build/run-tests.sh

   1 #!/bin/bash
   2 # Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
   3 #
   4 # SPDX-License-Identifier: AGPL-3.0
   5
   6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin.sh
   7
   8 COLUMNS=80
   9 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
  10
  11 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
  12 $(basename $0): Install and test Arvados components.
  13
  14 Exit non-zero if any tests fail.
  15
  16 Syntax:
  17         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
  18
  19 Options:
  20
  21 --skip FOO     Do not test the FOO component.
  22 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
  23 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
  24                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
  25 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
  26                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
  27                subsequent invocations.
  28 --repeat N     Repeat each install/test step until it succeeds N times.
  29 --retry        Prompt to retry if an install or test suite fails.
  30 --skip-install Do not run any install steps. Just run tests.
  31                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
  32                from a previous invocation if you use this option.
  33 --only-install Run specific install step
  34 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
  35 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
  36 CONFIGSRC=path Dir with api server config files to copy into source tree.
  37                (If none given, leave config files alone in source tree.)
  38 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
  39                Restrict apiserver tests to the given file
  40 sdk/python_test="--test-suite test.test_keep_locator"
  41                Restrict Python SDK tests to the given class
  42 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
  43                Restrict Workbench tests to the given file
  44 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
  45                Show all log messages, even when tests pass (also works
  46                with services/keepstore_test etc.)
  47 ARVADOS_DEBUG=1
  48                Print more debug messages
  49 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
  50                *_test, and other examples shown above.
  51
  52 Assuming --skip-install is not given, all components are installed
  53 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
  54 test suites depend on other components being installed, and installing
  55 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
  56
  57 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
  58 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
  59
  60 More information and background:
  61
  62 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
  63
  64 Available tests:
  65
  66 apps/workbench (*)
  67 apps/workbench_units (*)
  68 apps/workbench_functionals (*)
  69 apps/workbench_integration (*)
  70 apps/workbench_benchmark
  71 apps/workbench_profile
  72 doc
  73 services/api
  74 services/arv-git-httpd
  75 services/crunchstat
  76 services/dockercleaner
  77 services/fuse
  78 services/keep-web
  79 services/keepproxy
  80 services/keepstore
  81 services/keep-balance
  82 services/login-sync
  83 services/nodemanager
  84 services/nodemanager-integration
  85 services/crunch-run
  86 services/crunch-dispatch-local
  87 services/crunch-dispatch-slurm
  88 services/ws
  89 sdk/cli
  90 sdk/pam
  91 sdk/python
  92 sdk/python:py3
  93 sdk/ruby
  94 sdk/go/arvados
  95 sdk/go/arvadosclient
  96 sdk/go/dispatch
  97 sdk/go/keepclient
  98 sdk/go/httpserver
  99 sdk/go/manifest
 100 sdk/go/blockdigest
 101 sdk/go/streamer
 102 sdk/go/stats
 103 sdk/go/crunchrunner
 104 sdk/cwl
 105 tools/crunchstat-summary
 106 tools/keep-exercise
 107 tools/keep-rsync
 108 tools/keep-block-check
 109
 110 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
 111     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
 112
 113 EOF
 114
 115 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
 116 # environment that could interfere with the tests.
 117 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
 118
 119 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
 120 # accident.
 121 GITDIR=
 122 GOPATH=
 123 VENVDIR=
 124 VENV3DIR=
 125 PYTHONPATH=
 126 GEMHOME=
 127 PERLINSTALLBASE=
 128
 129 short=
 130 only_install=
 131 temp=
 132 temp_preserve=
 133
 134 clear_temp() {
 135     if [[ -z "$temp" ]]; then
 136         # we didn't even get as far as making a temp dir
 137         :
 138     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
 139         rm -rf "$temp"
 140     else
 141         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
 142     fi
 143 }
 144
 145 fatal() {
 146     clear_temp
 147     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
 148     exit 1
 149 }
 150
 151 exit_cleanly() {
 152     trap - INT
 153     create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
 154     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 155     stop_services
 156     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 157     report_outcomes
 158     clear_temp
 159     exit ${#failures}
 160 }
 161
 162 sanity_checks() {
 163     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
 164         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
 165     echo Checking dependencies:
 166     echo -n 'virtualenv: '
 167     virtualenv --version \
 168         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
 169     echo -n 'ruby: '
 170     ruby -v \
 171         || fatal "No ruby. Install >=2.1.9 (using rbenv, rvm, or source)"
 172     echo -n 'go: '
 173     go version \
 174         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
 175     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 8 ]] \
 176         || fatal "Go >= 1.8 required. See http://golang.org/doc/install"
 177     echo -n 'gcc: '
 178     gcc --version | egrep ^gcc \
 179         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
 180     echo -n 'fuse.h: '
 181     find /usr/include -path '*fuse/fuse.h' | egrep --max-count=1 . \
 182         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
 183     echo -n 'gnutls.h: '
 184     find /usr/include -path '*gnutls/gnutls.h' | egrep --max-count=1 . \
 185         || fatal "No gnutls/gnutls.h. Try: apt-get install libgnutls28-dev"
 186     echo -n 'Python2 pyconfig.h: '
 187     find /usr/include -path '*/python2*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 188         || fatal "No Python2 pyconfig.h. Try: apt-get install python2.7-dev"
 189     echo -n 'Python3 pyconfig.h: '
 190     find /usr/include -path '*/python3*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 191         || fatal "No Python3 pyconfig.h. Try: apt-get install python3-dev"
 192     echo -n 'nginx: '
 193     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
 194         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
 195     echo -n 'perl: '
 196     perl -v | grep version \
 197         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
 198     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
 199         echo -n "perl $mod: "
 200         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
 201             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
 202     done
 203     echo -n 'gitolite: '
 204     which gitolite \
 205         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
 206 }
 207
 208 rotate_logfile() {
 209   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 210   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
 211   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
 212     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
 213     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 214     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 215   fi
 216 }
 217
 218 declare -a failures
 219 declare -A skip
 220 declare -A testargs
 221 skip[apps/workbench_profile]=1
 222
 223 while [[ -n "$1" ]]
 224 do
 225     arg="$1"; shift
 226     case "$arg" in
 227         --help)
 228             echo >&2 "$helpmessage"
 229             echo >&2
 230             exit 1
 231             ;;
 232         --skip)
 233             skip[$1]=1; shift
 234             ;;
 235         --only)
 236             only="$1"; skip[$1]=""; shift
 237             ;;
 238         --short)
 239             short=1
 240             ;;
 241         --skip-install)
 242             only_install=nothing
 243             ;;
 244         --only-install)
 245             only_install="$1"; shift
 246             ;;
 247         --temp)
 248             temp="$1"; shift
 249             temp_preserve=1
 250             ;;
 251         --leave-temp)
 252             temp_preserve=1
 253             ;;
 254         --repeat)
 255             repeat=$((${1}+0)); shift
 256             ;;
 257         --retry)
 258             retry=1
 259             ;;
 260         *_test=*)
 261             suite="${arg%%_test=*}"
 262             args="${arg#*=}"
 263             testargs["$suite"]="$args"
 264             ;;
 265         *=*)
 266             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
 267             ;;
 268         *)
 269             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
 270             exit 1
 271             ;;
 272     esac
 273 done
 274
 275 start_api() {
 276     echo 'Starting API server...'
 277     cd "$WORKSPACE" \
 278         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
 279         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
 280         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
 281         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 282         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
 283         && (env | egrep ^ARVADOS)
 284 }
 285
 286 start_nginx_proxy_services() {
 287     echo 'Starting keepproxy, keep-web, ws, arv-git-httpd, and nginx ssl proxy...'
 288     cd "$WORKSPACE" \
 289         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
 290         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
 291         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
 292         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 293         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
 294         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1
 295 }
 296
 297 stop_services() {
 298     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES" ]]; then
 299         unset ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
 300         cd "$WORKSPACE" \
 301             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 302             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
 303             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 304             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
 305             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy
 306     fi
 307     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
 308         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
 309         cd "$WORKSPACE" \
 310             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 311             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 312             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop
 313     fi
 314 }
 315
 316 interrupt() {
 317     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
 318     exit_cleanly
 319 }
 320 trap interrupt INT
 321
 322 sanity_checks
 323
 324 echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
 325
 326 if [[ -z "$CONFIGSRC" ]] && [[ -d "$HOME/arvados-api-server" ]]; then
 327     # Jenkins expects us to use this by default.
 328     CONFIGSRC="$HOME/arvados-api-server"
 329 fi
 330
 331 # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
 332 cd "$WORKSPACE"
 333 find -name '*.pyc' -delete
 334
 335 if [[ -z "$temp" ]]; then
 336     temp="$(mktemp -d)"
 337 fi
 338
 339 # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
 340 for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE
 341 do
 342     if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
 343         eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
 344     fi
 345     if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
 346         mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
 347     fi
 348 done
 349
 350 setup_ruby_environment() {
 351     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 352         source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
 353         using_rvm=true
 354     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 355         source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
 356         using_rvm=true
 357     else
 358         using_rvm=false
 359     fi
 360
 361     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 362         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
 363         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
 364         # the environment to the "current gemset", which would lose
 365         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
 366         # programs (for example, the Workbench test suite could not
 367         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
 368         # rvm gemset and use it for everything.
 369
 370         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
 371             || fatal 'rvm check'
 372
 373         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
 374         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
 375         # complaint about not being in first place already.
 376         rvm use @default 2>/dev/null
 377
 378         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
 379         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
 380         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
 381         # ruby to the caller.
 382         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
 383         rvm use "@${gemset}" --create \
 384             || fatal 'rvm gemset setup'
 385
 386         rvm env
 387     else
 388         # When our "bundle install"s need to install new gems to
 389         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
 390         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
 391         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
 392         # should be installed, and we should leave it alone.)
 393
 394         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
 395             user_gempath="$(gem env gempath)"
 396             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
 397         fi
 398         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
 399
 400         # When we build and install our own gems, we install them in our
 401         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
 402         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
 403         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
 404
 405         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
 406         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
 407         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home"
 408
 409         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
 410         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
 411         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
 412     fi
 413     bundle config || gem install bundler \
 414         || fatal 'install bundler'
 415 }
 416
 417 with_test_gemset() {
 418     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 419         "$@"
 420     else
 421         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
 422     fi
 423 }
 424
 425 gem_uninstall_if_exists() {
 426     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
 427         gem uninstall --force --all --executables "$1"
 428     fi
 429 }
 430
 431 setup_virtualenv() {
 432     local venvdest="$1"; shift
 433     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
 434         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
 435     fi
 436     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
 437         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
 438         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
 439     else
 440         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
 441     fi
 442     # ubuntu1404 can't seem to install mock via tests_require, but it can do this.
 443     "$venvdest/bin/pip" install 'mock>=1.0' 'pbr<1.7.0'
 444 }
 445
 446 export PERLINSTALLBASE
 447 export PERLLIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5:${PERLLIB:+$PERLLIB}"
 448
 449 export GOPATH
 450 mkdir -p "$GOPATH/src/git.curoverse.com"
 451 ln -sfT "$WORKSPACE" "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" \
 452     || fatal "symlink failed"
 453 go get -v github.com/kardianos/govendor \
 454     || fatal "govendor install failed"
 455
 456 setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
 457 . "$VENVDIR/bin/activate"
 458
 459 # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
 460 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^PyYAML= \
 461     || pip install PyYAML >/dev/null \
 462     || fatal "pip install PyYAML failed"
 463
 464 # Preinstall forked version of libcloud, because nodemanager "pip install"
 465 # won't pick it up by default.
 466 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
 467     || pip install --pre --ignore-installed https://github.com/curoverse/libcloud/archive/apache-libcloud-$LIBCLOUD_PIN.zip >/dev/null \
 468     || fatal "pip install apache-libcloud failed"
 469
 470 # Uninstall old llfuse (<1.0), because services/fuse "pip install"
 471 # won't upgrade it by default.
 472 if pip freeze | egrep '^llfuse==0'; then
 473     yes | pip uninstall 'llfuse<1.0'
 474 fi
 475
 476 # Deactivate Python 2 virtualenv
 477 deactivate
 478
 479 declare -a pythonstuff
 480 pythonstuff=(
 481     sdk/pam
 482     sdk/python
 483     sdk/python:py3
 484     sdk/cwl
 485     services/dockercleaner:py3
 486     services/fuse
 487     services/nodemanager
 488     tools/crunchstat-summary
 489     )
 490
 491 # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
 492 # Otherwise, skip dependent tests.
 493 PYTHON3=$(which python3)
 494 if [[ ${?} = 0 ]]; then
 495     setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
 496 else
 497     PYTHON3=
 498     cat >&2 <<EOF
 499
 500 Warning: python3 could not be found. Python 3 tests will be skipped.
 501
 502 EOF
 503 fi
 504
 505 # Reactivate Python 2 virtualenv
 506 . "$VENVDIR/bin/activate"
 507
 508 # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
 509 # whine a lot.
 510 setup_ruby_environment
 511
 512 echo "PATH is $PATH"
 513
 514 if ! which bundler >/dev/null
 515 then
 516     gem install --user-install bundler || fatal 'Could not install bundler'
 517 fi
 518
 519 retry() {
 520     remain="${repeat}"
 521     while :
 522     do
 523         if ${@}; then
 524             if [[ "$remain" -gt 1 ]]; then
 525                 remain=$((${remain}-1))
 526                 title "Repeating ${remain} more times"
 527             else
 528                 break
 529             fi
 530         elif [[ "$retry" == 1 ]]; then
 531             read -p 'Try again? [Y/n] ' x
 532             if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
 533             then
 534                 break
 535             fi
 536         else
 537             break
 538         fi
 539     done
 540 }
 541
 542 do_test() {
 543     case "${1}" in
 544         apps/workbench_units | apps/workbench_functionals | apps/workbench_integration)
 545             suite=apps/workbench
 546             ;;
 547         *)
 548             suite="${1}"
 549             ;;
 550     esac
 551     if [[ -z "${skip[$suite]}" && -z "${skip[$1]}" && \
 552                 (-z "${only}" || "${only}" == "${suite}" || \
 553                  "${only}" == "${1}") ]]; then
 554         retry do_test_once ${@}
 555     else
 556         title "Skipping ${1} tests"
 557     fi
 558 }
 559
 560 do_test_once() {
 561     unset result
 562
 563     title "Running $1 tests"
 564     timer_reset
 565     if [[ "$2" == "go" ]]
 566     then
 567         covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
 568         coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
 569         # We do "go get -t" here to catch compilation errors
 570         # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
 571         # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
 572         # compilation errors.
 573         go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 574             cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 575             [[ -z "$(gofmt -e -d . | tee /dev/stderr)" ]] && \
 576             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
 577         then
 578             # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
 579             # does:
 580             go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
 581         else
 582             # The above form gets verbose even when testargs is
 583             # empty, so use this form in such cases:
 584             go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 585         fi
 586         result=${result:-$?}
 587         if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
 588         then
 589             go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
 590             rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
 591         fi
 592     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 593     then
 594         tries=0
 595         cd "$WORKSPACE/$1" && while :
 596         do
 597             tries=$((${tries}+1))
 598             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 599             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 600             "${3}python" setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
 601             result=$?
 602             if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
 603             then
 604                 printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
 605                 continue
 606             else
 607                 break
 608             fi
 609         done
 610     elif [[ "$2" != "" ]]
 611     then
 612         "test_$2"
 613     else
 614         "test_$1"
 615     fi
 616     result=${result:-$?}
 617     checkexit $result "$1 tests"
 618     title "End of $1 tests (`timer`)"
 619     return $result
 620 }
 621
 622 do_install() {
 623     if [[ -z "${only_install}" || "${only_install}" == "${1}" ]]; then
 624         retry do_install_once ${@}
 625     else
 626         title "Skipping $1 install"
 627     fi
 628 }
 629
 630 do_install_once() {
 631     title "Running $1 install"
 632     timer_reset
 633     if [[ "$2" == "go" ]]
 634     then
 635         go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 636     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 637     then
 638         # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 639         # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 640
 641         # Need to change to a different directory after creating
 642         # the source dist package to avoid a pip bug.
 643         # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
 644
 645         # Also need to install twice, because if it believes the package is
 646         # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
 647         # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
 648         # install" ensures that we've actually installed the local package
 649         # we just built.
 650         cd "$WORKSPACE/$1" \
 651             && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
 652             && cd "$WORKSPACE" \
 653             && "${3}pip" install --quiet "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
 654             && "${3}pip" install --quiet --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
 655     elif [[ "$2" != "" ]]
 656     then
 657         "install_$2"
 658     else
 659         "install_$1"
 660     fi
 661     result=$?
 662     checkexit $result "$1 install"
 663     title "End of $1 install (`timer`)"
 664     return $result
 665 }
 666
 667 bundle_install_trylocal() {
 668     (
 669         set -e
 670         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
 671         if ! bundle install --local --no-deployment; then
 672             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
 673             bundle install --no-deployment
 674         fi
 675         bundle package --all
 676     )
 677 }
 678
 679 install_doc() {
 680     cd "$WORKSPACE/doc" \
 681         && bundle_install_trylocal \
 682         && rm -rf .site
 683 }
 684 do_install doc
 685
 686 install_gem() {
 687     gemname=$1
 688     srcpath=$2
 689     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
 690         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
 691         && bundle_install_trylocal \
 692         && gem build "$gemname.gemspec" \
 693         && with_test_gemset gem install --no-ri --no-rdoc $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
 694 }
 695
 696 install_ruby_sdk() {
 697     install_gem arvados sdk/ruby
 698 }
 699 do_install sdk/ruby ruby_sdk
 700
 701 install_perl_sdk() {
 702     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
 703         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
 704         && make install INSTALLDIRS=perl
 705 }
 706 do_install sdk/perl perl_sdk
 707
 708 install_cli() {
 709     install_gem arvados-cli sdk/cli
 710 }
 711 do_install sdk/cli cli
 712
 713 install_login-sync() {
 714     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
 715 }
 716 do_install services/login-sync login-sync
 717
 718 # Install the Python SDK early. Various other test suites (like
 719 # keepproxy) bring up run_test_server.py, which imports the arvados
 720 # module. We can't actually *test* the Python SDK yet though, because
 721 # its own test suite brings up some of those other programs (like
 722 # keepproxy).
 723 for p in "${pythonstuff[@]}"
 724 do
 725     dir=${p%:py3}
 726     if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
 727         if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
 728             do_install ${dir} pip
 729         fi
 730     elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
 731         if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
 732             do_install ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
 733         fi
 734     fi
 735 done
 736
 737 install_apiserver() {
 738     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 739         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 740
 741     rm -f config/environments/test.rb
 742     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
 743
 744     if [ -n "$CONFIGSRC" ]
 745     then
 746         for f in database.yml
 747         do
 748             cp "$CONFIGSRC/$f" config/ || fatal "$f"
 749         done
 750     fi
 751
 752     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
 753     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
 754     # is a postgresql superuser.
 755     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 756         && test_database=$(python -c "import yaml; print yaml.load(file('config/database.yml'))['test']['database']") \
 757         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.procpid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
 758
 759     mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/tmp/pids"
 760
 761     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 762         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:drop \
 763         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:setup \
 764         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:fixtures:load
 765 }
 766 do_install services/api apiserver
 767
 768 cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" && \
 769     "$GOPATH/bin/govendor" sync -v || \
 770         fatal "govendor sync failed"
 771 declare -a gostuff
 772 gostuff=(
 773     sdk/go/arvados
 774     sdk/go/arvadosclient
 775     sdk/go/blockdigest
 776     sdk/go/dispatch
 777     sdk/go/httpserver
 778     sdk/go/manifest
 779     sdk/go/streamer
 780     sdk/go/crunchrunner
 781     sdk/go/stats
 782     lib/crunchstat
 783     services/arv-git-httpd
 784     services/crunchstat
 785     services/keep-web
 786     services/keepstore
 787     sdk/go/keepclient
 788     services/keep-balance
 789     services/keepproxy
 790     services/crunch-dispatch-local
 791     services/crunch-dispatch-slurm
 792     services/crunch-run
 793     services/ws
 794     tools/keep-block-check
 795     tools/keep-exercise
 796     tools/keep-rsync
 797 )
 798 for g in "${gostuff[@]}"
 799 do
 800     do_install "$g" go
 801 done
 802
 803 install_workbench() {
 804     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 805         && mkdir -p tmp/cache \
 806         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 807 }
 808 do_install apps/workbench workbench
 809
 810 unset http_proxy https_proxy no_proxy
 811
 812 test_doclinkchecker() {
 813     (
 814         set -e
 815         cd "$WORKSPACE/doc"
 816         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
 817         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
 818         # do much good!
 819         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ bundle exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
 820     )
 821 }
 822 do_test doc doclinkchecker
 823
 824 stop_services
 825
 826 test_apiserver() {
 827     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
 828     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 829         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/api]}
 830 }
 831 do_test services/api apiserver
 832
 833 # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
 834 # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
 835 if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
 836   rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 837   exit_cleanly
 838 fi
 839
 840 start_api || { stop_services; fatal "start_api"; }
 841
 842 test_ruby_sdk() {
 843     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
 844         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
 845 }
 846 do_test sdk/ruby ruby_sdk
 847
 848 test_cli() {
 849     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
 850         && mkdir -p /tmp/keep \
 851         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
 852 }
 853 do_test sdk/cli cli
 854
 855 test_login-sync() {
 856     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
 857         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
 858 }
 859 do_test services/login-sync login-sync
 860
 861 test_nodemanager-integration() {
 862     cd "$WORKSPACE/services/nodemanager" \
 863         && tests/integration_test.py ${testargs[services/nodemanager-integration]}
 864 }
 865 do_test services/nodemanager-integration nodemanager-integration
 866
 867 for p in "${pythonstuff[@]}"
 868 do
 869     dir=${p%:py3}
 870     if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
 871         if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
 872             do_test ${dir} pip
 873         fi
 874     elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
 875         if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
 876             do_test ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
 877         fi
 878     fi
 879 done
 880
 881 for g in "${gostuff[@]}"
 882 do
 883     do_test "$g" go
 884 done
 885
 886 test_workbench_units() {
 887     start_nginx_proxy_services \
 888         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 889         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:units TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 890 }
 891 do_test apps/workbench_units workbench_units
 892
 893 test_workbench_functionals() {
 894     start_nginx_proxy_services \
 895         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 896         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:functionals TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 897 }
 898 do_test apps/workbench_functionals workbench_functionals
 899
 900 test_workbench_integration() {
 901     start_nginx_proxy_services \
 902         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 903         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:integration TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 904 }
 905 do_test apps/workbench_integration workbench_integration
 906
 907
 908 test_workbench_benchmark() {
 909     start_nginx_proxy_services \
 910         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 911         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:benchmark ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
 912 }
 913 do_test apps/workbench_benchmark workbench_benchmark
 914
 915 test_workbench_profile() {
 916     start_nginx_proxy_services \
 917         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 918         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:profile ${testargs[apps/workbench_profile]}
 919 }
 920 do_test apps/workbench_profile workbench_profile
 921
 922 exit_cleanly