             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
 774         then
 775             # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
 776             # does:
 777             go test ${short:+-short} ${testflags[@]} ${testargs[$1]}
 778         else
 779             # The above form gets verbose even when testargs is
 780             # empty, so use this form in such cases:
 781             go test ${short:+-short} ${testflags[@]} ${coverflags[@]} "git.arvados.org/arvados.git/$1"
 782         fi
 783         result=${result:-$?}
 784         if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
 785         then
 786             go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
 787             rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
 788         fi
 789         [[ $result = 0 ]] && gofmt -e -d *.go
 790     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 791     then
 792         tries=0
 793         cd "$WORKSPACE/$1" && while :
 794         do
 795             tries=$((${tries}+1))
 796             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 797             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 798             if [[ -e "${3}activate" ]]; then
 799                 . "${3}activate"
 800             fi
 801             python setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
 802             result=$?
 803             if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
 804             then
 805                 printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
 806                 continue
 807             else
 808                 break
 809             fi
 810         done
 811     elif [[ "$2" != "" ]]
 812     then
 813         "test_$2"
 814     else
 815         "test_$1"
 816     fi
 817     result=${result:-$?}
 818     checkexit $result "$1 tests"
 819     title "test $1 -- `timer`"
 820     return $result
 821 }
 822
 823 check_arvados_config() {
 824     if [[ "$1" = "env" ]] ; then
 825         return
 826     fi
 827     if [[ -z "$ARVADOS_CONFIG" ]] ; then
 828         # Create config file.  The run_test_server script requires PyYAML,
 829         # so virtualenv needs to be active.  Downstream steps like
 830         # workbench install which require a valid config.yml.
 831         if [[ ! -s "$VENV3DIR/bin/activate" ]] ; then
 832             install_env
 833         fi
 834         . "$VENV3DIR/bin/activate"
 835         cd "$WORKSPACE"
 836         eval $(python3 sdk/python/tests/run_test_server.py setup_config)
 837         deactivate
 838     fi
 839 }
 840
 841 do_install() {
 842     if [[ -n "${skip[install]}" || ( -n "${only_install}" && "${only_install}" != "${1}" && "${only_install}" != "${2}" ) ]]; then
 843         return 0
 844     fi
 845     check_arvados_config "$1"
 846     retry do_install_once ${@}
 847 }
 848
 849 do_install_once() {
 850     title "install $1"
 851     timer_reset
 852
 853     result=
 854     if which deactivate >/dev/null; then deactivate; fi
 855     if [[ "$1" != "env" ]] && ! . "$VENV3DIR/bin/activate"; then
 856         result=1
 857     elif [[ "$2" == "go" ]]
 858     then
 859         go install -ldflags "$(go_ldflags)" "$WORKSPACE/$1"
 860     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 861     then
 862         # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 863         # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 864
 865         # Need to change to a different directory after creating
 866         # the source dist package to avoid a pip bug.
 867         # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
 868
 869         # Also need to install twice, because if it believes the package is
 870         # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
 871         # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
 872         # install" ensures that we've actually installed the local package
 873         # we just built.
 874         cd "$WORKSPACE/$1" \
 875             && "${3}python3" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
 876             && cd "$WORKSPACE" \
 877             && "${3}pip3" install --no-cache-dir "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
 878             && "${3}pip3" install --no-cache-dir --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
 879     elif [[ "$2" != "" ]]
 880     then
 881         "install_$2"
 882     else
 883         "install_$1"
 884     fi
 885     result=${result:-$?}
 886     checkexit $result "$1 install"
 887     title "install $1 -- `timer`"
 888     return $result
 889 }
 890
 891 bundle_install_trylocal() {
 892     (
 893         set -e
 894         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
 895         if ! "$bundle" install --local --no-deployment; then
 896             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
 897             "$bundle" install --no-deployment
 898         fi
 899         "$bundle" package
 900     )
 901 }
 902
 903 install_doc() {
 904     cd "$WORKSPACE/doc" \
 905         && bundle_install_trylocal \
 906         && rm -rf .site
 907 }
 908
 909 install_gem() {
 910     gemname=$1
 911     srcpath=$2
 912     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
 913         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
 914         && bundle_install_trylocal \
 915         && gem build "$gemname.gemspec" \
 916         && with_test_gemset gem install --no-document $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
 917 }
 918
 919 install_sdk/ruby() {
 920     install_gem arvados sdk/ruby
 921 }
 922
 923 install_sdk/ruby-google-api-client() {
 924     install_gem arvados-google-api-client sdk/ruby-google-api-client
 925 }
 926
 927 install_sdk/R() {
 928   if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
 929     cd "$WORKSPACE/sdk/R" \
 930        && Rscript --vanilla install_deps.R
 931   fi
 932 }
 933
 934 install_sdk/cli() {
 935     install_gem arvados-cli sdk/cli
 936 }
 937
 938 install_services/login-sync() {
 939     install_gem arvados-google-api-client sdk/ruby-google-api-client
 940     install_gem arvados sdk/ruby
 941     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
 942 }
 943
 944 install_services/api() {
 945     stop_services
 946     check_arvados_config "services/api"
 947     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 948         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal \
 949             || return 1
 950
 951     rm -f config/environments/test.rb
 952     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
 953
 954     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
 955     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
 956     # is a postgresql superuser.
 957     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 958         && test_database=$("${VENV3DIR}/bin/python3" -c "import yaml; print(yaml.safe_load(open('$ARVADOS_CONFIG','r'))['Clusters']['zzzzz']['PostgreSQL']['Connection']['dbname'])") \
 959         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.pid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
 960
 961     mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/tmp/pids"
 962
 963     cert="$WORKSPACE/services/api/tmp/self-signed"
 964     if [[ ! -e "$cert.pem" || "$(date -r "$cert.pem" +%s)" -lt 1512659226 ]]; then
 965         (
 966             dir="$WORKSPACE/services/api/tmp"
 967             set -e
 968             openssl req -newkey rsa:2048 -nodes -subj '/C=US/ST=State/L=City/CN=localhost' -out "$cert.csr" -keyout "$cert.key" </dev/null
 969             openssl x509 -req -in "$cert.csr" -signkey "$cert.key" -out "$cert.pem" -days 3650 -extfile <(printf 'subjectAltName=DNS:localhost,DNS:::1,DNS:0.0.0.0,DNS:127.0.0.1,IP:::1,IP:0.0.0.0,IP:127.0.0.1')
 970         ) || return 1
 971     fi
 972
 973     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 974         && rm -rf tmp/git \
 975         && mkdir -p tmp/git \
 976         && cd tmp/git \
 977         && tar xf ../../test/test.git.tar \
 978         && mkdir -p internal.git \
 979         && git --git-dir internal.git init \
 980             || return 1
 981
 982     (
 983         set -ex
 984         cd "$WORKSPACE/services/api"
 985         export RAILS_ENV=test
 986         if bin/rails db:environment:set ; then
 987             bin/rake db:drop
 988         fi
 989         bin/rake db:setup
 990         bin/rake db:fixtures:load
 991     ) || return 1
 992 }
 993
 994 declare -a pythonstuff
 995 pythonstuff=(
 996     sdk/python:py3
 997     sdk/cwl:py3
 998     services/dockercleaner:py3
 999     services/fuse:py3
1000     tools/crunchstat-summary:py3
1001 )
1002
1003 declare -a gostuff
1004 gostuff=($(cd "$WORKSPACE" && git ls-files | grep '\.go$' | sed -e 's/\/[^\/]*$//' | sort -u))
1005
1006 install_apps/workbench() {
1007     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1008         && mkdir -p tmp/cache \
1009         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal \
1010         && RAILS_ENV=test RAILS_GROUPS=assets "$bundle" exec rake npm:install
1011 }
1012
1013 install_services/workbench2() {
1014     cd "$WORKSPACE/services/workbench2" \
1015         && make yarn-install ARVADOS_DIRECTORY="${WORKSPACE}"
1016 }
1017
1018 test_doc() {
1019     (
1020         set -e
1021         cd "$WORKSPACE/doc"
1022         ARVADOS_API_HOST=pirca.arvadosapi.com
1023         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
1024         # do much good!
1025         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ "$bundle" exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
1026     )
1027 }
1028
1029 test_gofmt() {
1030     cd "$WORKSPACE" || return 1
1031     dirs=$(ls -d */ | egrep -v 'vendor|tmp')
1032     [[ -z "$(gofmt -e -d $dirs | tee -a /dev/stderr)" ]]
1033 }
1034
1035 test_services/api() {
1036     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
1037     cd "$WORKSPACE/services/api" \
1038         && eval env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} "$bundle" exec rake test TESTOPTS=\'-v -d\' ${testargs[services/api]}
1039 }
1040
1041 test_sdk/ruby() {
1042     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
1043         && "$bundle" exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
1044 }
1045
1046 test_sdk/ruby-google-api-client() {
1047     echo "*** note \`test sdk/ruby-google-api-client\` does not actually run any tests, see https://dev.arvados.org/issues/20993 ***"
1048     true
1049 }
1050
1051 test_sdk/R() {
1052   if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
1053     cd "$WORKSPACE/sdk/R" \
1054         && Rscript --vanilla run_test.R
1055   fi
1056 }
1057
1058 test_sdk/cli() {
1059     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
1060         && mkdir -p /tmp/keep \
1061         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep "$bundle" exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
1062 }
1063
1064 test_sdk/java-v2() {
1065     cd "$WORKSPACE/sdk/java-v2" && gradle test ${testargs[sdk/java-v2]}
1066 }
1067
1068 test_services/login-sync() {
1069     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
1070         && "$bundle" exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
1071 }
1072
1073 test_services/workbench2_units() {
1074     cd "$WORKSPACE/services/workbench2" && make unit-tests ARVADOS_DIRECTORY="${WORKSPACE}" WORKSPACE="$(pwd)" ${testargs[services/workbench2]}
1075 }
1076
1077 test_services/workbench2_integration() {
1078     cd "$WORKSPACE/services/workbench2" && make integration-tests ARVADOS_DIRECTORY="${WORKSPACE}" WORKSPACE="$(pwd)" ${testargs[services/workbench2]}
1079 }
1080
1081 test_apps/workbench_units() {
1082     local TASK="test:units"
1083     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1084         && eval env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} "$bundle" exec rake ${TASK} TESTOPTS=\'-v -d\' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_units]}
1085 }
1086
1087 test_apps/workbench_functionals() {
1088     local TASK="test:functionals"
1089     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1090         && eval env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} "$bundle" exec rake ${TASK} TESTOPTS=\'-v -d\' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_functionals]}
1091 }
1092
1093 test_apps/workbench_integration() {
1094     local TASK="test:integration"
1095     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1096         && eval env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} "$bundle" exec rake ${TASK} TESTOPTS=\'-v -d\' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_integration]}
1097 }
1098
1099 test_apps/workbench_benchmark() {
1100     local TASK="test:benchmark"
1101     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1102         && eval env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} "$bundle" exec rake ${TASK} ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
1103 }
1104
1105 test_apps/workbench_profile() {
1106     local TASK="test:profile"
1107     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1108         && eval env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} "$bundle" exec rake ${TASK} ${testargs[apps/workbench_profile]}
1109 }
1110
1111 install_deps() {
1112     # Install parts needed by test suites
1113     do_install env
1114     do_install cmd/arvados-server go
1115     do_install sdk/cli
1116     do_install sdk/python pip "${VENV3DIR}/bin/"
1117     do_install sdk/ruby-google-api-client
1118     do_install sdk/ruby
1119     do_install services/api
1120     do_install services/keepproxy go
1121     do_install services/keep-web go
1122 }
1123
1124 install_all() {
1125     do_install env
1126     do_install doc
1127     do_install sdk/ruby-google-api-client
1128     do_install sdk/ruby
1129     do_install sdk/R
1130     do_install sdk/cli
1131     do_install services/login-sync
1132     for p in "${pythonstuff[@]}"
1133     do
1134        dir=${p%:py3}
1135        if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
1136            do_install ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
1137        fi
1138     done
1139     for g in "${gostuff[@]}"
1140     do
1141         do_install "$g" go
1142     done
1143     do_install services/api
1144     do_install apps/workbench
1145     do_install services/workbench2
1146 }
1147
1148 test_all() {
1149     stop_services
1150     do_test services/api
1151
1152     # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
1153     # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
1154     if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
1155         rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
1156         exit_cleanly
1157     fi
1158
1159     do_test gofmt
1160     do_test doc
1161     do_test sdk/ruby-google-api-client
1162     do_test sdk/ruby
1163     do_test sdk/R
1164     do_test sdk/cli
1165     do_test services/login-sync
1166     do_test sdk/java-v2
1167     for p in "${pythonstuff[@]}"
1168     do
1169         dir=${p%:py3}
1170         if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
1171             do_test ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
1172         fi
1173     done
1174
1175     for g in "${gostuff[@]}"
1176     do
1177         do_test "$g" go
1178     done
1179     do_test apps/workbench_units
1180     do_test apps/workbench_functionals
1181     do_test apps/workbench_integration
1182     do_test apps/workbench_benchmark
1183     do_test apps/workbench_profile
1184     do_test services/workbench2_units
1185     do_test services/workbench2_integration
1186 }
1187
1188 test_go() {
1189     do_test gofmt
1190     for g in "${gostuff[@]}"
1191     do
1192         do_test "$g" go
1193     done
1194 }
1195
1196 help_interactive() {
1197     echo "== Interactive commands:"
1198     echo "TARGET                 (short for 'test DIR')"
1199     echo "test TARGET"
1200     echo "10 test TARGET         (run test 10 times)"
1201     echo "test TARGET:py3        (test with python3)"
1202     echo "test TARGET -check.vv  (pass arguments to test)"
1203     echo "install TARGET"
1204     echo "install env            (go/python libs)"
1205     echo "install deps           (go/python libs + arvados components needed for integration tests)"
1206     echo "reset                  (...services used by integration tests)"
1207     echo "exit"
1208     echo "== Test targets:"
1209     echo "${!testfuncargs[@]}" | tr ' ' '\n' | sort | column
1210 }
1211
1212 initialize
1213
1214 declare -A testfuncargs=()
1215 for g in "${gostuff[@]}"; do
1216     testfuncargs[$g]="$g go"
1217 done
1218 for p in "${pythonstuff[@]}"; do
1219     dir=${p%:py3}
1220     testfuncargs[$dir:py3]="$dir pip $VENV3DIR/bin/"
1221 done
1222
1223 testfuncargs["sdk/cli"]="sdk/cli"
1224 testfuncargs["sdk/R"]="sdk/R"
1225 testfuncargs["sdk/java-v2"]="sdk/java-v2"
1226 testfuncargs["apps/workbench_units"]="apps/workbench_units"
1227 testfuncargs["apps/workbench_functionals"]="apps/workbench_functionals"
1228 testfuncargs["apps/workbench_integration"]="apps/workbench_integration"
1229 testfuncargs["apps/workbench_benchmark"]="apps/workbench_benchmark"
1230 testfuncargs["apps/workbench_profile"]="apps/workbench_profile"
1231
1232 if [[ -z ${interactive} ]]; then
1233     install_all
1234     test_all
1235 else
1236     skip=()
1237     only=()
1238     only_install=()
1239     if [[ -e "$VENV3DIR/bin/activate" ]]; then stop_services; fi
1240     setnextcmd() {
1241         if [[ "$TERM" = dumb ]]; then
1242             # assume emacs, or something, is offering a history buffer
1243             # and pre-populating the command will only cause trouble
1244             nextcmd=
1245         elif [[ ! -e "$VENV3DIR/bin/activate" ]]; then
1246             nextcmd="install deps"
1247         else
1248             nextcmd=""
1249         fi
1250     }
1251     echo
1252     help_interactive
1253     nextcmd="install deps"
1254     setnextcmd
1255     HISTFILE="$WORKSPACE/tmp/.history"
1256     history -r
1257     ignore_sigint=1
1258     while read -p 'What next? ' -e -i "$nextcmd" nextcmd; do
1259         history -s "$nextcmd"
1260         history -w
1261         count=1
1262         if [[ "${nextcmd}" =~ ^[0-9] ]]; then
1263           read count nextcmd <<<"${nextcmd}"
1264         fi
1265         read verb target opts <<<"${nextcmd}"
1266         target="${target%/}"
1267         target="${target/\/:/:}"
1268         case "${verb}" in
1269             "exit" | "quit")
1270                 exit_cleanly
1271                 ;;
1272             "reset")
1273                 stop_services
1274                 ;;
1275             "test" | "install")
1276                 case "$target" in
1277                     "")
1278                         help_interactive
1279                         ;;
1280                     all | deps)
1281                         ${verb}_${target}
1282                         ;;
1283                     *)
1284                         argstarget=${target%:py3}
1285                         testargs["$argstarget"]="${opts}"
1286                         tt="${testfuncargs[${target}]}"
1287                         tt="${tt:-$target}"
1288                         while [ $count -gt 0 ]; do
1289                           do_$verb $tt
1290                           let "count=count-1"
1291                         done
1292                         ;;
1293                 esac
1294                 ;;
1295             "" | "help" | *)
1296                 help_interactive
1297                 ;;
1298         esac
1299         if [[ ${#successes[@]} -gt 0 || ${#failures[@]} -gt 0 ]]; then
1300             report_outcomes
1301             successes=()
1302             failures=()
1303         fi
1304         cd "$WORKSPACE"
1305         setnextcmd
1306     done
1307     echo
1308 fi
1309 exit_cleanly