build/run-tests.sh

   1 #!/bin/bash
   2 # Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
   3 #
   4 # SPDX-License-Identifier: AGPL-3.0
   5
   6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin.sh
   7
   8 COLUMNS=80
   9 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
  10
  11 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
  12 $(basename $0): Install and test Arvados components.
  13
  14 Exit non-zero if any tests fail.
  15
  16 Syntax:
  17         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
  18
  19 Options:
  20
  21 --skip FOO     Do not test the FOO component.
  22 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
  23 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
  24                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
  25 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
  26                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
  27                subsequent invocations.
  28 --repeat N     Repeat each install/test step until it succeeds N times.
  29 --retry        Prompt to retry if an install or test suite fails.
  30 --skip-install Do not run any install steps. Just run tests.
  31                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
  32                from a previous invocation if you use this option.
  33 --only-install Run specific install step
  34 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
  35 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
  36 CONFIGSRC=path Dir with api server config files to copy into source tree.
  37                (If none given, leave config files alone in source tree.)
  38 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
  39                Restrict apiserver tests to the given file
  40 sdk/python_test="--test-suite test.test_keep_locator"
  41                Restrict Python SDK tests to the given class
  42 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
  43                Restrict Workbench tests to the given file
  44 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
  45                Show all log messages, even when tests pass (also works
  46                with services/keepstore_test etc.)
  47 ARVADOS_DEBUG=1
  48                Print more debug messages
  49 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
  50                *_test, and other examples shown above.
  51
  52 Assuming --skip-install is not given, all components are installed
  53 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
  54 test suites depend on other components being installed, and installing
  55 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
  56
  57 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
  58 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
  59
  60 More information and background:
  61
  62 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
  63
  64 Available tests:
  65
  66 apps/workbench (*)
  67 apps/workbench_units (*)
  68 apps/workbench_functionals (*)
  69 apps/workbench_integration (*)
  70 apps/workbench_benchmark
  71 apps/workbench_profile
  72 doc
  73 services/api
  74 services/arv-git-httpd
  75 services/crunchstat
  76 services/dockercleaner
  77 services/fuse
  78 services/keep-web
  79 services/keepproxy
  80 services/keepstore
  81 services/keep-balance
  82 services/login-sync
  83 services/nodemanager
  84 services/nodemanager_integration
  85 services/crunch-run
  86 services/crunch-dispatch-local
  87 services/crunch-dispatch-slurm
  88 services/ws
  89 sdk/cli
  90 sdk/pam
  91 sdk/python
  92 sdk/python:py3
  93 sdk/ruby
  94 sdk/go/arvados
  95 sdk/go/arvadosclient
  96 sdk/go/dispatch
  97 sdk/go/keepclient
  98 sdk/go/health
  99 sdk/go/httpserver
 100 sdk/go/manifest
 101 sdk/go/blockdigest
 102 sdk/go/streamer
 103 sdk/go/stats
 104 sdk/go/crunchrunner
 105 sdk/cwl
 106 tools/crunchstat-summary
 107 tools/keep-exercise
 108 tools/keep-rsync
 109 tools/keep-block-check
 110
 111 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
 112     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
 113
 114 EOF
 115
 116 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
 117 # environment that could interfere with the tests.
 118 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
 119
 120 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
 121 # accident.
 122 GITDIR=
 123 GOPATH=
 124 VENVDIR=
 125 VENV3DIR=
 126 PYTHONPATH=
 127 GEMHOME=
 128 PERLINSTALLBASE=
 129
 130 short=
 131 only_install=
 132 temp=
 133 temp_preserve=
 134
 135 clear_temp() {
 136     if [[ -z "$temp" ]]; then
 137         # we didn't even get as far as making a temp dir
 138         :
 139     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
 140         rm -rf "$temp"
 141     else
 142         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
 143     fi
 144 }
 145
 146 fatal() {
 147     clear_temp
 148     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
 149     exit 1
 150 }
 151
 152 exit_cleanly() {
 153     trap - INT
 154     create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
 155     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 156     stop_services
 157     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 158     report_outcomes
 159     clear_temp
 160     exit ${#failures}
 161 }
 162
 163 sanity_checks() {
 164     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
 165         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
 166     echo Checking dependencies:
 167     echo -n 'virtualenv: '
 168     virtualenv --version \
 169         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
 170     echo -n 'ruby: '
 171     ruby -v \
 172         || fatal "No ruby. Install >=2.1.9 (using rbenv, rvm, or source)"
 173     echo -n 'go: '
 174     go version \
 175         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
 176     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 8 ]] \
 177         || fatal "Go >= 1.8 required. See http://golang.org/doc/install"
 178     echo -n 'gcc: '
 179     gcc --version | egrep ^gcc \
 180         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
 181     echo -n 'fuse.h: '
 182     find /usr/include -path '*fuse/fuse.h' | egrep --max-count=1 . \
 183         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
 184     echo -n 'gnutls.h: '
 185     find /usr/include -path '*gnutls/gnutls.h' | egrep --max-count=1 . \
 186         || fatal "No gnutls/gnutls.h. Try: apt-get install libgnutls28-dev"
 187     echo -n 'Python2 pyconfig.h: '
 188     find /usr/include -path '*/python2*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 189         || fatal "No Python2 pyconfig.h. Try: apt-get install python2.7-dev"
 190     echo -n 'Python3 pyconfig.h: '
 191     find /usr/include -path '*/python3*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 192         || fatal "No Python3 pyconfig.h. Try: apt-get install python3-dev"
 193     echo -n 'nginx: '
 194     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
 195         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
 196     echo -n 'perl: '
 197     perl -v | grep version \
 198         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
 199     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
 200         echo -n "perl $mod: "
 201         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
 202             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
 203     done
 204     echo -n 'gitolite: '
 205     which gitolite \
 206         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
 207 }
 208
 209 rotate_logfile() {
 210   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 211   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
 212   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
 213     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
 214     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 215     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 216   fi
 217 }
 218
 219 declare -a failures
 220 declare -A skip
 221 declare -A testargs
 222 skip[apps/workbench_profile]=1
 223
 224 while [[ -n "$1" ]]
 225 do
 226     arg="$1"; shift
 227     case "$arg" in
 228         --help)
 229             echo >&2 "$helpmessage"
 230             echo >&2
 231             exit 1
 232             ;;
 233         --skip)
 234             skip[$1]=1; shift
 235             ;;
 236         --only)
 237             only="$1"; skip[$1]=""; shift
 238             ;;
 239         --short)
 240             short=1
 241             ;;
 242         --skip-install)
 243             only_install=nothing
 244             ;;
 245         --only-install)
 246             only_install="$1"; shift
 247             ;;
 248         --temp)
 249             temp="$1"; shift
 250             temp_preserve=1
 251             ;;
 252         --leave-temp)
 253             temp_preserve=1
 254             ;;
 255         --repeat)
 256             repeat=$((${1}+0)); shift
 257             ;;
 258         --retry)
 259             retry=1
 260             ;;
 261         *_test=*)
 262             suite="${arg%%_test=*}"
 263             args="${arg#*=}"
 264             testargs["$suite"]="$args"
 265             ;;
 266         *=*)
 267             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
 268             ;;
 269         *)
 270             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
 271             exit 1
 272             ;;
 273     esac
 274 done
 275
 276 start_api() {
 277     echo 'Starting API server...'
 278     cd "$WORKSPACE" \
 279         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
 280         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
 281         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
 282         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 283         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
 284         && (env | egrep ^ARVADOS)
 285 }
 286
 287 start_nginx_proxy_services() {
 288     echo 'Starting keepproxy, keep-web, ws, arv-git-httpd, and nginx ssl proxy...'
 289     cd "$WORKSPACE" \
 290         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
 291         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
 292         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
 293         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 294         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
 295         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1
 296 }
 297
 298 stop_services() {
 299     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES" ]]; then
 300         unset ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
 301         cd "$WORKSPACE" \
 302             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 303             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
 304             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 305             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
 306             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy
 307     fi
 308     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
 309         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
 310         cd "$WORKSPACE" \
 311             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 312             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 313             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop
 314     fi
 315 }
 316
 317 interrupt() {
 318     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
 319     exit_cleanly
 320 }
 321 trap interrupt INT
 322
 323 sanity_checks
 324
 325 echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
 326
 327 if [[ -z "$CONFIGSRC" ]] && [[ -d "$HOME/arvados-api-server" ]]; then
 328     # Jenkins expects us to use this by default.
 329     CONFIGSRC="$HOME/arvados-api-server"
 330 fi
 331
 332 # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
 333 cd "$WORKSPACE"
 334 find -name '*.pyc' -delete
 335
 336 if [[ -z "$temp" ]]; then
 337     temp="$(mktemp -d)"
 338 fi
 339
 340 # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
 341 for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE
 342 do
 343     if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
 344         eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
 345     fi
 346     if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
 347         mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
 348     fi
 349 done
 350
 351 setup_ruby_environment() {
 352     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 353         source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
 354         using_rvm=true
 355     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 356         source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
 357         using_rvm=true
 358     else
 359         using_rvm=false
 360     fi
 361
 362     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 363         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
 364         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
 365         # the environment to the "current gemset", which would lose
 366         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
 367         # programs (for example, the Workbench test suite could not
 368         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
 369         # rvm gemset and use it for everything.
 370
 371         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
 372             || fatal 'rvm check'
 373
 374         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
 375         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
 376         # complaint about not being in first place already.
 377         rvm use @default 2>/dev/null
 378
 379         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
 380         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
 381         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
 382         # ruby to the caller.
 383         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
 384         rvm use "@${gemset}" --create \
 385             || fatal 'rvm gemset setup'
 386
 387         rvm env
 388     else
 389         # When our "bundle install"s need to install new gems to
 390         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
 391         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
 392         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
 393         # should be installed, and we should leave it alone.)
 394
 395         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
 396             user_gempath="$(gem env gempath)"
 397             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
 398         fi
 399         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
 400
 401         # When we build and install our own gems, we install them in our
 402         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
 403         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
 404         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
 405
 406         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
 407         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
 408         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home"
 409
 410         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
 411         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
 412         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
 413     fi
 414     bundle config || gem install bundler \
 415         || fatal 'install bundler'
 416 }
 417
 418 with_test_gemset() {
 419     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 420         "$@"
 421     else
 422         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
 423     fi
 424 }
 425
 426 gem_uninstall_if_exists() {
 427     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
 428         gem uninstall --force --all --executables "$1"
 429     fi
 430 }
 431
 432 setup_virtualenv() {
 433     local venvdest="$1"; shift
 434     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
 435         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
 436     fi
 437     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
 438         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
 439         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
 440     else
 441         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
 442     fi
 443     # ubuntu1404 can't seem to install mock via tests_require, but it can do this.
 444     "$venvdest/bin/pip" install 'mock>=1.0' 'pbr<1.7.0'
 445 }
 446
 447 export PERLINSTALLBASE
 448 export PERLLIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5:${PERLLIB:+$PERLLIB}"
 449
 450 export GOPATH
 451 mkdir -p "$GOPATH/src/git.curoverse.com"
 452 ln -sfT "$WORKSPACE" "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" \
 453     || fatal "symlink failed"
 454 go get -v github.com/kardianos/govendor \
 455     || fatal "govendor install failed"
 456
 457 setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
 458 . "$VENVDIR/bin/activate"
 459
 460 # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
 461 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^PyYAML= \
 462     || pip install PyYAML >/dev/null \
 463     || fatal "pip install PyYAML failed"
 464
 465 # Preinstall forked version of libcloud, because nodemanager "pip install"
 466 # won't pick it up by default.
 467 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
 468     || pip install --pre --ignore-installed https://github.com/curoverse/libcloud/archive/apache-libcloud-$LIBCLOUD_PIN.zip >/dev/null \
 469     || fatal "pip install apache-libcloud failed"
 470
 471 # We need an unreleased (as of 2017-08-17) llfuse bugfix, otherwise our fuse test suite deadlocks.
 472 pip freeze | grep -x llfuse==1.2.0 || (
 473     set -e
 474     yes | pip uninstall llfuse || true
 475     cython --version || fatal "no cython; try sudo apt-get install cython"
 476     cd "$temp"
 477     (cd python-llfuse || git clone https://github.com/curoverse/python-llfuse)
 478     cd python-llfuse
 479     git checkout 620722fd990ea642ddb8e7412676af482c090c0c
 480     git checkout setup.py
 481     sed -i -e "s:'1\\.2':'1.2.0':" setup.py
 482     python setup.py build_cython
 483     python setup.py install --force
 484 ) || fatal "llfuse fork failed"
 485 pip freeze | grep -x llfuse==1.2.0 || fatal "error: installed llfuse 1.2.0 but '$(pip freeze | grep llfuse)' ???"
 486
 487 # Deactivate Python 2 virtualenv
 488 deactivate
 489
 490 declare -a pythonstuff
 491 pythonstuff=(
 492     sdk/pam
 493     sdk/python
 494     sdk/python:py3
 495     sdk/cwl
 496     services/dockercleaner:py3
 497     services/fuse
 498     services/nodemanager
 499     tools/crunchstat-summary
 500     )
 501
 502 # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
 503 # Otherwise, skip dependent tests.
 504 PYTHON3=$(which python3)
 505 if [[ ${?} = 0 ]]; then
 506     setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
 507 else
 508     PYTHON3=
 509     cat >&2 <<EOF
 510
 511 Warning: python3 could not be found. Python 3 tests will be skipped.
 512
 513 EOF
 514 fi
 515
 516 # Reactivate Python 2 virtualenv
 517 . "$VENVDIR/bin/activate"
 518
 519 # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
 520 # whine a lot.
 521 setup_ruby_environment
 522
 523 echo "PATH is $PATH"
 524
 525 if ! which bundler >/dev/null
 526 then
 527     gem install --user-install bundler || fatal 'Could not install bundler'
 528 fi
 529
 530 retry() {
 531     remain="${repeat}"
 532     while :
 533     do
 534         if ${@}; then
 535             if [[ "$remain" -gt 1 ]]; then
 536                 remain=$((${remain}-1))
 537                 title "Repeating ${remain} more times"
 538             else
 539                 break
 540             fi
 541         elif [[ "$retry" == 1 ]]; then
 542             read -p 'Try again? [Y/n] ' x
 543             if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
 544             then
 545                 break
 546             fi
 547         else
 548             break
 549         fi
 550     done
 551 }
 552
 553 do_test() {
 554     case "${1}" in
 555         apps/workbench_units | apps/workbench_functionals | apps/workbench_integration)
 556             suite=apps/workbench
 557             ;;
 558         services/nodemanager | services/nodemanager_integration)
 559             suite=services/nodemanager_suite
 560             ;;
 561         *)
 562             suite="${1}"
 563             ;;
 564     esac
 565     if [[ -z "${skip[$suite]}" && -z "${skip[$1]}" && \
 566                 (-z "${only}" || "${only}" == "${suite}" || \
 567                  "${only}" == "${1}") ]]; then
 568         retry do_test_once ${@}
 569     else
 570         title "Skipping ${1} tests"
 571     fi
 572 }
 573
 574 do_test_once() {
 575     unset result
 576
 577     title "Running $1 tests"
 578     timer_reset
 579     if [[ "$2" == "go" ]]
 580     then
 581         covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
 582         coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
 583         # We do "go get -t" here to catch compilation errors
 584         # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
 585         # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
 586         # compilation errors.
 587         go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 588             cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 589             [[ -z "$(gofmt -e -d . | tee /dev/stderr)" ]] && \
 590             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
 591         then
 592             # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
 593             # does:
 594             go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
 595         else
 596             # The above form gets verbose even when testargs is
 597             # empty, so use this form in such cases:
 598             go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 599         fi
 600         result=${result:-$?}
 601         if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
 602         then
 603             go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
 604             rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
 605         fi
 606     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 607     then
 608         tries=0
 609         cd "$WORKSPACE/$1" && while :
 610         do
 611             tries=$((${tries}+1))
 612             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 613             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 614             "${3}python" setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
 615             result=$?
 616             if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
 617             then
 618                 printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
 619                 continue
 620             else
 621                 break
 622             fi
 623         done
 624     elif [[ "$2" != "" ]]
 625     then
 626         "test_$2"
 627     else
 628         "test_$1"
 629     fi
 630     result=${result:-$?}
 631     checkexit $result "$1 tests"
 632     title "End of $1 tests (`timer`)"
 633     return $result
 634 }
 635
 636 do_install() {
 637     if [[ -z "${only_install}" || "${only_install}" == "${1}" ]]; then
 638         retry do_install_once ${@}
 639     else
 640         title "Skipping $1 install"
 641     fi
 642 }
 643
 644 do_install_once() {
 645     title "Running $1 install"
 646     timer_reset
 647     if [[ "$2" == "go" ]]
 648     then
 649         go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 650     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 651     then
 652         # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 653         # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 654
 655         # Need to change to a different directory after creating
 656         # the source dist package to avoid a pip bug.
 657         # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
 658
 659         # Also need to install twice, because if it believes the package is
 660         # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
 661         # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
 662         # install" ensures that we've actually installed the local package
 663         # we just built.
 664         cd "$WORKSPACE/$1" \
 665             && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
 666             && cd "$WORKSPACE" \
 667             && "${3}pip" install --quiet "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
 668             && "${3}pip" install --quiet --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
 669     elif [[ "$2" != "" ]]
 670     then
 671         "install_$2"
 672     else
 673         "install_$1"
 674     fi
 675     result=$?
 676     checkexit $result "$1 install"
 677     title "End of $1 install (`timer`)"
 678     return $result
 679 }
 680
 681 bundle_install_trylocal() {
 682     (
 683         set -e
 684         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
 685         if ! bundle install --local --no-deployment; then
 686             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
 687             bundle install --no-deployment
 688         fi
 689         bundle package --all
 690     )
 691 }
 692
 693 install_doc() {
 694     cd "$WORKSPACE/doc" \
 695         && bundle_install_trylocal \
 696         && rm -rf .site
 697 }
 698 do_install doc
 699
 700 install_gem() {
 701     gemname=$1
 702     srcpath=$2
 703     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
 704         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
 705         && bundle_install_trylocal \
 706         && gem build "$gemname.gemspec" \
 707         && with_test_gemset gem install --no-ri --no-rdoc $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
 708 }
 709
 710 install_ruby_sdk() {
 711     install_gem arvados sdk/ruby
 712 }
 713 do_install sdk/ruby ruby_sdk
 714
 715 install_perl_sdk() {
 716     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
 717         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
 718         && make install INSTALLDIRS=perl
 719 }
 720 do_install sdk/perl perl_sdk
 721
 722 install_cli() {
 723     install_gem arvados-cli sdk/cli
 724 }
 725 do_install sdk/cli cli
 726
 727 install_login-sync() {
 728     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
 729 }
 730 do_install services/login-sync login-sync
 731
 732 # Install the Python SDK early. Various other test suites (like
 733 # keepproxy) bring up run_test_server.py, which imports the arvados
 734 # module. We can't actually *test* the Python SDK yet though, because
 735 # its own test suite brings up some of those other programs (like
 736 # keepproxy).
 737 for p in "${pythonstuff[@]}"
 738 do
 739     dir=${p%:py3}
 740     if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
 741         if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
 742             do_install ${dir} pip
 743         fi
 744     elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
 745         if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
 746             do_install ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
 747         fi
 748     fi
 749 done
 750
 751 install_apiserver() {
 752     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 753         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 754
 755     rm -f config/environments/test.rb
 756     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
 757
 758     if [ -n "$CONFIGSRC" ]
 759     then
 760         for f in database.yml
 761         do
 762             cp "$CONFIGSRC/$f" config/ || fatal "$f"
 763         done
 764     fi
 765
 766     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
 767     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
 768     # is a postgresql superuser.
 769     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 770         && test_database=$(python -c "import yaml; print yaml.load(file('config/database.yml'))['test']['database']") \
 771         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.procpid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
 772
 773     mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/tmp/pids"
 774
 775     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 776         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:drop \
 777         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:setup \
 778         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:fixtures:load
 779 }
 780 do_install services/api apiserver
 781
 782 cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" && \
 783     "$GOPATH/bin/govendor" sync -v || \
 784         fatal "govendor sync failed"
 785 declare -a gostuff
 786 gostuff=(
 787     sdk/go/arvados
 788     sdk/go/arvadosclient
 789     sdk/go/blockdigest
 790     sdk/go/dispatch
 791     sdk/go/health
 792     sdk/go/httpserver
 793     sdk/go/manifest
 794     sdk/go/streamer
 795     sdk/go/crunchrunner
 796     sdk/go/stats
 797     lib/crunchstat
 798     services/arv-git-httpd
 799     services/crunchstat
 800     services/keep-web
 801     services/keepstore
 802     sdk/go/keepclient
 803     services/keep-balance
 804     services/keepproxy
 805     services/crunch-dispatch-local
 806     services/crunch-dispatch-slurm
 807     services/crunch-run
 808     services/ws
 809     tools/keep-block-check
 810     tools/keep-exercise
 811     tools/keep-rsync
 812 )
 813 for g in "${gostuff[@]}"
 814 do
 815     do_install "$g" go
 816 done
 817
 818 install_workbench() {
 819     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 820         && mkdir -p tmp/cache \
 821         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 822 }
 823 do_install apps/workbench workbench
 824
 825 unset http_proxy https_proxy no_proxy
 826
 827 test_doclinkchecker() {
 828     (
 829         set -e
 830         cd "$WORKSPACE/doc"
 831         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
 832         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
 833         # do much good!
 834         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ bundle exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
 835     )
 836 }
 837 do_test doc doclinkchecker
 838
 839 stop_services
 840
 841 test_apiserver() {
 842     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
 843     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 844         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/api]}
 845 }
 846 do_test services/api apiserver
 847
 848 # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
 849 # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
 850 if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
 851   rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 852   exit_cleanly
 853 fi
 854
 855 start_api || { stop_services; fatal "start_api"; }
 856
 857 test_ruby_sdk() {
 858     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
 859         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
 860 }
 861 do_test sdk/ruby ruby_sdk
 862
 863 test_cli() {
 864     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
 865         && mkdir -p /tmp/keep \
 866         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
 867 }
 868 do_test sdk/cli cli
 869
 870 test_login-sync() {
 871     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
 872         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
 873 }
 874 do_test services/login-sync login-sync
 875
 876 test_nodemanager_integration() {
 877     cd "$WORKSPACE/services/nodemanager" \
 878         && tests/integration_test.py ${testargs[services/nodemanager_integration]}
 879 }
 880 do_test services/nodemanager_integration nodemanager_integration
 881
 882 for p in "${pythonstuff[@]}"
 883 do
 884     dir=${p%:py3}
 885     if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
 886         if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
 887             do_test ${dir} pip
 888         fi
 889     elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
 890         if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
 891             do_test ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
 892         fi
 893     fi
 894 done
 895
 896 for g in "${gostuff[@]}"
 897 do
 898     do_test "$g" go
 899 done
 900
 901 test_workbench_units() {
 902     start_nginx_proxy_services \
 903         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 904         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:units TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 905 }
 906 do_test apps/workbench_units workbench_units
 907
 908 test_workbench_functionals() {
 909     start_nginx_proxy_services \
 910         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 911         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:functionals TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 912 }
 913 do_test apps/workbench_functionals workbench_functionals
 914
 915 test_workbench_integration() {
 916     start_nginx_proxy_services \
 917         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 918         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:integration TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 919 }
 920 do_test apps/workbench_integration workbench_integration
 921
 922
 923 test_workbench_benchmark() {
 924     start_nginx_proxy_services \
 925         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 926         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:benchmark ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
 927 }
 928 do_test apps/workbench_benchmark workbench_benchmark
 929
 930 test_workbench_profile() {
 931     start_nginx_proxy_services \
 932         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 933         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:profile ${testargs[apps/workbench_profile]}
 934 }
 935 do_test apps/workbench_profile workbench_profile
 936
 937 exit_cleanly