build/run-tests.sh

   1 #!/bin/bash
   2
   3 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin
   4
   5 COLUMNS=80
   6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
   7
   8 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
   9 $(basename $0): Install and test Arvados components.
  10
  11 Exit non-zero if any tests fail.
  12
  13 Syntax:
  14         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
  15
  16 Options:
  17
  18 --skip FOO     Do not test the FOO component.
  19 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
  20 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
  21                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
  22 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
  23                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
  24                subsequent invocations.
  25 --repeat N     Repeat each install/test step until it succeeds N times.
  26 --retry        Prompt to retry if an install or test suite fails.
  27 --skip-install Do not run any install steps. Just run tests.
  28                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
  29                from a previous invocation if you use this option.
  30 --only-install Run specific install step
  31 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
  32 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
  33 CONFIGSRC=path Dir with api server config files to copy into source tree.
  34                (If none given, leave config files alone in source tree.)
  35 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
  36                Restrict apiserver tests to the given file
  37 sdk/python_test="--test-suite test.test_keep_locator"
  38                Restrict Python SDK tests to the given class
  39 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
  40                Restrict Workbench tests to the given file
  41 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
  42                Show all log messages, even when tests pass (also works
  43                with services/keepstore_test etc.)
  44 ARVADOS_DEBUG=1
  45                Print more debug messages
  46 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
  47                *_test, and other examples shown above.
  48
  49 Assuming --skip-install is not given, all components are installed
  50 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
  51 test suites depend on other components being installed, and installing
  52 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
  53
  54 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
  55 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
  56
  57 More information and background:
  58
  59 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
  60
  61 Available tests:
  62
  63 apps/workbench (*)
  64 apps/workbench_units (*)
  65 apps/workbench_functionals (*)
  66 apps/workbench_integration (*)
  67 apps/workbench_benchmark
  68 apps/workbench_profile
  69 doc
  70 services/api
  71 services/arv-git-httpd
  72 services/crunchstat
  73 services/dockercleaner
  74 services/fuse
  75 services/keep-web
  76 services/keepproxy
  77 services/keepstore
  78 services/keep-balance
  79 services/login-sync
  80 services/nodemanager
  81 services/nodemanager-integration
  82 services/crunch-run
  83 services/crunch-dispatch-local
  84 services/crunch-dispatch-slurm
  85 services/ws
  86 sdk/cli
  87 sdk/pam
  88 sdk/python
  89 sdk/python:py3
  90 sdk/ruby
  91 sdk/go/arvados
  92 sdk/go/arvadosclient
  93 sdk/go/dispatch
  94 sdk/go/keepclient
  95 sdk/go/httpserver
  96 sdk/go/manifest
  97 sdk/go/blockdigest
  98 sdk/go/streamer
  99 sdk/go/stats
 100 sdk/go/crunchrunner
 101 sdk/cwl
 102 tools/crunchstat-summary
 103 tools/keep-exercise
 104 tools/keep-rsync
 105 tools/keep-block-check
 106
 107 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
 108     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
 109
 110 EOF
 111
 112 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
 113 # environment that could interfere with the tests.
 114 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
 115
 116 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
 117 # accident.
 118 GITDIR=
 119 GOPATH=
 120 VENVDIR=
 121 VENV3DIR=
 122 PYTHONPATH=
 123 GEMHOME=
 124 PERLINSTALLBASE=
 125
 126 short=
 127 only_install=
 128 temp=
 129 temp_preserve=
 130
 131 clear_temp() {
 132     if [[ -z "$temp" ]]; then
 133         # we didn't even get as far as making a temp dir
 134         :
 135     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
 136         rm -rf "$temp"
 137     else
 138         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
 139     fi
 140 }
 141
 142 fatal() {
 143     clear_temp
 144     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
 145     exit 1
 146 }
 147
 148 exit_cleanly() {
 149     trap - INT
 150     create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
 151     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 152     stop_services
 153     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 154     report_outcomes
 155     clear_temp
 156     exit ${#failures}
 157 }
 158
 159 sanity_checks() {
 160     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
 161         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
 162     echo Checking dependencies:
 163     echo -n 'virtualenv: '
 164     virtualenv --version \
 165         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
 166     echo -n 'ruby: '
 167     ruby -v \
 168         || fatal "No ruby. Install >=2.1.9 (using rbenv, rvm, or source)"
 169     echo -n 'go: '
 170     go version \
 171         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
 172     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 7 ]] \
 173         || fatal "Go >= 1.7 required. See http://golang.org/doc/install"
 174     echo -n 'gcc: '
 175     gcc --version | egrep ^gcc \
 176         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
 177     echo -n 'fuse.h: '
 178     find /usr/include -path '*fuse/fuse.h' | egrep --max-count=1 . \
 179         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
 180     echo -n 'gnutls.h: '
 181     find /usr/include -path '*gnutls/gnutls.h' | egrep --max-count=1 . \
 182         || fatal "No gnutls/gnutls.h. Try: apt-get install libgnutls28-dev"
 183     echo -n 'Python2 pyconfig.h: '
 184     find /usr/include -path '*/python2*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 185         || fatal "No Python2 pyconfig.h. Try: apt-get install python2.7-dev"
 186     echo -n 'Python3 pyconfig.h: '
 187     find /usr/include -path '*/python3*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 188         || fatal "No Python3 pyconfig.h. Try: apt-get install python3-dev"
 189     echo -n 'nginx: '
 190     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
 191         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
 192     echo -n 'perl: '
 193     perl -v | grep version \
 194         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
 195     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
 196         echo -n "perl $mod: "
 197         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
 198             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
 199     done
 200     echo -n 'gitolite: '
 201     which gitolite \
 202         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
 203 }
 204
 205 rotate_logfile() {
 206   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 207   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
 208   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
 209     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
 210     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 211     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 212   fi
 213 }
 214
 215 declare -a failures
 216 declare -A skip
 217 declare -A testargs
 218 skip[apps/workbench_profile]=1
 219
 220 while [[ -n "$1" ]]
 221 do
 222     arg="$1"; shift
 223     case "$arg" in
 224         --help)
 225             echo >&2 "$helpmessage"
 226             echo >&2
 227             exit 1
 228             ;;
 229         --skip)
 230             skip[$1]=1; shift
 231             ;;
 232         --only)
 233             only="$1"; skip[$1]=""; shift
 234             ;;
 235         --short)
 236             short=1
 237             ;;
 238         --skip-install)
 239             only_install=nothing
 240             ;;
 241         --only-install)
 242             only_install="$1"; shift
 243             ;;
 244         --temp)
 245             temp="$1"; shift
 246             temp_preserve=1
 247             ;;
 248         --leave-temp)
 249             temp_preserve=1
 250             ;;
 251         --repeat)
 252             repeat=$((${1}+0)); shift
 253             ;;
 254         --retry)
 255             retry=1
 256             ;;
 257         *_test=*)
 258             suite="${arg%%_test=*}"
 259             args="${arg#*=}"
 260             testargs["$suite"]="$args"
 261             ;;
 262         *=*)
 263             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
 264             ;;
 265         *)
 266             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
 267             exit 1
 268             ;;
 269     esac
 270 done
 271
 272 start_api() {
 273     echo 'Starting API server...'
 274     cd "$WORKSPACE" \
 275         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
 276         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
 277         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
 278         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 279         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
 280         && (env | egrep ^ARVADOS)
 281 }
 282
 283 start_nginx_proxy_services() {
 284     echo 'Starting keepproxy, keep-web, ws, arv-git-httpd, and nginx ssl proxy...'
 285     cd "$WORKSPACE" \
 286         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
 287         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
 288         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
 289         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 290         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
 291         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1
 292 }
 293
 294 stop_services() {
 295     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES" ]]; then
 296         unset ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
 297         cd "$WORKSPACE" \
 298             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 299             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
 300             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 301             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
 302             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy
 303     fi
 304     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
 305         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
 306         cd "$WORKSPACE" \
 307             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 308             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 309             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop
 310     fi
 311 }
 312
 313 interrupt() {
 314     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
 315     exit_cleanly
 316 }
 317 trap interrupt INT
 318
 319 sanity_checks
 320
 321 echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
 322
 323 if [[ -z "$CONFIGSRC" ]] && [[ -d "$HOME/arvados-api-server" ]]; then
 324     # Jenkins expects us to use this by default.
 325     CONFIGSRC="$HOME/arvados-api-server"
 326 fi
 327
 328 # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
 329 cd "$WORKSPACE"
 330 find -name '*.pyc' -delete
 331
 332 if [[ -z "$temp" ]]; then
 333     temp="$(mktemp -d)"
 334 fi
 335
 336 # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
 337 for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE
 338 do
 339     if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
 340         eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
 341     fi
 342     if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
 343         mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
 344     fi
 345 done
 346
 347 setup_ruby_environment() {
 348     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 349         source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
 350         using_rvm=true
 351     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 352         source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
 353         using_rvm=true
 354     else
 355         using_rvm=false
 356     fi
 357
 358     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 359         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
 360         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
 361         # the environment to the "current gemset", which would lose
 362         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
 363         # programs (for example, the Workbench test suite could not
 364         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
 365         # rvm gemset and use it for everything.
 366
 367         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
 368             || fatal 'rvm check'
 369
 370         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
 371         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
 372         # complaint about not being in first place already.
 373         rvm use @default 2>/dev/null
 374
 375         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
 376         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
 377         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
 378         # ruby to the caller.
 379         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
 380         rvm use "@${gemset}" --create \
 381             || fatal 'rvm gemset setup'
 382
 383         rvm env
 384     else
 385         # When our "bundle install"s need to install new gems to
 386         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
 387         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
 388         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
 389         # should be installed, and we should leave it alone.)
 390
 391         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
 392             user_gempath="$(gem env gempath)"
 393             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
 394         fi
 395         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
 396
 397         # When we build and install our own gems, we install them in our
 398         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
 399         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
 400         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
 401
 402         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
 403         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
 404         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home"
 405
 406         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
 407         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
 408         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
 409     fi
 410     bundle config || gem install bundler \
 411         || fatal 'install bundler'
 412 }
 413
 414 with_test_gemset() {
 415     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 416         "$@"
 417     else
 418         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
 419     fi
 420 }
 421
 422 gem_uninstall_if_exists() {
 423     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
 424         gem uninstall --force --all --executables "$1"
 425     fi
 426 }
 427
 428 setup_virtualenv() {
 429     local venvdest="$1"; shift
 430     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
 431         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
 432     fi
 433     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
 434         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
 435         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
 436     else
 437         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
 438     fi
 439     # ubuntu1404 can't seem to install mock via tests_require, but it can do this.
 440     "$venvdest/bin/pip" install 'mock>=1.0' 'pbr<1.7.0'
 441 }
 442
 443 export PERLINSTALLBASE
 444 export PERLLIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5:${PERLLIB:+$PERLLIB}"
 445
 446 export GOPATH
 447 mkdir -p "$GOPATH/src/git.curoverse.com"
 448 ln -sfT "$WORKSPACE" "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" \
 449     || fatal "symlink failed"
 450 go get -v github.com/kardianos/govendor \
 451     || fatal "govendor install failed"
 452
 453 setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
 454 . "$VENVDIR/bin/activate"
 455
 456 # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
 457 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^PyYAML= \
 458     || pip install PyYAML >/dev/null \
 459     || fatal "pip install PyYAML failed"
 460
 461 # Preinstall forked version of libcloud, because nodemanager "pip install"
 462 # won't pick it up by default.
 463 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
 464     || pip install --pre --ignore-installed https://github.com/curoverse/libcloud/archive/apache-libcloud-$LIBCLOUD_PIN.zip >/dev/null \
 465     || fatal "pip install apache-libcloud failed"
 466
 467 # Uninstall old llfuse (<1.0), because services/fuse "pip install"
 468 # won't upgrade it by default.
 469 if pip freeze | egrep '^llfuse==0'; then
 470     yes | pip uninstall 'llfuse<1.0'
 471 fi
 472
 473 # Deactivate Python 2 virtualenv
 474 deactivate
 475
 476 declare -a pythonstuff
 477 pythonstuff=(
 478     sdk/pam
 479     sdk/python
 480     sdk/python:py3
 481     sdk/cwl
 482     services/dockercleaner:py3
 483     services/fuse
 484     services/nodemanager
 485     tools/crunchstat-summary
 486     )
 487
 488 # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
 489 # Otherwise, skip dependent tests.
 490 PYTHON3=$(which python3)
 491 if [[ ${?} = 0 ]]; then
 492     setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
 493 else
 494     PYTHON3=
 495     cat >&2 <<EOF
 496
 497 Warning: python3 could not be found. Python 3 tests will be skipped.
 498
 499 EOF
 500 fi
 501
 502 # Reactivate Python 2 virtualenv
 503 . "$VENVDIR/bin/activate"
 504
 505 # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
 506 # whine a lot.
 507 setup_ruby_environment
 508
 509 echo "PATH is $PATH"
 510
 511 if ! which bundler >/dev/null
 512 then
 513     gem install --user-install bundler || fatal 'Could not install bundler'
 514 fi
 515
 516 retry() {
 517     remain="${repeat}"
 518     while :
 519     do
 520         if ${@}; then
 521             if [[ "$remain" -gt 1 ]]; then
 522                 remain=$((${remain}-1))
 523                 title "Repeating ${remain} more times"
 524             else
 525                 break
 526             fi
 527         elif [[ "$retry" == 1 ]]; then
 528             read -p 'Try again? [Y/n] ' x
 529             if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
 530             then
 531                 break
 532             fi
 533         else
 534             break
 535         fi
 536     done
 537 }
 538
 539 do_test() {
 540     case "${1}" in
 541         apps/workbench_units | apps/workbench_functionals | apps/workbench_integration)
 542             suite=apps/workbench
 543             ;;
 544         *)
 545             suite="${1}"
 546             ;;
 547     esac
 548     if [[ -z "${skip[$suite]}" && -z "${skip[$1]}" && \
 549                 (-z "${only}" || "${only}" == "${suite}" || \
 550                  "${only}" == "${1}") ]]; then
 551         retry do_test_once ${@}
 552     else
 553         title "Skipping ${1} tests"
 554     fi
 555 }
 556
 557 do_test_once() {
 558     unset result
 559
 560     title "Running $1 tests"
 561     timer_reset
 562     if [[ "$2" == "go" ]]
 563     then
 564         covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
 565         coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
 566         # We do "go get -t" here to catch compilation errors
 567         # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
 568         # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
 569         # compilation errors.
 570         go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 571             cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 572             [[ -z "$(gofmt -e -d . | tee /dev/stderr)" ]] && \
 573             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
 574         then
 575             # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
 576             # does:
 577             go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
 578         else
 579             # The above form gets verbose even when testargs is
 580             # empty, so use this form in such cases:
 581             go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 582         fi
 583         result=${result:-$?}
 584         if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
 585         then
 586             go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
 587             rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
 588         fi
 589     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 590     then
 591         tries=0
 592         cd "$WORKSPACE/$1" && while :
 593         do
 594             tries=$((${tries}+1))
 595             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 596             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 597             "${3}python" setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
 598             result=$?
 599             if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
 600             then
 601                 printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
 602                 continue
 603             else
 604                 break
 605             fi
 606         done
 607     elif [[ "$2" != "" ]]
 608     then
 609         "test_$2"
 610     else
 611         "test_$1"
 612     fi
 613     result=${result:-$?}
 614     checkexit $result "$1 tests"
 615     title "End of $1 tests (`timer`)"
 616     return $result
 617 }
 618
 619 do_install() {
 620     if [[ -z "${only_install}" || "${only_install}" == "${1}" ]]; then
 621         retry do_install_once ${@}
 622     else
 623         title "Skipping $1 install"
 624     fi
 625 }
 626
 627 do_install_once() {
 628     title "Running $1 install"
 629     timer_reset
 630     if [[ "$2" == "go" ]]
 631     then
 632         go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 633     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 634     then
 635         # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 636         # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 637
 638         # Need to change to a different directory after creating
 639         # the source dist package to avoid a pip bug.
 640         # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
 641
 642         # Also need to install twice, because if it believes the package is
 643         # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
 644         # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
 645         # install" ensures that we've actually installed the local package
 646         # we just built.
 647         cd "$WORKSPACE/$1" \
 648             && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
 649             && cd "$WORKSPACE" \
 650             && "${3}pip" install --quiet "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
 651             && "${3}pip" install --quiet --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
 652     elif [[ "$2" != "" ]]
 653     then
 654         "install_$2"
 655     else
 656         "install_$1"
 657     fi
 658     result=$?
 659     checkexit $result "$1 install"
 660     title "End of $1 install (`timer`)"
 661     return $result
 662 }
 663
 664 bundle_install_trylocal() {
 665     (
 666         set -e
 667         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
 668         if ! bundle install --local --no-deployment; then
 669             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
 670             bundle install --no-deployment
 671         fi
 672         bundle package --all
 673     )
 674 }
 675
 676 install_doc() {
 677     cd "$WORKSPACE/doc" \
 678         && bundle_install_trylocal \
 679         && rm -rf .site
 680 }
 681 do_install doc
 682
 683 install_gem() {
 684     gemname=$1
 685     srcpath=$2
 686     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
 687         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
 688         && bundle_install_trylocal \
 689         && gem build "$gemname.gemspec" \
 690         && with_test_gemset gem install --no-ri --no-rdoc $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
 691 }
 692
 693 install_ruby_sdk() {
 694     install_gem arvados sdk/ruby
 695 }
 696 do_install sdk/ruby ruby_sdk
 697
 698 install_perl_sdk() {
 699     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
 700         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
 701         && make install INSTALLDIRS=perl
 702 }
 703 do_install sdk/perl perl_sdk
 704
 705 install_cli() {
 706     install_gem arvados-cli sdk/cli
 707 }
 708 do_install sdk/cli cli
 709
 710 install_login-sync() {
 711     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
 712 }
 713 do_install services/login-sync login-sync
 714
 715 # Install the Python SDK early. Various other test suites (like
 716 # keepproxy) bring up run_test_server.py, which imports the arvados
 717 # module. We can't actually *test* the Python SDK yet though, because
 718 # its own test suite brings up some of those other programs (like
 719 # keepproxy).
 720 for p in "${pythonstuff[@]}"
 721 do
 722     dir=${p%:py3}
 723     if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
 724         if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
 725             do_install ${dir} pip
 726         fi
 727     elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
 728         if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
 729             do_install ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
 730         fi
 731     fi
 732 done
 733
 734 install_apiserver() {
 735     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 736         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 737
 738     rm -f config/environments/test.rb
 739     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
 740
 741     if [ -n "$CONFIGSRC" ]
 742     then
 743         for f in database.yml
 744         do
 745             cp "$CONFIGSRC/$f" config/ || fatal "$f"
 746         done
 747     fi
 748
 749     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
 750     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
 751     # is a postgresql superuser.
 752     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 753         && test_database=$(python -c "import yaml; print yaml.load(file('config/database.yml'))['test']['database']") \
 754         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.procpid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
 755
 756     mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/tmp/pids"
 757
 758     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 759         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:drop \
 760         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:setup \
 761         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:fixtures:load
 762 }
 763 do_install services/api apiserver
 764
 765 cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" && \
 766     "$GOPATH/bin/govendor" sync -v || \
 767         fatal "govendor sync failed"
 768 declare -a gostuff
 769 gostuff=(
 770     sdk/go/arvados
 771     sdk/go/arvadosclient
 772     sdk/go/blockdigest
 773     sdk/go/dispatch
 774     sdk/go/httpserver
 775     sdk/go/manifest
 776     sdk/go/streamer
 777     sdk/go/crunchrunner
 778     sdk/go/stats
 779     lib/crunchstat
 780     services/arv-git-httpd
 781     services/crunchstat
 782     services/keep-web
 783     services/keepstore
 784     sdk/go/keepclient
 785     services/keep-balance
 786     services/keepproxy
 787     services/crunch-dispatch-local
 788     services/crunch-dispatch-slurm
 789     services/crunch-run
 790     services/ws
 791     tools/keep-block-check
 792     tools/keep-exercise
 793     tools/keep-rsync
 794 )
 795 for g in "${gostuff[@]}"
 796 do
 797     do_install "$g" go
 798 done
 799
 800 install_workbench() {
 801     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 802         && mkdir -p tmp/cache \
 803         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 804 }
 805 do_install apps/workbench workbench
 806
 807 unset http_proxy https_proxy no_proxy
 808
 809 test_doclinkchecker() {
 810     (
 811         set -e
 812         cd "$WORKSPACE/doc"
 813         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
 814         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
 815         # do much good!
 816         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ bundle exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
 817     )
 818 }
 819 do_test doc doclinkchecker
 820
 821 stop_services
 822
 823 test_apiserver() {
 824     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
 825     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 826         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/api]}
 827 }
 828 do_test services/api apiserver
 829
 830 # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
 831 # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
 832 if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
 833   rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 834   exit_cleanly
 835 fi
 836
 837 start_api || { stop_services; fatal "start_api"; }
 838
 839 test_ruby_sdk() {
 840     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
 841         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
 842 }
 843 do_test sdk/ruby ruby_sdk
 844
 845 test_cli() {
 846     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
 847         && mkdir -p /tmp/keep \
 848         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
 849 }
 850 do_test sdk/cli cli
 851
 852 test_login-sync() {
 853     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
 854         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
 855 }
 856 do_test services/login-sync login-sync
 857
 858 test_nodemanager-integration() {
 859     cd "$WORKSPACE/services/nodemanager" \
 860         && tests/integration_test.py ${testargs[services/nodemanager-integration]}
 861 }
 862 do_test services/nodemanager-integration nodemanager-integration
 863
 864 for p in "${pythonstuff[@]}"
 865 do
 866     dir=${p%:py3}
 867     if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
 868         if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
 869             do_test ${dir} pip
 870         fi
 871     elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
 872         if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
 873             do_test ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
 874         fi
 875     fi
 876 done
 877
 878 for g in "${gostuff[@]}"
 879 do
 880     do_test "$g" go
 881 done
 882
 883 test_workbench_units() {
 884     start_nginx_proxy_services \
 885         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 886         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:units TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 887 }
 888 do_test apps/workbench_units workbench_units
 889
 890 test_workbench_functionals() {
 891     start_nginx_proxy_services \
 892         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 893         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:functionals TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 894 }
 895 do_test apps/workbench_functionals workbench_functionals
 896
 897 test_workbench_integration() {
 898     start_nginx_proxy_services \
 899         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 900         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:integration TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 901 }
 902 do_test apps/workbench_integration workbench_integration
 903
 904
 905 test_workbench_benchmark() {
 906     start_nginx_proxy_services \
 907         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 908         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:benchmark ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
 909 }
 910 do_test apps/workbench_benchmark workbench_benchmark
 911
 912 test_workbench_profile() {
 913     start_nginx_proxy_services \
 914         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 915         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:profile ${testargs[apps/workbench_profile]}
 916 }
 917 do_test apps/workbench_profile workbench_profile
 918
 919 exit_cleanly