sdk/cwl/tests/federation/arvbox-make-federation.cwl

   1 # Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
   2 #
   3 # SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
   4
   5 cwlVersion: v1.1
   6 class: Workflow
   7 $namespaces:
   8   arv: "http://arvados.org/cwl#"
   9   cwltool: "http://commonwl.org/cwltool#"
  10 requirements:
  11   ScatterFeatureRequirement: {}
  12   StepInputExpressionRequirement: {}
  13   LoadListingRequirement:
  14     loadListing: no_listing
  15   InlineJavascriptRequirement: {}
  16 inputs:
  17   containers:
  18     type: string[]
  19     default: [fedbox1, fedbox2, fedbox3]
  20   arvbox_base: Directory
  21   in_acr: string?
  22   insecure:
  23     type: boolean
  24     default: true
  25   arvbox:
  26     type: File
  27     default:
  28       class: File
  29       location: ../../../../tools/arvbox/bin/arvbox
  30   branch:
  31     type: string
  32     default: master
  33   logincluster:
  34     type: boolean
  35     default: false
  36   arvbox_mode:
  37     type: string?
  38     default: "dev"
  39 outputs:
  40   arvados_api_token:
  41     type: string
  42     outputSource: setup-user/test_user_token
  43   arvados_api_hosts:
  44     type: string[]
  45     outputSource: start/container_host
  46   arvados_cluster_ids:
  47     type: string[]
  48     outputSource: start/cluster_id
  49   superuser_tokens:
  50     type: string[]
  51     outputSource: start/superuser_token
  52   acr:
  53     type: string?
  54     outputSource: in_acr
  55   arvado_api_host_insecure:
  56     type: boolean
  57     outputSource: insecure
  58   arvbox_containers:
  59     type: string[]
  60     outputSource: containers
  61   arvbox_bin:
  62     type: File
  63     outputSource: arvbox
  64 steps:
  65   mkdir:
  66     in:
  67       containers: containers
  68       arvbox_base: arvbox_base
  69     out: [arvbox_data]
  70     run: arvboxcwl/mkdir.cwl
  71   start:
  72     in:
  73       container_name: containers
  74       arvbox_data: mkdir/arvbox_data
  75       arvbox_bin: arvbox
  76       branch: branch
  77       arvbox_mode: arvbox_mode
  78     out: [cluster_id, container_host, arvbox_data_out, superuser_token]
  79     scatter: [container_name, arvbox_data]
  80     scatterMethod: dotproduct
  81     run: arvboxcwl/start.cwl
  82   fed-config:
  83     in:
  84       container_name: containers
  85       this_cluster_id: start/cluster_id
  86       cluster_ids: start/cluster_id
  87       cluster_hosts: start/container_host
  88       arvbox_data: start/arvbox_data_out
  89       arvbox_bin: arvbox
  90       logincluster: logincluster
  91     out: []
  92     scatter: [container_name, this_cluster_id, arvbox_data]
  93     scatterMethod: dotproduct
  94     run: arvboxcwl/fed-config.cwl
  95   setup-user:
  96     in:
  97       container_host: {source: start/container_host, valueFrom: "$(self[0])"}
  98       superuser_token: {source: start/superuser_token, valueFrom: "$(self[0])"}
  99     out: [test_user_uuid, test_user_token]
 100     run: arvboxcwl/setup-user.cwl