build/run-tests.sh

   1 #!/bin/bash
   2 # Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
   3 #
   4 # SPDX-License-Identifier: AGPL-3.0
   5
   6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin.sh
   7
   8 COLUMNS=80
   9 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
  10
  11 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
  12 $(basename $0): Install and test Arvados components.
  13
  14 Exit non-zero if any tests fail.
  15
  16 Syntax:
  17         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
  18
  19 Options:
  20
  21 --skip FOO     Do not test the FOO component.
  22 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
  23 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
  24                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
  25 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
  26                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
  27                subsequent invocations.
  28 --repeat N     Repeat each install/test step until it succeeds N times.
  29 --retry        Prompt to retry if an install or test suite fails.
  30 --skip-install Do not run any install steps. Just run tests.
  31                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
  32                from a previous invocation if you use this option.
  33 --only-install Run specific install step
  34 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
  35 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
  36 CONFIGSRC=path Dir with api server config files to copy into source tree.
  37                (If none given, leave config files alone in source tree.)
  38 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
  39                Restrict apiserver tests to the given file
  40 sdk/python_test="--test-suite test.test_keep_locator"
  41                Restrict Python SDK tests to the given class
  42 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
  43                Restrict Workbench tests to the given file
  44 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
  45                Show all log messages, even when tests pass (also works
  46                with services/keepstore_test etc.)
  47 ARVADOS_DEBUG=1
  48                Print more debug messages
  49 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
  50                *_test, and other examples shown above.
  51
  52 Assuming --skip-install is not given, all components are installed
  53 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
  54 test suites depend on other components being installed, and installing
  55 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
  56
  57 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
  58 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
  59
  60 More information and background:
  61
  62 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
  63
  64 Available tests:
  65
  66 apps/workbench (*)
  67 apps/workbench_units (*)
  68 apps/workbench_functionals (*)
  69 apps/workbench_integration (*)
  70 apps/workbench_benchmark
  71 apps/workbench_profile
  72 cmd/arvados-client
  73 doc
  74 lib/cli
  75 lib/cmd
  76 lib/crunchstat
  77 services/api
  78 services/arv-git-httpd
  79 services/crunchstat
  80 services/dispatchcloud
  81 services/dockercleaner
  82 services/fuse
  83 services/health
  84 services/keep-web
  85 services/keepproxy
  86 services/keepstore
  87 services/keep-balance
  88 services/login-sync
  89 services/nodemanager
  90 services/nodemanager_integration
  91 services/crunch-run
  92 services/crunch-dispatch-local
  93 services/crunch-dispatch-slurm
  94 services/ws
  95 sdk/cli
  96 sdk/pam
  97 sdk/python
  98 sdk/python:py3
  99 sdk/ruby
 100 sdk/go/arvados
 101 sdk/go/arvadosclient
 102 sdk/go/dispatch
 103 sdk/go/keepclient
 104 sdk/go/health
 105 sdk/go/httpserver
 106 sdk/go/manifest
 107 sdk/go/blockdigest
 108 sdk/go/asyncbuf
 109 sdk/go/stats
 110 sdk/go/crunchrunner
 111 sdk/cwl
 112 tools/sync-groups
 113 tools/crunchstat-summary
 114 tools/keep-exercise
 115 tools/keep-rsync
 116 tools/keep-block-check
 117
 118 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
 119     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
 120
 121 EOF
 122
 123 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
 124 # environment that could interfere with the tests.
 125 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
 126
 127 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
 128 # accident.
 129 GITDIR=
 130 GOPATH=
 131 VENVDIR=
 132 VENV3DIR=
 133 PYTHONPATH=
 134 GEMHOME=
 135 PERLINSTALLBASE=
 136
 137 short=
 138 only_install=
 139 temp=
 140 temp_preserve=
 141
 142 clear_temp() {
 143     if [[ -z "$temp" ]]; then
 144         # we didn't even get as far as making a temp dir
 145         :
 146     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
 147         rm -rf "$temp"
 148     else
 149         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
 150     fi
 151 }
 152
 153 fatal() {
 154     clear_temp
 155     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
 156     exit 1
 157 }
 158
 159 exit_cleanly() {
 160     trap - INT
 161     create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
 162     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 163     stop_services
 164     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 165     report_outcomes
 166     clear_temp
 167     exit ${#failures}
 168 }
 169
 170 sanity_checks() {
 171     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
 172         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
 173     echo Checking dependencies:
 174     echo -n 'virtualenv: '
 175     virtualenv --version \
 176         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
 177     echo -n 'ruby: '
 178     ruby -v \
 179         || fatal "No ruby. Install >=2.1.9 (using rbenv, rvm, or source)"
 180     echo -n 'go: '
 181     go version \
 182         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
 183     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 8 ]] \
 184         || fatal "Go >= 1.8 required. See http://golang.org/doc/install"
 185     echo -n 'gcc: '
 186     gcc --version | egrep ^gcc \
 187         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
 188     echo -n 'fuse.h: '
 189     find /usr/include -path '*fuse/fuse.h' | egrep --max-count=1 . \
 190         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
 191     echo -n 'gnutls.h: '
 192     find /usr/include -path '*gnutls/gnutls.h' | egrep --max-count=1 . \
 193         || fatal "No gnutls/gnutls.h. Try: apt-get install libgnutls28-dev"
 194     echo -n 'Python2 pyconfig.h: '
 195     find /usr/include -path '*/python2*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 196         || fatal "No Python2 pyconfig.h. Try: apt-get install python2.7-dev"
 197     echo -n 'Python3 pyconfig.h: '
 198     find /usr/include -path '*/python3*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 199         || fatal "No Python3 pyconfig.h. Try: apt-get install python3-dev"
 200     echo -n 'nginx: '
 201     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
 202         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
 203     echo -n 'perl: '
 204     perl -v | grep version \
 205         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
 206     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
 207         echo -n "perl $mod: "
 208         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
 209             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
 210     done
 211     echo -n 'gitolite: '
 212     which gitolite \
 213         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
 214     echo -n 'npm: '
 215     npm --version \
 216         || fatal "No npm. Try: wget -O- https://nodejs.org/dist/v6.11.2/node-v6.11.2-linux-x64.tar.xz | sudo tar -C /usr/local -xJf - && sudo ln -s ../node-v6.11.2-linux-x64/bin/{node,npm} /usr/local/bin/"
 217     echo -n 'cadaver: '
 218     cadaver --version | grep -w cadaver \
 219           || fatal "No cadaver. Try: apt-get install cadaver"
 220     echo -n 'libattr1 xattr.h: '
 221     find /usr/include -path '*/attr/xattr.h' | egrep --max-count=1 . \
 222         || fatal "No libattr1 xattr.h. Try: apt-get install libattr1-dev"
 223     echo -n 'libcurl curl.h: '
 224     find /usr/include -path '*/curl/curl.h' | egrep --max-count=1 . \
 225         || fatal "No libcurl curl.h. Try: apt-get install libcurl4-gnutls-dev"
 226     echo -n 'libpq libpq-fe.h: '
 227     find /usr/include -path '*/postgresql/libpq-fe.h' | egrep --max-count=1 . \
 228         || fatal "No libpq libpq-fe.h. Try: apt-get install libpq-dev"
 229     echo -n 'services/api/config/database.yml: '
 230     if [[ ! -f "$WORKSPACE/services/api/config/database.yml" ]]; then
 231             fatal "Please provide a database.yml file for the test suite"
 232     else
 233             echo "OK"
 234     fi
 235     echo -n 'postgresql: '
 236     psql --version || fatal "No postgresql. Try: apt-get install postgresql postgresql-client-common"
 237     echo -n 'phantomjs: '
 238     phantomjs --version || fatal "No phantomjs. Try: apt-get install phantomjs"
 239     echo -n 'xvfb: '
 240     which Xvfb || fatal "No xvfb. Try: apt-get install xvfb"
 241     echo -n 'graphviz: '
 242     dot -V || fatal "No graphviz. Try: apt-get install graphviz"
 243 }
 244
 245 rotate_logfile() {
 246   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 247   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
 248   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
 249     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
 250     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 251     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 252   fi
 253 }
 254
 255 declare -a failures
 256 declare -A skip
 257 declare -A testargs
 258 skip[apps/workbench_profile]=1
 259
 260 while [[ -n "$1" ]]
 261 do
 262     arg="$1"; shift
 263     case "$arg" in
 264         --help)
 265             echo >&2 "$helpmessage"
 266             echo >&2
 267             exit 1
 268             ;;
 269         --skip)
 270             skip[$1]=1; shift
 271             ;;
 272         --only)
 273             only="$1"; skip[$1]=""; shift
 274             ;;
 275         --short)
 276             short=1
 277             ;;
 278         --skip-install)
 279             only_install=nothing
 280             ;;
 281         --only-install)
 282             only_install="$1"; shift
 283             ;;
 284         --temp)
 285             temp="$1"; shift
 286             temp_preserve=1
 287             ;;
 288         --leave-temp)
 289             temp_preserve=1
 290             ;;
 291         --repeat)
 292             repeat=$((${1}+0)); shift
 293             ;;
 294         --retry)
 295             retry=1
 296             ;;
 297         *_test=*)
 298             suite="${arg%%_test=*}"
 299             args="${arg#*=}"
 300             testargs["$suite"]="$args"
 301             ;;
 302         *=*)
 303             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
 304             ;;
 305         *)
 306             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
 307             exit 1
 308             ;;
 309     esac
 310 done
 311
 312 start_services() {
 313     echo 'Starting API, keepproxy, keep-web, ws, arv-git-httpd, and nginx ssl proxy...'
 314     if [[ ! -d "$WORKSPACE/services/api/log" ]]; then
 315         mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/log"
 316     fi
 317     # Remove empty api.pid file if it exists
 318     if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/api.pid" && ! -s "$WORKSPACE/tmp/api.pid" ]]; then
 319         rm -f "$WORKSPACE/tmp/api.pid"
 320     fi
 321     cd "$WORKSPACE" \
 322         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
 323         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
 324         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
 325         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
 326         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
 327         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
 328         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 329         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
 330         && (env | egrep ^ARVADOS)
 331 }
 332
 333 stop_services() {
 334     if [[ -z "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
 335         return
 336     fi
 337     unset ARVADOS_TEST_API_HOST
 338     cd "$WORKSPACE" \
 339         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 340         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
 341         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 342         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
 343         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy \
 344         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop
 345 }
 346
 347 interrupt() {
 348     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
 349     exit_cleanly
 350 }
 351 trap interrupt INT
 352
 353 sanity_checks
 354
 355 echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
 356
 357 if [[ -z "$CONFIGSRC" ]] && [[ -d "$HOME/arvados-api-server" ]]; then
 358     # Jenkins expects us to use this by default.
 359     CONFIGSRC="$HOME/arvados-api-server"
 360 fi
 361
 362 # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
 363 cd "$WORKSPACE"
 364 find -name '*.pyc' -delete
 365
 366 if [[ -z "$temp" ]]; then
 367     temp="$(mktemp -d)"
 368 fi
 369
 370 # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
 371 for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE
 372 do
 373     if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
 374         eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
 375     fi
 376     if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
 377         mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
 378     fi
 379 done
 380
 381 setup_ruby_environment() {
 382     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 383         source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
 384         using_rvm=true
 385     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 386         source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
 387         using_rvm=true
 388     else
 389         using_rvm=false
 390     fi
 391
 392     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 393         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
 394         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
 395         # the environment to the "current gemset", which would lose
 396         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
 397         # programs (for example, the Workbench test suite could not
 398         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
 399         # rvm gemset and use it for everything.
 400
 401         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
 402             || fatal 'rvm check'
 403
 404         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
 405         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
 406         # complaint about not being in first place already.
 407         rvm use @default 2>/dev/null
 408
 409         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
 410         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
 411         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
 412         # ruby to the caller.
 413         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
 414         rvm use "@${gemset}" --create \
 415             || fatal 'rvm gemset setup'
 416
 417         rvm env
 418     else
 419         # When our "bundle install"s need to install new gems to
 420         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
 421         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
 422         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
 423         # should be installed, and we should leave it alone.)
 424
 425         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
 426             user_gempath="$(gem env gempath)"
 427             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
 428         fi
 429         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
 430
 431         # When we build and install our own gems, we install them in our
 432         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
 433         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
 434         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
 435
 436         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
 437         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
 438         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home"
 439
 440         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
 441         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
 442         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
 443     fi
 444     bundle config || gem install bundler \
 445         || fatal 'install bundler'
 446 }
 447
 448 with_test_gemset() {
 449     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 450         "$@"
 451     else
 452         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
 453     fi
 454 }
 455
 456 gem_uninstall_if_exists() {
 457     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
 458         gem uninstall --force --all --executables "$1"
 459     fi
 460 }
 461
 462 setup_virtualenv() {
 463     local venvdest="$1"; shift
 464     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
 465         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
 466     fi
 467     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
 468         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
 469         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
 470     else
 471         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
 472     fi
 473     # ubuntu1404 can't seem to install mock via tests_require, but it can do this.
 474     "$venvdest/bin/pip" install 'mock>=1.0' 'pbr<1.7.0'
 475 }
 476
 477 export PERLINSTALLBASE
 478 export PERLLIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5:${PERLLIB:+$PERLLIB}"
 479
 480
 481 export GOPATH
 482 mkdir -p "$GOPATH/src/git.curoverse.com"
 483 rmdir -v --parents --ignore-fail-on-non-empty "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/tmp/GOPATH"
 484 for d in \
 485     "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/arvados.git" \
 486     "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"; do
 487     [[ -d "$d" ]] && rmdir "$d"
 488     [[ -h "$d" ]] && rm "$d"
 489 done
 490 ln -vsnfT "$WORKSPACE" "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" \
 491     || fatal "symlink failed"
 492 go get -v github.com/kardianos/govendor \
 493     || fatal "govendor install failed"
 494 cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" \
 495     || fatal
 496 # Remove cached source dirs in workdir. Otherwise, they won't qualify
 497 # as +missing or +external below, and we won't be able to detect that
 498 # they're missing from vendor/vendor.json.
 499 rm -r vendor/*/
 500 go get -v -d ...
 501 "$GOPATH/bin/govendor" sync \
 502     || fatal "govendor sync failed"
 503 [[ -z $("$GOPATH/bin/govendor" list +unused +missing +external | tee /dev/stderr) ]] \
 504     || fatal "vendor/vendor.json has unused or missing dependencies -- try:
 505 * govendor remove +unused
 506 * govendor add +missing +external
 507 "
 508 cd "$WORKSPACE"
 509
 510
 511 setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
 512 . "$VENVDIR/bin/activate"
 513
 514 # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
 515 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^PyYAML= \
 516     || pip install PyYAML >/dev/null \
 517     || fatal "pip install PyYAML failed"
 518
 519 # Preinstall forked version of libcloud, because nodemanager "pip install"
 520 # won't pick it up by default.
 521 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
 522     || pip install --pre --ignore-installed https://github.com/curoverse/libcloud/archive/apache-libcloud-$LIBCLOUD_PIN.zip >/dev/null \
 523     || fatal "pip install apache-libcloud failed"
 524
 525 # We need an unreleased (as of 2017-08-17) llfuse bugfix, otherwise our fuse test suite deadlocks.
 526 pip freeze | grep -x llfuse==1.2.0 || (
 527     set -e
 528     yes | pip uninstall llfuse || true
 529     cython --version || fatal "no cython; try sudo apt-get install cython"
 530     cd "$temp"
 531     (cd python-llfuse 2>/dev/null || git clone https://github.com/curoverse/python-llfuse)
 532     cd python-llfuse
 533     git checkout 620722fd990ea642ddb8e7412676af482c090c0c
 534     git checkout setup.py
 535     sed -i -e "s:'1\\.2':'1.2.0':" setup.py
 536     python setup.py build_cython
 537     python setup.py install --force
 538 ) || fatal "llfuse fork failed"
 539 pip freeze | grep -x llfuse==1.2.0 || fatal "error: installed llfuse 1.2.0 but '$(pip freeze | grep llfuse)' ???"
 540
 541 # Deactivate Python 2 virtualenv
 542 deactivate
 543
 544 declare -a pythonstuff
 545 pythonstuff=(
 546     sdk/pam
 547     sdk/python
 548     sdk/python:py3
 549     sdk/cwl
 550     services/dockercleaner:py3
 551     services/fuse
 552     services/nodemanager
 553     tools/crunchstat-summary
 554     )
 555
 556 # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
 557 # Otherwise, skip dependent tests.
 558 PYTHON3=$(which python3)
 559 if [[ ${?} = 0 ]]; then
 560     setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
 561 else
 562     PYTHON3=
 563     cat >&2 <<EOF
 564
 565 Warning: python3 could not be found. Python 3 tests will be skipped.
 566
 567 EOF
 568 fi
 569
 570 # Reactivate Python 2 virtualenv
 571 . "$VENVDIR/bin/activate"
 572
 573 # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
 574 # whine a lot.
 575 setup_ruby_environment
 576
 577 echo "PATH is $PATH"
 578
 579 if ! which bundler >/dev/null
 580 then
 581     gem install --user-install bundler || fatal 'Could not install bundler'
 582 fi
 583
 584 retry() {
 585     remain="${repeat}"
 586     while :
 587     do
 588         if ${@}; then
 589             if [[ "$remain" -gt 1 ]]; then
 590                 remain=$((${remain}-1))
 591                 title "Repeating ${remain} more times"
 592             else
 593                 break
 594             fi
 595         elif [[ "$retry" == 1 ]]; then
 596             read -p 'Try again? [Y/n] ' x
 597             if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
 598             then
 599                 break
 600             fi
 601         else
 602             break
 603         fi
 604     done
 605 }
 606
 607 do_test() {
 608     case "${1}" in
 609         apps/workbench_units | apps/workbench_functionals | apps/workbench_integration)
 610             suite=apps/workbench
 611             ;;
 612         services/nodemanager | services/nodemanager_integration)
 613             suite=services/nodemanager_suite
 614             ;;
 615         *)
 616             suite="${1}"
 617             ;;
 618     esac
 619     if [[ -z "${skip[$suite]}" && -z "${skip[$1]}" && \
 620                 (-z "${only}" || "${only}" == "${suite}" || \
 621                  "${only}" == "${1}") ]]; then
 622         retry do_test_once ${@}
 623     else
 624         title "Skipping ${1} tests"
 625     fi
 626 }
 627
 628 do_test_once() {
 629     unset result
 630
 631     title "Running $1 tests"
 632     timer_reset
 633     if [[ "$2" == "go" ]]
 634     then
 635         covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
 636         coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
 637         # We do "go get -t" here to catch compilation errors
 638         # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
 639         # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
 640         # compilation errors.
 641         go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 642             cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 643             [[ -z "$(gofmt -e -d . | tee /dev/stderr)" ]] && \
 644             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
 645         then
 646             # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
 647             # does:
 648             go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
 649         else
 650             # The above form gets verbose even when testargs is
 651             # empty, so use this form in such cases:
 652             go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 653         fi
 654         result=${result:-$?}
 655         if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
 656         then
 657             go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
 658             rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
 659         fi
 660     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 661     then
 662         tries=0
 663         cd "$WORKSPACE/$1" && while :
 664         do
 665             tries=$((${tries}+1))
 666             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 667             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 668             "${3}python" setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
 669             result=$?
 670             if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
 671             then
 672                 printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
 673                 continue
 674             else
 675                 break
 676             fi
 677         done
 678     elif [[ "$2" != "" ]]
 679     then
 680         "test_$2"
 681     else
 682         "test_$1"
 683     fi
 684     result=${result:-$?}
 685     checkexit $result "$1 tests"
 686     title "End of $1 tests (`timer`)"
 687     return $result
 688 }
 689
 690 do_install() {
 691     if [[ -z "${only_install}" || "${only_install}" == "${1}" ]]; then
 692         retry do_install_once ${@}
 693     else
 694         title "Skipping $1 install"
 695     fi
 696 }
 697
 698 do_install_once() {
 699     title "Running $1 install"
 700     timer_reset
 701     if [[ "$2" == "go" ]]
 702     then
 703         go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 704     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 705     then
 706         # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 707         # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 708
 709         # Need to change to a different directory after creating
 710         # the source dist package to avoid a pip bug.
 711         # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
 712
 713         # Also need to install twice, because if it believes the package is
 714         # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
 715         # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
 716         # install" ensures that we've actually installed the local package
 717         # we just built.
 718         cd "$WORKSPACE/$1" \
 719             && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
 720             && cd "$WORKSPACE" \
 721             && "${3}pip" install --quiet "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
 722             && "${3}pip" install --quiet --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
 723     elif [[ "$2" != "" ]]
 724     then
 725         "install_$2"
 726     else
 727         "install_$1"
 728     fi
 729     result=$?
 730     checkexit $result "$1 install"
 731     title "End of $1 install (`timer`)"
 732     return $result
 733 }
 734
 735 bundle_install_trylocal() {
 736     (
 737         set -e
 738         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
 739         if ! bundle install --local --no-deployment; then
 740             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
 741             bundle install --no-deployment
 742         fi
 743         bundle package --all
 744     )
 745 }
 746
 747 install_doc() {
 748     cd "$WORKSPACE/doc" \
 749         && bundle_install_trylocal \
 750         && rm -rf .site
 751 }
 752 do_install doc
 753
 754 install_gem() {
 755     gemname=$1
 756     srcpath=$2
 757     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
 758         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
 759         && bundle_install_trylocal \
 760         && gem build "$gemname.gemspec" \
 761         && with_test_gemset gem install --no-ri --no-rdoc $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
 762 }
 763
 764 install_ruby_sdk() {
 765     install_gem arvados sdk/ruby
 766 }
 767 do_install sdk/ruby ruby_sdk
 768
 769 install_perl_sdk() {
 770     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
 771         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
 772         && make install INSTALLDIRS=perl
 773 }
 774 do_install sdk/perl perl_sdk
 775
 776 install_cli() {
 777     install_gem arvados-cli sdk/cli
 778 }
 779 do_install sdk/cli cli
 780
 781 install_login-sync() {
 782     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
 783 }
 784 do_install services/login-sync login-sync
 785
 786 # Install the Python SDK early. Various other test suites (like
 787 # keepproxy) bring up run_test_server.py, which imports the arvados
 788 # module. We can't actually *test* the Python SDK yet though, because
 789 # its own test suite brings up some of those other programs (like
 790 # keepproxy).
 791 for p in "${pythonstuff[@]}"
 792 do
 793     dir=${p%:py3}
 794     if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
 795         if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
 796             do_install ${dir} pip
 797         fi
 798     elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
 799         if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
 800             do_install ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
 801         fi
 802     fi
 803 done
 804
 805 install_apiserver() {
 806     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 807         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 808
 809     rm -f config/environments/test.rb
 810     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
 811
 812     if [ -n "$CONFIGSRC" ]
 813     then
 814         for f in database.yml
 815         do
 816             cp "$CONFIGSRC/$f" config/ || fatal "$f"
 817         done
 818     fi
 819
 820     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
 821     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
 822     # is a postgresql superuser.
 823     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 824         && test_database=$(python -c "import yaml; print yaml.load(file('config/database.yml'))['test']['database']") \
 825         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.procpid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
 826
 827     mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/tmp/pids"
 828
 829     cert="$WORKSPACE/services/api/tmp/self-signed"
 830     if [[ ! -e "$cert.pem" || "$(date -r "$cert.pem" +%s)" -lt 1512659226 ]]; then
 831         (
 832             dir="$WORKSPACE/services/api/tmp"
 833             set -ex
 834             openssl req -newkey rsa:2048 -nodes -subj '/C=US/ST=State/L=City/CN=localhost' -out "$cert.csr" -keyout "$cert.key" </dev/null
 835             openssl x509 -req -in "$cert.csr" -signkey "$cert.key" -out "$cert.pem" -days 3650 -extfile <(printf 'subjectAltName=DNS:localhost,DNS:::1,DNS:0.0.0.0,DNS:127.0.0.1,IP:::1,IP:0.0.0.0,IP:127.0.0.1')
 836         ) || return 1
 837     fi
 838
 839     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 840         && rm -rf tmp/git \
 841         && mkdir -p tmp/git \
 842         && cd tmp/git \
 843         && tar xf ../../test/test.git.tar \
 844         && mkdir -p internal.git \
 845         && git --git-dir internal.git init \
 846             || return 1
 847
 848     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 849         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:drop \
 850         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:setup \
 851         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:fixtures:load
 852 }
 853 do_install services/api apiserver
 854
 855 declare -a gostuff
 856 gostuff=(
 857     cmd/arvados-client
 858     lib/cli
 859     lib/cmd
 860     lib/crunchstat
 861     sdk/go/arvados
 862     sdk/go/arvadosclient
 863     sdk/go/blockdigest
 864     sdk/go/dispatch
 865     sdk/go/health
 866     sdk/go/httpserver
 867     sdk/go/manifest
 868     sdk/go/asyncbuf
 869     sdk/go/crunchrunner
 870     sdk/go/stats
 871     services/arv-git-httpd
 872     services/crunchstat
 873     services/dispatchcloud
 874     services/health
 875     services/keep-web
 876     services/keepstore
 877     sdk/go/keepclient
 878     services/keep-balance
 879     services/keepproxy
 880     services/crunch-dispatch-local
 881     services/crunch-dispatch-slurm
 882     services/crunch-run
 883     services/ws
 884     tools/keep-block-check
 885     tools/keep-exercise
 886     tools/keep-rsync
 887     tools/sync-groups
 888 )
 889 for g in "${gostuff[@]}"
 890 do
 891     do_install "$g" go
 892 done
 893
 894 install_workbench() {
 895     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 896         && mkdir -p tmp/cache \
 897         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal \
 898         && RAILS_ENV=test RAILS_GROUPS=assets bundle exec rake npm:install
 899 }
 900 do_install apps/workbench workbench
 901
 902 unset http_proxy https_proxy no_proxy
 903
 904 test_doclinkchecker() {
 905     (
 906         set -e
 907         cd "$WORKSPACE/doc"
 908         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
 909         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
 910         # do much good!
 911         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ bundle exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
 912     )
 913 }
 914 do_test doc doclinkchecker
 915
 916 stop_services
 917
 918 test_apiserver() {
 919     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
 920     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 921         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/api]}
 922 }
 923 do_test services/api apiserver
 924
 925 # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
 926 # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
 927 if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
 928   rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 929   exit_cleanly
 930 fi
 931
 932 start_services || { stop_services; fatal "start_services"; }
 933
 934 test_ruby_sdk() {
 935     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
 936         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
 937 }
 938 do_test sdk/ruby ruby_sdk
 939
 940 test_cli() {
 941     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
 942         && mkdir -p /tmp/keep \
 943         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
 944 }
 945 do_test sdk/cli cli
 946
 947 test_login-sync() {
 948     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
 949         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
 950 }
 951 do_test services/login-sync login-sync
 952
 953 test_nodemanager_integration() {
 954     cd "$WORKSPACE/services/nodemanager" \
 955         && tests/integration_test.py ${testargs[services/nodemanager_integration]}
 956 }
 957 do_test services/nodemanager_integration nodemanager_integration
 958
 959 for p in "${pythonstuff[@]}"
 960 do
 961     dir=${p%:py3}
 962     if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
 963         if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
 964             do_test ${dir} pip
 965         fi
 966     elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
 967         if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
 968             do_test ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
 969         fi
 970     fi
 971 done
 972
 973 for g in "${gostuff[@]}"
 974 do
 975     do_test "$g" go
 976 done
 977
 978 test_workbench_units() {
 979     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 980         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:units TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 981 }
 982 do_test apps/workbench_units workbench_units
 983
 984 test_workbench_functionals() {
 985     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 986         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:functionals TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 987 }
 988 do_test apps/workbench_functionals workbench_functionals
 989
 990 test_workbench_integration() {
 991     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 992         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:integration TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 993 }
 994 do_test apps/workbench_integration workbench_integration
 995
 996
 997 test_workbench_benchmark() {
 998     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 999         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:benchmark ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
1000 }
1001 do_test apps/workbench_benchmark workbench_benchmark
1002
1003 test_workbench_profile() {
1004     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1005         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:profile ${testargs[apps/workbench_profile]}
1006 }
1007 do_test apps/workbench_profile workbench_profile
1008
1009 exit_cleanly