services/api/app/models/pipeline_instance.rb

   1 class PipelineInstance < ArvadosModel
   2   include HasUuid
   3   include KindAndEtag
   4   include CommonApiTemplate
   5   serialize :components, Hash
   6   serialize :properties, Hash
   7   serialize :components_summary, Hash
   8   belongs_to :pipeline_template, :foreign_key => :pipeline_template_uuid, :primary_key => :uuid
   9
  10   before_validation :bootstrap_components
  11   before_validation :update_state
  12   before_validation :verify_status
  13   before_create :set_state_before_save
  14   before_save :set_state_before_save
  15
  16   api_accessible :user, extend: :common do |t|
  17     t.add :pipeline_template_uuid
  18     t.add :pipeline_template, :if => :pipeline_template
  19     t.add :name
  20     t.add :components
  21     t.add :dependencies
  22     t.add :properties
  23     t.add :state
  24     t.add :components_summary
  25     t.add :started_at
  26     t.add :finished_at
  27   end
  28
  29   # Supported states for a pipeline instance
  30   States =
  31     [
  32      (New = 'New'),
  33      (Ready = 'Ready'),
  34      (RunningOnServer = 'RunningOnServer'),
  35      (RunningOnClient = 'RunningOnClient'),
  36      (Paused = 'Paused'),
  37      (Failed = 'Failed'),
  38      (Complete = 'Complete'),
  39     ]
  40
  41   def dependencies
  42     dependency_search(self.components).keys
  43   end
  44
  45   # if all components have input, the pipeline is Ready
  46   def components_look_ready?
  47     if !self.components || self.components.empty?
  48       return false
  49     end
  50
  51     all_components_have_input = true
  52     self.components.each do |name, component|
  53       component['script_parameters'].andand.each do |parametername, parameter|
  54         parameter = { 'value' => parameter } unless parameter.is_a? Hash
  55         if parameter['value'].nil? and parameter['required']
  56           if parameter['output_of']
  57             next
  58           end
  59           all_components_have_input = false
  60           break
  61         end
  62       end
  63     end
  64     return all_components_have_input
  65   end
  66
  67   def progress_table
  68     begin
  69       # v0 pipeline format
  70       nrow = -1
  71       components['steps'].collect do |step|
  72         nrow += 1
  73         row = [nrow, step['name']]
  74         if step['complete'] and step['complete'] != 0
  75           if step['output_data_locator']
  76             row << 1.0
  77           else
  78             row << 0.0
  79           end
  80         else
  81           row << 0.0
  82           if step['failed']
  83             self.state = Failed
  84           end
  85         end
  86         row << (step['warehousejob']['id'] rescue nil)
  87         row << (step['warehousejob']['revision'] rescue nil)
  88         row << step['output_data_locator']
  89         row << (Time.parse(step['warehousejob']['finishtime']) rescue nil)
  90         row
  91       end
  92     rescue
  93       []
  94     end
  95   end
  96
  97   def progress_ratio
  98     t = progress_table
  99     return 0 if t.size < 1
 100     t.collect { |r| r[2] }.inject(0.0) { |sum,a| sum += a } / t.size
 101   end
 102
 103   def self.queue
 104     self.where("state = 'RunningOnServer'")
 105   end
 106
 107   protected
 108   def bootstrap_components
 109     if pipeline_template and (!components or components.empty?)
 110       self.components = pipeline_template.components.deep_dup
 111     end
 112   end
 113
 114   def update_state
 115     if components and progress_ratio == 1.0
 116       self.state = Complete
 117     end
 118   end
 119
 120   def dependency_search(haystack)
 121     if haystack.is_a? String
 122       if (re = haystack.match /^([0-9a-f]{32}(\+[^,]+)*)+/)
 123         {re[1] => true}
 124       else
 125         {}
 126       end
 127     elsif haystack.is_a? Array
 128       deps = {}
 129       haystack.each do |value|
 130         deps.merge! dependency_search(value)
 131       end
 132       deps
 133     elsif haystack.respond_to? :keys
 134       deps = {}
 135       haystack.each do |key, value|
 136         deps.merge! dependency_search(value)
 137       end
 138       deps
 139     else
 140       {}
 141     end
 142   end
 143
 144   def verify_status
 145     changed_attributes = self.changed
 146
 147     if new_record? or 'components'.in? changed_attributes
 148       self.state ||= New
 149       if (self.state == New) and self.components_look_ready?
 150         self.state = Ready
 151       end
 152     end
 153
 154     if self.state.in?(States)
 155       true
 156     else
 157       errors.add :state, "'#{state.inspect} must be one of: [#{States.join ', '}]"
 158       false
 159     end
 160   end
 161
 162   def set_state_before_save
 163     if self.components_look_ready? && (!self.state || self.state == New)
 164       self.state = Ready
 165     end
 166   end
 167
 168 end