build/run-tests.sh

   1 #!/bin/bash
   2
   3 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin
   4
   5 COLUMNS=80
   6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
   7
   8 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
   9 $(basename $0): Install and test Arvados components.
  10
  11 Exit non-zero if any tests fail.
  12
  13 Syntax:
  14         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
  15
  16 Options:
  17
  18 --skip FOO     Do not test the FOO component.
  19 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
  20 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
  21                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
  22 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
  23                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
  24                subsequent invocations.
  25 --skip-install Do not run any install steps. Just run tests.
  26                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
  27                from a previous invocation if you use this option.
  28 --only-install Run specific install step
  29 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
  30 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
  31 CONFIGSRC=path Dir with api server config files to copy into source tree.
  32                (If none given, leave config files alone in source tree.)
  33 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
  34                Restrict apiserver tests to the given file
  35 sdk/python_test="--test-suite test.test_keep_locator"
  36                Restrict Python SDK tests to the given class
  37 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
  38                Restrict Workbench tests to the given file
  39 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
  40                Show all log messages, even when tests pass (also works
  41                with services/keepstore_test etc.)
  42 ARVADOS_DEBUG=1
  43                Print more debug messages
  44 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
  45                *_test, and other examples shown above.
  46
  47 Assuming --skip-install is not given, all components are installed
  48 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
  49 test suites depend on other components being installed, and installing
  50 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
  51
  52 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
  53 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
  54
  55 More information and background:
  56
  57 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
  58
  59 Available tests:
  60
  61 apps/workbench (*)
  62 apps/workbench_units (*)
  63 apps/workbench_functionals (*)
  64 apps/workbench_integration (*)
  65 apps/workbench_benchmark
  66 apps/workbench_profile
  67 doc
  68 services/api
  69 services/arv-git-httpd
  70 services/crunchstat
  71 services/dockercleaner
  72 services/fuse
  73 services/keep-web
  74 services/keepproxy
  75 services/keepstore
  76 services/keep-balance
  77 services/login-sync
  78 services/nodemanager
  79 services/crunch-run
  80 services/crunch-dispatch-local
  81 services/crunch-dispatch-slurm
  82 sdk/cli
  83 sdk/pam
  84 sdk/python
  85 sdk/ruby
  86 sdk/go/arvados
  87 sdk/go/arvadosclient
  88 sdk/go/keepclient
  89 sdk/go/httpserver
  90 sdk/go/manifest
  91 sdk/go/blockdigest
  92 sdk/go/streamer
  93 sdk/go/crunchrunner
  94 sdk/cwl
  95 tools/crunchstat-summary
  96 tools/keep-exercise
  97 tools/keep-rsync
  98 tools/keep-block-check
  99
 100 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
 101     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
 102
 103 EOF
 104
 105 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
 106 # environment that could interfere with the tests.
 107 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
 108
 109 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
 110 # accident.
 111 GITDIR=
 112 GOPATH=
 113 VENVDIR=
 114 VENV3DIR=
 115 PYTHONPATH=
 116 GEMHOME=
 117 PERLINSTALLBASE=
 118
 119 short=
 120 skip_install=
 121 temp=
 122 temp_preserve=
 123
 124 clear_temp() {
 125     if [[ -z "$temp" ]]; then
 126         # we didn't even get as far as making a temp dir
 127         :
 128     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
 129         rm -rf "$temp"
 130     else
 131         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
 132     fi
 133 }
 134
 135 fatal() {
 136     clear_temp
 137     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
 138     exit 1
 139 }
 140
 141 exit_cleanly() {
 142     trap - INT
 143     create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
 144     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 145     stop_services
 146     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 147     report_outcomes
 148     clear_temp
 149     exit ${#failures}
 150 }
 151
 152 sanity_checks() {
 153     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
 154         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
 155     echo Checking dependencies:
 156     echo -n 'virtualenv: '
 157     virtualenv --version \
 158         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
 159     echo -n 'ruby: '
 160     ruby -v \
 161         || fatal "No ruby. Install >=2.1.9 (using rbenv, rvm, or source)"
 162     echo -n 'bundler: '
 163     bundle version \
 164         || fatal "No bundler. Try: gem install bundler"
 165     echo -n 'go: '
 166     go version \
 167         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
 168     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 7 ]] \
 169         || fatal "Go >= 1.7 required. See http://golang.org/doc/install"
 170     echo -n 'gcc: '
 171     gcc --version | egrep ^gcc \
 172         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
 173     echo -n 'fuse.h: '
 174     find /usr/include -wholename '*fuse/fuse.h' \
 175         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
 176     echo -n 'pyconfig.h: '
 177     find /usr/include -name pyconfig.h | egrep --max-count=1 . \
 178         || fatal "No pyconfig.h. Try: apt-get install python-dev"
 179     echo -n 'nginx: '
 180     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
 181         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
 182     echo -n 'perl: '
 183     perl -v | grep version \
 184         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
 185     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
 186         echo -n "perl $mod: "
 187         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
 188             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
 189     done
 190     echo -n 'gitolite: '
 191     which gitolite \
 192         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
 193 }
 194
 195 rotate_logfile() {
 196   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 197   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
 198   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
 199     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
 200     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 201     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 202   fi
 203 }
 204
 205 declare -a failures
 206 declare -A skip
 207 declare -A testargs
 208 skip[apps/workbench_profile]=1
 209
 210 while [[ -n "$1" ]]
 211 do
 212     arg="$1"; shift
 213     case "$arg" in
 214         --help)
 215             echo >&2 "$helpmessage"
 216             echo >&2
 217             exit 1
 218             ;;
 219         --skip)
 220             skipwhat="$1"; shift
 221             if [[ "$skipwhat" == "apps/workbench" ]]; then
 222               skip["apps/workbench_units"]=1
 223               skip["apps/workbench_functionals"]=1
 224               skip["apps/workbench_integration"]=1
 225             else
 226               skip[$skipwhat]=1
 227             fi
 228             ;;
 229         --only)
 230             only="$1"; skip[$1]=""; shift
 231             ;;
 232         --short)
 233             short=1
 234             ;;
 235         --skip-install)
 236             skip_install=1
 237             ;;
 238         --only-install)
 239             skip_install=1
 240             only_install="$1"; shift
 241             ;;
 242         --temp)
 243             temp="$1"; shift
 244             temp_preserve=1
 245             ;;
 246         --leave-temp)
 247             temp_preserve=1
 248             ;;
 249         --retry)
 250             retry=1
 251             ;;
 252         *_test=*)
 253             suite="${arg%%_test=*}"
 254             args="${arg#*=}"
 255             testargs["$suite"]="$args"
 256             ;;
 257         *=*)
 258             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
 259             ;;
 260         *)
 261             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
 262             exit 1
 263             ;;
 264     esac
 265 done
 266
 267 start_api() {
 268     echo 'Starting API server...'
 269     cd "$WORKSPACE" \
 270         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
 271         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
 272         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
 273         && (env | egrep ^ARVADOS)
 274 }
 275
 276 start_nginx_proxy_services() {
 277     echo 'Starting keepproxy, keep-web, arv-git-httpd, and nginx ssl proxy...'
 278     cd "$WORKSPACE" \
 279         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
 280         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
 281         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
 282         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
 283         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1
 284 }
 285
 286 stop_services() {
 287     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES" ]]; then
 288         unset ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
 289         cd "$WORKSPACE" \
 290             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 291             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
 292             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
 293             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy
 294     fi
 295     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
 296         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
 297         cd "$WORKSPACE" \
 298             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop
 299     fi
 300 }
 301
 302 interrupt() {
 303     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
 304     exit_cleanly
 305 }
 306 trap interrupt INT
 307
 308 sanity_checks
 309
 310 echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
 311
 312 if [[ -z "$CONFIGSRC" ]] && [[ -d "$HOME/arvados-api-server" ]]; then
 313     # Jenkins expects us to use this by default.
 314     CONFIGSRC="$HOME/arvados-api-server"
 315 fi
 316
 317 # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
 318 cd "$WORKSPACE"
 319 find -name '*.pyc' -delete
 320
 321 if [[ -z "$temp" ]]; then
 322     temp="$(mktemp -d)"
 323 fi
 324
 325 # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
 326 for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE
 327 do
 328     if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
 329         eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
 330     fi
 331     if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
 332         mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
 333     fi
 334 done
 335
 336 setup_ruby_environment() {
 337     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 338       source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
 339       using_rvm=true
 340     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 341       source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
 342       using_rvm=true
 343     else
 344       using_rvm=false
 345     fi
 346
 347     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 348         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
 349         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
 350         # the environment to the "current gemset", which would lose
 351         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
 352         # programs (for example, the Workbench test suite could not
 353         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
 354         # rvm gemset and use it for everything.
 355
 356         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
 357             || fatal 'rvm check'
 358
 359         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
 360         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
 361         # complaint about not being in first place already.
 362         rvm use @default 2>/dev/null
 363
 364         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
 365         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
 366         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
 367         # ruby to the caller.
 368         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
 369         rvm use "@${gemset}" --create \
 370             || fatal 'rvm gemset setup'
 371
 372         rvm env
 373     else
 374         # When our "bundle install"s need to install new gems to
 375         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
 376         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
 377         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
 378         # should be installed, and we should leave it alone.)
 379
 380         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
 381             user_gempath="$(gem env gempath)"
 382             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
 383         fi
 384         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
 385
 386         # When we build and install our own gems, we install them in our
 387         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
 388         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
 389         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
 390
 391         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
 392         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
 393         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home:$(gem env gempath)"
 394
 395         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
 396         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
 397         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
 398     fi
 399 }
 400
 401 with_test_gemset() {
 402     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 403         "$@"
 404     else
 405         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
 406     fi
 407 }
 408
 409 gem_uninstall_if_exists() {
 410     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
 411         gem uninstall --force --all --executables "$1"
 412     fi
 413 }
 414
 415 setup_virtualenv() {
 416     local venvdest="$1"; shift
 417     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
 418         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
 419     fi
 420     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
 421         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
 422         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
 423     else
 424         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
 425     fi
 426     # ubuntu1404 can't seem to install mock via tests_require, but it can do this.
 427     "$venvdest/bin/pip" install 'mock>=1.0' 'pbr<1.7.0'
 428 }
 429
 430 export PERLINSTALLBASE
 431 export PERLLIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5:${PERLLIB:+$PERLLIB}"
 432
 433 export GOPATH
 434 mkdir -p "$GOPATH/src/git.curoverse.com"
 435 ln -sfn "$WORKSPACE" "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" \
 436     || fatal "symlink failed"
 437
 438 setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
 439 . "$VENVDIR/bin/activate"
 440
 441 # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
 442 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^PyYAML= \
 443     || pip install PyYAML >/dev/null \
 444     || fatal "pip install PyYAML failed"
 445
 446 # Preinstall forked version of libcloud, because nodemanager "pip install"
 447 # won't pick it up by default.
 448 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
 449     || pip install --pre --ignore-installed https://github.com/curoverse/libcloud/archive/apache-libcloud-$LIBCLOUD_PIN.zip >/dev/null \
 450     || fatal "pip install apache-libcloud failed"
 451
 452 # This will help people who reuse --temp dirs when we upgrade to llfuse 0.42
 453 if egrep -q 'llfuse.*>= *0\.42' "$WORKSPACE/services/fuse/setup.py"; then
 454     # Uninstall old llfuse, because services/fuse "pip install" won't
 455     # upgrade it by default.
 456     if pip freeze | egrep '^llfuse==0\.41\.'; then
 457         yes | pip uninstall 'llfuse<0.42'
 458     fi
 459 fi
 460
 461 # Deactivate Python 2 virtualenv
 462 deactivate
 463
 464 # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
 465 # Otherwise, skip dependent tests.
 466 PYTHON3=$(which python3)
 467 if [ "0" = "$?" ]; then
 468     setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
 469 else
 470     PYTHON3=
 471     skip[services/dockercleaner]=1
 472     cat >&2 <<EOF
 473
 474 Warning: python3 could not be found
 475 services/dockercleaner install and tests will be skipped
 476
 477 EOF
 478 fi
 479
 480 # Reactivate Python 2 virtualenv
 481 . "$VENVDIR/bin/activate"
 482
 483 # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
 484 # whine a lot.
 485 setup_ruby_environment
 486
 487 echo "PATH is $PATH"
 488
 489 if ! which bundler >/dev/null
 490 then
 491     gem install --user-install bundler || fatal 'Could not install bundler'
 492 fi
 493
 494 retry() {
 495     while ! ${@} && [[ "$retry" == 1 ]]
 496     do
 497         read -p 'Try again? [Y/n] ' x
 498         if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
 499         then
 500             break
 501         fi
 502     done
 503 }
 504
 505 do_test() {
 506     retry do_test_once ${@}
 507 }
 508
 509 do_test_once() {
 510     unset result
 511     to_test=$1
 512     if (( [[ "$only" == "apps/workbench" ]] ) &&
 513        ( [[ "$to_test" == "apps/workbench_units" ]] || [[ "$to_test" == "apps/workbench_functionals" ]] ||
 514          [[ "$to_test" == "apps/workbench_integration" ]])); then
 515       to_test="apps/workbench"
 516     fi
 517     if [[ -z "${skip[$1]}" ]] && ( [[ -z "$only" ]] || [[ "$only" == "$to_test" ]] )
 518     then
 519         title "Running $1 tests"
 520         timer_reset
 521         if [[ "$2" == "go" ]]
 522         then
 523             covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
 524             coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
 525             # We do "go get -t" here to catch compilation errors
 526             # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
 527             # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
 528             # compilation errors.
 529             go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1" || return 1
 530             cd "$WORKSPACE/$1" || return 1
 531             gofmt -e -d . | egrep . && result=1
 532             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
 533             then
 534                 # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
 535                 # does:
 536                 cd "$WORKSPACE/$1" && go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
 537             else
 538                 # The above form gets verbose even when testargs is
 539                 # empty, so use this form in such cases:
 540                 go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 541             fi
 542             result=${result:-$?}
 543             if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
 544             then
 545                 go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
 546                 rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
 547             fi
 548         elif [[ "$2" == "pip" ]]
 549         then
 550             tries=0
 551             cd "$WORKSPACE/$1" && while :
 552             do
 553                 tries=$((${tries}+1))
 554                 # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 555                 # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 556                 "${3}python" setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
 557                 result=$?
 558                 if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
 559                 then
 560                     printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
 561                     continue
 562                 else
 563                     break
 564                 fi
 565             done
 566         elif [[ "$2" != "" ]]
 567         then
 568             "test_$2"
 569         else
 570             "test_$1"
 571         fi
 572         result=${result:-$?}
 573         checkexit $result "$1 tests"
 574         title "End of $1 tests (`timer`)"
 575         return $result
 576     else
 577         title "Skipping $1 tests"
 578     fi
 579 }
 580
 581 do_install() {
 582     retry do_install_once ${@}
 583 }
 584
 585 do_install_once() {
 586     if [[ -z "$skip_install" || (-n "$only_install" && "$only_install" == "$1") ]]
 587     then
 588         title "Running $1 install"
 589         timer_reset
 590         if [[ "$2" == "go" ]]
 591         then
 592             go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 593         elif [[ "$2" == "pip" ]]
 594         then
 595             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 596             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 597
 598             # Need to change to a different directory after creating
 599             # the source dist package to avoid a pip bug.
 600             # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
 601
 602             # Also need to install twice, because if it believes the package is
 603             # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
 604             # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
 605             # install" ensures that we've actually installed the local package
 606             # we just built.
 607             cd "$WORKSPACE/$1" \
 608                 && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
 609                 && cd "$WORKSPACE" \
 610                 && "${3}pip" install --quiet "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
 611                 && "${3}pip" install --quiet --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
 612         elif [[ "$2" != "" ]]
 613         then
 614             "install_$2"
 615         else
 616             "install_$1"
 617         fi
 618         result=$?
 619         checkexit $result "$1 install"
 620         title "End of $1 install (`timer`)"
 621         return $result
 622     else
 623         title "Skipping $1 install"
 624     fi
 625 }
 626
 627 bundle_install_trylocal() {
 628     (
 629         set -e
 630         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
 631         if ! bundle install --local --no-deployment; then
 632             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
 633             bundle install --no-deployment
 634         fi
 635         bundle package --all
 636     )
 637 }
 638
 639 install_doc() {
 640     cd "$WORKSPACE/doc" \
 641         && bundle_install_trylocal \
 642         && rm -rf .site
 643 }
 644 do_install doc
 645
 646 install_gem() {
 647     gemname=$1
 648     srcpath=$2
 649     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
 650         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
 651         && bundle_install_trylocal \
 652         && gem build "$gemname.gemspec" \
 653         && with_test_gemset gem install --no-ri --no-rdoc $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
 654 }
 655
 656 install_ruby_sdk() {
 657     install_gem arvados sdk/ruby
 658 }
 659 do_install sdk/ruby ruby_sdk
 660
 661 install_perl_sdk() {
 662     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
 663         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
 664         && make install INSTALLDIRS=perl
 665 }
 666 do_install sdk/perl perl_sdk
 667
 668 install_cli() {
 669     install_gem arvados-cli sdk/cli
 670 }
 671 do_install sdk/cli cli
 672
 673 install_login-sync() {
 674     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
 675 }
 676 do_install services/login-sync login-sync
 677
 678 # Install the Python SDK early. Various other test suites (like
 679 # keepproxy) bring up run_test_server.py, which imports the arvados
 680 # module. We can't actually *test* the Python SDK yet though, because
 681 # its own test suite brings up some of those other programs (like
 682 # keepproxy).
 683 declare -a pythonstuff
 684 pythonstuff=(
 685     sdk/pam
 686     sdk/python
 687     sdk/cwl
 688     services/fuse
 689     services/nodemanager
 690     tools/crunchstat-summary
 691     )
 692 for p in "${pythonstuff[@]}"
 693 do
 694     do_install "$p" pip
 695 done
 696 if [ -n "$PYTHON3" ]; then
 697     do_install services/dockercleaner pip "$VENV3DIR/bin/"
 698 fi
 699
 700 install_apiserver() {
 701     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 702         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 703
 704     rm -f config/environments/test.rb
 705     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
 706
 707     if [ -n "$CONFIGSRC" ]
 708     then
 709         for f in database.yml application.yml
 710         do
 711             cp "$CONFIGSRC/$f" config/ || fatal "$f"
 712         done
 713     fi
 714
 715     # Fill in a random secret_token and blob_signing_key for testing
 716     SECRET_TOKEN=`echo 'puts rand(2**512).to_s(36)' |ruby`
 717     BLOB_SIGNING_KEY=`echo 'puts rand(2**512).to_s(36)' |ruby`
 718
 719     sed -i'' -e "s:SECRET_TOKEN:$SECRET_TOKEN:" config/application.yml
 720     sed -i'' -e "s:BLOB_SIGNING_KEY:$BLOB_SIGNING_KEY:" config/application.yml
 721
 722     # Set up empty git repo (for git tests)
 723     GITDIR=$(mktemp -d)
 724     sed -i'' -e "s:/var/cache/git:$GITDIR:" config/application.default.yml
 725
 726     rm -rf $GITDIR
 727     mkdir -p $GITDIR/test
 728     cd $GITDIR/test \
 729         && git init \
 730         && git config user.email "jenkins@ci.curoverse.com" \
 731         && git config user.name "Jenkins, CI" \
 732         && touch tmp \
 733         && git add tmp \
 734         && git commit -m 'initial commit'
 735
 736     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
 737     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
 738     # is a postgresql superuser.
 739     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 740         && test_database=$(python -c "import yaml; print yaml.load(file('config/database.yml'))['test']['database']") \
 741         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.procpid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
 742
 743     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 744         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:drop \
 745         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:setup \
 746         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:fixtures:load
 747 }
 748 do_install services/api apiserver
 749
 750 declare -a gostuff
 751 gostuff=(
 752     sdk/go/arvados
 753     sdk/go/arvadosclient
 754     sdk/go/blockdigest
 755     sdk/go/httpserver
 756     sdk/go/manifest
 757     sdk/go/streamer
 758     sdk/go/crunchrunner
 759     lib/crunchstat
 760     services/arv-git-httpd
 761     services/crunchstat
 762     services/keep-web
 763     services/keepstore
 764     sdk/go/keepclient
 765     services/keep-balance
 766     services/keepproxy
 767     services/crunch-dispatch-local
 768     services/crunch-dispatch-slurm
 769     services/crunch-run
 770     tools/keep-block-check
 771     tools/keep-exercise
 772     tools/keep-rsync
 773     )
 774 for g in "${gostuff[@]}"
 775 do
 776     do_install "$g" go
 777 done
 778
 779 install_workbench() {
 780     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 781         && mkdir -p tmp/cache \
 782         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 783 }
 784 do_install apps/workbench workbench
 785
 786 test_doclinkchecker() {
 787     (
 788         set -e
 789         cd "$WORKSPACE/doc"
 790         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
 791         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
 792         # do much good!
 793         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ bundle exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
 794     )
 795 }
 796 do_test doc doclinkchecker
 797
 798 stop_services
 799
 800 test_apiserver() {
 801     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
 802     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 803         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/api]}
 804 }
 805 do_test services/api apiserver
 806
 807 # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
 808 # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
 809 if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
 810   rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 811   exit_cleanly
 812 fi
 813
 814 start_api
 815
 816 test_ruby_sdk() {
 817     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
 818         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
 819 }
 820 do_test sdk/ruby ruby_sdk
 821
 822 test_cli() {
 823     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
 824         && mkdir -p /tmp/keep \
 825         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
 826 }
 827 do_test sdk/cli cli
 828
 829 test_login-sync() {
 830     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
 831         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
 832 }
 833 do_test services/login-sync login-sync
 834
 835 for p in "${pythonstuff[@]}"
 836 do
 837     do_test "$p" pip
 838 done
 839 do_test services/dockercleaner pip "$VENV3DIR/bin/"
 840
 841 for g in "${gostuff[@]}"
 842 do
 843     do_test "$g" go
 844 done
 845
 846 test_workbench_units() {
 847     start_nginx_proxy_services \
 848         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 849         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:units TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 850 }
 851 do_test apps/workbench_units workbench_units
 852
 853 test_workbench_functionals() {
 854     start_nginx_proxy_services \
 855         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 856         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:functionals TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 857 }
 858 do_test apps/workbench_functionals workbench_functionals
 859
 860 test_workbench_integration() {
 861     start_nginx_proxy_services \
 862         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 863         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:integration TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 864 }
 865 do_test apps/workbench_integration workbench_integration
 866
 867
 868 test_workbench_benchmark() {
 869     start_nginx_proxy_services \
 870         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 871         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:benchmark ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
 872 }
 873 do_test apps/workbench_benchmark workbench_benchmark
 874
 875 test_workbench_profile() {
 876     start_nginx_proxy_services \
 877         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 878         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:profile ${testargs[apps/workbench_profile]}
 879 }
 880 do_test apps/workbench_profile workbench_profile
 881
 882 exit_cleanly