build/run-tests.sh

   1 #!/bin/bash
   2
   3 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin
   4
   5 COLUMNS=80
   6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
   7
   8 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
   9 $(basename $0): Install and test Arvados components.
  10
  11 Exit non-zero if any tests fail.
  12
  13 Syntax:
  14         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
  15
  16 Options:
  17
  18 --skip FOO     Do not test the FOO component.
  19 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
  20 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
  21                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
  22 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
  23                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
  24                subsequent invocations.
  25 --repeat N     Repeat each install/test step until it succeeds N times.
  26 --retry        Prompt to retry if an install or test suite fails.
  27 --skip-install Do not run any install steps. Just run tests.
  28                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
  29                from a previous invocation if you use this option.
  30 --only-install Run specific install step
  31 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
  32 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
  33 CONFIGSRC=path Dir with api server config files to copy into source tree.
  34                (If none given, leave config files alone in source tree.)
  35 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
  36                Restrict apiserver tests to the given file
  37 sdk/python_test="--test-suite test.test_keep_locator"
  38                Restrict Python SDK tests to the given class
  39 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
  40                Restrict Workbench tests to the given file
  41 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
  42                Show all log messages, even when tests pass (also works
  43                with services/keepstore_test etc.)
  44 ARVADOS_DEBUG=1
  45                Print more debug messages
  46 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
  47                *_test, and other examples shown above.
  48
  49 Assuming --skip-install is not given, all components are installed
  50 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
  51 test suites depend on other components being installed, and installing
  52 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
  53
  54 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
  55 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
  56
  57 More information and background:
  58
  59 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
  60
  61 Available tests:
  62
  63 apps/workbench (*)
  64 apps/workbench_units (*)
  65 apps/workbench_functionals (*)
  66 apps/workbench_integration (*)
  67 apps/workbench_benchmark
  68 apps/workbench_profile
  69 doc
  70 services/api
  71 services/arv-git-httpd
  72 services/crunchstat
  73 services/dockercleaner
  74 services/fuse
  75 services/keep-web
  76 services/keepproxy
  77 services/keepstore
  78 services/keep-balance
  79 services/login-sync
  80 services/nodemanager
  81 services/crunch-run
  82 services/crunch-dispatch-local
  83 services/crunch-dispatch-slurm
  84 services/ws
  85 sdk/cli
  86 sdk/pam
  87 sdk/python
  88 sdk/ruby
  89 sdk/go/arvados
  90 sdk/go/arvadosclient
  91 sdk/go/dispatch
  92 sdk/go/keepclient
  93 sdk/go/httpserver
  94 sdk/go/manifest
  95 sdk/go/blockdigest
  96 sdk/go/streamer
  97 sdk/go/stats
  98 sdk/go/crunchrunner
  99 sdk/cwl
 100 tools/crunchstat-summary
 101 tools/keep-exercise
 102 tools/keep-rsync
 103 tools/keep-block-check
 104
 105 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
 106     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
 107
 108 EOF
 109
 110 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
 111 # environment that could interfere with the tests.
 112 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
 113
 114 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
 115 # accident.
 116 GITDIR=
 117 GOPATH=
 118 VENVDIR=
 119 VENV3DIR=
 120 PYTHONPATH=
 121 GEMHOME=
 122 PERLINSTALLBASE=
 123
 124 short=
 125 only_install=
 126 temp=
 127 temp_preserve=
 128
 129 clear_temp() {
 130     if [[ -z "$temp" ]]; then
 131         # we didn't even get as far as making a temp dir
 132         :
 133     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
 134         rm -rf "$temp"
 135     else
 136         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
 137     fi
 138 }
 139
 140 fatal() {
 141     clear_temp
 142     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
 143     exit 1
 144 }
 145
 146 exit_cleanly() {
 147     trap - INT
 148     create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
 149     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 150     stop_services
 151     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 152     report_outcomes
 153     clear_temp
 154     exit ${#failures}
 155 }
 156
 157 sanity_checks() {
 158     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
 159         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
 160     echo Checking dependencies:
 161     echo -n 'virtualenv: '
 162     virtualenv --version \
 163         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
 164     echo -n 'ruby: '
 165     ruby -v \
 166         || fatal "No ruby. Install >=2.1.9 (using rbenv, rvm, or source)"
 167     echo -n 'bundler: '
 168     bundle version \
 169         || fatal "No bundler. Try: gem install bundler"
 170     echo -n 'go: '
 171     go version \
 172         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
 173     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 7 ]] \
 174         || fatal "Go >= 1.7 required. See http://golang.org/doc/install"
 175     echo -n 'gcc: '
 176     gcc --version | egrep ^gcc \
 177         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
 178     echo -n 'fuse.h: '
 179     find /usr/include -wholename '*fuse/fuse.h' \
 180         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
 181     echo -n 'pyconfig.h: '
 182     find /usr/include -name pyconfig.h | egrep --max-count=1 . \
 183         || fatal "No pyconfig.h. Try: apt-get install python-dev"
 184     echo -n 'nginx: '
 185     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
 186         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
 187     echo -n 'perl: '
 188     perl -v | grep version \
 189         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
 190     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
 191         echo -n "perl $mod: "
 192         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
 193             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
 194     done
 195     echo -n 'gitolite: '
 196     which gitolite \
 197         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
 198 }
 199
 200 rotate_logfile() {
 201   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 202   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
 203   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
 204     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
 205     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 206     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 207   fi
 208 }
 209
 210 declare -a failures
 211 declare -A skip
 212 declare -A testargs
 213 skip[apps/workbench_profile]=1
 214
 215 while [[ -n "$1" ]]
 216 do
 217     arg="$1"; shift
 218     case "$arg" in
 219         --help)
 220             echo >&2 "$helpmessage"
 221             echo >&2
 222             exit 1
 223             ;;
 224         --skip)
 225             skip[$1]=1; shift
 226             ;;
 227         --only)
 228             only="$1"; skip[$1]=""; shift
 229             ;;
 230         --short)
 231             short=1
 232             ;;
 233         --skip-install)
 234             only_install=nothing
 235             ;;
 236         --only-install)
 237             only_install="$1"; shift
 238             ;;
 239         --temp)
 240             temp="$1"; shift
 241             temp_preserve=1
 242             ;;
 243         --leave-temp)
 244             temp_preserve=1
 245             ;;
 246         --repeat)
 247             repeat=$((${1}+0)); shift
 248             ;;
 249         --retry)
 250             retry=1
 251             ;;
 252         *_test=*)
 253             suite="${arg%%_test=*}"
 254             args="${arg#*=}"
 255             testargs["$suite"]="$args"
 256             ;;
 257         *=*)
 258             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
 259             ;;
 260         *)
 261             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
 262             exit 1
 263             ;;
 264     esac
 265 done
 266
 267 start_api() {
 268     echo 'Starting API server...'
 269     cd "$WORKSPACE" \
 270         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
 271         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
 272         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
 273         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 274         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
 275         && (env | egrep ^ARVADOS)
 276 }
 277
 278 start_nginx_proxy_services() {
 279     echo 'Starting keepproxy, keep-web, ws, arv-git-httpd, and nginx ssl proxy...'
 280     cd "$WORKSPACE" \
 281         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
 282         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
 283         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
 284         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 285         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
 286         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1
 287 }
 288
 289 stop_services() {
 290     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES" ]]; then
 291         unset ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
 292         cd "$WORKSPACE" \
 293             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 294             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
 295             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 296             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
 297             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy
 298     fi
 299     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
 300         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
 301         cd "$WORKSPACE" \
 302             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 303             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 304             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop
 305     fi
 306 }
 307
 308 interrupt() {
 309     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
 310     exit_cleanly
 311 }
 312 trap interrupt INT
 313
 314 sanity_checks
 315
 316 echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
 317
 318 if [[ -z "$CONFIGSRC" ]] && [[ -d "$HOME/arvados-api-server" ]]; then
 319     # Jenkins expects us to use this by default.
 320     CONFIGSRC="$HOME/arvados-api-server"
 321 fi
 322
 323 # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
 324 cd "$WORKSPACE"
 325 find -name '*.pyc' -delete
 326
 327 if [[ -z "$temp" ]]; then
 328     temp="$(mktemp -d)"
 329 fi
 330
 331 # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
 332 for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE
 333 do
 334     if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
 335         eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
 336     fi
 337     if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
 338         mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
 339     fi
 340 done
 341
 342 setup_ruby_environment() {
 343     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 344       source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
 345       using_rvm=true
 346     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 347       source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
 348       using_rvm=true
 349     else
 350       using_rvm=false
 351     fi
 352
 353     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 354         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
 355         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
 356         # the environment to the "current gemset", which would lose
 357         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
 358         # programs (for example, the Workbench test suite could not
 359         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
 360         # rvm gemset and use it for everything.
 361
 362         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
 363             || fatal 'rvm check'
 364
 365         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
 366         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
 367         # complaint about not being in first place already.
 368         rvm use @default 2>/dev/null
 369
 370         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
 371         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
 372         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
 373         # ruby to the caller.
 374         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
 375         rvm use "@${gemset}" --create \
 376             || fatal 'rvm gemset setup'
 377
 378         rvm env
 379     else
 380         # When our "bundle install"s need to install new gems to
 381         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
 382         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
 383         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
 384         # should be installed, and we should leave it alone.)
 385
 386         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
 387             user_gempath="$(gem env gempath)"
 388             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
 389         fi
 390         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
 391
 392         # When we build and install our own gems, we install them in our
 393         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
 394         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
 395         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
 396
 397         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
 398         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
 399         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home:$(gem env gempath)"
 400
 401         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
 402         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
 403         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
 404     fi
 405 }
 406
 407 with_test_gemset() {
 408     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 409         "$@"
 410     else
 411         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
 412     fi
 413 }
 414
 415 gem_uninstall_if_exists() {
 416     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
 417         gem uninstall --force --all --executables "$1"
 418     fi
 419 }
 420
 421 setup_virtualenv() {
 422     local venvdest="$1"; shift
 423     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
 424         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
 425     fi
 426     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
 427         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
 428         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
 429     else
 430         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
 431     fi
 432     # ubuntu1404 can't seem to install mock via tests_require, but it can do this.
 433     "$venvdest/bin/pip" install 'mock>=1.0' 'pbr<1.7.0'
 434 }
 435
 436 export PERLINSTALLBASE
 437 export PERLLIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5:${PERLLIB:+$PERLLIB}"
 438
 439 export GOPATH
 440 mkdir -p "$GOPATH/src/git.curoverse.com"
 441 ln -sfn "$WORKSPACE" "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" \
 442     || fatal "symlink failed"
 443
 444 setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
 445 . "$VENVDIR/bin/activate"
 446
 447 # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
 448 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^PyYAML= \
 449     || pip install PyYAML >/dev/null \
 450     || fatal "pip install PyYAML failed"
 451
 452 # Preinstall forked version of libcloud, because nodemanager "pip install"
 453 # won't pick it up by default.
 454 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
 455     || pip install --pre --ignore-installed https://github.com/curoverse/libcloud/archive/apache-libcloud-$LIBCLOUD_PIN.zip >/dev/null \
 456     || fatal "pip install apache-libcloud failed"
 457
 458 # Uninstall old llfuse (<1.0), because services/fuse "pip install"
 459 # won't upgrade it by default.
 460 if pip freeze | egrep '^llfuse==0'; then
 461     yes | pip uninstall 'llfuse<1.0'
 462 fi
 463
 464 # Deactivate Python 2 virtualenv
 465 deactivate
 466
 467 declare -a pythonstuff
 468 pythonstuff=(
 469     sdk/pam
 470     sdk/python
 471     sdk/cwl
 472     services/fuse
 473     services/nodemanager
 474     tools/crunchstat-summary
 475     )
 476
 477 declare -a python3stuff
 478 python3stuff=(
 479     sdk/python
 480     services/dockercleaner
 481 )
 482
 483 # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
 484 # Otherwise, skip dependent tests.
 485 PYTHON3=$(which python3)
 486 if [[ ${?} = 0 ]]; then
 487     setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
 488 else
 489     cat >&2 <<EOF
 490
 491 Warning: python3 could not be found. The following tests will be skipped:
 492
 493   ${python3stuff}
 494
 495 EOF
 496     python3stuff=()
 497 fi
 498
 499 # Reactivate Python 2 virtualenv
 500 . "$VENVDIR/bin/activate"
 501
 502 # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
 503 # whine a lot.
 504 setup_ruby_environment
 505
 506 echo "PATH is $PATH"
 507
 508 if ! which bundler >/dev/null
 509 then
 510     gem install --user-install bundler || fatal 'Could not install bundler'
 511 fi
 512
 513 retry() {
 514     remain="${repeat}"
 515     while :
 516     do
 517         if ${@}; then
 518             if [[ "$remain" -gt 1 ]]; then
 519                 remain=$((${remain}-1))
 520                 title "Repeating ${remain} more times"
 521             else
 522                 break
 523             fi
 524         elif [[ "$retry" == 1 ]]; then
 525             read -p 'Try again? [Y/n] ' x
 526             if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
 527             then
 528                 break
 529             fi
 530         else
 531             break
 532         fi
 533     done
 534 }
 535
 536 do_test() {
 537     case "${1}" in
 538         apps/workbench_units | apps/workbench_functionals | apps/workbench_integration)
 539             suite=apps/workbench
 540             ;;
 541         *)
 542             suite="${1}"
 543             ;;
 544     esac
 545     if [[ -z "${skip[$suite]}" && -z "${skip[$1]}" && \
 546                 (-z "${only}" || "${only}" == "${suite}" || \
 547                  "${only}" == "${1}") ]]; then
 548         retry do_test_once ${@}
 549     else
 550         title "Skipping ${1} tests"
 551     fi
 552 }
 553
 554 do_test_once() {
 555     unset result
 556
 557     title "Running $1 tests"
 558     timer_reset
 559     if [[ "$2" == "go" ]]
 560     then
 561         covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
 562         coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
 563         # We do "go get -t" here to catch compilation errors
 564         # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
 565         # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
 566         # compilation errors.
 567         go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 568             cd "$WORKSPACE/$1" && \
 569             [[ -z "$(gofmt -e -d . | tee /dev/stderr)" ]] && \
 570             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
 571         then
 572             # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
 573             # does:
 574             go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
 575         else
 576             # The above form gets verbose even when testargs is
 577             # empty, so use this form in such cases:
 578             go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 579         fi
 580         result=${result:-$?}
 581         if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
 582         then
 583             go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
 584             rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
 585         fi
 586     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 587     then
 588         tries=0
 589         cd "$WORKSPACE/$1" && while :
 590         do
 591             tries=$((${tries}+1))
 592             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 593             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 594             "${3}python" setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
 595             result=$?
 596             if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
 597             then
 598                 printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
 599                 continue
 600             else
 601                 break
 602             fi
 603         done
 604     elif [[ "$2" != "" ]]
 605     then
 606         "test_$2"
 607     else
 608         "test_$1"
 609     fi
 610     result=${result:-$?}
 611     checkexit $result "$1 tests"
 612     title "End of $1 tests (`timer`)"
 613     return $result
 614 }
 615
 616 do_install() {
 617     if [[ -z "${only_install}" || "${only_install}" == "${1}" ]]; then
 618         retry do_install_once ${@}
 619     else
 620         title "Skipping $1 install"
 621     fi
 622 }
 623
 624 do_install_once() {
 625     title "Running $1 install"
 626     timer_reset
 627     if [[ "$2" == "go" ]]
 628     then
 629         go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 630     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 631     then
 632         # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 633         # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 634
 635         # Need to change to a different directory after creating
 636         # the source dist package to avoid a pip bug.
 637         # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
 638
 639         # Also need to install twice, because if it believes the package is
 640         # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
 641         # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
 642         # install" ensures that we've actually installed the local package
 643         # we just built.
 644         cd "$WORKSPACE/$1" \
 645             && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
 646             && cd "$WORKSPACE" \
 647             && "${3}pip" install --quiet "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
 648             && "${3}pip" install --quiet --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
 649     elif [[ "$2" != "" ]]
 650     then
 651         "install_$2"
 652     else
 653         "install_$1"
 654     fi
 655     result=$?
 656     checkexit $result "$1 install"
 657     title "End of $1 install (`timer`)"
 658     return $result
 659 }
 660
 661 bundle_install_trylocal() {
 662     (
 663         set -e
 664         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
 665         if ! bundle install --local --no-deployment; then
 666             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
 667             bundle install --no-deployment
 668         fi
 669         bundle package --all
 670     )
 671 }
 672
 673 install_doc() {
 674     cd "$WORKSPACE/doc" \
 675         && bundle_install_trylocal \
 676         && rm -rf .site
 677 }
 678 do_install doc
 679
 680 install_gem() {
 681     gemname=$1
 682     srcpath=$2
 683     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
 684         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
 685         && bundle_install_trylocal \
 686         && gem build "$gemname.gemspec" \
 687         && with_test_gemset gem install --no-ri --no-rdoc $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
 688 }
 689
 690 install_ruby_sdk() {
 691     install_gem arvados sdk/ruby
 692 }
 693 do_install sdk/ruby ruby_sdk
 694
 695 install_perl_sdk() {
 696     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
 697         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
 698         && make install INSTALLDIRS=perl
 699 }
 700 do_install sdk/perl perl_sdk
 701
 702 install_cli() {
 703     install_gem arvados-cli sdk/cli
 704 }
 705 do_install sdk/cli cli
 706
 707 install_login-sync() {
 708     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
 709 }
 710 do_install services/login-sync login-sync
 711
 712 # Install the Python SDK early. Various other test suites (like
 713 # keepproxy) bring up run_test_server.py, which imports the arvados
 714 # module. We can't actually *test* the Python SDK yet though, because
 715 # its own test suite brings up some of those other programs (like
 716 # keepproxy).
 717 for p in "${pythonstuff[@]}"
 718 do
 719     do_install "$p" pip
 720 done
 721
 722 for p in "${python3stuff[@]}"
 723 do
 724     do_install "$p" pip "$VENV3DIR/bin/"
 725 done
 726
 727 install_apiserver() {
 728     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 729         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 730
 731     rm -f config/environments/test.rb
 732     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
 733
 734     if [ -n "$CONFIGSRC" ]
 735     then
 736         for f in database.yml application.yml
 737         do
 738             cp "$CONFIGSRC/$f" config/ || fatal "$f"
 739         done
 740     fi
 741
 742     # Fill in a random secret_token and blob_signing_key for testing
 743     SECRET_TOKEN=`echo 'puts rand(2**512).to_s(36)' |ruby`
 744     BLOB_SIGNING_KEY=`echo 'puts rand(2**512).to_s(36)' |ruby`
 745
 746     sed -i'' -e "s:SECRET_TOKEN:$SECRET_TOKEN:" config/application.yml
 747     sed -i'' -e "s:BLOB_SIGNING_KEY:$BLOB_SIGNING_KEY:" config/application.yml
 748
 749     # Set up empty git repo (for git tests)
 750     GITDIR=$(mktemp -d)
 751     sed -i'' -e "s:/var/cache/git:$GITDIR:" config/application.default.yml
 752
 753     rm -rf $GITDIR
 754     mkdir -p $GITDIR/test
 755     cd $GITDIR/test \
 756         && git init \
 757         && git config user.email "jenkins@ci.curoverse.com" \
 758         && git config user.name "Jenkins, CI" \
 759         && touch tmp \
 760         && git add tmp \
 761         && git commit -m 'initial commit'
 762
 763     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
 764     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
 765     # is a postgresql superuser.
 766     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 767         && test_database=$(python -c "import yaml; print yaml.load(file('config/database.yml'))['test']['database']") \
 768         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.procpid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
 769
 770     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 771         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:drop \
 772         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:setup \
 773         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:fixtures:load
 774 }
 775 do_install services/api apiserver
 776
 777 declare -a gostuff
 778 gostuff=(
 779     sdk/go/arvados
 780     sdk/go/arvadosclient
 781     sdk/go/blockdigest
 782     sdk/go/dispatch
 783     sdk/go/httpserver
 784     sdk/go/manifest
 785     sdk/go/streamer
 786     sdk/go/crunchrunner
 787     sdk/go/stats
 788     lib/crunchstat
 789     services/arv-git-httpd
 790     services/crunchstat
 791     services/keep-web
 792     services/keepstore
 793     sdk/go/keepclient
 794     services/keep-balance
 795     services/keepproxy
 796     services/crunch-dispatch-local
 797     services/crunch-dispatch-slurm
 798     services/crunch-run
 799     services/ws
 800     tools/keep-block-check
 801     tools/keep-exercise
 802     tools/keep-rsync
 803     )
 804 for g in "${gostuff[@]}"
 805 do
 806     do_install "$g" go
 807 done
 808
 809 install_workbench() {
 810     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 811         && mkdir -p tmp/cache \
 812         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 813 }
 814 do_install apps/workbench workbench
 815
 816 test_doclinkchecker() {
 817     (
 818         set -e
 819         cd "$WORKSPACE/doc"
 820         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
 821         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
 822         # do much good!
 823         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ bundle exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
 824     )
 825 }
 826 do_test doc doclinkchecker
 827
 828 stop_services
 829
 830 test_apiserver() {
 831     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
 832     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 833         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/api]}
 834 }
 835 do_test services/api apiserver
 836
 837 # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
 838 # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
 839 if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
 840   rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 841   exit_cleanly
 842 fi
 843
 844 start_api
 845
 846 test_ruby_sdk() {
 847     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
 848         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
 849 }
 850 do_test sdk/ruby ruby_sdk
 851
 852 test_cli() {
 853     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
 854         && mkdir -p /tmp/keep \
 855         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
 856 }
 857 do_test sdk/cli cli
 858
 859 test_login-sync() {
 860     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
 861         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
 862 }
 863 do_test services/login-sync login-sync
 864
 865 for p in "${pythonstuff[@]}"
 866 do
 867     do_test "$p" pip
 868 done
 869
 870 for p in "${python3stuff[@]}"
 871 do
 872     do_test "$p" pip "$VENV3DIR/bin/"
 873 done
 874
 875 for g in "${gostuff[@]}"
 876 do
 877     do_test "$g" go
 878 done
 879
 880 test_workbench_units() {
 881     start_nginx_proxy_services \
 882         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 883         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:units TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 884 }
 885 do_test apps/workbench_units workbench_units
 886
 887 test_workbench_functionals() {
 888     start_nginx_proxy_services \
 889         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 890         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:functionals TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 891 }
 892 do_test apps/workbench_functionals workbench_functionals
 893
 894 test_workbench_integration() {
 895     start_nginx_proxy_services \
 896         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 897         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:integration TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 898 }
 899 do_test apps/workbench_integration workbench_integration
 900
 901
 902 test_workbench_benchmark() {
 903     start_nginx_proxy_services \
 904         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 905         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:benchmark ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
 906 }
 907 do_test apps/workbench_benchmark workbench_benchmark
 908
 909 test_workbench_profile() {
 910     start_nginx_proxy_services \
 911         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 912         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:profile ${testargs[apps/workbench_profile]}
 913 }
 914 do_test apps/workbench_profile workbench_profile
 915
 916 exit_cleanly