apps/workbench/app/helpers/application_helper.rb

   1 module ApplicationHelper
   2   def current_user
   3     controller.current_user
   4   end
   5
   6   def self.match_uuid(uuid)
   7     /^([0-9a-z]{5})-([0-9a-z]{5})-([0-9a-z]{15})$/.match(uuid.to_s)
   8   end
   9
  10   def current_api_host
  11     Rails.configuration.arvados_v1_base.gsub /https?:\/\/|\/arvados\/v1/,''
  12   end
  13
  14   def render_content_from_database(markup)
  15     raw RedCloth.new(markup).to_html
  16   end
  17
  18   def human_readable_bytes_html(n)
  19     return h(n) unless n.is_a? Fixnum
  20     return "0 bytes" if (n == 0)
  21
  22     orders = {
  23       1 => "bytes",
  24       1024 => "KiB",
  25       (1024*1024) => "MiB",
  26       (1024*1024*1024) => "GiB",
  27       (1024*1024*1024*1024) => "TiB"
  28     }
  29
  30     orders.each do |k, v|
  31       sig = (n.to_f/k)
  32       if sig >=1 and sig < 1024
  33         if v == 'bytes'
  34           return "%i #{v}" % sig
  35         else
  36           return "%0.1f #{v}" % sig
  37         end
  38       end
  39     end
  40
  41     return h(n)
  42     #raw = n.to_s
  43     #cooked = ''
  44     #while raw.length > 3
  45     #  cooked = ',' + raw[-3..-1] + cooked
  46     #  raw = raw[0..-4]
  47     #end
  48     #cooked = raw + cooked
  49   end
  50
  51   def resource_class_for_uuid(attrvalue, opts={})
  52     ArvadosBase::resource_class_for_uuid(attrvalue, opts)
  53   end
  54
  55   ##
  56   # Returns HTML that links to the Arvados object specified in +attrvalue+
  57   # Provides various output control and styling options.
  58   #
  59   # +attrvalue+ an Arvados model object or uuid
  60   #
  61   # +opts+ a set of flags to control output:
  62   #
  63   # [:link_text] the link text to use (may include HTML), overrides everything else
  64   #
  65   # [:friendly_name] whether to use the "friendly" name in the link text (by
  66   # calling #friendly_link_name on the object), otherwise use the uuid
  67   #
  68   # [:with_class_name] prefix the link text with the class name of the model
  69   #
  70   # [:no_tags] disable tags in the link text (default is to show tags).
  71   # Currently tags are only shown for Collections.
  72   #
  73   # [:thumbnail] if the object is a collection, show an image thumbnail if the
  74   # collection consists of a single image file.
  75   #
  76   # [:no_link] don't create a link, just return the link text
  77   #
  78   # +style_opts+ additional HTML properties for the anchor tag, passed to link_to
  79   #
  80   def link_to_if_arvados_object(attrvalue, opts={}, style_opts={})
  81     if (resource_class = resource_class_for_uuid(attrvalue, opts))
  82       if attrvalue.is_a? ArvadosBase
  83         object = attrvalue
  84         link_uuid = attrvalue.uuid
  85       else
  86         object = nil
  87         link_uuid = attrvalue
  88       end
  89       link_name = opts[:link_text]
  90       if !link_name
  91         link_name = object.andand.default_name || resource_class.default_name
  92
  93         if opts[:friendly_name]
  94           if attrvalue.respond_to? :friendly_link_name
  95             link_name = attrvalue.friendly_link_name
  96           else
  97             begin
  98               link_name = resource_class.find(link_uuid).friendly_link_name
  99             rescue RuntimeError
 100               # If that lookup failed, the link will too. So don't make one.
 101               return attrvalue
 102             end
 103           end
 104         end
 105         if opts[:with_class_name]
 106           link_name = "#{resource_class.to_s}: #{link_name}"
 107         end
 108         if !opts[:no_tags] and resource_class == Collection
 109           Link.where(head_uuid: link_uuid, link_class: ["tag", "identifier"]).each do |tag|
 110             link_name += ' <span class="label label-info">' + html_escape(tag.name) + '</span>'
 111           end
 112         end
 113         if opts[:thumbnail] and resource_class == Collection
 114           # add an image thumbnail if the collection consists of a single image file.
 115           Collection.where(uuid: link_uuid).each do |c|
 116             if c.files.length == 1 and CollectionsHelper::is_image c.files.first[1]
 117               link_name += " "
 118               link_name += image_tag "#{url_for c}/#{CollectionsHelper::file_path c.files.first}", style: "height: 4em; width: auto"
 119             end
 120           end
 121         end
 122       end
 123       style_opts[:class] = (style_opts[:class] || '') + ' nowrap'
 124       if opts[:no_link]
 125         raw(link_name)
 126       else
 127         link_to raw(link_name), { controller: resource_class.to_s.tableize, action: 'show', id: link_uuid }, style_opts
 128       end
 129     else
 130       # just return attrvalue if it is not recognizable as an Arvados object or uuid.
 131       attrvalue
 132     end
 133   end
 134
 135   def render_editable_attribute(object, attr, attrvalue=nil, htmloptions={})
 136     attrvalue = object.send(attr) if attrvalue.nil?
 137     if !object.attribute_editable?(attr, :ever) or
 138         (!object.editable? and
 139          !object.owner_uuid.in?(my_folders.collect(&:uuid)))
 140       return attrvalue
 141     end
 142
 143     input_type = 'text'
 144     case object.class.attribute_info[attr.to_sym].andand[:type]
 145     when 'text'
 146       input_type = 'textarea'
 147     when 'datetime'
 148       input_type = 'date'
 149     else
 150       input_type = 'text'
 151     end
 152
 153     attrvalue = attrvalue.to_json if attrvalue.is_a? Hash or attrvalue.is_a? Array
 154
 155     ajax_options = {
 156       "data-pk" => {
 157         id: object.uuid,
 158         key: object.class.to_s.underscore
 159       }
 160     }
 161     if object.uuid
 162       ajax_options['data-url'] = url_for(action: "update", id: object.uuid, controller: object.class.to_s.pluralize.underscore)
 163     else
 164       ajax_options['data-url'] = url_for(action: "create", controller: object.class.to_s.pluralize.underscore)
 165       ajax_options['data-pk'][:defaults] = object.attributes
 166     end
 167     ajax_options['data-pk'] = ajax_options['data-pk'].to_json
 168     @unique_id ||= (Time.now.to_f*1000000).to_i
 169     span_id = object.uuid.to_s + '-' + attr.to_s + '-' + (@unique_id += 1).to_s
 170
 171     span_tag = content_tag 'span', attrvalue.to_s, {
 172       "data-emptytext" => (object.andand.default_name || 'none'),
 173       "data-placement" => "bottom",
 174       "data-type" => input_type,
 175       "data-title" => "Edit #{attr.gsub '_', ' '}",
 176       "data-name" => attr,
 177       "data-object-uuid" => object.uuid,
 178       "data-toggle" => "manual",
 179       "id" => span_id,
 180       :class => "editable"
 181     }.merge(htmloptions).merge(ajax_options)
 182     span_tag + raw(' <a href="#" class="btn btn-xs btn-default btn-nodecorate" data-toggle="x-editable tooltip" data-toggle-selector="#' + span_id + '" data-placement="top" title="edit"><i class="fa fa-fw fa-pencil"></i></a>')
 183   end
 184
 185   def render_pipeline_component_attribute(object, attr, subattr, value_info, htmloptions={})
 186     datatype = nil
 187     required = true
 188     attrvalue = value_info
 189
 190     if value_info.is_a? Hash
 191       if value_info[:output_of]
 192         return raw("<span class='label label-default'>#{value_info[:output_of]}</span>")
 193       end
 194       if value_info[:dataclass]
 195         dataclass = value_info[:dataclass]
 196       end
 197       if value_info[:optional] != nil
 198         required = (value_info[:optional] != "true")
 199       end
 200       if value_info[:required] != nil
 201         required = value_info[:required]
 202       end
 203
 204       # Pick a suitable attrvalue to show as the current value (i.e.,
 205       # the one that would be used if we ran the pipeline right now).
 206       if value_info[:value]
 207         attrvalue = value_info[:value]
 208       elsif value_info[:default]
 209         attrvalue = value_info[:default]
 210       else
 211         attrvalue = ''
 212       end
 213     end
 214
 215     if !object or
 216         !object.attribute_editable?(attr, :ever) or
 217         (!object.editable? and
 218          !object.owner_uuid.in?(my_folders.collect(&:uuid)))
 219       return link_to_if_arvados_object attrvalue
 220     end
 221
 222     if dataclass
 223       begin
 224         dataclass = dataclass.constantize
 225       rescue NameError
 226       end
 227     else
 228       dataclass = ArvadosBase.resource_class_for_uuid(attrvalue)
 229     end
 230
 231     id = "#{object.uuid}-#{subattr.join('-')}"
 232     dn = "[#{attr}]"
 233     subattr.each do |a|
 234       dn += "[#{a}]"
 235     end
 236     if value_info.is_a? Hash
 237       dn += '[value]'
 238     end
 239
 240     if dataclass == Collection
 241       selection_param = object.class.to_s.underscore + dn
 242       display_value = attrvalue
 243       if value_info.is_a?(Hash)
 244         if (link = Link.find? value_info[:link_uuid])
 245           display_value = link.name
 246         elsif value_info[:link_name]
 247           display_value = value_info[:link_name]
 248         end
 249       end
 250       modal_path = choose_collections_path \
 251       ({ title: 'Choose a dataset:',
 252          filters: [['owner_uuid', '=', object.owner_uuid]].to_json,
 253          action_name: 'OK',
 254          action_href: pipeline_instance_path(id: object.uuid),
 255          action_method: 'patch',
 256          action_data: {
 257            merge: true,
 258            selection_param: selection_param,
 259            success: 'page-refresh'
 260          }.to_json,
 261         })
 262       return content_tag('div', :class => 'input-group') do
 263         html = text_field_tag(dn, display_value, :class => 'form-control')
 264         html + content_tag('span', :class => 'input-group-btn') do
 265           link_to('Choose',
 266                   modal_path,
 267                   { :class => "btn btn-primary",
 268                     :remote => true,
 269                     :method => 'get',
 270                   })
 271         end
 272       end
 273     end
 274
 275     if dataclass.andand.is_a?(Class)
 276       datatype = 'select'
 277     elsif dataclass == 'number'
 278       datatype = 'number'
 279     elsif attrvalue.is_a? Array
 280       # TODO: find a way to edit arrays with x-editable
 281       return attrvalue
 282     elsif attrvalue.is_a? Fixnum or attrvalue.is_a? Float
 283       datatype = 'number'
 284     elsif attrvalue.is_a? String
 285       datatype = 'text'
 286     end
 287
 288     selectables = []
 289     attrtext = attrvalue
 290     if dataclass and dataclass.is_a? Class
 291       if attrvalue and !attrvalue.empty?
 292         Link.where(head_uuid: attrvalue, link_class: ["tag", "identifier"]).each do |tag|
 293           attrtext += " [#{tag.name}]"
 294         end
 295         selectables.append({name: attrtext, uuid: attrvalue, type: dataclass.to_s})
 296       end
 297       #dataclass.where(uuid: attrvalue).each do |item|
 298       #  selectables.append({name: item.uuid, uuid: item.uuid, type: dataclass.to_s})
 299       #end
 300       itemuuids = []
 301       dataclass.limit(10).each do |item|
 302         itemuuids << item.uuid
 303         selectables.append({name: item.uuid, uuid: item.uuid, type: dataclass.to_s})
 304       end
 305       Link.where(head_uuid: itemuuids, link_class: ["tag", "identifier"]).each do |tag|
 306         selectables.each do |selectable|
 307           if selectable['uuid'] == tag.head_uuid
 308             selectable['name'] += ' [' + tag.name + ']'
 309           end
 310         end
 311       end
 312     end
 313
 314     lt = link_to attrtext, '#', {
 315       "data-emptytext" => "none",
 316       "data-placement" => "bottom",
 317       "data-type" => datatype,
 318       "data-url" => url_for(action: "update", id: object.uuid, controller: object.class.to_s.pluralize.underscore, merge: true),
 319       "data-title" => "Set value for #{subattr[-1].to_s}",
 320       "data-name" => dn,
 321       "data-pk" => "{id: \"#{object.uuid}\", key: \"#{object.class.to_s.underscore}\"}",
 322       "data-showbuttons" => "false",
 323       "data-value" => attrvalue,
 324       :class => "editable #{'required' if required} form-control",
 325       :id => id
 326     }.merge(htmloptions)
 327
 328     lt += raw("\n<script>")
 329
 330     if selectables.any?
 331       lt += raw("add_form_selection_sources(#{selectables.to_json});\n")
 332     end
 333
 334     lt += raw("$('[data-name=\"#{dn}\"]').editable({source: function() { return select_form_sources('#{dataclass}'); } });\n")
 335
 336     lt += raw("</script>")
 337
 338     lt
 339   end
 340
 341   def render_arvados_object_list_start(list, button_text, button_href,
 342                                        params={}, *rest, &block)
 343     show_max = params.delete(:show_max) || 3
 344     params[:class] ||= 'btn btn-xs btn-default'
 345     list[0...show_max].each { |item| yield item }
 346     unless list[show_max].nil?
 347       link_to(h(button_text) +
 348               raw(' &nbsp; <i class="fa fa-fw fa-arrow-circle-right"></i>'),
 349               button_href, params, *rest)
 350     end
 351   end
 352
 353   def render_controller_partial partial, opts
 354     cname = opts.delete :controller_name
 355     begin
 356       render opts.merge(partial: "#{cname}/#{partial}")
 357     rescue ActionView::MissingTemplate
 358       render opts.merge(partial: "application/#{partial}")
 359     end
 360   end
 361
 362   def fa_icon_class_for_object object
 363     case object.class.to_s.to_sym
 364     when :User
 365       'fa-user'
 366     when :Group
 367       object.group_class ? 'fa-folder' : 'fa-users'
 368     when :Job, :PipelineInstance, :PipelineTemplate
 369       'fa-gears'
 370     when :Collection
 371       'fa-archive'
 372     when :Specimen
 373       'fa-flask'
 374     when :Trait
 375       'fa-clipboard'
 376     when :Human
 377       'fa-male'
 378     when :VirtualMachine
 379       'fa-terminal'
 380     when :Repository
 381       'fa-code-fork'
 382     when :Link
 383       'fa-arrows-h'
 384     when :User
 385       'fa-user'
 386     when :Node
 387       'fa-cloud'
 388     when :KeepService
 389       'fa-exchange'
 390     when :KeepDisk
 391       'fa-hdd-o'
 392     else
 393       'fa-cube'
 394     end
 395   end
 396 end