build/run-tests.sh

   1 #!/bin/bash
   2
   3 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin
   4
   5 COLUMNS=80
   6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
   7
   8 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
   9 $(basename $0): Install and test Arvados components.
  10
  11 Exit non-zero if any tests fail.
  12
  13 Syntax:
  14         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
  15
  16 Options:
  17
  18 --skip FOO     Do not test the FOO component.
  19 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
  20 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
  21                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
  22 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
  23                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
  24                subsequent invocations.
  25 --skip-install Do not run any install steps. Just run tests.
  26                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
  27                from a previous invocation if you use this option.
  28 --only-install Run specific install step
  29 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
  30 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
  31 CONFIGSRC=path Dir with api server config files to copy into source tree.
  32                (If none given, leave config files alone in source tree.)
  33 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
  34                Restrict apiserver tests to the given file
  35 sdk/python_test="--test-suite test.test_keep_locator"
  36                Restrict Python SDK tests to the given class
  37 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
  38                Restrict Workbench tests to the given file
  39 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
  40                Show all log messages, even when tests pass (also works
  41                with services/keepstore_test etc.)
  42 ARVADOS_DEBUG=1
  43                Print more debug messages
  44 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
  45                *_test, and other examples shown above.
  46
  47 Assuming --skip-install is not given, all components are installed
  48 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
  49 test suites depend on other components being installed, and installing
  50 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
  51
  52 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
  53 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
  54
  55 More information and background:
  56
  57 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
  58
  59 Available tests:
  60
  61 apps/workbench (*)
  62 apps/workbench_units (*)
  63 apps/workbench_functionals (*)
  64 apps/workbench_integration (*)
  65 apps/workbench_benchmark
  66 apps/workbench_profile
  67 doc
  68 services/api
  69 services/arv-git-httpd
  70 services/crunchstat
  71 services/dockercleaner
  72 services/fuse
  73 services/keep-web
  74 services/keepproxy
  75 services/keepstore
  76 services/keep-balance
  77 services/login-sync
  78 services/nodemanager
  79 services/crunch-run
  80 services/crunch-dispatch-local
  81 services/crunch-dispatch-slurm
  82 services/ws
  83 sdk/cli
  84 sdk/pam
  85 sdk/python
  86 sdk/ruby
  87 sdk/go/arvados
  88 sdk/go/arvadosclient
  89 sdk/go/keepclient
  90 sdk/go/httpserver
  91 sdk/go/manifest
  92 sdk/go/blockdigest
  93 sdk/go/streamer
  94 sdk/go/stats
  95 sdk/go/crunchrunner
  96 sdk/cwl
  97 tools/crunchstat-summary
  98 tools/keep-exercise
  99 tools/keep-rsync
 100 tools/keep-block-check
 101
 102 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
 103     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
 104
 105 EOF
 106
 107 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
 108 # environment that could interfere with the tests.
 109 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
 110
 111 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
 112 # accident.
 113 GITDIR=
 114 GOPATH=
 115 VENVDIR=
 116 VENV3DIR=
 117 PYTHONPATH=
 118 GEMHOME=
 119 PERLINSTALLBASE=
 120
 121 short=
 122 skip_install=
 123 temp=
 124 temp_preserve=
 125
 126 clear_temp() {
 127     if [[ -z "$temp" ]]; then
 128         # we didn't even get as far as making a temp dir
 129         :
 130     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
 131         rm -rf "$temp"
 132     else
 133         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
 134     fi
 135 }
 136
 137 fatal() {
 138     clear_temp
 139     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
 140     exit 1
 141 }
 142
 143 exit_cleanly() {
 144     trap - INT
 145     create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
 146     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 147     stop_services
 148     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 149     report_outcomes
 150     clear_temp
 151     exit ${#failures}
 152 }
 153
 154 sanity_checks() {
 155     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
 156         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
 157     echo Checking dependencies:
 158     echo -n 'virtualenv: '
 159     virtualenv --version \
 160         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
 161     echo -n 'go: '
 162     go version \
 163         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
 164     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 7 ]] \
 165         || fatal "Go >= 1.7 required. See http://golang.org/doc/install"
 166     echo -n 'gcc: '
 167     gcc --version | egrep ^gcc \
 168         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
 169     echo -n 'fuse.h: '
 170     find /usr/include -wholename '*fuse/fuse.h' \
 171         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
 172     echo -n 'pyconfig.h: '
 173     find /usr/include -name pyconfig.h | egrep --max-count=1 . \
 174         || fatal "No pyconfig.h. Try: apt-get install python-dev"
 175     echo -n 'nginx: '
 176     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
 177         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
 178     echo -n 'perl: '
 179     perl -v | grep version \
 180         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
 181     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
 182         echo -n "perl $mod: "
 183         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
 184             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
 185     done
 186     echo -n 'gitolite: '
 187     which gitolite \
 188         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
 189 }
 190
 191 rotate_logfile() {
 192   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 193   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
 194   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
 195     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
 196     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 197     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 198   fi
 199 }
 200
 201 declare -a failures
 202 declare -A skip
 203 declare -A testargs
 204 skip[apps/workbench_profile]=1
 205
 206 while [[ -n "$1" ]]
 207 do
 208     arg="$1"; shift
 209     case "$arg" in
 210         --help)
 211             echo >&2 "$helpmessage"
 212             echo >&2
 213             exit 1
 214             ;;
 215         --skip)
 216             skipwhat="$1"; shift
 217             if [[ "$skipwhat" == "apps/workbench" ]]; then
 218               skip["apps/workbench_units"]=1
 219               skip["apps/workbench_functionals"]=1
 220               skip["apps/workbench_integration"]=1
 221             else
 222               skip[$skipwhat]=1
 223             fi
 224             ;;
 225         --only)
 226             only="$1"; skip[$1]=""; shift
 227             ;;
 228         --short)
 229             short=1
 230             ;;
 231         --skip-install)
 232             skip_install=1
 233             ;;
 234         --only-install)
 235             skip_install=1
 236             only_install="$1"; shift
 237             ;;
 238         --temp)
 239             temp="$1"; shift
 240             temp_preserve=1
 241             ;;
 242         --leave-temp)
 243             temp_preserve=1
 244             ;;
 245         --retry)
 246             retry=1
 247             ;;
 248         *_test=*)
 249             suite="${arg%%_test=*}"
 250             args="${arg#*=}"
 251             testargs["$suite"]="$args"
 252             ;;
 253         *=*)
 254             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
 255             ;;
 256         *)
 257             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
 258             exit 1
 259             ;;
 260     esac
 261 done
 262
 263 start_api() {
 264     echo 'Starting API server...'
 265     cd "$WORKSPACE" \
 266         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
 267         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
 268         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
 269         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 270         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
 271         && (env | egrep ^ARVADOS)
 272 }
 273
 274 start_nginx_proxy_services() {
 275     echo 'Starting keepproxy, keep-web, ws, arv-git-httpd, and nginx ssl proxy...'
 276     cd "$WORKSPACE" \
 277         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
 278         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
 279         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
 280         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 281         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
 282         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1
 283 }
 284
 285 stop_services() {
 286     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES" ]]; then
 287         unset ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
 288         cd "$WORKSPACE" \
 289             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 290             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
 291             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 292             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
 293             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy
 294     fi
 295     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
 296         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
 297         cd "$WORKSPACE" \
 298             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 299             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 300             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop
 301     fi
 302 }
 303
 304 interrupt() {
 305     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
 306     exit_cleanly
 307 }
 308 trap interrupt INT
 309
 310 sanity_checks
 311
 312 echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
 313
 314 if [[ -z "$CONFIGSRC" ]] && [[ -d "$HOME/arvados-api-server" ]]; then
 315     # Jenkins expects us to use this by default.
 316     CONFIGSRC="$HOME/arvados-api-server"
 317 fi
 318
 319 # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
 320 cd "$WORKSPACE"
 321 find -name '*.pyc' -delete
 322
 323 if [[ -z "$temp" ]]; then
 324     temp="$(mktemp -d)"
 325 fi
 326
 327 # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
 328 for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE
 329 do
 330     if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
 331         eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
 332     fi
 333     if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
 334         mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
 335     fi
 336 done
 337
 338 setup_ruby_environment() {
 339     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 340       source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
 341       using_rvm=true
 342     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 343       source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
 344       using_rvm=true
 345     else
 346       using_rvm=false
 347     fi
 348
 349     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 350         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
 351         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
 352         # the environment to the "current gemset", which would lose
 353         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
 354         # programs (for example, the Workbench test suite could not
 355         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
 356         # rvm gemset and use it for everything.
 357
 358         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
 359             || fatal 'rvm check'
 360
 361         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
 362         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
 363         # complaint about not being in first place already.
 364         rvm use @default 2>/dev/null
 365
 366         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
 367         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
 368         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
 369         # ruby to the caller.
 370         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
 371         rvm use "@${gemset}" --create \
 372             || fatal 'rvm gemset setup'
 373
 374         rvm env
 375     else
 376         # When our "bundle install"s need to install new gems to
 377         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
 378         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
 379         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
 380         # should be installed, and we should leave it alone.)
 381
 382         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
 383             user_gempath="$(gem env gempath)"
 384             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
 385         fi
 386         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
 387
 388         # When we build and install our own gems, we install them in our
 389         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
 390         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
 391         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
 392
 393         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
 394         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
 395         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home:$(gem env gempath)"
 396
 397         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
 398         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
 399         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
 400     fi
 401 }
 402
 403 with_test_gemset() {
 404     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 405         "$@"
 406     else
 407         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
 408     fi
 409 }
 410
 411 gem_uninstall_if_exists() {
 412     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
 413         gem uninstall --force --all --executables "$1"
 414     fi
 415 }
 416
 417 setup_virtualenv() {
 418     local venvdest="$1"; shift
 419     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
 420         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
 421     fi
 422     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
 423         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
 424         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
 425     else
 426         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
 427     fi
 428     # ubuntu1404 can't seem to install mock via tests_require, but it can do this.
 429     "$venvdest/bin/pip" install 'mock>=1.0' 'pbr<1.7.0'
 430 }
 431
 432 export PERLINSTALLBASE
 433 export PERLLIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5:${PERLLIB:+$PERLLIB}"
 434
 435 export GOPATH
 436 mkdir -p "$GOPATH/src/git.curoverse.com"
 437 ln -sfn "$WORKSPACE" "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" \
 438     || fatal "symlink failed"
 439
 440 setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
 441 . "$VENVDIR/bin/activate"
 442
 443 # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
 444 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^PyYAML= \
 445     || pip install PyYAML >/dev/null \
 446     || fatal "pip install PyYAML failed"
 447
 448 # Preinstall forked version of libcloud, because nodemanager "pip install"
 449 # won't pick it up by default.
 450 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
 451     || pip install --pre --ignore-installed https://github.com/curoverse/libcloud/archive/apache-libcloud-$LIBCLOUD_PIN.zip >/dev/null \
 452     || fatal "pip install apache-libcloud failed"
 453
 454 # This will help people who reuse --temp dirs when we upgrade to llfuse 0.42
 455 if egrep -q 'llfuse.*>= *0\.42' "$WORKSPACE/services/fuse/setup.py"; then
 456     # Uninstall old llfuse, because services/fuse "pip install" won't
 457     # upgrade it by default.
 458     if pip freeze | egrep '^llfuse==0\.41\.'; then
 459         yes | pip uninstall 'llfuse<0.42'
 460     fi
 461 fi
 462
 463 # Deactivate Python 2 virtualenv
 464 deactivate
 465
 466 # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
 467 # Otherwise, skip dependent tests.
 468 PYTHON3=$(which python3)
 469 if [ "0" = "$?" ]; then
 470     setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
 471 else
 472     PYTHON3=
 473     skip[services/dockercleaner]=1
 474     cat >&2 <<EOF
 475
 476 Warning: python3 could not be found
 477 services/dockercleaner install and tests will be skipped
 478
 479 EOF
 480 fi
 481
 482 # Reactivate Python 2 virtualenv
 483 . "$VENVDIR/bin/activate"
 484
 485 # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
 486 # whine a lot.
 487 setup_ruby_environment
 488
 489 echo "PATH is $PATH"
 490
 491 if ! which bundler >/dev/null
 492 then
 493     gem install --user-install bundler || fatal 'Could not install bundler'
 494 fi
 495
 496 retry() {
 497     while ! ${@} && [[ "$retry" == 1 ]]
 498     do
 499         read -p 'Try again? [Y/n] ' x
 500         if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
 501         then
 502             break
 503         fi
 504     done
 505 }
 506
 507 do_test() {
 508     retry do_test_once ${@}
 509 }
 510
 511 do_test_once() {
 512     unset result
 513     to_test=$1
 514     if (( [[ "$only" == "apps/workbench" ]] ) &&
 515        ( [[ "$to_test" == "apps/workbench_units" ]] || [[ "$to_test" == "apps/workbench_functionals" ]] ||
 516          [[ "$to_test" == "apps/workbench_integration" ]])); then
 517       to_test="apps/workbench"
 518     fi
 519     if [[ -z "${skip[$1]}" ]] && ( [[ -z "$only" ]] || [[ "$only" == "$to_test" ]] )
 520     then
 521         title "Running $1 tests"
 522         timer_reset
 523         if [[ "$2" == "go" ]]
 524         then
 525             covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
 526             coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
 527             # We do "go get -t" here to catch compilation errors
 528             # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
 529             # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
 530             # compilation errors.
 531             go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1" || return 1
 532             cd "$WORKSPACE/$1" || return 1
 533             gofmt -e -d . | egrep . && result=1
 534             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
 535             then
 536                 # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
 537                 # does:
 538                 cd "$WORKSPACE/$1" && go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
 539             else
 540                 # The above form gets verbose even when testargs is
 541                 # empty, so use this form in such cases:
 542                 go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 543             fi
 544             result=${result:-$?}
 545             if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
 546             then
 547                 go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
 548                 rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
 549             fi
 550         elif [[ "$2" == "pip" ]]
 551         then
 552             tries=0
 553             cd "$WORKSPACE/$1" && while :
 554             do
 555                 tries=$((${tries}+1))
 556                 # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 557                 # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 558                 "${3}python" setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
 559                 result=$?
 560                 if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
 561                 then
 562                     printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
 563                     continue
 564                 else
 565                     break
 566                 fi
 567             done
 568         elif [[ "$2" != "" ]]
 569         then
 570             "test_$2"
 571         else
 572             "test_$1"
 573         fi
 574         result=${result:-$?}
 575         checkexit $result "$1 tests"
 576         title "End of $1 tests (`timer`)"
 577         return $result
 578     else
 579         title "Skipping $1 tests"
 580     fi
 581 }
 582
 583 do_install() {
 584     retry do_install_once ${@}
 585 }
 586
 587 do_install_once() {
 588     if [[ -z "$skip_install" || (-n "$only_install" && "$only_install" == "$1") ]]
 589     then
 590         title "Running $1 install"
 591         timer_reset
 592         if [[ "$2" == "go" ]]
 593         then
 594             go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 595         elif [[ "$2" == "pip" ]]
 596         then
 597             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 598             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 599
 600             # Need to change to a different directory after creating
 601             # the source dist package to avoid a pip bug.
 602             # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
 603
 604             # Also need to install twice, because if it believes the package is
 605             # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
 606             # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
 607             # install" ensures that we've actually installed the local package
 608             # we just built.
 609             cd "$WORKSPACE/$1" \
 610                 && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
 611                 && cd "$WORKSPACE" \
 612                 && "${3}pip" install --quiet "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
 613                 && "${3}pip" install --quiet --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
 614         elif [[ "$2" != "" ]]
 615         then
 616             "install_$2"
 617         else
 618             "install_$1"
 619         fi
 620         result=$?
 621         checkexit $result "$1 install"
 622         title "End of $1 install (`timer`)"
 623         return $result
 624     else
 625         title "Skipping $1 install"
 626     fi
 627 }
 628
 629 bundle_install_trylocal() {
 630     (
 631         set -e
 632         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
 633         if ! bundle install --local --no-deployment; then
 634             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
 635             bundle install --no-deployment
 636         fi
 637         bundle package --all
 638     )
 639 }
 640
 641 install_doc() {
 642     cd "$WORKSPACE/doc" \
 643         && bundle_install_trylocal \
 644         && rm -rf .site
 645 }
 646 do_install doc
 647
 648 install_gem() {
 649     gemname=$1
 650     srcpath=$2
 651     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
 652         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
 653         && bundle_install_trylocal \
 654         && gem build "$gemname.gemspec" \
 655         && with_test_gemset gem install --no-ri --no-rdoc $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
 656 }
 657
 658 install_ruby_sdk() {
 659     install_gem arvados sdk/ruby
 660 }
 661 do_install sdk/ruby ruby_sdk
 662
 663 install_perl_sdk() {
 664     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
 665         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
 666         && make install INSTALLDIRS=perl
 667 }
 668 do_install sdk/perl perl_sdk
 669
 670 install_cli() {
 671     install_gem arvados-cli sdk/cli
 672 }
 673 do_install sdk/cli cli
 674
 675 install_login-sync() {
 676     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
 677 }
 678 do_install services/login-sync login-sync
 679
 680 # Install the Python SDK early. Various other test suites (like
 681 # keepproxy) bring up run_test_server.py, which imports the arvados
 682 # module. We can't actually *test* the Python SDK yet though, because
 683 # its own test suite brings up some of those other programs (like
 684 # keepproxy).
 685 declare -a pythonstuff
 686 pythonstuff=(
 687     sdk/pam
 688     sdk/python
 689     sdk/cwl
 690     services/fuse
 691     services/nodemanager
 692     tools/crunchstat-summary
 693     )
 694 for p in "${pythonstuff[@]}"
 695 do
 696     do_install "$p" pip
 697 done
 698 if [ -n "$PYTHON3" ]; then
 699     do_install services/dockercleaner pip "$VENV3DIR/bin/"
 700 fi
 701
 702 install_apiserver() {
 703     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 704         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 705
 706     rm -f config/environments/test.rb
 707     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
 708
 709     if [ -n "$CONFIGSRC" ]
 710     then
 711         for f in database.yml application.yml
 712         do
 713             cp "$CONFIGSRC/$f" config/ || fatal "$f"
 714         done
 715     fi
 716
 717     # Fill in a random secret_token and blob_signing_key for testing
 718     SECRET_TOKEN=`echo 'puts rand(2**512).to_s(36)' |ruby`
 719     BLOB_SIGNING_KEY=`echo 'puts rand(2**512).to_s(36)' |ruby`
 720
 721     sed -i'' -e "s:SECRET_TOKEN:$SECRET_TOKEN:" config/application.yml
 722     sed -i'' -e "s:BLOB_SIGNING_KEY:$BLOB_SIGNING_KEY:" config/application.yml
 723
 724     # Set up empty git repo (for git tests)
 725     GITDIR=$(mktemp -d)
 726     sed -i'' -e "s:/var/cache/git:$GITDIR:" config/application.default.yml
 727
 728     rm -rf $GITDIR
 729     mkdir -p $GITDIR/test
 730     cd $GITDIR/test \
 731         && git init \
 732         && git config user.email "jenkins@ci.curoverse.com" \
 733         && git config user.name "Jenkins, CI" \
 734         && touch tmp \
 735         && git add tmp \
 736         && git commit -m 'initial commit'
 737
 738     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
 739     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
 740     # is a postgresql superuser.
 741     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 742         && test_database=$(python -c "import yaml; print yaml.load(file('config/database.yml'))['test']['database']") \
 743         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.procpid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
 744
 745     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 746         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:drop \
 747         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:setup \
 748         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:fixtures:load
 749 }
 750 do_install services/api apiserver
 751
 752 declare -a gostuff
 753 gostuff=(
 754     sdk/go/arvados
 755     sdk/go/arvadosclient
 756     sdk/go/blockdigest
 757     sdk/go/httpserver
 758     sdk/go/manifest
 759     sdk/go/streamer
 760     sdk/go/crunchrunner
 761     sdk/go/stats
 762     lib/crunchstat
 763     services/arv-git-httpd
 764     services/crunchstat
 765     services/keep-web
 766     services/keepstore
 767     sdk/go/keepclient
 768     services/keep-balance
 769     services/keepproxy
 770     services/datamanager/summary
 771     services/datamanager/collection
 772     services/datamanager/keep
 773     services/datamanager
 774     services/crunch-dispatch-local
 775     services/crunch-dispatch-slurm
 776     services/crunch-run
 777     services/ws
 778     tools/keep-block-check
 779     tools/keep-exercise
 780     tools/keep-rsync
 781     )
 782 for g in "${gostuff[@]}"
 783 do
 784     do_install "$g" go
 785 done
 786
 787 install_workbench() {
 788     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 789         && mkdir -p tmp/cache \
 790         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 791 }
 792 do_install apps/workbench workbench
 793
 794 test_doclinkchecker() {
 795     (
 796         set -e
 797         cd "$WORKSPACE/doc"
 798         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
 799         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
 800         # do much good!
 801         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ bundle exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
 802     )
 803 }
 804 do_test doc doclinkchecker
 805
 806 stop_services
 807
 808 test_apiserver() {
 809     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
 810     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 811         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/api]}
 812 }
 813 do_test services/api apiserver
 814
 815 # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
 816 # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
 817 if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
 818   rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 819   exit_cleanly
 820 fi
 821
 822 start_api
 823
 824 test_ruby_sdk() {
 825     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
 826         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
 827 }
 828 do_test sdk/ruby ruby_sdk
 829
 830 test_cli() {
 831     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
 832         && mkdir -p /tmp/keep \
 833         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
 834 }
 835 do_test sdk/cli cli
 836
 837 test_login-sync() {
 838     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
 839         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
 840 }
 841 do_test services/login-sync login-sync
 842
 843 for p in "${pythonstuff[@]}"
 844 do
 845     do_test "$p" pip
 846 done
 847 do_test services/dockercleaner pip "$VENV3DIR/bin/"
 848
 849 for g in "${gostuff[@]}"
 850 do
 851     do_test "$g" go
 852 done
 853
 854 test_workbench_units() {
 855     start_nginx_proxy_services \
 856         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 857         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:units TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 858 }
 859 do_test apps/workbench_units workbench_units
 860
 861 test_workbench_functionals() {
 862     start_nginx_proxy_services \
 863         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 864         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:functionals TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 865 }
 866 do_test apps/workbench_functionals workbench_functionals
 867
 868 test_workbench_integration() {
 869     start_nginx_proxy_services \
 870         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 871         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:integration TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 872 }
 873 do_test apps/workbench_integration workbench_integration
 874
 875
 876 test_workbench_benchmark() {
 877     start_nginx_proxy_services \
 878         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 879         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:benchmark ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
 880 }
 881 do_test apps/workbench_benchmark workbench_benchmark
 882
 883 test_workbench_profile() {
 884     start_nginx_proxy_services \
 885         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 886         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:profile ${testargs[apps/workbench_profile]}
 887 }
 888 do_test apps/workbench_profile workbench_profile
 889
 890 exit_cleanly