build/run-tests.sh

   1 #!/bin/bash
   2 # Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
   3 #
   4 # SPDX-License-Identifier: AGPL-3.0
   5
   6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin.sh
   7
   8 COLUMNS=80
   9 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
  10
  11 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
  12 $(basename $0): Install and test Arvados components.
  13
  14 Exit non-zero if any tests fail.
  15
  16 Syntax:
  17         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
  18
  19 Options:
  20
  21 --skip FOO     Do not test the FOO component.
  22 --skip sanity  Skip initial dev environment sanity checks.
  23 --skip install Do not run any install steps. Just run tests.
  24                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
  25                from a previous invocation if you use this option.
  26 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
  27 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
  28                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
  29 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
  30                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
  31                subsequent invocations.
  32 --repeat N     Repeat each install/test step until it succeeds N times.
  33 --retry        Prompt to retry if an install or test suite fails.
  34 --only-install Run specific install step
  35 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
  36 --interactive  Set up, then prompt for test/install steps to perform.
  37 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
  38 CONFIGSRC=path Dir with api server config files to copy into source tree.
  39                (If none given, leave config files alone in source tree.)
  40 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
  41                Restrict apiserver tests to the given file
  42 sdk/python_test="--test-suite tests.test_keep_locator"
  43                Restrict Python SDK tests to the given class
  44 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
  45                Restrict Workbench tests to the given file
  46 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
  47                Show all log messages, even when tests pass (also works
  48                with services/keepstore_test etc.)
  49 ARVADOS_DEBUG=1
  50                Print more debug messages
  51 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
  52                *_test, and other examples shown above.
  53
  54 Assuming "--skip install" is not given, all components are installed
  55 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
  56 test suites depend on other components being installed, and installing
  57 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
  58
  59 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
  60 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
  61
  62 More information and background:
  63
  64 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
  65
  66 Available tests:
  67
  68 apps/workbench (*)
  69 apps/workbench_units (*)
  70 apps/workbench_functionals (*)
  71 apps/workbench_integration (*)
  72 apps/workbench_benchmark
  73 apps/workbench_profile
  74 cmd/arvados-client
  75 cmd/arvados-server
  76 doc
  77 lib/cli
  78 lib/cmd
  79 lib/controller
  80 lib/controller/federation
  81 lib/controller/railsproxy
  82 lib/controller/router
  83 lib/controller/rpc
  84 lib/crunchstat
  85 lib/cloud
  86 lib/cloud/azure
  87 lib/cloud/cloudtest
  88 lib/dispatchcloud
  89 lib/dispatchcloud/container
  90 lib/dispatchcloud/scheduler
  91 lib/dispatchcloud/ssh_executor
  92 lib/dispatchcloud/worker
  93 lib/service
  94 services/api
  95 services/arv-git-httpd
  96 services/crunchstat
  97 services/dockercleaner
  98 services/fuse
  99 services/fuse:py3
 100 services/health
 101 services/keep-web
 102 services/keepproxy
 103 services/keepstore
 104 services/keep-balance
 105 services/login-sync
 106 services/nodemanager
 107 services/nodemanager_integration
 108 services/crunch-run
 109 services/crunch-dispatch-local
 110 services/crunch-dispatch-slurm
 111 services/ws
 112 sdk/cli
 113 sdk/pam
 114 sdk/pam:py3
 115 sdk/python
 116 sdk/python:py3
 117 sdk/ruby
 118 sdk/go/arvados
 119 sdk/go/arvadosclient
 120 sdk/go/auth
 121 sdk/go/dispatch
 122 sdk/go/keepclient
 123 sdk/go/health
 124 sdk/go/httpserver
 125 sdk/go/manifest
 126 sdk/go/blockdigest
 127 sdk/go/asyncbuf
 128 sdk/go/stats
 129 sdk/go/crunchrunner
 130 sdk/cwl
 131 sdk/R
 132 sdk/java-v2
 133 tools/sync-groups
 134 tools/crunchstat-summary
 135 tools/crunchstat-summary:py3
 136 tools/keep-exercise
 137 tools/keep-rsync
 138 tools/keep-block-check
 139
 140 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
 141     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
 142
 143 EOF
 144
 145 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
 146 # environment that could interfere with the tests.
 147 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
 148
 149 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
 150 # accident.
 151 GITDIR=
 152 GOPATH=
 153 VENVDIR=
 154 VENV3DIR=
 155 PYTHONPATH=
 156 GEMHOME=
 157 PERLINSTALLBASE=
 158 R_LIBS=
 159 export LANG=en_US.UTF-8
 160
 161 short=
 162 only_install=
 163 temp=
 164 temp_preserve=
 165
 166 clear_temp() {
 167     if [[ -z "$temp" ]]; then
 168         # we didn't even get as far as making a temp dir
 169         :
 170     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
 171         rm -rf "$temp"
 172     else
 173         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
 174     fi
 175 }
 176
 177 fatal() {
 178     clear_temp
 179     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
 180     exit 1
 181 }
 182
 183 exit_cleanly() {
 184     trap - INT
 185     if which create-plot-data-from-log.sh >/dev/null; then
 186         create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
 187     fi
 188     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 189     stop_services
 190     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 191     report_outcomes
 192     clear_temp
 193     exit ${#failures}
 194 }
 195
 196 sanity_checks() {
 197     [[ -n "${skip[sanity]}" ]] && return 0
 198     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
 199         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
 200     echo Checking dependencies:
 201     echo "locale: ${LANG}"
 202     [[ "$(locale charmap)" = "UTF-8" ]] \
 203         || fatal "Locale '${LANG}' is broken/missing. Try: echo ${LANG} | sudo tee -a /etc/locale.gen && sudo locale-gen"
 204     echo -n 'virtualenv: '
 205     virtualenv --version \
 206         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
 207     echo -n 'ruby: '
 208     ruby -v \
 209         || fatal "No ruby. Install >=2.1.9 (using rbenv, rvm, or source)"
 210     echo -n 'go: '
 211     go version \
 212         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
 213     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 12 ]] \
 214         || fatal "Go >= 1.12 required. See http://golang.org/doc/install"
 215     echo -n 'gcc: '
 216     gcc --version | egrep ^gcc \
 217         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
 218     echo -n 'fuse.h: '
 219     find /usr/include -path '*fuse/fuse.h' | egrep --max-count=1 . \
 220         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
 221     echo -n 'gnutls.h: '
 222     find /usr/include -path '*gnutls/gnutls.h' | egrep --max-count=1 . \
 223         || fatal "No gnutls/gnutls.h. Try: apt-get install libgnutls28-dev"
 224     echo -n 'Python2 pyconfig.h: '
 225     find /usr/include -path '*/python2*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 226         || fatal "No Python2 pyconfig.h. Try: apt-get install python2.7-dev"
 227     echo -n 'Python3 pyconfig.h: '
 228     find /usr/include -path '*/python3*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 229         || fatal "No Python3 pyconfig.h. Try: apt-get install python3-dev"
 230     which netstat \
 231         || fatal "No netstat. Try: apt-get install net-tools"
 232     echo -n 'nginx: '
 233     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
 234         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
 235     echo -n 'perl: '
 236     perl -v | grep version \
 237         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
 238     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
 239         echo -n "perl $mod: "
 240         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
 241             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
 242     done
 243     echo -n 'gitolite: '
 244     which gitolite \
 245         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
 246     echo -n 'npm: '
 247     npm --version \
 248         || fatal "No npm. Try: wget -O- https://nodejs.org/dist/v6.11.2/node-v6.11.2-linux-x64.tar.xz | sudo tar -C /usr/local -xJf - && sudo ln -s ../node-v6.11.2-linux-x64/bin/{node,npm} /usr/local/bin/"
 249     echo -n 'cadaver: '
 250     cadaver --version | grep -w cadaver \
 251           || fatal "No cadaver. Try: apt-get install cadaver"
 252     echo -n 'libattr1 xattr.h: '
 253     find /usr/include -path '*/attr/xattr.h' | egrep --max-count=1 . \
 254         || fatal "No libattr1 xattr.h. Try: apt-get install libattr1-dev"
 255     echo -n 'libcurl curl.h: '
 256     find /usr/include -path '*/curl/curl.h' | egrep --max-count=1 . \
 257         || fatal "No libcurl curl.h. Try: apt-get install libcurl4-gnutls-dev"
 258     echo -n 'libpq libpq-fe.h: '
 259     find /usr/include -path '*/postgresql/libpq-fe.h' | egrep --max-count=1 . \
 260         || fatal "No libpq libpq-fe.h. Try: apt-get install libpq-dev"
 261     echo -n 'postgresql: '
 262     psql --version || fatal "No postgresql. Try: apt-get install postgresql postgresql-client-common"
 263     echo -n 'phantomjs: '
 264     phantomjs --version || fatal "No phantomjs. Try: apt-get install phantomjs"
 265     echo -n 'xvfb: '
 266     which Xvfb || fatal "No xvfb. Try: apt-get install xvfb"
 267     echo -n 'graphviz: '
 268     dot -V || fatal "No graphviz. Try: apt-get install graphviz"
 269     echo -n 'geckodriver: '
 270     geckodriver --version | grep ^geckodriver || echo "No geckodriver. Try: wget -O- https://github.com/mozilla/geckodriver/releases/download/v0.23.0/geckodriver-v0.23.0-linux64.tar.gz | sudo tar -C /usr/local/bin -xzf - geckodriver"
 271
 272     if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
 273       # R SDK stuff
 274       echo -n 'R: '
 275       which Rscript || fatal "No Rscript. Try: apt-get install r-base"
 276       echo -n 'testthat: '
 277       Rscript -e "library('testthat')" || fatal "No testthat. Try: apt-get install r-cran-testthat"
 278       # needed for roxygen2, needed for devtools, needed for R sdk
 279       pkg-config --exists libxml-2.0 || fatal "No libxml2. Try: apt-get install libxml2-dev"
 280       # needed for pkgdown, builds R SDK doc pages
 281       which pandoc || fatal "No pandoc. Try: apt-get install pandoc"
 282     fi
 283 }
 284
 285 rotate_logfile() {
 286   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 287   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
 288   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
 289     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
 290     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 291     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 292   fi
 293 }
 294
 295 declare -a failures
 296 declare -A skip
 297 declare -A only
 298 declare -A testargs
 299 skip[apps/workbench_profile]=1
 300 # nodemanager_integration tests are not reliable, see #12061.
 301 skip[services/nodemanager_integration]=1
 302
 303 while [[ -n "$1" ]]
 304 do
 305     arg="$1"; shift
 306     case "$arg" in
 307         --help)
 308             echo >&2 "$helpmessage"
 309             echo >&2
 310             exit 1
 311             ;;
 312         --skip)
 313             skip[$1]=1; shift
 314             ;;
 315         --only)
 316             only[$1]=1; skip[$1]=""; shift
 317             ;;
 318         --short)
 319             short=1
 320             ;;
 321         --interactive)
 322             interactive=1
 323             ;;
 324         --skip-install)
 325             skip[install]=1
 326             ;;
 327         --only-install)
 328             only_install="$1"; shift
 329             ;;
 330         --temp)
 331             temp="$1"; shift
 332             temp_preserve=1
 333             ;;
 334         --leave-temp)
 335             temp_preserve=1
 336             ;;
 337         --repeat)
 338             repeat=$((${1}+0)); shift
 339             ;;
 340         --retry)
 341             retry=1
 342             ;;
 343         *_test=*)
 344             suite="${arg%%_test=*}"
 345             args="${arg#*=}"
 346             testargs["$suite"]="$args"
 347             ;;
 348         *=*)
 349             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
 350             ;;
 351         *)
 352             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
 353             exit 1
 354             ;;
 355     esac
 356 done
 357
 358 # R SDK installation is very slow (~360s in a clean environment) and only
 359 # required when testing it. Skip that step if it is not needed.
 360 NEED_SDK_R=true
 361
 362 if [[ ${#only[@]} -ne 0 ]] &&
 363    [[ -z "${only['sdk/R']}" && -z "${only['doc']}" ]]; then
 364   NEED_SDK_R=false
 365 fi
 366
 367 if [[ ${skip["sdk/R"]} == 1 && ${skip["doc"]} == 1 ]]; then
 368   NEED_SDK_R=false
 369 fi
 370
 371 if [[ $NEED_SDK_R == false ]]; then
 372         echo "R SDK not needed, it will not be installed."
 373 fi
 374
 375 checkpidfile() {
 376     svc="$1"
 377     pid="$(cat "$WORKSPACE/tmp/${svc}.pid")"
 378     if [[ -z "$pid" ]] || ! kill -0 "$pid"; then
 379         tail $WORKSPACE/tmp/${1}*.log
 380         echo "${svc} pid ${pid} not running"
 381         return 1
 382     fi
 383     echo "${svc} pid ${pid} ok"
 384 }
 385
 386 checkhealth() {
 387     svc="$1"
 388     port="$(cat "$WORKSPACE/tmp/${svc}.port")"
 389     scheme=http
 390     if [[ ${svc} =~ -ssl$ || ${svc} = wss ]]; then
 391         scheme=https
 392     fi
 393     url="$scheme://localhost:${port}/_health/ping"
 394     if ! curl -Ss -H "Authorization: Bearer e687950a23c3a9bceec28c6223a06c79" "${url}" | tee -a /dev/stderr | grep '"OK"'; then
 395         echo "${url} failed"
 396         return 1
 397     fi
 398 }
 399
 400 checkdiscoverydoc() {
 401     dd="https://${1}/discovery/v1/apis/arvados/v1/rest"
 402     if ! (set -o pipefail; curl -fsk "$dd" | grep -q ^{ ); then
 403         echo >&2 "ERROR: could not retrieve discovery doc from RailsAPI at $dd"
 404         tail -v $WORKSPACE/services/api/log/test.log
 405         return 1
 406     fi
 407     echo "${dd} ok"
 408 }
 409
 410 start_services() {
 411     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
 412         return 0
 413     fi
 414     . "$VENVDIR/bin/activate"
 415     echo 'Starting API, controller, keepproxy, keep-web, arv-git-httpd, ws, and nginx ssl proxy...'
 416     if [[ ! -d "$WORKSPACE/services/api/log" ]]; then
 417         mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/log"
 418     fi
 419     # Remove empty api.pid file if it exists
 420     if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/api.pid" && ! -s "$WORKSPACE/tmp/api.pid" ]]; then
 421         rm -f "$WORKSPACE/tmp/api.pid"
 422     fi
 423     all_services_stopped=
 424     fail=1
 425     cd "$WORKSPACE" \
 426         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
 427         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
 428         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
 429         && checkpidfile api \
 430         && checkdiscoverydoc $ARVADOS_API_HOST \
 431         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_controller \
 432         && checkpidfile controller \
 433         && checkhealth controller \
 434         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
 435         && checkpidfile keepproxy \
 436         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
 437         && checkpidfile keep-web \
 438         && checkhealth keep-web \
 439         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
 440         && checkpidfile arv-git-httpd \
 441         && checkhealth arv-git-httpd \
 442         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 443         && checkpidfile ws \
 444         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx) \
 445         && checkdiscoverydoc $ARVADOS_API_HOST \
 446         && checkpidfile nginx \
 447         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1 \
 448         && (env | egrep ^ARVADOS) \
 449         && fail=0
 450     deactivate
 451     if [[ $fail != 0 ]]; then
 452         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
 453     fi
 454     return $fail
 455 }
 456
 457 stop_services() {
 458     if [[ -n "$all_services_stopped" ]]; then
 459         return
 460     fi
 461     unset ARVADOS_TEST_API_HOST ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
 462     . "$VENVDIR/bin/activate" || return
 463     cd "$WORKSPACE" \
 464         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 465         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
 466         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 467         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
 468         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy \
 469         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_controller \
 470         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop \
 471         && all_services_stopped=1
 472     deactivate
 473 }
 474
 475 interrupt() {
 476     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
 477     exit_cleanly
 478 }
 479 trap interrupt INT
 480
 481 setup_ruby_environment() {
 482     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 483         source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
 484         using_rvm=true
 485     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 486         source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
 487         using_rvm=true
 488     else
 489         using_rvm=false
 490     fi
 491
 492     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 493         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
 494         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
 495         # the environment to the "current gemset", which would lose
 496         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
 497         # programs (for example, the Workbench test suite could not
 498         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
 499         # rvm gemset and use it for everything.
 500
 501         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
 502             || fatal 'rvm check'
 503
 504         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
 505         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
 506         # complaint about not being in first place already.
 507         rvm use @default 2>/dev/null
 508
 509         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
 510         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
 511         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
 512         # ruby to the caller.
 513         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
 514         rvm use "@${gemset}" --create \
 515             || fatal 'rvm gemset setup'
 516
 517         rvm env
 518     else
 519         # When our "bundle install"s need to install new gems to
 520         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
 521         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
 522         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
 523         # should be installed, and we should leave it alone.)
 524
 525         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
 526             user_gempath="$(gem env gempath)"
 527             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
 528         fi
 529         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
 530
 531         # When we build and install our own gems, we install them in our
 532         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
 533         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
 534         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
 535
 536         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
 537         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
 538         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home"
 539
 540         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
 541         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
 542         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
 543     fi
 544     bundle config || gem install bundler \
 545         || fatal 'install bundler'
 546 }
 547
 548 with_test_gemset() {
 549     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 550         "$@"
 551     else
 552         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
 553     fi
 554 }
 555
 556 gem_uninstall_if_exists() {
 557     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
 558         gem uninstall --force --all --executables "$1"
 559     fi
 560 }
 561
 562 setup_virtualenv() {
 563     local venvdest="$1"; shift
 564     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
 565         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
 566     elif [[ -n "$short" ]]; then
 567         return
 568     fi
 569     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
 570         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
 571         "$venvdest/bin/pip" install --no-cache-dir 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
 572     else
 573         "$venvdest/bin/pip" install --no-cache-dir 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
 574     fi
 575 }
 576
 577 initialize() {
 578     sanity_checks
 579
 580     echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
 581
 582     if [[ -z "$CONFIGSRC" ]] && [[ -d "$HOME/arvados-api-server" ]]; then
 583         # Jenkins expects us to use this by default.
 584         CONFIGSRC="$HOME/arvados-api-server"
 585     fi
 586
 587     # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
 588     cd "$WORKSPACE"
 589     find -name '*.pyc' -delete
 590
 591     if [[ -z "$temp" ]]; then
 592         temp="$(mktemp -d)"
 593     fi
 594
 595     # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
 596     for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE R_LIBS
 597     do
 598         if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
 599             eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
 600         fi
 601         if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
 602             mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
 603         fi
 604     done
 605
 606     rm -vf "${WORKSPACE}/tmp/*.log"
 607
 608     export PERLINSTALLBASE
 609     export PERL5LIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5${PERL5LIB:+:$PERL5LIB}"
 610
 611     export R_LIBS
 612
 613     export GOPATH
 614     # Make sure our compiled binaries under test override anything
 615     # else that might be in the environment.
 616     export PATH=$GOPATH/bin:$PATH
 617
 618     # Jenkins config requires that glob tmp/*.log match something. Ensure
 619     # that happens even if we don't end up running services that set up
 620     # logging.
 621     mkdir -p "${WORKSPACE}/tmp/" || fatal "could not mkdir ${WORKSPACE}/tmp"
 622     touch "${WORKSPACE}/tmp/controller.log" || fatal "could not touch ${WORKSPACE}/tmp/controller.log"
 623
 624     unset http_proxy https_proxy no_proxy
 625
 626     # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
 627     # whine a lot.
 628     setup_ruby_environment
 629
 630     if [[ -s "$CONFIGSRC/config.yml" ]] ; then
 631         cp "$CONFIGSRC/config.yml" "$temp/test-config.yml"
 632         export ARVADOS_CONFIG="$temp/test-config.yml"
 633     else
 634         if [[ -s /etc/arvados/config.yml ]] ; then
 635             python > "$temp/test-config.yml" <<EOF
 636 import yaml
 637 import json
 638 v = list(yaml.safe_load(open('/etc/arvados/config.yml'))['Clusters'].values())[0]['PostgreSQL']
 639 v['Connection']['dbname'] = 'arvados_test'
 640 print(json.dumps({"Clusters": { "zzzzz": {'PostgreSQL': v}}}))
 641 EOF
 642             export ARVADOS_CONFIG="$temp/test-config.yml"
 643         else
 644             if [[ ! -f "$WORKSPACE/services/api/config/database.yml" ]]; then
 645                 fatal "Please provide a database.yml file for the test suite"
 646             fi
 647         fi
 648     fi
 649
 650     echo "PATH is $PATH"
 651 }
 652
 653 install_env() {
 654     (
 655         set -e
 656         mkdir -p "$GOPATH/src/git.curoverse.com"
 657         if [[ ! -h "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" ]]; then
 658             for d in \
 659                 "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/tmp/GOPATH" \
 660                     "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/tmp" \
 661                     "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"; do
 662                 [[ -d "$d" ]] && rmdir "$d"
 663             done
 664         fi
 665         for d in \
 666             "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/arvados" \
 667                 "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"; do
 668             [[ -h "$d" ]] && rm "$d"
 669         done
 670         ln -vsfT "$WORKSPACE" "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"
 671         go get -v github.com/kardianos/govendor
 672         cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"
 673         go get -v -d ...
 674         "$GOPATH/bin/govendor" sync
 675     ) || fatal "Go setup failed"
 676
 677     setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
 678     . "$VENVDIR/bin/activate"
 679
 680     # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
 681     pip install --no-cache-dir PyYAML \
 682         || fatal "pip install PyYAML failed"
 683
 684     # Preinstall libcloud if using a fork; otherwise nodemanager "pip
 685     # install" won't pick it up by default.
 686     if [[ -n "$LIBCLOUD_PIN_SRC" ]]; then
 687         pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
 688             || pip install --pre --ignore-installed --no-cache-dir "$LIBCLOUD_PIN_SRC" >/dev/null \
 689             || fatal "pip install apache-libcloud failed"
 690     fi
 691
 692     # Deactivate Python 2 virtualenv
 693     deactivate
 694
 695     # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
 696     # Otherwise, skip dependent tests.
 697     PYTHON3=$(which python3)
 698     if [[ ${?} = 0 ]]; then
 699         setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
 700     else
 701         PYTHON3=
 702         cat >&2 <<EOF
 703
 704 Warning: python3 could not be found. Python 3 tests will be skipped.
 705
 706 EOF
 707     fi
 708
 709     if ! which bundler >/dev/null
 710     then
 711         gem install --user-install bundler || fatal 'Could not install bundler'
 712     fi
 713 }
 714
 715 retry() {
 716     remain="${repeat}"
 717     while :
 718     do
 719         if ${@}; then
 720             if [[ "$remain" -gt 1 ]]; then
 721                 remain=$((${remain}-1))
 722                 title "(repeating ${remain} more times)"
 723             else
 724                 break
 725             fi
 726         elif [[ "$retry" == 1 ]]; then
 727             read -p 'Try again? [Y/n] ' x
 728             if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
 729             then
 730                 break
 731             fi
 732         else
 733             break
 734         fi
 735     done
 736 }
 737
 738 do_test() {
 739     case "${1}" in
 740         apps/workbench_units | apps/workbench_functionals | apps/workbench_integration)
 741             suite=apps/workbench
 742             ;;
 743         services/nodemanager | services/nodemanager_integration)
 744             suite=services/nodemanager_suite
 745             ;;
 746         *)
 747             suite="${1}"
 748             ;;
 749     esac
 750     if [[ -n "${skip[$suite]}" || \
 751               -n "${skip[$1]}" || \
 752               (${#only[@]} -ne 0 && ${only[$suite]} -eq 0 && ${only[$1]} -eq 0) ]]; then
 753         return 0
 754     fi
 755     case "${1}" in
 756         services/api)
 757             stop_services
 758             ;;
 759         gofmt | govendor | doc | lib/cli | lib/cloud/azure | lib/cloud/ec2 | lib/cloud/cloudtest | lib/cmd | lib/dispatchcloud/ssh_executor | lib/dispatchcloud/worker)
 760             # don't care whether services are running
 761             ;;
 762         *)
 763             if ! start_services; then
 764                 title "test $1 -- failed to start services"
 765                 return 1
 766             fi
 767             ;;
 768     esac
 769     retry do_test_once ${@}
 770 }
 771
 772 do_test_once() {
 773     unset result
 774
 775     title "test $1"
 776     timer_reset
 777
 778     result=
 779     if which deactivate >/dev/null; then deactivate; fi
 780     if ! . "$VENVDIR/bin/activate"
 781     then
 782         result=1
 783     elif [[ "$2" == "go" ]]
 784     then
 785         covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
 786         coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
 787         # We do "go get -t" here to catch compilation errors
 788         # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
 789         # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
 790         # compilation errors.
 791         go get -ldflags "-X git.curoverse.com/arvados.git/lib/cmd.version=${ARVADOS_VERSION:-$(git log -n1 --format=%H)-dev}" -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 792             cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 793             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
 794         then
 795             # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
 796             # does:
 797             go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
 798         else
 799             # The above form gets verbose even when testargs is
 800             # empty, so use this form in such cases:
 801             go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 802         fi
 803         result=${result:-$?}
 804         if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
 805         then
 806             go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
 807             rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
 808         fi
 809         [[ $result = 0 ]] && gofmt -e -d *.go
 810     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 811     then
 812         tries=0
 813         cd "$WORKSPACE/$1" && while :
 814         do
 815             tries=$((${tries}+1))
 816             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 817             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 818             if [[ -e "${3}activate" ]]; then
 819                 . "${3}activate"
 820             fi
 821             python setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
 822             result=$?
 823             if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
 824             then
 825                 printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
 826                 continue
 827             else
 828                 break
 829             fi
 830         done
 831     elif [[ "$2" != "" ]]
 832     then
 833         "test_$2"
 834     else
 835         "test_$1"
 836     fi
 837     result=${result:-$?}
 838     checkexit $result "$1 tests"
 839     title "test $1 -- `timer`"
 840     return $result
 841 }
 842
 843 do_install() {
 844     if [[ -n "${skip[install]}" || ( -n "${only_install}" && "${only_install}" != "${1}" && "${only_install}" != "${2}" ) ]]; then
 845         return 0
 846     fi
 847     retry do_install_once ${@}
 848 }
 849
 850 do_install_once() {
 851     title "install $1"
 852     timer_reset
 853
 854     result=
 855     if which deactivate >/dev/null; then deactivate; fi
 856     if [[ "$1" != "env" ]] && ! . "$VENVDIR/bin/activate"; then
 857         result=1
 858     elif [[ "$2" == "go" ]]
 859     then
 860         go get -ldflags "-X git.curoverse.com/arvados.git/lib/cmd.version=${ARVADOS_VERSION:-$(git log -n1 --format=%H)-dev}" -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 861     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 862     then
 863         # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 864         # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 865
 866         # Need to change to a different directory after creating
 867         # the source dist package to avoid a pip bug.
 868         # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
 869
 870         # Also need to install twice, because if it believes the package is
 871         # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
 872         # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
 873         # install" ensures that we've actually installed the local package
 874         # we just built.
 875         cd "$WORKSPACE/$1" \
 876             && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
 877             && cd "$WORKSPACE" \
 878             && "${3}pip" install --no-cache-dir --quiet "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
 879             && "${3}pip" install --no-cache-dir --quiet --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
 880     elif [[ "$2" != "" ]]
 881     then
 882         "install_$2"
 883     else
 884         "install_$1"
 885     fi
 886     result=${result:-$?}
 887     checkexit $result "$1 install"
 888     title "install $1 -- `timer`"
 889     return $result
 890 }
 891
 892 bundle_install_trylocal() {
 893     (
 894         set -e
 895         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
 896         if ! bundle install --local --no-deployment; then
 897             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
 898             bundle install --no-deployment
 899         fi
 900         bundle package --all
 901     )
 902 }
 903
 904 install_doc() {
 905     cd "$WORKSPACE/doc" \
 906         && bundle_install_trylocal \
 907         && rm -rf .site
 908 }
 909
 910 install_gem() {
 911     gemname=$1
 912     srcpath=$2
 913     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
 914         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
 915         && bundle_install_trylocal \
 916         && gem build "$gemname.gemspec" \
 917         && with_test_gemset gem install --no-document $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
 918 }
 919
 920 install_sdk/ruby() {
 921     install_gem arvados sdk/ruby
 922 }
 923
 924 install_sdk/R() {
 925   if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
 926     cd "$WORKSPACE/sdk/R" \
 927        && Rscript --vanilla install_deps.R
 928   fi
 929 }
 930
 931 install_sdk/perl() {
 932     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
 933         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
 934         && make install INSTALLDIRS=perl
 935 }
 936
 937 install_sdk/cli() {
 938     install_gem arvados-cli sdk/cli
 939 }
 940
 941 install_services/login-sync() {
 942     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
 943 }
 944
 945 install_services/api() {
 946     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 947         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 948
 949     rm -f config/environments/test.rb
 950     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
 951
 952     if [ -n "$CONFIGSRC" ]
 953     then
 954         for f in database.yml
 955         do
 956             cp "$CONFIGSRC/$f" config/ || fatal "$f"
 957         done
 958     fi
 959
 960     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
 961     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
 962     # is a postgresql superuser.
 963     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 964         && test_database=$(python -c "import yaml; print yaml.safe_load(file('config/database.yml'))['test']['database']") \
 965         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.pid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
 966
 967     mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/tmp/pids"
 968
 969     cert="$WORKSPACE/services/api/tmp/self-signed"
 970     if [[ ! -e "$cert.pem" || "$(date -r "$cert.pem" +%s)" -lt 1512659226 ]]; then
 971         (
 972             dir="$WORKSPACE/services/api/tmp"
 973             set -ex
 974             openssl req -newkey rsa:2048 -nodes -subj '/C=US/ST=State/L=City/CN=localhost' -out "$cert.csr" -keyout "$cert.key" </dev/null
 975             openssl x509 -req -in "$cert.csr" -signkey "$cert.key" -out "$cert.pem" -days 3650 -extfile <(printf 'subjectAltName=DNS:localhost,DNS:::1,DNS:0.0.0.0,DNS:127.0.0.1,IP:::1,IP:0.0.0.0,IP:127.0.0.1')
 976         ) || return 1
 977     fi
 978
 979     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 980         && rm -rf tmp/git \
 981         && mkdir -p tmp/git \
 982         && cd tmp/git \
 983         && tar xf ../../test/test.git.tar \
 984         && mkdir -p internal.git \
 985         && git --git-dir internal.git init \
 986             || return 1
 987
 988     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 989         && RAILS_ENV=test bundle exec rails db:environment:set \
 990         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:drop \
 991         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:setup \
 992         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:fixtures:load
 993 }
 994
 995 declare -a pythonstuff
 996 pythonstuff=(
 997     sdk/pam
 998     sdk/python
 999     sdk/python:py3
1000     sdk/cwl
1001     sdk/cwl:py3
1002     services/dockercleaner:py3
1003     services/fuse
1004     services/fuse:py3
1005     services/nodemanager
1006     tools/crunchstat-summary
1007     tools/crunchstat-summary:py3
1008 )
1009
1010 declare -a gostuff
1011 gostuff=($(cd "$WORKSPACE" && git grep -lw func | grep \\.go | sed -e 's/\/[^\/]*$//' | sort -u))
1012
1013 install_apps/workbench() {
1014     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1015         && mkdir -p tmp/cache \
1016         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal \
1017         && RAILS_ENV=test RAILS_GROUPS=assets bundle exec rake npm:install
1018 }
1019
1020 test_doc() {
1021     (
1022         set -e
1023         cd "$WORKSPACE/doc"
1024         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
1025         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
1026         # do much good!
1027         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ bundle exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
1028     )
1029 }
1030
1031 test_gofmt() {
1032     cd "$WORKSPACE" || return 1
1033     dirs=$(ls -d */ | egrep -v 'vendor|tmp')
1034     [[ -z "$(gofmt -e -d $dirs | tee -a /dev/stderr)" ]]
1035 }
1036
1037 test_govendor() {
1038     (
1039         set -e
1040         cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"
1041         # Remove cached source dirs in workdir. Otherwise, they will
1042         # not qualify as +missing or +external below, and we won't be
1043         # able to detect that they're missing from vendor/vendor.json.
1044         rm -rf vendor/*/
1045         go get -v -d ...
1046         "$GOPATH/bin/govendor" sync
1047         if [[ -n $("$GOPATH/bin/govendor" list +unused +missing +external | tee /dev/stderr) ]]; then
1048             echo >&2 "vendor/vendor.json has unused or missing dependencies -- try:
1049
1050 (export GOPATH=\"${GOPATH}\"; cd \$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git && \$GOPATH/bin/govendor add +missing +external && \$GOPATH/bin/govendor remove +unused)
1051
1052 "
1053             return 1
1054         fi
1055     )
1056 }
1057
1058 test_services/api() {
1059     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
1060     cd "$WORKSPACE/services/api" \
1061         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test TESTOPTS='-v -d' ${testargs[services/api]}
1062 }
1063
1064 test_sdk/ruby() {
1065     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
1066         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
1067 }
1068
1069 test_sdk/R() {
1070   if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
1071     cd "$WORKSPACE/sdk/R" \
1072         && Rscript --vanilla run_test.R
1073   fi
1074 }
1075
1076 test_sdk/cli() {
1077     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
1078         && mkdir -p /tmp/keep \
1079         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
1080 }
1081
1082 test_sdk/java-v2() {
1083     cd "$WORKSPACE/sdk/java-v2" && gradle test
1084 }
1085
1086 test_services/login-sync() {
1087     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
1088         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
1089 }
1090
1091 test_services/nodemanager_integration() {
1092     cd "$WORKSPACE/services/nodemanager" \
1093         && tests/integration_test.py ${testargs[services/nodemanager_integration]}
1094 }
1095
1096 test_apps/workbench_units() {
1097     local TASK="test:units"
1098     if [[ -n "${testargs[apps/workbench]}" ]] || [[ -n "${testargs[apps/workbench_units]}" ]]; then
1099         TASK="test"
1100     fi
1101     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1102         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake ${TASK} TESTOPTS='-v -d' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_units]}
1103 }
1104
1105 test_apps/workbench_functionals() {
1106     local TASK="test:functionals"
1107     if [[ -n "${testargs[apps/workbench]}" ]] || [[ -n "${testargs[apps/workbench_functionals]}" ]]; then
1108         TASK="test"
1109     fi
1110     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1111         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake ${TASK} TESTOPTS='-v -d' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_functionals]}
1112 }
1113
1114 test_apps/workbench_integration() {
1115     local TASK="test:integration"
1116     if [[ -n "${testargs[apps/workbench]}" ]] || [[ -n "${testargs[apps/workbench_integration]}" ]]; then
1117         TASK="test"
1118     fi
1119     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1120         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake ${TASK} TESTOPTS='-v -d' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_integration]}
1121 }
1122
1123 test_apps/workbench_benchmark() {
1124     local TASK="test:benchmark"
1125     if [[ -n "${testargs[apps/workbench]}" ]] || [[ -n "${testargs[apps/workbench_benchmark]}" ]]; then
1126         TASK="test"
1127     fi
1128     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1129         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake ${TASK} ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
1130 }
1131
1132 test_apps/workbench_profile() {
1133     local TASK="test:profile"
1134     if [[ -n "${testargs[apps/workbench]}" ]] || [[ -n "${testargs[apps/workbench_profile]}" ]]; then
1135         TASK="test"
1136     fi
1137     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1138         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake ${TASK} ${testargs[apps/workbench_profile]}
1139 }
1140
1141 install_deps() {
1142     # Install parts needed by test suites
1143     do_install env
1144     do_install cmd/arvados-server go
1145     do_install sdk/cli
1146     do_install sdk/perl
1147     do_install sdk/python pip
1148     do_install sdk/ruby
1149     do_install services/api
1150     do_install services/arv-git-httpd go
1151     do_install services/keepproxy go
1152     do_install services/keepstore go
1153     do_install services/keep-web go
1154     do_install services/ws go
1155 }
1156
1157 install_all() {
1158     do_install env
1159     do_install doc
1160     do_install sdk/ruby
1161     do_install sdk/R
1162     do_install sdk/perl
1163     do_install sdk/cli
1164     do_install services/login-sync
1165     for p in "${pythonstuff[@]}"
1166     do
1167         dir=${p%:py3}
1168         if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
1169             if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
1170                 do_install ${dir} pip
1171             fi
1172         elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
1173             if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
1174                 do_install ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
1175             fi
1176         fi
1177     done
1178     for g in "${gostuff[@]}"
1179     do
1180         do_install "$g" go
1181     done
1182     do_install services/api
1183     do_install apps/workbench
1184 }
1185
1186 test_all() {
1187     stop_services
1188     do_test services/api
1189
1190     # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
1191     # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
1192     if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
1193         rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
1194         exit_cleanly
1195     fi
1196
1197     do_test gofmt
1198     do_test govendor
1199     do_test doc
1200     do_test sdk/ruby
1201     do_test sdk/R
1202     do_test sdk/cli
1203     do_test services/login-sync
1204     do_test sdk/java-v2
1205     do_test services/nodemanager_integration
1206     for p in "${pythonstuff[@]}"
1207     do
1208         dir=${p%:py3}
1209         if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
1210             if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
1211                 do_test ${dir} pip
1212             fi
1213         elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
1214             if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
1215                 do_test ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
1216             fi
1217         fi
1218     done
1219
1220     for g in "${gostuff[@]}"
1221     do
1222         do_test "$g" go
1223     done
1224     do_test apps/workbench_units
1225     do_test apps/workbench_functionals
1226     do_test apps/workbench_integration
1227     do_test apps/workbench_benchmark
1228     do_test apps/workbench_profile
1229 }
1230
1231 help_interactive() {
1232     echo "== Interactive commands:"
1233     echo "TARGET                 (short for 'test DIR')"
1234     echo "test TARGET"
1235     echo "test TARGET:py3        (test with python3)"
1236     echo "test TARGET -check.vv  (pass arguments to test)"
1237     echo "install TARGET"
1238     echo "install env            (go/python libs)"
1239     echo "install deps           (go/python libs + arvados components needed for integration tests)"
1240     echo "reset                  (...services used by integration tests)"
1241     echo "exit"
1242     echo "== Test targets:"
1243     echo "${!testfuncargs[@]}" | tr ' ' '\n' | sort | column
1244 }
1245
1246 initialize
1247
1248 declare -A testfuncargs=()
1249 for g in "${gostuff[@]}"; do
1250     testfuncargs[$g]="$g go"
1251 done
1252 for p in "${pythonstuff[@]}"; do
1253     dir=${p%:py3}
1254     testfuncargs[$dir]="$dir pip $VENVDIR/bin/"
1255     testfuncargs[$dir:py3]="$dir pip $VENV3DIR/bin/"
1256 done
1257
1258 testfuncargs["sdk/cli"]="sdk/cli"
1259 testfuncargs["sdk/R"]="sdk/R"
1260 testfuncargs["sdk/java-v2"]="sdk/java-v2"
1261 testfuncargs["apps/workbench_units"]="apps/workbench_units"
1262 testfuncargs["apps/workbench_functionals"]="apps/workbench_functionals"
1263 testfuncargs["apps/workbench_integration"]="apps/workbench_integration"
1264 testfuncargs["apps/workbench_benchmark"]="apps/workbench_benchmark"
1265 testfuncargs["apps/workbench_profile"]="apps/workbench_profile"
1266
1267 if [[ -z ${interactive} ]]; then
1268     install_all
1269     test_all
1270 else
1271     skip=()
1272     only=()
1273     only_install=()
1274     if [[ -e "$VENVDIR/bin/activate" ]]; then stop_services; fi
1275     setnextcmd() {
1276         if [[ "$TERM" = dumb ]]; then
1277             # assume emacs, or something, is offering a history buffer
1278             # and pre-populating the command will only cause trouble
1279             nextcmd=
1280         elif [[ ! -e "$VENVDIR/bin/activate" ]]; then
1281             nextcmd="install deps"
1282         else
1283             nextcmd=""
1284         fi
1285     }
1286     echo
1287     help_interactive
1288     nextcmd="install deps"
1289     setnextcmd
1290     HISTFILE="$WORKSPACE/tmp/.history"
1291     history -r
1292     while read -p 'What next? ' -e -i "$nextcmd" nextcmd; do
1293         history -s "$nextcmd"
1294         history -w
1295         read verb target opts <<<"${nextcmd}"
1296         target="${target%/}"
1297         target="${target/\/:/:}"
1298         case "${verb}" in
1299             "exit" | "quit")
1300                 exit_cleanly
1301                 ;;
1302             "reset")
1303                 stop_services
1304                 ;;
1305             "test" | "install")
1306                 case "$target" in
1307                     "")
1308                         help_interactive
1309                         ;;
1310                     all | deps)
1311                         ${verb}_${target}
1312                         ;;
1313                     *)
1314                         testargs["$target"]="${opts}"
1315                         tt="${testfuncargs[${target}]}"
1316                         tt="${tt:-$target}"
1317                         do_$verb $tt
1318                         ;;
1319                 esac
1320                 ;;
1321             "" | "help" | *)
1322                 help_interactive
1323                 ;;
1324         esac
1325         if [[ ${#successes[@]} -gt 0 || ${#failures[@]} -gt 0 ]]; then
1326             report_outcomes
1327             successes=()
1328             failures=()
1329         fi
1330         cd "$WORKSPACE"
1331         setnextcmd
1332     done
1333     echo
1334 fi
1335 exit_cleanly