sdk/R/man/ArvadosFile.Rd

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   3 \name{ArvadosFile}
   4 \alias{ArvadosFile}
   5 \title{ArvadosFile}
   6 \description{
   7 ArvadosFile class represents a file inside Arvados collection.
   8 }
   9 \section{Usage}{
  10
  11 \preformatted{file = ArvadosFile$new(name)}
  12 }
  13
  14 \section{Arguments}{
  15
  16 \describe{
  17   \item{name}{Name of the file.}
  18 }
  19 }
  20
  21 \section{Methods}{
  22
  23 \describe{
  24   \item{getName()}{Returns name of the file.}
  25   \item{getRelativePath()}{Returns file path relative to the root.}
  26   \item{read(contentType = "raw", offset = 0, length = 0)}{Read file content.}
  27   \item{write(content, contentType = "text/html")}{Write to file (override current content of the file).}
  28   \item{connection(rw)}{Get connection opened in "read" or "write" mode.}
  29   \item{flush()}{Write connections content to a file (override current content of the file).}
  30   \item{remove(name)}{Removes ArvadosFile or Subcollection specified by name from the subcollection.}
  31   \item{getSizeInBytes()}{Returns file size in bytes.}
  32   \item{move(destination)}{Moves file to a new location inside collection.}
  33   \item{copy(destination)}{Copies file to a new location inside collection.}
  34 }
  35 }
  36
  37 \examples{
  38 \dontrun{
  39 myFile <- ArvadosFile$new("myFile")
  40
  41 myFile$write("This is new file content")
  42 fileContent <- myFile$read()
  43 fileContent <- myFile$read("text")
  44 fileContent <- myFile$read("raw", offset = 8, length = 4)
  45
  46 #Write a table:
  47 arvConnection <- myFile$connection("w")
  48 write.table(mytable, arvConnection)
  49 arvadosFile$flush()
  50
  51 #Read a table:
  52 arvConnection <- myFile$connection("r")
  53 mytable <- read.table(arvConnection)
  54
  55 myFile$move("newFolder/myFile")
  56 myFile$copy("newFolder/myFile")
  57 }
  58 }