11579: Removed feature about not uploading a symlinked dir twice.
[arvados.git] / build / run-tests.sh
1 #!/bin/bash
2
3 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin
4
5 COLUMNS=80
6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
7
8 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
9 $(basename $0): Install and test Arvados components.
10
11 Exit non-zero if any tests fail.
12
13 Syntax:
14         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
15
16 Options:
17
18 --skip FOO     Do not test the FOO component.
19 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
20 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
21                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
22 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
23                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
24                subsequent invocations.
25 --repeat N     Repeat each install/test step until it succeeds N times.
26 --retry        Prompt to retry if an install or test suite fails.
27 --skip-install Do not run any install steps. Just run tests.
28                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
29                from a previous invocation if you use this option.
30 --only-install Run specific install step
31 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
32 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
33 CONFIGSRC=path Dir with api server config files to copy into source tree.
34                (If none given, leave config files alone in source tree.)
35 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
36                Restrict apiserver tests to the given file
37 sdk/python_test="--test-suite test.test_keep_locator"
38                Restrict Python SDK tests to the given class
39 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
40                Restrict Workbench tests to the given file
41 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
42                Show all log messages, even when tests pass (also works
43                with services/keepstore_test etc.)
44 ARVADOS_DEBUG=1
45                Print more debug messages
46 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
47                *_test, and other examples shown above.
48
49 Assuming --skip-install is not given, all components are installed
50 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
51 test suites depend on other components being installed, and installing
52 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
53
54 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
55 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
56
57 More information and background:
58
59 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
60
61 Available tests:
62
63 apps/workbench (*)
64 apps/workbench_units (*)
65 apps/workbench_functionals (*)
66 apps/workbench_integration (*)
67 apps/workbench_benchmark
68 apps/workbench_profile
69 doc
70 services/api
71 services/arv-git-httpd
72 services/crunchstat
73 services/dockercleaner
74 services/fuse
75 services/keep-web
76 services/keepproxy
77 services/keepstore
78 services/keep-balance
79 services/login-sync
80 services/nodemanager
81 services/crunch-run
82 services/crunch-dispatch-local
83 services/crunch-dispatch-slurm
84 services/ws
85 sdk/cli
86 sdk/pam
87 sdk/python
88 sdk/ruby
89 sdk/go/arvados
90 sdk/go/arvadosclient
91 sdk/go/dispatch
92 sdk/go/keepclient
93 sdk/go/httpserver
94 sdk/go/manifest
95 sdk/go/blockdigest
96 sdk/go/streamer
97 sdk/go/stats
98 sdk/go/crunchrunner
99 sdk/cwl
100 tools/crunchstat-summary
101 tools/keep-exercise
102 tools/keep-rsync
103 tools/keep-block-check
104
105 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
106     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
107
108 EOF
109
110 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
111 # environment that could interfere with the tests.
112 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
113
114 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
115 # accident.
116 GITDIR=
117 GOPATH=
118 VENVDIR=
119 VENV3DIR=
120 PYTHONPATH=
121 GEMHOME=
122 PERLINSTALLBASE=
123
124 short=
125 only_install=
126 temp=
127 temp_preserve=
128
129 clear_temp() {
130     if [[ -z "$temp" ]]; then
131         # we didn't even get as far as making a temp dir
132         :
133     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
134         rm -rf "$temp"
135     else
136         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
137     fi
138 }
139
140 fatal() {
141     clear_temp
142     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
143     exit 1
144 }
145
146 exit_cleanly() {
147     trap - INT
148     create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
149     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
150     stop_services
151     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
152     report_outcomes
153     clear_temp
154     exit ${#failures}
155 }
156
157 sanity_checks() {
158     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
159         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
160     echo Checking dependencies:
161     echo -n 'virtualenv: '
162     virtualenv --version \
163         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
164     echo -n 'ruby: '
165     ruby -v \
166         || fatal "No ruby. Install >=2.1.9 (using rbenv, rvm, or source)"
167     echo -n 'bundler: '
168     bundle version \
169         || fatal "No bundler. Try: gem install bundler"
170     echo -n 'go: '
171     go version \
172         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
173     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 7 ]] \
174         || fatal "Go >= 1.7 required. See http://golang.org/doc/install"
175     echo -n 'gcc: '
176     gcc --version | egrep ^gcc \
177         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
178     echo -n 'fuse.h: '
179     find /usr/include -wholename '*fuse/fuse.h' \
180         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
181     echo -n 'gnutls.h: '
182     find /usr/include -wholename '*gnutls/gnutls.h' \
183         || fatal "No gnutls/gnutls.h. Try: apt-get install libgnutls28-dev"
184     echo -n 'pyconfig.h: '
185     find /usr/include -name pyconfig.h | egrep --max-count=1 . \
186         || fatal "No pyconfig.h. Try: apt-get install python-dev"
187     echo -n 'nginx: '
188     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
189         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
190     echo -n 'perl: '
191     perl -v | grep version \
192         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
193     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
194         echo -n "perl $mod: "
195         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
196             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
197     done
198     echo -n 'gitolite: '
199     which gitolite \
200         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
201 }
202
203 rotate_logfile() {
204   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
205   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
206   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
207     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
208     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
209     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
210   fi
211 }
212
213 declare -a failures
214 declare -A skip
215 declare -A testargs
216 skip[apps/workbench_profile]=1
217
218 while [[ -n "$1" ]]
219 do
220     arg="$1"; shift
221     case "$arg" in
222         --help)
223             echo >&2 "$helpmessage"
224             echo >&2
225             exit 1
226             ;;
227         --skip)
228             skip[$1]=1; shift
229             ;;
230         --only)
231             only="$1"; skip[$1]=""; shift
232             ;;
233         --short)
234             short=1
235             ;;
236         --skip-install)
237             only_install=nothing
238             ;;
239         --only-install)
240             only_install="$1"; shift
241             ;;
242         --temp)
243             temp="$1"; shift
244             temp_preserve=1
245             ;;
246         --leave-temp)
247             temp_preserve=1
248             ;;
249         --repeat)
250             repeat=$((${1}+0)); shift
251             ;;
252         --retry)
253             retry=1
254             ;;
255         *_test=*)
256             suite="${arg%%_test=*}"
257             args="${arg#*=}"
258             testargs["$suite"]="$args"
259             ;;
260         *=*)
261             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
262             ;;
263         *)
264             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
265             exit 1
266             ;;
267     esac
268 done
269
270 start_api() {
271     echo 'Starting API server...'
272     cd "$WORKSPACE" \
273         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
274         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
275         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
276         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
277         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
278         && (env | egrep ^ARVADOS)
279 }
280
281 start_nginx_proxy_services() {
282     echo 'Starting keepproxy, keep-web, ws, arv-git-httpd, and nginx ssl proxy...'
283     cd "$WORKSPACE" \
284         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
285         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
286         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
287         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
288         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
289         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1
290 }
291
292 stop_services() {
293     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES" ]]; then
294         unset ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
295         cd "$WORKSPACE" \
296             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
297             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
298             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
299             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
300             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy
301     fi
302     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
303         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
304         cd "$WORKSPACE" \
305             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
306             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
307             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop
308     fi
309 }
310
311 interrupt() {
312     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
313     exit_cleanly
314 }
315 trap interrupt INT
316
317 sanity_checks
318
319 echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
320
321 if [[ -z "$CONFIGSRC" ]] && [[ -d "$HOME/arvados-api-server" ]]; then
322     # Jenkins expects us to use this by default.
323     CONFIGSRC="$HOME/arvados-api-server"
324 fi
325
326 # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
327 cd "$WORKSPACE"
328 find -name '*.pyc' -delete
329
330 if [[ -z "$temp" ]]; then
331     temp="$(mktemp -d)"
332 fi
333
334 # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
335 for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE
336 do
337     if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
338         eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
339     fi
340     if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
341         mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
342     fi
343 done
344
345 setup_ruby_environment() {
346     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
347       source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
348       using_rvm=true
349     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
350       source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
351       using_rvm=true
352     else
353       using_rvm=false
354     fi
355
356     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
357         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
358         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
359         # the environment to the "current gemset", which would lose
360         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
361         # programs (for example, the Workbench test suite could not
362         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
363         # rvm gemset and use it for everything.
364
365         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
366             || fatal 'rvm check'
367
368         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
369         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
370         # complaint about not being in first place already.
371         rvm use @default 2>/dev/null
372
373         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
374         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
375         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
376         # ruby to the caller.
377         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
378         rvm use "@${gemset}" --create \
379             || fatal 'rvm gemset setup'
380
381         rvm env
382     else
383         # When our "bundle install"s need to install new gems to
384         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
385         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
386         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
387         # should be installed, and we should leave it alone.)
388
389         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
390             user_gempath="$(gem env gempath)"
391             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
392         fi
393         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
394
395         # When we build and install our own gems, we install them in our
396         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
397         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
398         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
399
400         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
401         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
402         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home:$(gem env gempath)"
403
404         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
405         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
406         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
407     fi
408 }
409
410 with_test_gemset() {
411     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
412         "$@"
413     else
414         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
415     fi
416 }
417
418 gem_uninstall_if_exists() {
419     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
420         gem uninstall --force --all --executables "$1"
421     fi
422 }
423
424 setup_virtualenv() {
425     local venvdest="$1"; shift
426     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
427         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
428     fi
429     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
430         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
431         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
432     else
433         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
434     fi
435     # ubuntu1404 can't seem to install mock via tests_require, but it can do this.
436     "$venvdest/bin/pip" install 'mock>=1.0' 'pbr<1.7.0'
437 }
438
439 export PERLINSTALLBASE
440 export PERLLIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5:${PERLLIB:+$PERLLIB}"
441
442 export GOPATH
443 mkdir -p "$GOPATH/src/git.curoverse.com"
444 ln -sfT "$WORKSPACE" "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" \
445     || fatal "symlink failed"
446
447 setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
448 . "$VENVDIR/bin/activate"
449
450 # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
451 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^PyYAML= \
452     || pip install PyYAML >/dev/null \
453     || fatal "pip install PyYAML failed"
454
455 # Preinstall forked version of libcloud, because nodemanager "pip install"
456 # won't pick it up by default.
457 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
458     || pip install --pre --ignore-installed https://github.com/curoverse/libcloud/archive/apache-libcloud-$LIBCLOUD_PIN.zip >/dev/null \
459     || fatal "pip install apache-libcloud failed"
460
461 # Uninstall old llfuse (<1.0), because services/fuse "pip install"
462 # won't upgrade it by default.
463 if pip freeze | egrep '^llfuse==0'; then
464     yes | pip uninstall 'llfuse<1.0'
465 fi
466
467 # Deactivate Python 2 virtualenv
468 deactivate
469
470 # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
471 # Otherwise, skip dependent tests.
472 PYTHON3=$(which python3)
473 if [ "0" = "$?" ]; then
474     setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
475 else
476     PYTHON3=
477     skip[services/dockercleaner]=1
478     cat >&2 <<EOF
479
480 Warning: python3 could not be found
481 services/dockercleaner install and tests will be skipped
482
483 EOF
484 fi
485
486 # Reactivate Python 2 virtualenv
487 . "$VENVDIR/bin/activate"
488
489 # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
490 # whine a lot.
491 setup_ruby_environment
492
493 echo "PATH is $PATH"
494
495 if ! which bundler >/dev/null
496 then
497     gem install --user-install bundler || fatal 'Could not install bundler'
498 fi
499
500 retry() {
501     remain="${repeat}"
502     while :
503     do
504         if ${@}; then
505             if [[ "$remain" -gt 1 ]]; then
506                 remain=$((${remain}-1))
507                 title "Repeating ${remain} more times"
508             else
509                 break
510             fi
511         elif [[ "$retry" == 1 ]]; then
512             read -p 'Try again? [Y/n] ' x
513             if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
514             then
515                 break
516             fi
517         else
518             break
519         fi
520     done
521 }
522
523 do_test() {
524     case "${1}" in
525         apps/workbench_units | apps/workbench_functionals | apps/workbench_integration)
526             suite=apps/workbench
527             ;;
528         *)
529             suite="${1}"
530             ;;
531     esac
532     if [[ -z "${skip[$suite]}" && -z "${skip[$1]}" && \
533                 (-z "${only}" || "${only}" == "${suite}" || \
534                  "${only}" == "${1}") ]]; then
535         retry do_test_once ${@}
536     else
537         title "Skipping ${1} tests"
538     fi
539 }
540
541 do_test_once() {
542     unset result
543
544     title "Running $1 tests"
545     timer_reset
546     if [[ "$2" == "go" ]]
547     then
548         covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
549         coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
550         # We do "go get -t" here to catch compilation errors
551         # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
552         # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
553         # compilation errors.
554         go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
555             cd "$WORKSPACE/$1" && \
556             [[ -z "$(gofmt -e -d . | tee /dev/stderr)" ]] && \
557             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
558         then
559             # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
560             # does:
561             go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
562         else
563             # The above form gets verbose even when testargs is
564             # empty, so use this form in such cases:
565             go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
566         fi
567         result=${result:-$?}
568         if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
569         then
570             go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
571             rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
572         fi
573     elif [[ "$2" == "pip" ]]
574     then
575         tries=0
576         cd "$WORKSPACE/$1" && while :
577         do
578             tries=$((${tries}+1))
579             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
580             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
581             "${3}python" setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
582             result=$?
583             if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
584             then
585                 printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
586                 continue
587             else
588                 break
589             fi
590         done
591     elif [[ "$2" != "" ]]
592     then
593         "test_$2"
594     else
595         "test_$1"
596     fi
597     result=${result:-$?}
598     checkexit $result "$1 tests"
599     title "End of $1 tests (`timer`)"
600     return $result
601 }
602
603 do_install() {
604     if [[ -z "${only_install}" || "${only_install}" == "${1}" ]]; then
605         retry do_install_once ${@}
606     else
607         title "Skipping $1 install"
608     fi
609 }
610
611 do_install_once() {
612     title "Running $1 install"
613     timer_reset
614     if [[ "$2" == "go" ]]
615     then
616         go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
617     elif [[ "$2" == "pip" ]]
618     then
619         # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
620         # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
621
622         # Need to change to a different directory after creating
623         # the source dist package to avoid a pip bug.
624         # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
625
626         # Also need to install twice, because if it believes the package is
627         # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
628         # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
629         # install" ensures that we've actually installed the local package
630         # we just built.
631         cd "$WORKSPACE/$1" \
632             && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
633             && cd "$WORKSPACE" \
634             && "${3}pip" install --quiet "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
635             && "${3}pip" install --quiet --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
636     elif [[ "$2" != "" ]]
637     then
638         "install_$2"
639     else
640         "install_$1"
641     fi
642     result=$?
643     checkexit $result "$1 install"
644     title "End of $1 install (`timer`)"
645     return $result
646 }
647
648 bundle_install_trylocal() {
649     (
650         set -e
651         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
652         if ! bundle install --local --no-deployment; then
653             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
654             bundle install --no-deployment
655         fi
656         bundle package --all
657     )
658 }
659
660 install_doc() {
661     cd "$WORKSPACE/doc" \
662         && bundle_install_trylocal \
663         && rm -rf .site
664 }
665 do_install doc
666
667 install_gem() {
668     gemname=$1
669     srcpath=$2
670     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
671         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
672         && bundle_install_trylocal \
673         && gem build "$gemname.gemspec" \
674         && with_test_gemset gem install --no-ri --no-rdoc $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
675 }
676
677 install_ruby_sdk() {
678     install_gem arvados sdk/ruby
679 }
680 do_install sdk/ruby ruby_sdk
681
682 install_perl_sdk() {
683     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
684         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
685         && make install INSTALLDIRS=perl
686 }
687 do_install sdk/perl perl_sdk
688
689 install_cli() {
690     install_gem arvados-cli sdk/cli
691 }
692 do_install sdk/cli cli
693
694 install_login-sync() {
695     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
696 }
697 do_install services/login-sync login-sync
698
699 # Install the Python SDK early. Various other test suites (like
700 # keepproxy) bring up run_test_server.py, which imports the arvados
701 # module. We can't actually *test* the Python SDK yet though, because
702 # its own test suite brings up some of those other programs (like
703 # keepproxy).
704 declare -a pythonstuff
705 pythonstuff=(
706     sdk/pam
707     sdk/python
708     sdk/cwl
709     services/fuse
710     services/nodemanager
711     tools/crunchstat-summary
712     )
713 for p in "${pythonstuff[@]}"
714 do
715     do_install "$p" pip
716 done
717 if [ -n "$PYTHON3" ]; then
718     do_install services/dockercleaner pip "$VENV3DIR/bin/"
719 fi
720
721 install_apiserver() {
722     cd "$WORKSPACE/services/api" \
723         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
724
725     rm -f config/environments/test.rb
726     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
727
728     if [ -n "$CONFIGSRC" ]
729     then
730         for f in database.yml application.yml
731         do
732             cp "$CONFIGSRC/$f" config/ || fatal "$f"
733         done
734     fi
735
736     # Fill in a random secret_token and blob_signing_key for testing
737     SECRET_TOKEN=`echo 'puts rand(2**512).to_s(36)' |ruby`
738     BLOB_SIGNING_KEY=`echo 'puts rand(2**512).to_s(36)' |ruby`
739
740     sed -i'' -e "s:SECRET_TOKEN:$SECRET_TOKEN:" config/application.yml
741     sed -i'' -e "s:BLOB_SIGNING_KEY:$BLOB_SIGNING_KEY:" config/application.yml
742
743     # Set up empty git repo (for git tests)
744     GITDIR=$(mktemp -d)
745     sed -i'' -e "s:/var/cache/git:$GITDIR:" config/application.default.yml
746
747     rm -rf $GITDIR
748     mkdir -p $GITDIR/test
749     cd $GITDIR/test \
750         && git init \
751         && git config user.email "jenkins@ci.curoverse.com" \
752         && git config user.name "Jenkins, CI" \
753         && touch tmp \
754         && git add tmp \
755         && git commit -m 'initial commit'
756
757     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
758     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
759     # is a postgresql superuser.
760     cd "$WORKSPACE/services/api" \
761         && test_database=$(python -c "import yaml; print yaml.load(file('config/database.yml'))['test']['database']") \
762         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.procpid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
763
764     cd "$WORKSPACE/services/api" \
765         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:drop \
766         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:setup \
767         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:fixtures:load
768 }
769 do_install services/api apiserver
770
771 declare -a gostuff
772 gostuff=(
773     sdk/go/arvados
774     sdk/go/arvadosclient
775     sdk/go/blockdigest
776     sdk/go/dispatch
777     sdk/go/httpserver
778     sdk/go/manifest
779     sdk/go/streamer
780     sdk/go/crunchrunner
781     sdk/go/stats
782     lib/crunchstat
783     services/arv-git-httpd
784     services/crunchstat
785     services/keep-web
786     services/keepstore
787     sdk/go/keepclient
788     services/keep-balance
789     services/keepproxy
790     services/crunch-dispatch-local
791     services/crunch-dispatch-slurm
792     services/crunch-run
793     services/ws
794     tools/keep-block-check
795     tools/keep-exercise
796     tools/keep-rsync
797     )
798 for g in "${gostuff[@]}"
799 do
800     do_install "$g" go
801 done
802
803 install_workbench() {
804     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
805         && mkdir -p tmp/cache \
806         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
807 }
808 do_install apps/workbench workbench
809
810 test_doclinkchecker() {
811     (
812         set -e
813         cd "$WORKSPACE/doc"
814         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
815         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
816         # do much good!
817         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ bundle exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
818     )
819 }
820 do_test doc doclinkchecker
821
822 stop_services
823
824 test_apiserver() {
825     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
826     cd "$WORKSPACE/services/api" \
827         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/api]}
828 }
829 do_test services/api apiserver
830
831 # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
832 # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
833 if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
834   rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
835   exit_cleanly
836 fi
837
838 start_api
839
840 test_ruby_sdk() {
841     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
842         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
843 }
844 do_test sdk/ruby ruby_sdk
845
846 test_cli() {
847     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
848         && mkdir -p /tmp/keep \
849         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
850 }
851 do_test sdk/cli cli
852
853 test_login-sync() {
854     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
855         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
856 }
857 do_test services/login-sync login-sync
858
859 for p in "${pythonstuff[@]}"
860 do
861     do_test "$p" pip
862 done
863 do_test services/dockercleaner pip "$VENV3DIR/bin/"
864
865 for g in "${gostuff[@]}"
866 do
867     do_test "$g" go
868 done
869
870 test_workbench_units() {
871     start_nginx_proxy_services \
872         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
873         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:units TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
874 }
875 do_test apps/workbench_units workbench_units
876
877 test_workbench_functionals() {
878     start_nginx_proxy_services \
879         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
880         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:functionals TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
881 }
882 do_test apps/workbench_functionals workbench_functionals
883
884 test_workbench_integration() {
885     start_nginx_proxy_services \
886         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
887         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:integration TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
888 }
889 do_test apps/workbench_integration workbench_integration
890
891
892 test_workbench_benchmark() {
893     start_nginx_proxy_services \
894         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
895         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:benchmark ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
896 }
897 do_test apps/workbench_benchmark workbench_benchmark
898
899 test_workbench_profile() {
900     start_nginx_proxy_services \
901         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
902         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:profile ${testargs[apps/workbench_profile]}
903 }
904 do_test apps/workbench_profile workbench_profile
905
906 exit_cleanly