build/run-tests.sh

   1 #!/bin/bash
   2 # Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
   3 #
   4 # SPDX-License-Identifier: AGPL-3.0
   5
   6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin.sh
   7
   8 COLUMNS=80
   9 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
  10
  11 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
  12 $(basename $0): Install and test Arvados components.
  13
  14 Exit non-zero if any tests fail.
  15
  16 Syntax:
  17         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
  18
  19 Options:
  20
  21 --skip FOO     Do not test the FOO component.
  22 --skip sanity  Skip initial dev environment sanity checks.
  23 --skip install Do not run any install steps. Just run tests.
  24                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
  25                from a previous invocation if you use this option.
  26 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
  27 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
  28                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
  29 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
  30                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
  31                subsequent invocations.
  32 --repeat N     Repeat each install/test step until it succeeds N times.
  33 --retry        Prompt to retry if an install or test suite fails.
  34 --only-install Run specific install step
  35 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
  36 --interactive  Set up, then prompt for test/install steps to perform.
  37 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
  38 CONFIGSRC=path Dir with config.yml file containing PostgreSQL section for use by tests.
  39 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
  40                Restrict apiserver tests to the given file
  41 sdk/python_test="--test-suite tests.test_keep_locator"
  42                Restrict Python SDK tests to the given class
  43 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
  44                Restrict Workbench tests to the given file
  45 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
  46                Show all log messages, even when tests pass (also works
  47                with services/keepstore_test etc.)
  48 ARVADOS_DEBUG=1
  49                Print more debug messages
  50 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
  51                *_test, and other examples shown above.
  52
  53 Assuming "--skip install" is not given, all components are installed
  54 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
  55 test suites depend on other components being installed, and installing
  56 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
  57
  58 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
  59 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
  60
  61 More information and background:
  62
  63 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
  64
  65 Available tests:
  66
  67 apps/workbench (*)
  68 apps/workbench_units (*)
  69 apps/workbench_functionals (*)
  70 apps/workbench_integration (*)
  71 apps/workbench_benchmark
  72 apps/workbench_profile
  73 cmd/arvados-client
  74 cmd/arvados-server
  75 doc
  76 lib/cli
  77 lib/cmd
  78 lib/controller
  79 lib/controller/federation
  80 lib/controller/railsproxy
  81 lib/controller/router
  82 lib/controller/rpc
  83 lib/crunchstat
  84 lib/crunch-run
  85 lib/cloud
  86 lib/cloud/azure
  87 lib/cloud/cloudtest
  88 lib/dispatchcloud
  89 lib/dispatchcloud/container
  90 lib/dispatchcloud/scheduler
  91 lib/dispatchcloud/ssh_executor
  92 lib/dispatchcloud/worker
  93 lib/mount
  94 lib/service
  95 services/api
  96 services/arv-git-httpd
  97 services/crunchstat
  98 services/dockercleaner
  99 services/fuse
 100 services/fuse:py3
 101 services/health
 102 services/keep-web
 103 services/keepproxy
 104 services/keepstore
 105 services/keep-balance
 106 services/login-sync
 107 services/nodemanager
 108 services/nodemanager_integration
 109 services/crunch-dispatch-local
 110 services/crunch-dispatch-slurm
 111 services/ws
 112 sdk/cli
 113 sdk/pam
 114 sdk/pam:py3
 115 sdk/python
 116 sdk/python:py3
 117 sdk/ruby
 118 sdk/go/arvados
 119 sdk/go/arvadosclient
 120 sdk/go/auth
 121 sdk/go/dispatch
 122 sdk/go/keepclient
 123 sdk/go/health
 124 sdk/go/httpserver
 125 sdk/go/manifest
 126 sdk/go/blockdigest
 127 sdk/go/asyncbuf
 128 sdk/go/stats
 129 sdk/go/crunchrunner
 130 sdk/cwl
 131 sdk/R
 132 sdk/java-v2
 133 tools/sync-groups
 134 tools/crunchstat-summary
 135 tools/crunchstat-summary:py3
 136 tools/keep-exercise
 137 tools/keep-rsync
 138 tools/keep-block-check
 139
 140 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
 141     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
 142
 143 EOF
 144
 145 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
 146 # environment that could interfere with the tests.
 147 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
 148
 149 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
 150 # accident.
 151 GITDIR=
 152 GOPATH=
 153 VENVDIR=
 154 VENV3DIR=
 155 PYTHONPATH=
 156 GEMHOME=
 157 PERLINSTALLBASE=
 158 R_LIBS=
 159 export LANG=en_US.UTF-8
 160
 161 short=
 162 only_install=
 163 temp=
 164 temp_preserve=
 165
 166 clear_temp() {
 167     if [[ -z "$temp" ]]; then
 168         # we didn't even get as far as making a temp dir
 169         :
 170     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
 171         rm -rf "$temp"
 172     else
 173         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
 174     fi
 175 }
 176
 177 fatal() {
 178     clear_temp
 179     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
 180     exit 1
 181 }
 182
 183 exit_cleanly() {
 184     trap - INT
 185     if which create-plot-data-from-log.sh >/dev/null; then
 186         create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
 187     fi
 188     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 189     stop_services
 190     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 191     report_outcomes
 192     clear_temp
 193     exit ${#failures}
 194 }
 195
 196 sanity_checks() {
 197     [[ -n "${skip[sanity]}" ]] && return 0
 198     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
 199         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
 200     [[ -z "$CONFIGSRC" ]] || [[ -s "$CONFIGSRC/config.yml" ]] \
 201         || fatal "CONFIGSRC is $CONFIGSRC but '$CONFIGSRC/config.yml' is empty or not found (see: $0 --help)"
 202     echo Checking dependencies:
 203     echo "locale: ${LANG}"
 204     [[ "$(locale charmap)" = "UTF-8" ]] \
 205         || fatal "Locale '${LANG}' is broken/missing. Try: echo ${LANG} | sudo tee -a /etc/locale.gen && sudo locale-gen"
 206     echo -n 'virtualenv: '
 207     virtualenv --version \
 208         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
 209     echo -n 'ruby: '
 210     ruby -v \
 211         || fatal "No ruby. Install >=2.1.9 (using rbenv, rvm, or source)"
 212     echo -n 'go: '
 213     go version \
 214         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
 215     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 12 ]] \
 216         || fatal "Go >= 1.12 required. See http://golang.org/doc/install"
 217     echo -n 'gcc: '
 218     gcc --version | egrep ^gcc \
 219         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
 220     echo -n 'fuse.h: '
 221     find /usr/include -path '*fuse/fuse.h' | egrep --max-count=1 . \
 222         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
 223     echo -n 'gnutls.h: '
 224     find /usr/include -path '*gnutls/gnutls.h' | egrep --max-count=1 . \
 225         || fatal "No gnutls/gnutls.h. Try: apt-get install libgnutls28-dev"
 226     echo -n 'Python2 pyconfig.h: '
 227     find /usr/include -path '*/python2*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 228         || fatal "No Python2 pyconfig.h. Try: apt-get install python2.7-dev"
 229     echo -n 'Python3 pyconfig.h: '
 230     find /usr/include -path '*/python3*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 231         || fatal "No Python3 pyconfig.h. Try: apt-get install python3-dev"
 232     which netstat \
 233         || fatal "No netstat. Try: apt-get install net-tools"
 234     echo -n 'nginx: '
 235     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
 236         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
 237     echo -n 'perl: '
 238     perl -v | grep version \
 239         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
 240     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
 241         echo -n "perl $mod: "
 242         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
 243             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
 244     done
 245     echo -n 'gitolite: '
 246     which gitolite \
 247         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
 248     echo -n 'npm: '
 249     npm --version \
 250         || fatal "No npm. Try: wget -O- https://nodejs.org/dist/v6.11.2/node-v6.11.2-linux-x64.tar.xz | sudo tar -C /usr/local -xJf - && sudo ln -s ../node-v6.11.2-linux-x64/bin/{node,npm} /usr/local/bin/"
 251     echo -n 'cadaver: '
 252     cadaver --version | grep -w cadaver \
 253           || fatal "No cadaver. Try: apt-get install cadaver"
 254     echo -n 'libattr1 xattr.h: '
 255     find /usr/include -path '*/attr/xattr.h' | egrep --max-count=1 . \
 256         || fatal "No libattr1 xattr.h. Try: apt-get install libattr1-dev"
 257     echo -n 'libcurl curl.h: '
 258     find /usr/include -path '*/curl/curl.h' | egrep --max-count=1 . \
 259         || fatal "No libcurl curl.h. Try: apt-get install libcurl4-gnutls-dev"
 260     echo -n 'libpq libpq-fe.h: '
 261     find /usr/include -path '*/postgresql/libpq-fe.h' | egrep --max-count=1 . \
 262         || fatal "No libpq libpq-fe.h. Try: apt-get install libpq-dev"
 263     echo -n 'postgresql: '
 264     psql --version || fatal "No postgresql. Try: apt-get install postgresql postgresql-client-common"
 265     echo -n 'phantomjs: '
 266     phantomjs --version || fatal "No phantomjs. Try: apt-get install phantomjs"
 267     echo -n 'xvfb: '
 268     which Xvfb || fatal "No xvfb. Try: apt-get install xvfb"
 269     echo -n 'graphviz: '
 270     dot -V || fatal "No graphviz. Try: apt-get install graphviz"
 271     echo -n 'geckodriver: '
 272     geckodriver --version | grep ^geckodriver || echo "No geckodriver. Try: wget -O- https://github.com/mozilla/geckodriver/releases/download/v0.23.0/geckodriver-v0.23.0-linux64.tar.gz | sudo tar -C /usr/local/bin -xzf - geckodriver"
 273
 274     if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
 275       # R SDK stuff
 276       echo -n 'R: '
 277       which Rscript || fatal "No Rscript. Try: apt-get install r-base"
 278       echo -n 'testthat: '
 279       Rscript -e "library('testthat')" || fatal "No testthat. Try: apt-get install r-cran-testthat"
 280       # needed for roxygen2, needed for devtools, needed for R sdk
 281       pkg-config --exists libxml-2.0 || fatal "No libxml2. Try: apt-get install libxml2-dev"
 282       # needed for pkgdown, builds R SDK doc pages
 283       which pandoc || fatal "No pandoc. Try: apt-get install pandoc"
 284     fi
 285     echo 'procs with /dev/fuse open:'
 286     find /proc/*/fd -lname /dev/fuse 2>/dev/null | cut -d/ -f3 | xargs --no-run-if-empty ps -lywww
 287     echo 'grep fuse /proc/self/mountinfo:'
 288     grep fuse /proc/self/mountinfo
 289 }
 290
 291 rotate_logfile() {
 292   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 293   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
 294   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
 295     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
 296     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 297     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 298   fi
 299 }
 300
 301 declare -a failures
 302 declare -A skip
 303 declare -A only
 304 declare -A testargs
 305 skip[apps/workbench_profile]=1
 306 # nodemanager_integration tests are not reliable, see #12061.
 307 skip[services/nodemanager_integration]=1
 308
 309 while [[ -n "$1" ]]
 310 do
 311     arg="$1"; shift
 312     case "$arg" in
 313         --help)
 314             echo >&2 "$helpmessage"
 315             echo >&2
 316             exit 1
 317             ;;
 318         --skip)
 319             skip[$1]=1; shift
 320             ;;
 321         --only)
 322             only[$1]=1; skip[$1]=""; shift
 323             ;;
 324         --short)
 325             short=1
 326             ;;
 327         --interactive)
 328             interactive=1
 329             ;;
 330         --skip-install)
 331             skip[install]=1
 332             ;;
 333         --only-install)
 334             only_install="$1"; shift
 335             ;;
 336         --temp)
 337             temp="$1"; shift
 338             temp_preserve=1
 339             ;;
 340         --leave-temp)
 341             temp_preserve=1
 342             ;;
 343         --repeat)
 344             repeat=$((${1}+0)); shift
 345             ;;
 346         --retry)
 347             retry=1
 348             ;;
 349         *_test=*)
 350             suite="${arg%%_test=*}"
 351             args="${arg#*=}"
 352             testargs["$suite"]="$args"
 353             ;;
 354         *=*)
 355             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
 356             ;;
 357         *)
 358             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
 359             exit 1
 360             ;;
 361     esac
 362 done
 363
 364 # R SDK installation is very slow (~360s in a clean environment) and only
 365 # required when testing it. Skip that step if it is not needed.
 366 NEED_SDK_R=true
 367
 368 if [[ ${#only[@]} -ne 0 ]] &&
 369    [[ -z "${only['sdk/R']}" && -z "${only['doc']}" ]]; then
 370   NEED_SDK_R=false
 371 fi
 372
 373 if [[ ${skip["sdk/R"]} == 1 && ${skip["doc"]} == 1 ]]; then
 374   NEED_SDK_R=false
 375 fi
 376
 377 if [[ $NEED_SDK_R == false ]]; then
 378         echo "R SDK not needed, it will not be installed."
 379 fi
 380
 381 checkpidfile() {
 382     svc="$1"
 383     pid="$(cat "$WORKSPACE/tmp/${svc}.pid")"
 384     if [[ -z "$pid" ]] || ! kill -0 "$pid"; then
 385         tail $WORKSPACE/tmp/${1}*.log
 386         echo "${svc} pid ${pid} not running"
 387         return 1
 388     fi
 389     echo "${svc} pid ${pid} ok"
 390 }
 391
 392 checkhealth() {
 393     svc="$1"
 394     base=$("${VENVDIR}/bin/python" -c "import yaml; print list(yaml.safe_load(file('$ARVADOS_CONFIG'))['Clusters']['zzzzz']['Services']['$1']['InternalURLs'].keys())[0]")
 395     url="$base/_health/ping"
 396     if ! curl -Ss -H "Authorization: Bearer e687950a23c3a9bceec28c6223a06c79" "${url}" | tee -a /dev/stderr | grep '"OK"'; then
 397         echo "${url} failed"
 398         return 1
 399     fi
 400 }
 401
 402 checkdiscoverydoc() {
 403     dd="https://${1}/discovery/v1/apis/arvados/v1/rest"
 404     if ! (set -o pipefail; curl -fsk "$dd" | grep -q ^{ ); then
 405         echo >&2 "ERROR: could not retrieve discovery doc from RailsAPI at $dd"
 406         tail -v $WORKSPACE/tmp/railsapi.log
 407         return 1
 408     fi
 409     echo "${dd} ok"
 410 }
 411
 412 start_services() {
 413     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
 414         return 0
 415     fi
 416     . "$VENVDIR/bin/activate"
 417     echo 'Starting API, controller, keepproxy, keep-web, arv-git-httpd, ws, and nginx ssl proxy...'
 418     if [[ ! -d "$WORKSPACE/services/api/log" ]]; then
 419         mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/log"
 420     fi
 421     # Remove empty api.pid file if it exists
 422     if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/api.pid" && ! -s "$WORKSPACE/tmp/api.pid" ]]; then
 423         rm -f "$WORKSPACE/tmp/api.pid"
 424     fi
 425     all_services_stopped=
 426     fail=1
 427
 428     cd "$WORKSPACE" \
 429         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
 430         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
 431         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
 432         && checkpidfile api \
 433         && checkdiscoverydoc $ARVADOS_API_HOST \
 434         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx) \
 435         && checkpidfile nginx \
 436         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_controller \
 437         && checkpidfile controller \
 438         && checkhealth Controller \
 439         && checkdiscoverydoc $ARVADOS_API_HOST \
 440         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
 441         && checkpidfile keepproxy \
 442         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
 443         && checkpidfile keep-web \
 444         && checkhealth WebDAV \
 445         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
 446         && checkpidfile arv-git-httpd \
 447         && checkhealth GitHTTP \
 448         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 449         && checkpidfile ws \
 450         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1 \
 451         && (env | egrep ^ARVADOS) \
 452         && fail=0
 453     deactivate
 454     if [[ $fail != 0 ]]; then
 455         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
 456     fi
 457     return $fail
 458 }
 459
 460 stop_services() {
 461     if [[ -n "$all_services_stopped" ]]; then
 462         return
 463     fi
 464     unset ARVADOS_TEST_API_HOST ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
 465     . "$VENVDIR/bin/activate" || return
 466     cd "$WORKSPACE" \
 467         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 468         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
 469         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 470         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
 471         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy \
 472         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_controller \
 473         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop \
 474         && all_services_stopped=1
 475     deactivate
 476     unset ARVADOS_CONFIG
 477 }
 478
 479 interrupt() {
 480     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
 481     exit_cleanly
 482 }
 483 trap interrupt INT
 484
 485 setup_ruby_environment() {
 486     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 487         source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
 488         using_rvm=true
 489     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 490         source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
 491         using_rvm=true
 492     else
 493         using_rvm=false
 494     fi
 495
 496     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 497         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
 498         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
 499         # the environment to the "current gemset", which would lose
 500         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
 501         # programs (for example, the Workbench test suite could not
 502         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
 503         # rvm gemset and use it for everything.
 504
 505         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
 506             || fatal 'rvm check'
 507
 508         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
 509         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
 510         # complaint about not being in first place already.
 511         rvm use @default 2>/dev/null
 512
 513         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
 514         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
 515         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
 516         # ruby to the caller.
 517         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
 518         rvm use "@${gemset}" --create \
 519             || fatal 'rvm gemset setup'
 520
 521         rvm env
 522         (bundle version | grep -q 2.0.2) || gem install bundler -v 2.0.2
 523         bundle="$(which bundle)"
 524         echo "$bundle"
 525         "$bundle" version | grep 2.0.2 || fatal 'install bundler'
 526     else
 527         # When our "bundle install"s need to install new gems to
 528         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
 529         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
 530         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
 531         # should be installed, and we should leave it alone.)
 532
 533         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
 534             user_gempath="$(gem env gempath)"
 535             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
 536         fi
 537         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
 538
 539         # When we build and install our own gems, we install them in our
 540         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
 541         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
 542         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
 543
 544         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
 545         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
 546         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home"
 547
 548         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
 549         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
 550         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
 551         bundle="$(gem env gempath | cut -f1 -d:)/bin/bundle"
 552         (
 553             export HOME=$GEMHOME
 554             bundlers="$(gem list --details bundler)"
 555             for v in 1.11 1.17.3 2.0.2; do
 556                 if ! echo "$bundlers" | fgrep -q "($v)"; then
 557                     gem install --user bundler:1.11 bundler:1.17.3 bundler:2.0.2
 558                     break
 559                 fi
 560             done
 561             "$bundle" version | tee /dev/stderr | grep -q 'version 2'
 562         ) || fatal 'install bundler'
 563     fi
 564 }
 565
 566 with_test_gemset() {
 567     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 568         "$@"
 569     else
 570         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
 571     fi
 572 }
 573
 574 gem_uninstall_if_exists() {
 575     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
 576         gem uninstall --force --all --executables "$1"
 577     fi
 578 }
 579
 580 setup_virtualenv() {
 581     local venvdest="$1"; shift
 582     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
 583         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
 584     elif [[ -n "$short" ]]; then
 585         return
 586     fi
 587     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
 588         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
 589         "$venvdest/bin/pip" install --no-cache-dir 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
 590     else
 591         "$venvdest/bin/pip" install --no-cache-dir 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
 592     fi
 593 }
 594
 595 initialize() {
 596     # If dependencies like ruby, go, etc. are installed in
 597     # /var/lib/arvados -- presumably by "arvados-server install" --
 598     # then we want to use those versions, instead of whatever happens
 599     # to be installed in /usr.
 600     PATH="/var/lib/arvados/bin:${PATH}"
 601     sanity_checks
 602
 603     echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
 604
 605     # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
 606     cd "$WORKSPACE"
 607     find -name '*.pyc' -delete
 608
 609     if [[ -z "$temp" ]]; then
 610         temp="$(mktemp -d)"
 611     fi
 612
 613     # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
 614     for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE R_LIBS
 615     do
 616         if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
 617             eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
 618         fi
 619         if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
 620             mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
 621         fi
 622     done
 623
 624     rm -vf "${WORKSPACE}/tmp/*.log"
 625
 626     export PERLINSTALLBASE
 627     export PERL5LIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5${PERL5LIB:+:$PERL5LIB}"
 628
 629     export R_LIBS
 630
 631     export GOPATH
 632     # Make sure our compiled binaries under test override anything
 633     # else that might be in the environment.
 634     export PATH=$GOPATH/bin:$PATH
 635
 636     # Jenkins config requires that glob tmp/*.log match something. Ensure
 637     # that happens even if we don't end up running services that set up
 638     # logging.
 639     mkdir -p "${WORKSPACE}/tmp/" || fatal "could not mkdir ${WORKSPACE}/tmp"
 640     touch "${WORKSPACE}/tmp/controller.log" || fatal "could not touch ${WORKSPACE}/tmp/controller.log"
 641
 642     unset http_proxy https_proxy no_proxy
 643
 644     # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
 645     # whine a lot.
 646     setup_ruby_environment
 647
 648     echo "PATH is $PATH"
 649 }
 650
 651 install_env() {
 652     go mod download || fatal "Go deps failed"
 653     which goimports >/dev/null || go get golang.org/x/tools/cmd/goimports || fatal "Go setup failed"
 654
 655     setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
 656     . "$VENVDIR/bin/activate"
 657
 658     # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
 659     (
 660         set -e
 661         "${VENVDIR}/bin/pip" install PyYAML
 662         "${VENV3DIR}/bin/pip" install PyYAML
 663         cd "$WORKSPACE/sdk/python"
 664         python setup.py install
 665     ) || fatal "installing PyYAML and sdk/python failed"
 666
 667     # Preinstall libcloud if using a fork; otherwise nodemanager "pip
 668     # install" won't pick it up by default.
 669     if [[ -n "$LIBCLOUD_PIN_SRC" ]]; then
 670         pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
 671             || pip install --pre --ignore-installed --no-cache-dir "$LIBCLOUD_PIN_SRC" >/dev/null \
 672             || fatal "pip install apache-libcloud failed"
 673     fi
 674
 675     # Deactivate Python 2 virtualenv
 676     deactivate
 677
 678     # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
 679     # Otherwise, skip dependent tests.
 680     PYTHON3=$(which python3)
 681     if [[ ${?} = 0 ]]; then
 682         setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
 683     else
 684         PYTHON3=
 685         cat >&2 <<EOF
 686
 687 Warning: python3 could not be found. Python 3 tests will be skipped.
 688
 689 EOF
 690     fi
 691 }
 692
 693 retry() {
 694     remain="${repeat}"
 695     while :
 696     do
 697         if ${@}; then
 698             if [[ "$remain" -gt 1 ]]; then
 699                 remain=$((${remain}-1))
 700                 title "(repeating ${remain} more times)"
 701             else
 702                 break
 703             fi
 704         elif [[ "$retry" == 1 ]]; then
 705             read -p 'Try again? [Y/n] ' x
 706             if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
 707             then
 708                 break
 709             fi
 710         else
 711             break
 712         fi
 713     done
 714 }
 715
 716 do_test() {
 717     case "${1}" in
 718         apps/workbench_units | apps/workbench_functionals | apps/workbench_integration)
 719             suite=apps/workbench
 720             ;;
 721         services/nodemanager | services/nodemanager_integration)
 722             suite=services/nodemanager_suite
 723             ;;
 724         *)
 725             suite="${1}"
 726             ;;
 727     esac
 728     if [[ -n "${skip[$suite]}" || \
 729               -n "${skip[$1]}" || \
 730               (${#only[@]} -ne 0 && ${only[$suite]} -eq 0 && ${only[$1]} -eq 0) ]]; then
 731         return 0
 732     fi
 733     case "${1}" in
 734         services/api)
 735             stop_services
 736             check_arvados_config "$1"
 737             ;;
 738         gofmt | doc | lib/cli | lib/cloud/azure | lib/cloud/ec2 | lib/cloud/cloudtest | lib/cmd | lib/dispatchcloud/ssh_executor | lib/dispatchcloud/worker)
 739             check_arvados_config "$1"
 740             # don't care whether services are running
 741             ;;
 742         *)
 743             check_arvados_config "$1"
 744             if ! start_services; then
 745                 checkexit 1 "$1 tests"
 746                 title "test $1 -- failed to start services"
 747                 return 1
 748             fi
 749             ;;
 750     esac
 751     retry do_test_once ${@}
 752 }
 753
 754 go_ldflags() {
 755     version=${ARVADOS_VERSION:-$(git log -n1 --format=%H)-dev}
 756     echo "-X git.arvados.org/arvados.git/lib/cmd.version=${version} -X main.version=${version}"
 757 }
 758
 759 do_test_once() {
 760     unset result
 761
 762     title "test $1"
 763     timer_reset
 764
 765     result=
 766     if which deactivate >/dev/null; then deactivate; fi
 767     if ! . "$VENVDIR/bin/activate"
 768     then
 769         result=1
 770     elif [[ "$2" == "go" ]]
 771     then
 772         covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
 773         coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
 774         # We do "go install" here to catch compilation errors
 775         # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
 776         # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
 777         # compilation errors.
 778         go install -ldflags "$(go_ldflags)" "$WORKSPACE/$1" && \
 779             cd "$WORKSPACE/$1" && \
 780             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
 781         then
 782             # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
 783             # does:
 784             go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
 785         else
 786             # The above form gets verbose even when testargs is
 787             # empty, so use this form in such cases:
 788             go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.arvados.org/arvados.git/$1"
 789         fi
 790         result=${result:-$?}
 791         if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
 792         then
 793             go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
 794             rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
 795         fi
 796         [[ $result = 0 ]] && gofmt -e -d *.go
 797     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 798     then
 799         tries=0
 800         cd "$WORKSPACE/$1" && while :
 801         do
 802             tries=$((${tries}+1))
 803             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 804             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 805             if [[ -e "${3}activate" ]]; then
 806                 . "${3}activate"
 807             fi
 808             python setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
 809             result=$?
 810             if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
 811             then
 812                 printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
 813                 continue
 814             else
 815                 break
 816             fi
 817         done
 818     elif [[ "$2" != "" ]]
 819     then
 820         "test_$2"
 821     else
 822         "test_$1"
 823     fi
 824     result=${result:-$?}
 825     checkexit $result "$1 tests"
 826     title "test $1 -- `timer`"
 827     return $result
 828 }
 829
 830 check_arvados_config() {
 831     if [[ "$1" = "env" ]] ; then
 832         return
 833     fi
 834     if [[ -z "$ARVADOS_CONFIG" ]] ; then
 835         # Create config file.  The run_test_server script requires PyYAML,
 836         # so virtualenv needs to be active.  Downstream steps like
 837         # workbench install which require a valid config.yml.
 838         if [[ ! -s "$VENVDIR/bin/activate" ]] ; then
 839             install_env
 840         fi
 841         . "$VENVDIR/bin/activate"
 842         cd "$WORKSPACE"
 843         eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py setup_config)
 844         deactivate
 845     fi
 846 }
 847
 848 do_install() {
 849     if [[ -n "${skip[install]}" || ( -n "${only_install}" && "${only_install}" != "${1}" && "${only_install}" != "${2}" ) ]]; then
 850         return 0
 851     fi
 852     check_arvados_config "$1"
 853     retry do_install_once ${@}
 854 }
 855
 856 do_install_once() {
 857     title "install $1"
 858     timer_reset
 859
 860     result=
 861     if which deactivate >/dev/null; then deactivate; fi
 862     if [[ "$1" != "env" ]] && ! . "$VENVDIR/bin/activate"; then
 863         result=1
 864     elif [[ "$2" == "go" ]]
 865     then
 866         go install -ldflags "$(go_ldflags)" "$WORKSPACE/$1"
 867     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 868     then
 869         # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 870         # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 871
 872         # Need to change to a different directory after creating
 873         # the source dist package to avoid a pip bug.
 874         # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
 875
 876         # Also need to install twice, because if it believes the package is
 877         # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
 878         # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
 879         # install" ensures that we've actually installed the local package
 880         # we just built.
 881         cd "$WORKSPACE/$1" \
 882             && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
 883             && cd "$WORKSPACE" \
 884             && "${3}pip" install --no-cache-dir "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
 885             && "${3}pip" install --no-cache-dir --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
 886     elif [[ "$2" != "" ]]
 887     then
 888         "install_$2"
 889     else
 890         "install_$1"
 891     fi
 892     result=${result:-$?}
 893     checkexit $result "$1 install"
 894     title "install $1 -- `timer`"
 895     return $result
 896 }
 897
 898 bundle_install_trylocal() {
 899     (
 900         set -e
 901         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
 902         if ! "$bundle" install --local --no-deployment; then
 903             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
 904             "$bundle" install --no-deployment
 905         fi
 906         "$bundle" package
 907     )
 908 }
 909
 910 install_doc() {
 911     cd "$WORKSPACE/doc" \
 912         && bundle_install_trylocal \
 913         && rm -rf .site
 914 }
 915
 916 install_gem() {
 917     gemname=$1
 918     srcpath=$2
 919     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
 920         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
 921         && bundle_install_trylocal \
 922         && gem build "$gemname.gemspec" \
 923         && with_test_gemset gem install --no-document $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
 924 }
 925
 926 install_sdk/ruby() {
 927     install_gem arvados sdk/ruby
 928 }
 929
 930 install_sdk/R() {
 931   if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
 932     cd "$WORKSPACE/sdk/R" \
 933        && Rscript --vanilla install_deps.R
 934   fi
 935 }
 936
 937 install_sdk/perl() {
 938     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
 939         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
 940         && make install INSTALLDIRS=perl
 941 }
 942
 943 install_sdk/cli() {
 944     install_gem arvados-cli sdk/cli
 945 }
 946
 947 install_services/login-sync() {
 948     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
 949 }
 950
 951 install_services/api() {
 952     stop_services
 953     check_arvados_config "services/api"
 954     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 955         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal \
 956             || return 1
 957
 958     rm -f config/environments/test.rb
 959     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
 960
 961     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
 962     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
 963     # is a postgresql superuser.
 964     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 965         && test_database=$("${VENVDIR}/bin/python" -c "import yaml; print yaml.safe_load(file('$ARVADOS_CONFIG'))['Clusters']['zzzzz']['PostgreSQL']['Connection']['dbname']") \
 966         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.pid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
 967
 968     mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/tmp/pids"
 969
 970     cert="$WORKSPACE/services/api/tmp/self-signed"
 971     if [[ ! -e "$cert.pem" || "$(date -r "$cert.pem" +%s)" -lt 1512659226 ]]; then
 972         (
 973             dir="$WORKSPACE/services/api/tmp"
 974             set -ex
 975             openssl req -newkey rsa:2048 -nodes -subj '/C=US/ST=State/L=City/CN=localhost' -out "$cert.csr" -keyout "$cert.key" </dev/null
 976             openssl x509 -req -in "$cert.csr" -signkey "$cert.key" -out "$cert.pem" -days 3650 -extfile <(printf 'subjectAltName=DNS:localhost,DNS:::1,DNS:0.0.0.0,DNS:127.0.0.1,IP:::1,IP:0.0.0.0,IP:127.0.0.1')
 977         ) || return 1
 978     fi
 979
 980     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 981         && rm -rf tmp/git \
 982         && mkdir -p tmp/git \
 983         && cd tmp/git \
 984         && tar xf ../../test/test.git.tar \
 985         && mkdir -p internal.git \
 986         && git --git-dir internal.git init \
 987             || return 1
 988
 989     (
 990         set -e
 991         cd "$WORKSPACE/services/api"
 992         export RAILS_ENV=test
 993         if "$bundle" exec rails db:environment:set ; then
 994             "$bundle" exec rake db:drop
 995         fi
 996         "$bundle" exec rake db:setup
 997         "$bundle" exec rake db:fixtures:load
 998     ) || return 1
 999 }
1000
1001 declare -a pythonstuff
1002 pythonstuff=(
1003     sdk/pam
1004     sdk/python
1005     sdk/python:py3
1006     sdk/cwl
1007     sdk/cwl:py3
1008     services/dockercleaner:py3
1009     services/fuse
1010     services/fuse:py3
1011     services/nodemanager
1012     tools/crunchstat-summary
1013     tools/crunchstat-summary:py3
1014 )
1015
1016 declare -a gostuff
1017 gostuff=($(cd "$WORKSPACE" && git grep -lw func | grep \\.go | sed -e 's/\/[^\/]*$//' | sort -u))
1018
1019 install_apps/workbench() {
1020     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1021         && mkdir -p tmp/cache \
1022         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal \
1023         && RAILS_ENV=test RAILS_GROUPS=assets "$bundle" exec rake npm:install
1024 }
1025
1026 test_doc() {
1027     (
1028         set -e
1029         cd "$WORKSPACE/doc"
1030         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
1031         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
1032         # do much good!
1033         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ "$bundle" exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
1034     )
1035 }
1036
1037 test_gofmt() {
1038     cd "$WORKSPACE" || return 1
1039     dirs=$(ls -d */ | egrep -v 'vendor|tmp')
1040     [[ -z "$(gofmt -e -d $dirs | tee -a /dev/stderr)" ]]
1041 }
1042
1043 test_services/api() {
1044     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
1045     cd "$WORKSPACE/services/api" \
1046         && eval env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} "$bundle" exec rake test TESTOPTS=\'-v -d\' ${testargs[services/api]}
1047 }
1048
1049 test_sdk/ruby() {
1050     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
1051         && "$bundle" exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
1052 }
1053
1054 test_sdk/R() {
1055   if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
1056     cd "$WORKSPACE/sdk/R" \
1057         && Rscript --vanilla run_test.R
1058   fi
1059 }
1060
1061 test_sdk/cli() {
1062     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
1063         && mkdir -p /tmp/keep \
1064         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep "$bundle" exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
1065 }
1066
1067 test_sdk/java-v2() {
1068     cd "$WORKSPACE/sdk/java-v2" && gradle test ${testargs[sdk/java-v2]}
1069 }
1070
1071 test_services/login-sync() {
1072     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
1073         && "$bundle" exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
1074 }
1075
1076 test_services/nodemanager_integration() {
1077     cd "$WORKSPACE/services/nodemanager" \
1078         && tests/integration_test.py ${testargs[services/nodemanager_integration]}
1079 }
1080
1081 test_apps/workbench_units() {
1082     local TASK="test:units"
1083     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1084         && eval env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} "$bundle" exec rake ${TASK} TESTOPTS=\'-v -d\' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_units]}
1085 }
1086
1087 test_apps/workbench_functionals() {
1088     local TASK="test:functionals"
1089     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1090         && eval env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} "$bundle" exec rake ${TASK} TESTOPTS=\'-v -d\' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_functionals]}
1091 }
1092
1093 test_apps/workbench_integration() {
1094     local TASK="test:integration"
1095     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1096         && eval env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} "$bundle" exec rake ${TASK} TESTOPTS=\'-v -d\' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_integration]}
1097 }
1098
1099 test_apps/workbench_benchmark() {
1100     local TASK="test:benchmark"
1101     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1102         && eval env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} "$bundle" exec rake ${TASK} ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
1103 }
1104
1105 test_apps/workbench_profile() {
1106     local TASK="test:profile"
1107     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1108         && eval env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} "$bundle" exec rake ${TASK} ${testargs[apps/workbench_profile]}
1109 }
1110
1111 install_deps() {
1112     # Install parts needed by test suites
1113     do_install env
1114     do_install cmd/arvados-server go
1115     do_install sdk/cli
1116     do_install sdk/perl
1117     do_install sdk/python pip
1118     do_install sdk/python pip "${VENV3DIR}/bin/"
1119     do_install sdk/ruby
1120     do_install services/api
1121     do_install services/arv-git-httpd go
1122     do_install services/keepproxy go
1123     do_install services/keepstore go
1124     do_install services/keep-web go
1125     do_install services/ws go
1126 }
1127
1128 install_all() {
1129     do_install env
1130     do_install doc
1131     do_install sdk/ruby
1132     do_install sdk/R
1133     do_install sdk/perl
1134     do_install sdk/cli
1135     do_install services/login-sync
1136     for p in "${pythonstuff[@]}"
1137     do
1138         dir=${p%:py3}
1139         if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
1140             if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
1141                 do_install ${dir} pip
1142             fi
1143         elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
1144             if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
1145                 do_install ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
1146             fi
1147         fi
1148     done
1149     for g in "${gostuff[@]}"
1150     do
1151         do_install "$g" go
1152     done
1153     do_install services/api
1154     do_install apps/workbench
1155 }
1156
1157 test_all() {
1158     stop_services
1159     do_test services/api
1160
1161     # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
1162     # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
1163     if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
1164         rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
1165         exit_cleanly
1166     fi
1167
1168     do_test gofmt
1169     do_test doc
1170     do_test sdk/ruby
1171     do_test sdk/R
1172     do_test sdk/cli
1173     do_test services/login-sync
1174     do_test sdk/java-v2
1175     do_test services/nodemanager_integration
1176     for p in "${pythonstuff[@]}"
1177     do
1178         dir=${p%:py3}
1179         if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
1180             if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
1181                 do_test ${dir} pip
1182             fi
1183         elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
1184             if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
1185                 do_test ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
1186             fi
1187         fi
1188     done
1189
1190     for g in "${gostuff[@]}"
1191     do
1192         do_test "$g" go
1193     done
1194     do_test apps/workbench_units
1195     do_test apps/workbench_functionals
1196     do_test apps/workbench_integration
1197     do_test apps/workbench_benchmark
1198     do_test apps/workbench_profile
1199 }
1200
1201 help_interactive() {
1202     echo "== Interactive commands:"
1203     echo "TARGET                 (short for 'test DIR')"
1204     echo "test TARGET"
1205     echo "test TARGET:py3        (test with python3)"
1206     echo "test TARGET -check.vv  (pass arguments to test)"
1207     echo "install TARGET"
1208     echo "install env            (go/python libs)"
1209     echo "install deps           (go/python libs + arvados components needed for integration tests)"
1210     echo "reset                  (...services used by integration tests)"
1211     echo "exit"
1212     echo "== Test targets:"
1213     echo "${!testfuncargs[@]}" | tr ' ' '\n' | sort | column
1214 }
1215
1216 initialize
1217
1218 declare -A testfuncargs=()
1219 for g in "${gostuff[@]}"; do
1220     testfuncargs[$g]="$g go"
1221 done
1222 for p in "${pythonstuff[@]}"; do
1223     dir=${p%:py3}
1224     testfuncargs[$dir]="$dir pip $VENVDIR/bin/"
1225     testfuncargs[$dir:py3]="$dir pip $VENV3DIR/bin/"
1226 done
1227
1228 testfuncargs["sdk/cli"]="sdk/cli"
1229 testfuncargs["sdk/R"]="sdk/R"
1230 testfuncargs["sdk/java-v2"]="sdk/java-v2"
1231 testfuncargs["apps/workbench_units"]="apps/workbench_units"
1232 testfuncargs["apps/workbench_functionals"]="apps/workbench_functionals"
1233 testfuncargs["apps/workbench_integration"]="apps/workbench_integration"
1234 testfuncargs["apps/workbench_benchmark"]="apps/workbench_benchmark"
1235 testfuncargs["apps/workbench_profile"]="apps/workbench_profile"
1236
1237 if [[ -z ${interactive} ]]; then
1238     install_all
1239     test_all
1240 else
1241     skip=()
1242     only=()
1243     only_install=()
1244     if [[ -e "$VENVDIR/bin/activate" ]]; then stop_services; fi
1245     setnextcmd() {
1246         if [[ "$TERM" = dumb ]]; then
1247             # assume emacs, or something, is offering a history buffer
1248             # and pre-populating the command will only cause trouble
1249             nextcmd=
1250         elif [[ ! -e "$VENVDIR/bin/activate" ]]; then
1251             nextcmd="install deps"
1252         else
1253             nextcmd=""
1254         fi
1255     }
1256     echo
1257     help_interactive
1258     nextcmd="install deps"
1259     setnextcmd
1260     HISTFILE="$WORKSPACE/tmp/.history"
1261     history -r
1262     while read -p 'What next? ' -e -i "$nextcmd" nextcmd; do
1263         history -s "$nextcmd"
1264         history -w
1265         read verb target opts <<<"${nextcmd}"
1266         target="${target%/}"
1267         target="${target/\/:/:}"
1268         case "${verb}" in
1269             "exit" | "quit")
1270                 exit_cleanly
1271                 ;;
1272             "reset")
1273                 stop_services
1274                 ;;
1275             "test" | "install")
1276                 case "$target" in
1277                     "")
1278                         help_interactive
1279                         ;;
1280                     all | deps)
1281                         ${verb}_${target}
1282                         ;;
1283                     *)
1284                         testargs["$target"]="${opts}"
1285                         tt="${testfuncargs[${target}]}"
1286                         tt="${tt:-$target}"
1287                         do_$verb $tt
1288                         ;;
1289                 esac
1290                 ;;
1291             "" | "help" | *)
1292                 help_interactive
1293                 ;;
1294         esac
1295         if [[ ${#successes[@]} -gt 0 || ${#failures[@]} -gt 0 ]]; then
1296             report_outcomes
1297             successes=()
1298             failures=()
1299         fi
1300         cd "$WORKSPACE"
1301         setnextcmd
1302     done
1303     echo
1304 fi
1305 exit_cleanly