10383: Merge branch 'master' into 10383-arv-put-incremental-upload
[arvados.git] / build / run-tests.sh
1 #!/bin/bash
2
3 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin
4
5 COLUMNS=80
6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
7
8 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
9 $(basename $0): Install and test Arvados components.
10
11 Exit non-zero if any tests fail.
12
13 Syntax:
14         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
15
16 Options:
17
18 --skip FOO     Do not test the FOO component.
19 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
20 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
21                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
22 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
23                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
24                subsequent invocations.
25 --skip-install Do not run any install steps. Just run tests.
26                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
27                from a previous invocation if you use this option.
28 --only-install Run specific install step
29 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
30 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
31 CONFIGSRC=path Dir with api server config files to copy into source tree.
32                (If none given, leave config files alone in source tree.)
33 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
34                Restrict apiserver tests to the given file
35 sdk/python_test="--test-suite test.test_keep_locator"
36                Restrict Python SDK tests to the given class
37 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
38                Restrict Workbench tests to the given file
39 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
40                Show all log messages, even when tests pass (also works
41                with services/keepstore_test etc.)
42 ARVADOS_DEBUG=1
43                Print more debug messages
44 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
45                *_test, and other examples shown above.
46
47 Assuming --skip-install is not given, all components are installed
48 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
49 test suites depend on other components being installed, and installing
50 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
51
52 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
53 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
54
55 More information and background:
56
57 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
58
59 Available tests:
60
61 apps/workbench (*)
62 apps/workbench_units (*)
63 apps/workbench_functionals (*)
64 apps/workbench_integration (*)
65 apps/workbench_benchmark
66 apps/workbench_profile
67 doc
68 services/api
69 services/arv-git-httpd
70 services/crunchstat
71 services/dockercleaner
72 services/fuse
73 services/keep-web
74 services/keepproxy
75 services/keepstore
76 services/keep-balance
77 services/login-sync
78 services/nodemanager
79 services/crunch-run
80 services/crunch-dispatch-local
81 services/crunch-dispatch-slurm
82 sdk/cli
83 sdk/pam
84 sdk/python
85 sdk/ruby
86 sdk/go/arvados
87 sdk/go/arvadosclient
88 sdk/go/keepclient
89 sdk/go/httpserver
90 sdk/go/manifest
91 sdk/go/blockdigest
92 sdk/go/streamer
93 sdk/go/crunchrunner
94 sdk/cwl
95 tools/crunchstat-summary
96 tools/keep-exercise
97 tools/keep-rsync
98 tools/keep-block-check
99
100 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
101     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
102
103 EOF
104
105 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
106 # environment that could interfere with the tests.
107 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
108
109 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
110 # accident.
111 GITDIR=
112 GOPATH=
113 VENVDIR=
114 VENV3DIR=
115 PYTHONPATH=
116 GEMHOME=
117 PERLINSTALLBASE=
118
119 short=
120 skip_install=
121 temp=
122 temp_preserve=
123
124 clear_temp() {
125     if [[ -z "$temp" ]]; then
126         # we didn't even get as far as making a temp dir
127         :
128     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
129         rm -rf "$temp"
130     else
131         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
132     fi
133 }
134
135 fatal() {
136     clear_temp
137     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
138     exit 1
139 }
140
141 exit_cleanly() {
142     trap - INT
143     create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
144     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
145     stop_services
146     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
147     report_outcomes
148     clear_temp
149     exit ${#failures}
150 }
151
152 sanity_checks() {
153     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
154         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
155     echo Checking dependencies:
156     echo -n 'virtualenv: '
157     virtualenv --version \
158         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
159     echo -n 'ruby: '
160     ruby -v \
161         || fatal "No ruby. Install >=2.1.9 (using rbenv, rvm, or source)"
162     echo -n 'bundler: '
163     bundle version \
164         || fatal "No bundler. Try: gem install bundler"
165     echo -n 'go: '
166     go version \
167         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
168     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 7 ]] \
169         || fatal "Go >= 1.7 required. See http://golang.org/doc/install"
170     echo -n 'gcc: '
171     gcc --version | egrep ^gcc \
172         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
173     echo -n 'fuse.h: '
174     find /usr/include -wholename '*fuse/fuse.h' \
175         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
176     echo -n 'pyconfig.h: '
177     find /usr/include -name pyconfig.h | egrep --max-count=1 . \
178         || fatal "No pyconfig.h. Try: apt-get install python-dev"
179     echo -n 'nginx: '
180     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
181         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
182     echo -n 'perl: '
183     perl -v | grep version \
184         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
185     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
186         echo -n "perl $mod: "
187         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
188             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
189     done
190     echo -n 'gitolite: '
191     which gitolite \
192         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
193 }
194
195 rotate_logfile() {
196   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
197   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
198   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
199     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
200     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
201     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
202   fi
203 }
204
205 declare -a failures
206 declare -A skip
207 declare -A testargs
208 skip[apps/workbench_profile]=1
209
210 while [[ -n "$1" ]]
211 do
212     arg="$1"; shift
213     case "$arg" in
214         --help)
215             echo >&2 "$helpmessage"
216             echo >&2
217             exit 1
218             ;;
219         --skip)
220             skipwhat="$1"; shift
221             if [[ "$skipwhat" == "apps/workbench" ]]; then
222               skip["apps/workbench_units"]=1
223               skip["apps/workbench_functionals"]=1
224               skip["apps/workbench_integration"]=1
225             else
226               skip[$skipwhat]=1
227             fi
228             ;;
229         --only)
230             only="$1"; skip[$1]=""; shift
231             ;;
232         --short)
233             short=1
234             ;;
235         --skip-install)
236             skip_install=1
237             ;;
238         --only-install)
239             skip_install=1
240             only_install="$1"; shift
241             ;;
242         --temp)
243             temp="$1"; shift
244             temp_preserve=1
245             ;;
246         --leave-temp)
247             temp_preserve=1
248             ;;
249         --retry)
250             retry=1
251             ;;
252         *_test=*)
253             suite="${arg%%_test=*}"
254             args="${arg#*=}"
255             testargs["$suite"]="$args"
256             ;;
257         *=*)
258             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
259             ;;
260         *)
261             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
262             exit 1
263             ;;
264     esac
265 done
266
267 start_api() {
268     echo 'Starting API server...'
269     cd "$WORKSPACE" \
270         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
271         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
272         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
273         && (env | egrep ^ARVADOS)
274 }
275
276 start_nginx_proxy_services() {
277     echo 'Starting keepproxy, keep-web, arv-git-httpd, and nginx ssl proxy...'
278     cd "$WORKSPACE" \
279         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
280         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
281         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
282         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
283         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1
284 }
285
286 stop_services() {
287     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES" ]]; then
288         unset ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
289         cd "$WORKSPACE" \
290             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
291             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
292             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
293             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy
294     fi
295     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
296         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
297         cd "$WORKSPACE" \
298             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop
299     fi
300 }
301
302 interrupt() {
303     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
304     exit_cleanly
305 }
306 trap interrupt INT
307
308 sanity_checks
309
310 echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
311
312 if [[ -z "$CONFIGSRC" ]] && [[ -d "$HOME/arvados-api-server" ]]; then
313     # Jenkins expects us to use this by default.
314     CONFIGSRC="$HOME/arvados-api-server"
315 fi
316
317 # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
318 cd "$WORKSPACE"
319 find -name '*.pyc' -delete
320
321 if [[ -z "$temp" ]]; then
322     temp="$(mktemp -d)"
323 fi
324
325 # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
326 for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE
327 do
328     if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
329         eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
330     fi
331     if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
332         mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
333     fi
334 done
335
336 setup_ruby_environment() {
337     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
338       source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
339       using_rvm=true
340     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
341       source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
342       using_rvm=true
343     else
344       using_rvm=false
345     fi
346
347     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
348         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
349         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
350         # the environment to the "current gemset", which would lose
351         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
352         # programs (for example, the Workbench test suite could not
353         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
354         # rvm gemset and use it for everything.
355
356         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
357             || fatal 'rvm check'
358
359         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
360         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
361         # complaint about not being in first place already.
362         rvm use @default 2>/dev/null
363
364         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
365         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
366         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
367         # ruby to the caller.
368         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
369         rvm use "@${gemset}" --create \
370             || fatal 'rvm gemset setup'
371
372         rvm env
373     else
374         # When our "bundle install"s need to install new gems to
375         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
376         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
377         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
378         # should be installed, and we should leave it alone.)
379
380         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
381             user_gempath="$(gem env gempath)"
382             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
383         fi
384         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
385
386         # When we build and install our own gems, we install them in our
387         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
388         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
389         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
390
391         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
392         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
393         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home:$(gem env gempath)"
394
395         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
396         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
397         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
398     fi
399 }
400
401 with_test_gemset() {
402     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
403         "$@"
404     else
405         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
406     fi
407 }
408
409 gem_uninstall_if_exists() {
410     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
411         gem uninstall --force --all --executables "$1"
412     fi
413 }
414
415 setup_virtualenv() {
416     local venvdest="$1"; shift
417     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
418         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
419     fi
420     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
421         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
422         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
423     else
424         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
425     fi
426     # ubuntu1404 can't seem to install mock via tests_require, but it can do this.
427     "$venvdest/bin/pip" install 'mock>=1.0' 'pbr<1.7.0'
428 }
429
430 export PERLINSTALLBASE
431 export PERLLIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5:${PERLLIB:+$PERLLIB}"
432
433 export GOPATH
434 mkdir -p "$GOPATH/src/git.curoverse.com"
435 ln -sfn "$WORKSPACE" "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" \
436     || fatal "symlink failed"
437
438 setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
439 . "$VENVDIR/bin/activate"
440
441 # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
442 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^PyYAML= \
443     || pip install PyYAML >/dev/null \
444     || fatal "pip install PyYAML failed"
445
446 # Preinstall forked version of libcloud, because nodemanager "pip install"
447 # won't pick it up by default.
448 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
449     || pip install --pre --ignore-installed https://github.com/curoverse/libcloud/archive/apache-libcloud-$LIBCLOUD_PIN.zip >/dev/null \
450     || fatal "pip install apache-libcloud failed"
451
452 # This will help people who reuse --temp dirs when we upgrade to llfuse 0.42
453 if egrep -q 'llfuse.*>= *0\.42' "$WORKSPACE/services/fuse/setup.py"; then
454     # Uninstall old llfuse, because services/fuse "pip install" won't
455     # upgrade it by default.
456     if pip freeze | egrep '^llfuse==0\.41\.'; then
457         yes | pip uninstall 'llfuse<0.42'
458     fi
459 fi
460
461 # Deactivate Python 2 virtualenv
462 deactivate
463
464 # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
465 # Otherwise, skip dependent tests.
466 PYTHON3=$(which python3)
467 if [ "0" = "$?" ]; then
468     setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
469 else
470     PYTHON3=
471     skip[services/dockercleaner]=1
472     cat >&2 <<EOF
473
474 Warning: python3 could not be found
475 services/dockercleaner install and tests will be skipped
476
477 EOF
478 fi
479
480 # Reactivate Python 2 virtualenv
481 . "$VENVDIR/bin/activate"
482
483 # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
484 # whine a lot.
485 setup_ruby_environment
486
487 echo "PATH is $PATH"
488
489 if ! which bundler >/dev/null
490 then
491     gem install --user-install bundler || fatal 'Could not install bundler'
492 fi
493
494 retry() {
495     while ! ${@} && [[ "$retry" == 1 ]]
496     do
497         read -p 'Try again? [Y/n] ' x
498         if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
499         then
500             break
501         fi
502     done
503 }
504
505 do_test() {
506     retry do_test_once ${@}
507 }
508
509 do_test_once() {
510     unset result
511     to_test=$1
512     if (( [[ "$only" == "apps/workbench" ]] ) &&
513        ( [[ "$to_test" == "apps/workbench_units" ]] || [[ "$to_test" == "apps/workbench_functionals" ]] ||
514          [[ "$to_test" == "apps/workbench_integration" ]])); then
515       to_test="apps/workbench"
516     fi
517     if [[ -z "${skip[$1]}" ]] && ( [[ -z "$only" ]] || [[ "$only" == "$to_test" ]] )
518     then
519         title "Running $1 tests"
520         timer_reset
521         if [[ "$2" == "go" ]]
522         then
523             covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
524             coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
525             # We do "go get -t" here to catch compilation errors
526             # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
527             # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
528             # compilation errors.
529             go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1" || return 1
530             cd "$WORKSPACE/$1" || return 1
531             gofmt -e -d . | egrep . && result=1
532             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
533             then
534                 # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
535                 # does:
536                 cd "$WORKSPACE/$1" && go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
537             else
538                 # The above form gets verbose even when testargs is
539                 # empty, so use this form in such cases:
540                 go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
541             fi
542             result=${result:-$?}
543             if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
544             then
545                 go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
546                 rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
547             fi
548         elif [[ "$2" == "pip" ]]
549         then
550             tries=0
551             cd "$WORKSPACE/$1" && while :
552             do
553                 tries=$((${tries}+1))
554                 # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
555                 # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
556                 "${3}python" setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
557                 result=$?
558                 if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
559                 then
560                     printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
561                     continue
562                 else
563                     break
564                 fi
565             done
566         elif [[ "$2" != "" ]]
567         then
568             "test_$2"
569         else
570             "test_$1"
571         fi
572         result=${result:-$?}
573         checkexit $result "$1 tests"
574         title "End of $1 tests (`timer`)"
575         return $result
576     else
577         title "Skipping $1 tests"
578     fi
579 }
580
581 do_install() {
582     retry do_install_once ${@}
583 }
584
585 do_install_once() {
586     if [[ -z "$skip_install" || (-n "$only_install" && "$only_install" == "$1") ]]
587     then
588         title "Running $1 install"
589         timer_reset
590         if [[ "$2" == "go" ]]
591         then
592             go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
593         elif [[ "$2" == "pip" ]]
594         then
595             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
596             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
597
598             # Need to change to a different directory after creating
599             # the source dist package to avoid a pip bug.
600             # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
601
602             # Also need to install twice, because if it believes the package is
603             # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
604             # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
605             # install" ensures that we've actually installed the local package
606             # we just built.
607             cd "$WORKSPACE/$1" \
608                 && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
609                 && cd "$WORKSPACE" \
610                 && "${3}pip" install --quiet "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
611                 && "${3}pip" install --quiet --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
612         elif [[ "$2" != "" ]]
613         then
614             "install_$2"
615         else
616             "install_$1"
617         fi
618         result=$?
619         checkexit $result "$1 install"
620         title "End of $1 install (`timer`)"
621         return $result
622     else
623         title "Skipping $1 install"
624     fi
625 }
626
627 bundle_install_trylocal() {
628     (
629         set -e
630         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
631         if ! bundle install --local --no-deployment; then
632             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
633             bundle install --no-deployment
634         fi
635         bundle package --all
636     )
637 }
638
639 install_doc() {
640     cd "$WORKSPACE/doc" \
641         && bundle_install_trylocal \
642         && rm -rf .site
643 }
644 do_install doc
645
646 install_gem() {
647     gemname=$1
648     srcpath=$2
649     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
650         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
651         && bundle_install_trylocal \
652         && gem build "$gemname.gemspec" \
653         && with_test_gemset gem install --no-ri --no-rdoc $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
654 }
655
656 install_ruby_sdk() {
657     install_gem arvados sdk/ruby
658 }
659 do_install sdk/ruby ruby_sdk
660
661 install_perl_sdk() {
662     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
663         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
664         && make install INSTALLDIRS=perl
665 }
666 do_install sdk/perl perl_sdk
667
668 install_cli() {
669     install_gem arvados-cli sdk/cli
670 }
671 do_install sdk/cli cli
672
673 install_login-sync() {
674     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
675 }
676 do_install services/login-sync login-sync
677
678 # Install the Python SDK early. Various other test suites (like
679 # keepproxy) bring up run_test_server.py, which imports the arvados
680 # module. We can't actually *test* the Python SDK yet though, because
681 # its own test suite brings up some of those other programs (like
682 # keepproxy).
683 declare -a pythonstuff
684 pythonstuff=(
685     sdk/pam
686     sdk/python
687     sdk/cwl
688     services/fuse
689     services/nodemanager
690     tools/crunchstat-summary
691     )
692 for p in "${pythonstuff[@]}"
693 do
694     do_install "$p" pip
695 done
696 if [ -n "$PYTHON3" ]; then
697     do_install services/dockercleaner pip "$VENV3DIR/bin/"
698 fi
699
700 install_apiserver() {
701     cd "$WORKSPACE/services/api" \
702         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
703
704     rm -f config/environments/test.rb
705     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
706
707     if [ -n "$CONFIGSRC" ]
708     then
709         for f in database.yml application.yml
710         do
711             cp "$CONFIGSRC/$f" config/ || fatal "$f"
712         done
713     fi
714
715     # Fill in a random secret_token and blob_signing_key for testing
716     SECRET_TOKEN=`echo 'puts rand(2**512).to_s(36)' |ruby`
717     BLOB_SIGNING_KEY=`echo 'puts rand(2**512).to_s(36)' |ruby`
718
719     sed -i'' -e "s:SECRET_TOKEN:$SECRET_TOKEN:" config/application.yml
720     sed -i'' -e "s:BLOB_SIGNING_KEY:$BLOB_SIGNING_KEY:" config/application.yml
721
722     # Set up empty git repo (for git tests)
723     GITDIR=$(mktemp -d)
724     sed -i'' -e "s:/var/cache/git:$GITDIR:" config/application.default.yml
725
726     rm -rf $GITDIR
727     mkdir -p $GITDIR/test
728     cd $GITDIR/test \
729         && git init \
730         && git config user.email "jenkins@ci.curoverse.com" \
731         && git config user.name "Jenkins, CI" \
732         && touch tmp \
733         && git add tmp \
734         && git commit -m 'initial commit'
735
736     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
737     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
738     # is a postgresql superuser.
739     cd "$WORKSPACE/services/api" \
740         && test_database=$(python -c "import yaml; print yaml.load(file('config/database.yml'))['test']['database']") \
741         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.procpid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
742
743     cd "$WORKSPACE/services/api" \
744         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:drop \
745         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:setup \
746         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:fixtures:load
747 }
748 do_install services/api apiserver
749
750 declare -a gostuff
751 gostuff=(
752     sdk/go/arvados
753     sdk/go/arvadosclient
754     sdk/go/blockdigest
755     sdk/go/httpserver
756     sdk/go/manifest
757     sdk/go/streamer
758     sdk/go/crunchrunner
759     lib/crunchstat
760     services/arv-git-httpd
761     services/crunchstat
762     services/keep-web
763     services/keepstore
764     sdk/go/keepclient
765     services/keep-balance
766     services/keepproxy
767     services/crunch-dispatch-local
768     services/crunch-dispatch-slurm
769     services/crunch-run
770     tools/keep-block-check
771     tools/keep-exercise
772     tools/keep-rsync
773     )
774 for g in "${gostuff[@]}"
775 do
776     do_install "$g" go
777 done
778
779 install_workbench() {
780     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
781         && mkdir -p tmp/cache \
782         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
783 }
784 do_install apps/workbench workbench
785
786 test_doclinkchecker() {
787     (
788         set -e
789         cd "$WORKSPACE/doc"
790         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
791         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
792         # do much good!
793         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ bundle exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
794     )
795 }
796 do_test doc doclinkchecker
797
798 stop_services
799
800 test_apiserver() {
801     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
802     cd "$WORKSPACE/services/api" \
803         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/api]}
804 }
805 do_test services/api apiserver
806
807 # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
808 # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
809 if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
810   rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
811   exit_cleanly
812 fi
813
814 start_api
815
816 test_ruby_sdk() {
817     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
818         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
819 }
820 do_test sdk/ruby ruby_sdk
821
822 test_cli() {
823     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
824         && mkdir -p /tmp/keep \
825         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
826 }
827 do_test sdk/cli cli
828
829 test_login-sync() {
830     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
831         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
832 }
833 do_test services/login-sync login-sync
834
835 for p in "${pythonstuff[@]}"
836 do
837     do_test "$p" pip
838 done
839 do_test services/dockercleaner pip "$VENV3DIR/bin/"
840
841 for g in "${gostuff[@]}"
842 do
843     do_test "$g" go
844 done
845
846 test_workbench_units() {
847     start_nginx_proxy_services \
848         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
849         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:units TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
850 }
851 do_test apps/workbench_units workbench_units
852
853 test_workbench_functionals() {
854     start_nginx_proxy_services \
855         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
856         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:functionals TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
857 }
858 do_test apps/workbench_functionals workbench_functionals
859
860 test_workbench_integration() {
861     start_nginx_proxy_services \
862         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
863         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:integration TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
864 }
865 do_test apps/workbench_integration workbench_integration
866
867
868 test_workbench_benchmark() {
869     start_nginx_proxy_services \
870         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
871         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:benchmark ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
872 }
873 do_test apps/workbench_benchmark workbench_benchmark
874
875 test_workbench_profile() {
876     start_nginx_proxy_services \
877         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
878         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:profile ${testargs[apps/workbench_profile]}
879 }
880 do_test apps/workbench_profile workbench_profile
881
882 exit_cleanly