apps/workbench/app/helpers/application_helper.rb

   1 module ApplicationHelper
   2   def current_user
   3     controller.current_user
   4   end
   5
   6   def self.match_uuid(uuid)
   7     /^([0-9a-z]{5})-([0-9a-z]{5})-([0-9a-z]{15})$/.match(uuid.to_s)
   8   end
   9
  10   def current_api_host
  11     Rails.configuration.arvados_v1_base.gsub /https?:\/\/|\/arvados\/v1/,''
  12   end
  13
  14   def render_content_from_database(markup)
  15     raw RedCloth.new(markup).to_html
  16   end
  17
  18   def human_readable_bytes_html(n)
  19     return h(n) unless n.is_a? Fixnum
  20     return "0 bytes" if (n == 0)
  21
  22     orders = {
  23       1 => "bytes",
  24       1024 => "KiB",
  25       (1024*1024) => "MiB",
  26       (1024*1024*1024) => "GiB",
  27       (1024*1024*1024*1024) => "TiB"
  28     }
  29
  30     orders.each do |k, v|
  31       sig = (n.to_f/k)
  32       if sig >=1 and sig < 1024
  33         if v == 'bytes'
  34           return "%i #{v}" % sig
  35         else
  36           return "%0.1f #{v}" % sig
  37         end
  38       end
  39     end
  40
  41     return h(n)
  42     #raw = n.to_s
  43     #cooked = ''
  44     #while raw.length > 3
  45     #  cooked = ',' + raw[-3..-1] + cooked
  46     #  raw = raw[0..-4]
  47     #end
  48     #cooked = raw + cooked
  49   end
  50
  51   def resource_class_for_uuid(attrvalue, opts={})
  52     ArvadosBase::resource_class_for_uuid(attrvalue, opts)
  53   end
  54
  55   ##
  56   # Returns HTML that links to the Arvados object specified in +attrvalue+
  57   # Provides various output control and styling options.
  58   #
  59   # +attrvalue+ an Arvados model object or uuid
  60   #
  61   # +opts+ a set of flags to control output:
  62   #
  63   # [:link_text] the link text to use (may include HTML), overrides everything else
  64   #
  65   # [:friendly_name] whether to use the "friendly" name in the link text (by
  66   # calling #friendly_link_name on the object), otherwise use the uuid
  67   #
  68   # [:with_class_name] prefix the link text with the class name of the model
  69   #
  70   # [:no_tags] disable tags in the link text (default is to show tags).
  71   # Currently tags are only shown for Collections.
  72   #
  73   # [:thumbnail] if the object is a collection, show an image thumbnail if the
  74   # collection consists of a single image file.
  75   #
  76   # [:no_link] don't create a link, just return the link text
  77   #
  78   # +style_opts+ additional HTML properties for the anchor tag, passed to link_to
  79   #
  80   def link_to_if_arvados_object(attrvalue, opts={}, style_opts={})
  81     if (resource_class = resource_class_for_uuid(attrvalue, opts))
  82       if attrvalue.is_a? ArvadosBase
  83         object = attrvalue
  84         link_uuid = attrvalue.uuid
  85       else
  86         object = nil
  87         link_uuid = attrvalue
  88       end
  89       link_name = opts[:link_text]
  90       if !link_name
  91         link_name = object.andand.default_name || resource_class.default_name
  92
  93         if opts[:friendly_name]
  94           if attrvalue.respond_to? :friendly_link_name
  95             link_name = attrvalue.friendly_link_name
  96           else
  97             begin
  98               if resource_class.name == 'Collection'
  99                 link_name = collections_for_object(link_uuid).andand.first.andand.friendly_link_name
 100               else
 101                 link_name = object_for_dataclass(resource_class, link_uuid).andand.friendly_link_name
 102               end
 103             rescue ArvadosApiClient::NotFoundException
 104               # If that lookup failed, the link will too. So don't make one.
 105               return attrvalue
 106             end
 107           end
 108         end
 109         if opts[:with_class_name]
 110           link_name = "#{resource_class.to_s}: #{link_name}"
 111         end
 112         if !opts[:no_tags] and resource_class == Collection
 113           links_for_object(link_uuid).each do |tag|
 114             if tag.link_class.in? ["tag", "identifier"]
 115               link_name += ' <span class="label label-info">' + html_escape(tag.name) + '</span>'
 116             end
 117           end
 118         end
 119         if opts[:thumbnail] and resource_class == Collection
 120           # add an image thumbnail if the collection consists of a single image file.
 121           collections_for_object(link_uuid).each do |c|
 122             if c.files.length == 1 and CollectionsHelper::is_image c.files.first[1]
 123               link_name += " "
 124               link_name += image_tag "#{url_for c}/#{CollectionsHelper::file_path c.files.first}", style: "height: 4em; width: auto"
 125             end
 126           end
 127         end
 128       end
 129       style_opts[:class] = (style_opts[:class] || '') + ' nowrap'
 130       if opts[:no_link]
 131         raw(link_name)
 132       else
 133         link_to raw(link_name), { controller: resource_class.to_s.tableize, action: 'show', id: ((opts[:name_link].andand.uuid) || link_uuid) }, style_opts
 134       end
 135     else
 136       # just return attrvalue if it is not recognizable as an Arvados object or uuid.
 137       attrvalue
 138     end
 139   end
 140
 141   def render_editable_attribute(object, attr, attrvalue=nil, htmloptions={})
 142     attrvalue = object.send(attr) if attrvalue.nil?
 143     if !object.attribute_editable?(attr, :ever) or
 144         (!object.editable? and
 145          !object.owner_uuid.in?(my_projects.collect(&:uuid)))
 146       return ((attrvalue && attrvalue.length > 0 && attrvalue) ||
 147               (attr == 'name' and object.andand.default_name) ||
 148               '(none)')
 149     end
 150
 151     input_type = 'text'
 152     case object.class.attribute_info[attr.to_sym].andand[:type]
 153     when 'text'
 154       input_type = 'textarea'
 155     when 'datetime'
 156       input_type = 'date'
 157     else
 158       input_type = 'text'
 159     end
 160
 161     attrvalue = attrvalue.to_json if attrvalue.is_a? Hash or attrvalue.is_a? Array
 162
 163     ajax_options = {
 164       "data-pk" => {
 165         id: object.uuid,
 166         key: object.class.to_s.underscore
 167       }
 168     }
 169     if object.uuid
 170       ajax_options['data-url'] = url_for(action: "update", id: object.uuid, controller: object.class.to_s.pluralize.underscore)
 171     else
 172       ajax_options['data-url'] = url_for(action: "create", controller: object.class.to_s.pluralize.underscore)
 173       ajax_options['data-pk'][:defaults] = object.attributes
 174     end
 175     ajax_options['data-pk'] = ajax_options['data-pk'].to_json
 176     @unique_id ||= (Time.now.to_f*1000000).to_i
 177     span_id = object.uuid.to_s + '-' + attr.to_s + '-' + (@unique_id += 1).to_s
 178
 179     span_tag = content_tag 'span', attrvalue.to_s, {
 180       "data-emptytext" => (object.andand.default_name || 'none'),
 181       "data-placement" => "bottom",
 182       "data-type" => input_type,
 183       "data-title" => "Edit #{attr.gsub '_', ' '}",
 184       "data-name" => attr,
 185       "data-object-uuid" => object.uuid,
 186       "data-toggle" => "manual",
 187       "id" => span_id,
 188       :class => "editable"
 189     }.merge(htmloptions).merge(ajax_options)
 190     edit_button = raw('<a href="#" class="btn btn-xs btn-default btn-nodecorate" data-toggle="x-editable tooltip" data-toggle-selector="#' + span_id + '" data-placement="top" title="' + (htmloptions[:tiptitle] || 'edit') + '"><i class="fa fa-fw fa-pencil"></i></a>')
 191     if htmloptions[:btnplacement] == :left
 192       edit_button + ' ' + span_tag
 193     else
 194       span_tag + ' ' + edit_button
 195     end
 196   end
 197
 198   def render_pipeline_component_attribute(object, attr, subattr, value_info, htmloptions={})
 199     datatype = nil
 200     required = true
 201     attrvalue = value_info
 202
 203     if value_info.is_a? Hash
 204       if value_info[:output_of]
 205         return raw("<span class='label label-default'>#{value_info[:output_of]}</span>")
 206       end
 207       if value_info[:dataclass]
 208         dataclass = value_info[:dataclass]
 209       end
 210       if value_info[:optional] != nil
 211         required = (value_info[:optional] != "true")
 212       end
 213       if value_info[:required] != nil
 214         required = value_info[:required]
 215       end
 216
 217       # Pick a suitable attrvalue to show as the current value (i.e.,
 218       # the one that would be used if we ran the pipeline right now).
 219       if value_info[:value]
 220         attrvalue = value_info[:value]
 221       elsif value_info[:default]
 222         attrvalue = value_info[:default]
 223       else
 224         attrvalue = ''
 225       end
 226     end
 227
 228     if !object or
 229         !object.attribute_editable?(attr, :ever) or
 230         (!object.editable? and
 231          !object.owner_uuid.in?(my_projects.collect(&:uuid)))
 232       return link_to_if_arvados_object attrvalue
 233     end
 234
 235     if dataclass
 236       begin
 237         dataclass = dataclass.constantize
 238       rescue NameError
 239       end
 240     else
 241       dataclass = ArvadosBase.resource_class_for_uuid(attrvalue)
 242     end
 243
 244     id = "#{object.uuid}-#{subattr.join('-')}"
 245     dn = "[#{attr}]"
 246     subattr.each do |a|
 247       dn += "[#{a}]"
 248     end
 249     if value_info.is_a? Hash
 250       dn += '[value]'
 251     end
 252
 253     if dataclass == Collection
 254       selection_param = object.class.to_s.underscore + dn
 255       display_value = attrvalue
 256       if value_info.is_a?(Hash)
 257         if (link = Link.find? value_info[:link_uuid])
 258           display_value = link.name
 259         elsif value_info[:link_name]
 260           display_value = value_info[:link_name]
 261         end
 262       end
 263       modal_path = choose_collections_path \
 264       ({ title: 'Choose a dataset:',
 265          filters: [['tail_uuid', '=', object.owner_uuid]].to_json,
 266          action_name: 'OK',
 267          action_href: pipeline_instance_path(id: object.uuid),
 268          action_method: 'patch',
 269          action_data: {
 270            merge: true,
 271            selection_param: selection_param,
 272            success: 'page-refresh'
 273          }.to_json,
 274         })
 275       return content_tag('div', :class => 'input-group') do
 276         html = text_field_tag(dn, display_value,
 277                               :class =>
 278                               "form-control #{'required' if required}")
 279         html + content_tag('span', :class => 'input-group-btn') do
 280           link_to('Choose',
 281                   modal_path,
 282                   { :class => "btn btn-primary",
 283                     :remote => true,
 284                     :method => 'get',
 285                   })
 286         end
 287       end
 288     end
 289
 290     if dataclass.andand.is_a?(Class)
 291       datatype = 'select'
 292     elsif dataclass == 'number'
 293       datatype = 'number'
 294     elsif attrvalue.is_a? Array
 295       # TODO: find a way to edit arrays with x-editable
 296       return attrvalue
 297     elsif attrvalue.is_a? Fixnum or attrvalue.is_a? Float
 298       datatype = 'number'
 299     elsif attrvalue.is_a? String
 300       datatype = 'text'
 301     end
 302
 303     # preload data
 304     preload_uuids = []
 305     items = []
 306     selectables = []
 307
 308     attrtext = attrvalue
 309     if dataclass.is_a? Class and dataclass < ArvadosBase
 310       objects = get_n_objects_of_class dataclass, 10
 311       objects.each do |item|
 312         items << item
 313         preload_uuids << item.uuid
 314       end
 315       if attrvalue and !attrvalue.empty?
 316         preload_uuids << attrvalue
 317       end
 318       preload_links_for_objects preload_uuids
 319
 320       if attrvalue and !attrvalue.empty?
 321         links_for_object(attrvalue).each do |link|
 322           if link.link_class.in? ["tag", "identifier"]
 323             attrtext += " [#{link.name}]"
 324           end
 325         end
 326         selectables.append({name: attrtext, uuid: attrvalue, type: dataclass.to_s})
 327       end
 328       itemuuids = []
 329       items.each do |item|
 330         itemuuids << item.uuid
 331         selectables.append({name: item.uuid, uuid: item.uuid, type: dataclass.to_s})
 332       end
 333
 334       itemuuids.each do |itemuuid|
 335         links_for_object(itemuuid).each do |link|
 336           if link.link_class.in? ["tag", "identifier"]
 337             selectables.each do |selectable|
 338               if selectable['uuid'] == link.head_uuid
 339                 selectable['name'] += ' [' + link.name + ']'
 340               end
 341             end
 342           end
 343         end
 344       end
 345     end
 346
 347     lt = link_to attrtext, '#', {
 348       "data-emptytext" => "none",
 349       "data-placement" => "bottom",
 350       "data-type" => datatype,
 351       "data-url" => url_for(action: "update", id: object.uuid, controller: object.class.to_s.pluralize.underscore, merge: true),
 352       "data-title" => "Set value for #{subattr[-1].to_s}",
 353       "data-name" => dn,
 354       "data-pk" => "{id: \"#{object.uuid}\", key: \"#{object.class.to_s.underscore}\"}",
 355       "data-value" => attrvalue,
 356       # "clear" button interferes with form-control's up/down arrows
 357       "data-clear" => false,
 358       :class => "editable #{'required' if required} form-control",
 359       :id => id
 360     }.merge(htmloptions)
 361
 362     lt += raw("\n<script>")
 363
 364     if selectables.any?
 365       lt += raw("add_form_selection_sources(#{selectables.to_json});\n")
 366     end
 367
 368     lt += raw("$('[data-name=\"#{dn}\"]').editable({source: function() { return select_form_sources('#{dataclass}'); } });\n")
 369
 370     lt += raw("</script>")
 371
 372     lt
 373   end
 374
 375   def render_arvados_object_list_start(list, button_text, button_href,
 376                                        params={}, *rest, &block)
 377     show_max = params.delete(:show_max) || 3
 378     params[:class] ||= 'btn btn-xs btn-default'
 379     list[0...show_max].each { |item| yield item }
 380     unless list[show_max].nil?
 381       link_to(h(button_text) +
 382               raw(' &nbsp; <i class="fa fa-fw fa-arrow-circle-right"></i>'),
 383               button_href, params, *rest)
 384     end
 385   end
 386
 387   def render_controller_partial partial, opts
 388     cname = opts.delete :controller_name
 389     begin
 390       render opts.merge(partial: "#{cname}/#{partial}")
 391     rescue ActionView::MissingTemplate
 392       render opts.merge(partial: "application/#{partial}")
 393     end
 394   end
 395
 396   def fa_icon_class_for_object object
 397     case object.class.to_s.to_sym
 398     when :User
 399       'fa-user'
 400     when :Group
 401       object.group_class ? 'fa-folder' : 'fa-users'
 402     when :Job, :PipelineInstance, :PipelineTemplate
 403       'fa-gears'
 404     when :Collection
 405       'fa-archive'
 406     when :Specimen
 407       'fa-flask'
 408     when :Trait
 409       'fa-clipboard'
 410     when :Human
 411       'fa-male'
 412     when :VirtualMachine
 413       'fa-terminal'
 414     when :Repository
 415       'fa-code-fork'
 416     when :Link
 417       'fa-arrows-h'
 418     when :User
 419       'fa-user'
 420     when :Node
 421       'fa-cloud'
 422     when :KeepService
 423       'fa-exchange'
 424     when :KeepDisk
 425       'fa-hdd-o'
 426     else
 427       'fa-cube'
 428     end
 429   end
 430 end