8232: Remove outdated/misleading Docker install
[arvados.git] / build / run-tests.sh
1 #!/bin/bash
2
3 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin
4
5 COLUMNS=80
6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
7
8 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
9 $(basename $0): Install and test Arvados components.
10
11 Exit non-zero if any tests fail.
12
13 Syntax:
14         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
15
16 Options:
17
18 --skip FOO     Do not test the FOO component.
19 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
20 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
21                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
22 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
23                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
24                subsequent invocations.
25 --skip-install Do not run any install steps. Just run tests.
26                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
27                from a previous invocation if you use this option.
28 --only-install Run specific install step
29 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
30 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
31 CONFIGSRC=path Dir with api server config files to copy into source tree.
32                (If none given, leave config files alone in source tree.)
33 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
34                Restrict apiserver tests to the given file
35 sdk/python_test="--test-suite test.test_keep_locator"
36                Restrict Python SDK tests to the given class
37 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
38                Restrict Workbench tests to the given file
39 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
40                Show all log messages, even when tests pass (also works
41                with services/keepstore_test etc.)
42 ARVADOS_DEBUG=1
43                Print more debug messages
44 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
45                *_test, and other examples shown above.
46
47 Assuming --skip-install is not given, all components are installed
48 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
49 test suites depend on other components being installed, and installing
50 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
51
52 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
53 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
54
55 More information and background:
56
57 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
58
59 Available tests:
60
61 apps/workbench (*)
62 apps/workbench_units (*)
63 apps/workbench_functionals (*)
64 apps/workbench_integration (*)
65 apps/workbench_benchmark
66 apps/workbench_profile
67 doc
68 services/api
69 services/arv-git-httpd
70 services/crunchstat
71 services/dockercleaner
72 services/fuse
73 services/keep-web
74 services/keepproxy
75 services/keepstore
76 services/keep-balance
77 services/login-sync
78 services/nodemanager
79 services/crunch-run
80 services/crunch-dispatch-local
81 services/crunch-dispatch-slurm
82 sdk/cli
83 sdk/pam
84 sdk/python
85 sdk/ruby
86 sdk/go/arvados
87 sdk/go/arvadosclient
88 sdk/go/keepclient
89 sdk/go/httpserver
90 sdk/go/manifest
91 sdk/go/blockdigest
92 sdk/go/streamer
93 sdk/go/crunchrunner
94 sdk/cwl
95 tools/crunchstat-summary
96 tools/keep-rsync
97 tools/keep-block-check
98
99 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
100     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
101
102 EOF
103
104 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
105 # environment that could interfere with the tests.
106 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
107
108 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
109 # accident.
110 GITDIR=
111 GOPATH=
112 VENVDIR=
113 VENV3DIR=
114 PYTHONPATH=
115 GEMHOME=
116 PERLINSTALLBASE=
117
118 short=
119 skip_install=
120 temp=
121 temp_preserve=
122
123 clear_temp() {
124     if [[ -z "$temp" ]]; then
125         # we didn't even get as far as making a temp dir
126         :
127     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
128         rm -rf "$temp"
129     else
130         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
131     fi
132 }
133
134 fatal() {
135     clear_temp
136     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
137     exit 1
138 }
139
140 exit_cleanly() {
141     trap - INT
142     create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
143     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
144     stop_services
145     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
146     report_outcomes
147     clear_temp
148     exit ${#failures}
149 }
150
151 sanity_checks() {
152     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
153         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
154     echo Checking dependencies:
155     echo -n 'virtualenv: '
156     virtualenv --version \
157         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
158     echo -n 'go: '
159     go version \
160         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
161     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 6 ]] \
162         || fatal "Go >= 1.6 required. See http://golang.org/doc/install"
163     echo -n 'gcc: '
164     gcc --version | egrep ^gcc \
165         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
166     echo -n 'fuse.h: '
167     find /usr/include -wholename '*fuse/fuse.h' \
168         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
169     echo -n 'pyconfig.h: '
170     find /usr/include -name pyconfig.h | egrep --max-count=1 . \
171         || fatal "No pyconfig.h. Try: apt-get install python-dev"
172     echo -n 'nginx: '
173     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
174         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
175     echo -n 'perl: '
176     perl -v | grep version \
177         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
178     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
179         echo -n "perl $mod: "
180         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
181             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
182     done
183     echo -n 'gitolite: '
184     which gitolite \
185         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
186 }
187
188 rotate_logfile() {
189   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
190   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
191   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
192     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
193     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
194     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
195   fi
196 }
197
198 declare -a failures
199 declare -A skip
200 declare -A testargs
201 skip[apps/workbench_profile]=1
202
203 while [[ -n "$1" ]]
204 do
205     arg="$1"; shift
206     case "$arg" in
207         --help)
208             echo >&2 "$helpmessage"
209             echo >&2
210             exit 1
211             ;;
212         --skip)
213             skipwhat="$1"; shift
214             if [[ "$skipwhat" == "apps/workbench" ]]; then
215               skip["apps/workbench_units"]=1
216               skip["apps/workbench_functionals"]=1
217               skip["apps/workbench_integration"]=1
218             else
219               skip[$skipwhat]=1
220             fi
221             ;;
222         --only)
223             only="$1"; skip[$1]=""; shift
224             ;;
225         --short)
226             short=1
227             ;;
228         --skip-install)
229             skip_install=1
230             ;;
231         --only-install)
232             skip_install=1
233             only_install="$1"; shift
234             ;;
235         --temp)
236             temp="$1"; shift
237             temp_preserve=1
238             ;;
239         --leave-temp)
240             temp_preserve=1
241             ;;
242         --retry)
243             retry=1
244             ;;
245         *_test=*)
246             suite="${arg%%_test=*}"
247             args="${arg#*=}"
248             testargs["$suite"]="$args"
249             ;;
250         *=*)
251             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
252             ;;
253         *)
254             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
255             exit 1
256             ;;
257     esac
258 done
259
260 start_api() {
261     echo 'Starting API server...'
262     cd "$WORKSPACE" \
263         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
264         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
265         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
266         && (env | egrep ^ARVADOS)
267 }
268
269 start_nginx_proxy_services() {
270     echo 'Starting keepproxy, keep-web, arv-git-httpd, and nginx ssl proxy...'
271     cd "$WORKSPACE" \
272         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
273         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
274         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
275         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
276         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1
277 }
278
279 stop_services() {
280     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES" ]]; then
281         unset ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
282         cd "$WORKSPACE" \
283             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
284             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
285             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
286             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy
287     fi
288     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
289         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
290         cd "$WORKSPACE" \
291             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop
292     fi
293 }
294
295 interrupt() {
296     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
297     exit_cleanly
298 }
299 trap interrupt INT
300
301 sanity_checks
302
303 echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
304
305 if [[ -z "$CONFIGSRC" ]] && [[ -d "$HOME/arvados-api-server" ]]; then
306     # Jenkins expects us to use this by default.
307     CONFIGSRC="$HOME/arvados-api-server"
308 fi
309
310 # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
311 cd "$WORKSPACE"
312 find -name '*.pyc' -delete
313
314 if [[ -z "$temp" ]]; then
315     temp="$(mktemp -d)"
316 fi
317
318 # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
319 for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE
320 do
321     if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
322         eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
323     fi
324     if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
325         mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
326     fi
327 done
328
329 setup_ruby_environment() {
330     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
331       source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
332       using_rvm=true
333     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
334       source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
335       using_rvm=true
336     else
337       using_rvm=false
338     fi
339
340     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
341         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
342         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
343         # the environment to the "current gemset", which would lose
344         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
345         # programs (for example, the Workbench test suite could not
346         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
347         # rvm gemset and use it for everything.
348
349         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
350             || fatal 'rvm check'
351
352         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
353         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
354         # complaint about not being in first place already.
355         rvm use @default 2>/dev/null
356
357         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
358         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
359         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
360         # ruby to the caller.
361         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
362         rvm use "@${gemset}" --create \
363             || fatal 'rvm gemset setup'
364
365         rvm env
366     else
367         # When our "bundle install"s need to install new gems to
368         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
369         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
370         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
371         # should be installed, and we should leave it alone.)
372
373         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
374             user_gempath="$(gem env gempath)"
375             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
376         fi
377         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
378
379         # When we build and install our own gems, we install them in our
380         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
381         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
382         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
383
384         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
385         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
386         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home:$(gem env gempath)"
387
388         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
389         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
390         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
391     fi
392 }
393
394 with_test_gemset() {
395     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
396         "$@"
397     else
398         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
399     fi
400 }
401
402 gem_uninstall_if_exists() {
403     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
404         gem uninstall --force --all --executables "$1"
405     fi
406 }
407
408 setup_virtualenv() {
409     local venvdest="$1"; shift
410     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
411         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
412     fi
413     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
414         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
415         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
416     else
417         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
418     fi
419     # ubuntu1404 can't seem to install mock via tests_require, but it can do this.
420     "$venvdest/bin/pip" install 'mock>=1.0' 'pbr<1.7.0'
421 }
422
423 export PERLINSTALLBASE
424 export PERLLIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5:${PERLLIB:+$PERLLIB}"
425
426 export GOPATH
427 mkdir -p "$GOPATH/src/git.curoverse.com"
428 ln -sfn "$WORKSPACE" "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" \
429     || fatal "symlink failed"
430
431 setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
432 . "$VENVDIR/bin/activate"
433
434 # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
435 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^PyYAML= \
436     || pip install PyYAML >/dev/null \
437     || fatal "pip install PyYAML failed"
438
439 # Preinstall forked version of libcloud, because nodemanager "pip install"
440 # won't pick it up by default.
441 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
442     || pip install --pre --ignore-installed https://github.com/curoverse/libcloud/archive/apache-libcloud-$LIBCLOUD_PIN.zip >/dev/null \
443     || fatal "pip install apache-libcloud failed"
444
445 # This will help people who reuse --temp dirs when we upgrade to llfuse 0.42
446 if egrep -q 'llfuse.*>= *0\.42' "$WORKSPACE/services/fuse/setup.py"; then
447     # Uninstall old llfuse, because services/fuse "pip install" won't
448     # upgrade it by default.
449     if pip freeze | egrep '^llfuse==0\.41\.'; then
450         yes | pip uninstall 'llfuse<0.42'
451     fi
452 fi
453
454 # Deactivate Python 2 virtualenv
455 deactivate
456
457 # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
458 # Otherwise, skip dependent tests.
459 PYTHON3=$(which python3)
460 if [ "0" = "$?" ]; then
461     setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
462 else
463     PYTHON3=
464     skip[services/dockercleaner]=1
465     cat >&2 <<EOF
466
467 Warning: python3 could not be found
468 services/dockercleaner install and tests will be skipped
469
470 EOF
471 fi
472
473 # Reactivate Python 2 virtualenv
474 . "$VENVDIR/bin/activate"
475
476 # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
477 # whine a lot.
478 setup_ruby_environment
479
480 echo "PATH is $PATH"
481
482 if ! which bundler >/dev/null
483 then
484     gem install --user-install bundler || fatal 'Could not install bundler'
485 fi
486
487 retry() {
488     while ! ${@} && [[ "$retry" == 1 ]]
489     do
490         read -p 'Try again? [Y/n] ' x
491         if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
492         then
493             break
494         fi
495     done
496 }
497
498 do_test() {
499     retry do_test_once ${@}
500 }
501
502 do_test_once() {
503     unset result
504     to_test=$1
505     if (( [[ "$only" == "apps/workbench" ]] ) &&
506        ( [[ "$to_test" == "apps/workbench_units" ]] || [[ "$to_test" == "apps/workbench_functionals" ]] ||
507          [[ "$to_test" == "apps/workbench_integration" ]])); then
508       to_test="apps/workbench"
509     fi
510     if [[ -z "${skip[$1]}" ]] && ( [[ -z "$only" ]] || [[ "$only" == "$to_test" ]] )
511     then
512         title "Running $1 tests"
513         timer_reset
514         if [[ "$2" == "go" ]]
515         then
516             covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
517             coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
518             # We do "go get -t" here to catch compilation errors
519             # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
520             # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
521             # compilation errors.
522             go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1" || return 1
523             cd "$WORKSPACE/$1" || return 1
524             gofmt -e -d . | egrep . && result=1
525             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
526             then
527                 # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
528                 # does:
529                 cd "$WORKSPACE/$1" && go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
530             else
531                 # The above form gets verbose even when testargs is
532                 # empty, so use this form in such cases:
533                 go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
534             fi
535             result=${result:-$?}
536             if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
537             then
538                 go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
539                 rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
540             fi
541         elif [[ "$2" == "pip" ]]
542         then
543             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
544             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
545             cd "$WORKSPACE/$1" \
546                 && "${3}python" setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
547         elif [[ "$2" != "" ]]
548         then
549             "test_$2"
550         else
551             "test_$1"
552         fi
553         result=${result:-$?}
554         checkexit $result "$1 tests"
555         title "End of $1 tests (`timer`)"
556         return $result
557     else
558         title "Skipping $1 tests"
559     fi
560 }
561
562 do_install() {
563     retry do_install_once ${@}
564 }
565
566 do_install_once() {
567     if [[ -z "$skip_install" || (-n "$only_install" && "$only_install" == "$1") ]]
568     then
569         title "Running $1 install"
570         timer_reset
571         if [[ "$2" == "go" ]]
572         then
573             go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
574         elif [[ "$2" == "pip" ]]
575         then
576             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
577             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
578
579             # Need to change to a different directory after creating
580             # the source dist package to avoid a pip bug.
581             # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
582
583             # Also need to install twice, because if it believes the package is
584             # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
585             # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
586             # install" ensures that we've actually installed the local package
587             # we just built.
588             cd "$WORKSPACE/$1" \
589                 && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
590                 && cd "$WORKSPACE" \
591                 && "${3}pip" install --quiet "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
592                 && "${3}pip" install --quiet --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
593         elif [[ "$2" != "" ]]
594         then
595             "install_$2"
596         else
597             "install_$1"
598         fi
599         result=$?
600         checkexit $result "$1 install"
601         title "End of $1 install (`timer`)"
602         return $result
603     else
604         title "Skipping $1 install"
605     fi
606 }
607
608 bundle_install_trylocal() {
609     (
610         set -e
611         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
612         if ! bundle install --local --no-deployment; then
613             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
614             bundle install --no-deployment
615         fi
616         bundle package --all
617     )
618 }
619
620 install_doc() {
621     cd "$WORKSPACE/doc" \
622         && bundle_install_trylocal \
623         && rm -rf .site
624 }
625 do_install doc
626
627 install_gem() {
628     gemname=$1
629     srcpath=$2
630     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
631         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
632         && bundle_install_trylocal \
633         && gem build "$gemname.gemspec" \
634         && with_test_gemset gem install --no-ri --no-rdoc $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
635 }
636
637 install_ruby_sdk() {
638     install_gem arvados sdk/ruby
639 }
640 do_install sdk/ruby ruby_sdk
641
642 install_perl_sdk() {
643     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
644         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
645         && make install INSTALLDIRS=perl
646 }
647 do_install sdk/perl perl_sdk
648
649 install_cli() {
650     install_gem arvados-cli sdk/cli
651 }
652 do_install sdk/cli cli
653
654 install_login-sync() {
655     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
656 }
657 do_install services/login-sync login-sync
658
659 # Install the Python SDK early. Various other test suites (like
660 # keepproxy) bring up run_test_server.py, which imports the arvados
661 # module. We can't actually *test* the Python SDK yet though, because
662 # its own test suite brings up some of those other programs (like
663 # keepproxy).
664 declare -a pythonstuff
665 pythonstuff=(
666     sdk/pam
667     sdk/python
668     sdk/cwl
669     services/fuse
670     services/nodemanager
671     tools/crunchstat-summary
672     )
673 for p in "${pythonstuff[@]}"
674 do
675     do_install "$p" pip
676 done
677 if [ -n "$PYTHON3" ]; then
678     do_install services/dockercleaner pip "$VENV3DIR/bin/"
679 fi
680
681 install_apiserver() {
682     cd "$WORKSPACE/services/api" \
683         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
684
685     rm -f config/environments/test.rb
686     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
687
688     if [ -n "$CONFIGSRC" ]
689     then
690         for f in database.yml application.yml
691         do
692             cp "$CONFIGSRC/$f" config/ || fatal "$f"
693         done
694     fi
695
696     # Fill in a random secret_token and blob_signing_key for testing
697     SECRET_TOKEN=`echo 'puts rand(2**512).to_s(36)' |ruby`
698     BLOB_SIGNING_KEY=`echo 'puts rand(2**512).to_s(36)' |ruby`
699
700     sed -i'' -e "s:SECRET_TOKEN:$SECRET_TOKEN:" config/application.yml
701     sed -i'' -e "s:BLOB_SIGNING_KEY:$BLOB_SIGNING_KEY:" config/application.yml
702
703     # Set up empty git repo (for git tests)
704     GITDIR=$(mktemp -d)
705     sed -i'' -e "s:/var/cache/git:$GITDIR:" config/application.default.yml
706
707     rm -rf $GITDIR
708     mkdir -p $GITDIR/test
709     cd $GITDIR/test \
710         && git init \
711         && git config user.email "jenkins@ci.curoverse.com" \
712         && git config user.name "Jenkins, CI" \
713         && touch tmp \
714         && git add tmp \
715         && git commit -m 'initial commit'
716
717     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
718     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
719     # is a postgresql superuser.
720     cd "$WORKSPACE/services/api" \
721         && test_database=$(python -c "import yaml; print yaml.load(file('config/database.yml'))['test']['database']") \
722         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.procpid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
723
724     cd "$WORKSPACE/services/api" \
725         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:drop \
726         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:setup \
727         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:fixtures:load
728 }
729 do_install services/api apiserver
730
731 declare -a gostuff
732 gostuff=(
733     sdk/go/arvados
734     sdk/go/arvadosclient
735     sdk/go/blockdigest
736     sdk/go/httpserver
737     sdk/go/manifest
738     sdk/go/streamer
739     sdk/go/crunchrunner
740     lib/crunchstat
741     services/arv-git-httpd
742     services/crunchstat
743     services/keep-web
744     services/keepstore
745     sdk/go/keepclient
746     services/keep-balance
747     services/keepproxy
748     services/datamanager/summary
749     services/datamanager/collection
750     services/datamanager/keep
751     services/datamanager
752     services/crunch-dispatch-local
753     services/crunch-dispatch-slurm
754     services/crunch-run
755     tools/keep-rsync
756     tools/keep-block-check
757     )
758 for g in "${gostuff[@]}"
759 do
760     do_install "$g" go
761 done
762
763 install_workbench() {
764     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
765         && mkdir -p tmp/cache \
766         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
767 }
768 do_install apps/workbench workbench
769
770 test_doclinkchecker() {
771     (
772         set -e
773         cd "$WORKSPACE/doc"
774         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
775         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
776         # do much good!
777         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ bundle exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
778     )
779 }
780 do_test doc doclinkchecker
781
782 stop_services
783
784 test_apiserver() {
785     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
786     cd "$WORKSPACE/services/api" \
787         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/api]}
788 }
789 do_test services/api apiserver
790
791 # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
792 # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
793 if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
794   rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
795   exit_cleanly
796 fi
797
798 start_api
799
800 test_ruby_sdk() {
801     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
802         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
803 }
804 do_test sdk/ruby ruby_sdk
805
806 test_cli() {
807     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
808         && mkdir -p /tmp/keep \
809         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
810 }
811 do_test sdk/cli cli
812
813 test_login-sync() {
814     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
815         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
816 }
817 do_test services/login-sync login-sync
818
819 for p in "${pythonstuff[@]}"
820 do
821     do_test "$p" pip
822 done
823 do_test services/dockercleaner pip "$VENV3DIR/bin/"
824
825 for g in "${gostuff[@]}"
826 do
827     do_test "$g" go
828 done
829
830 test_workbench_units() {
831     start_nginx_proxy_services \
832         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
833         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:units TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
834 }
835 do_test apps/workbench_units workbench_units
836
837 test_workbench_functionals() {
838     start_nginx_proxy_services \
839         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
840         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:functionals TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
841 }
842 do_test apps/workbench_functionals workbench_functionals
843
844 test_workbench_integration() {
845     start_nginx_proxy_services \
846         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
847         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:integration TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
848 }
849 do_test apps/workbench_integration workbench_integration
850
851
852 test_workbench_benchmark() {
853     start_nginx_proxy_services \
854         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
855         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:benchmark ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
856 }
857 do_test apps/workbench_benchmark workbench_benchmark
858
859 test_workbench_profile() {
860     start_nginx_proxy_services \
861         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
862         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:profile ${testargs[apps/workbench_profile]}
863 }
864 do_test apps/workbench_profile workbench_profile
865
866 exit_cleanly