4926: typos & rewording
[arvados.git] / doc / start / index.html.textile.liquid
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2 layout: default
3 navsection: start 
4 title: Welcome to Arvados!
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7 This guide provides an introduction to using Arvados to solve big data bioinformatics problems.
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9 h2. What is Arvados?
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11 Arvados is a free and open source bioinformatics platform for genomic and biomedical data.
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13 We address the needs of IT directors, lab principals, and bioinformaticians.
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15 h2. Why use Arvados?
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17 Arvados enables you to quickly begin using cloud computing resources in your bioinformatics work. It allows you to track your methods and datasets, share them securely, and easily re-run analyses.
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19 h3. Take a look (Screenshots gallery) 
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21 <div id="carousel-keyfeatures" class="carousel slide" data-interval="false">
22   <!-- Indicators -->
23   <ol class="carousel-indicators">
24     <li data-target="#carousel-keyfeatures" data-slide-to="0" class="active"></li>
25     <li data-target="#carousel-keyfeatures" data-slide-to="1"></li>
26     <li data-target="#carousel-keyfeatures" data-slide-to="2"></li>
27     <li data-target="#carousel-keyfeatures" data-slide-to="3"></li>
28     <li data-target="#carousel-keyfeatures" data-slide-to="4"></li>
29     <li data-target="#carousel-keyfeatures" data-slide-to="5"></li>
30     <li data-target="#carousel-keyfeatures" data-slide-to="6"></li>
31     <li data-target="#carousel-keyfeatures" data-slide-to="7"></li>
32     <li data-target="#carousel-keyfeatures" data-slide-to="8"></li>
33   </ol>
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35   <!-- Wrapper for slides -->
36   <div class="carousel-inner" role="listbox">
37     <div class="item active">
38       <img src="{{ site.baseurl }}/images/keyfeatures/dashboard2.png" alt="[START] After logging in, you will see Workbench's dashboard.">
39       <div class="carousel-caption">
40         [START] After logging in, you will see Workbench's dashboard.
41       </div>
42     </div>
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44     <div class="item">
45       <img src="{{ site.baseurl }}/images/keyfeatures/running2.png" alt="Pipelines describe a set of computational tasks (jobs).">
46       <div class="carousel-caption">
47         Pipelines describe a set of computational tasks (jobs).
48       </div>
49     </div>
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51     <div class="item">
52       <img src="{{ site.baseurl }}/images/keyfeatures/log.png" alt="The output of all jobs is logged and stored automatically.">
53       <div class="carousel-caption">
54         The output of all jobs is logged and stored automatically.
55       </div>
56     </div>
57
58     <div class="item">
59       <img src="{{ site.baseurl }}/images/keyfeatures/graph.png" alt="Pipelines can also be viewed in auto-generated graph form.">
60       <div class="carousel-caption">
61         Pipelines can also be viewed in auto-generated graph form.
62       </div>
63     </div>
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65     <div class="item">
66       <img src="{{ site.baseurl }}/images/keyfeatures/rerun.png" alt="Pipelines can easily be re-run exactly as before, or...">
67       <div class="carousel-caption">
68         Pipelines can easily be re-run exactly as before, or...
69       </div>
70     </div>
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72     <div class="item">
73       <img src="{{ site.baseurl }}/images/keyfeatures/chooseinputs.png" alt="...you can change parameters or pick new datasets.">
74       <div class="carousel-caption">
75         ...you can change parameters or pick new datasets.
76       </div>
77     </div>
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79     <div class="item">
80       <img src="{{ site.baseurl }}/images/keyfeatures/webupload.png" alt="With web upload, data can be uploaded right in Workbench.">
81       <div class="carousel-caption">
82         With web upload, data can be uploaded right in Workbench.
83       </div>
84     </div>
85
86     <div class="item">
87       <img src="{{ site.baseurl }}/images/keyfeatures/collectionpage.png" alt="Collections allow sharing datasets and job outputs easily. 'Create sharing link' with one click.">
88       <div class="carousel-caption">
89         Collections allow sharing datasets and job outputs easily. 'Create sharing link' with one click.
90       </div>
91     </div>
92
93     <div class="item">
94       <img src="{{ site.baseurl }}/images/keyfeatures/provenance.png" alt="Data provenance is tracked automatically. [END]">
95       <div class="carousel-caption">
96         Data provenance is tracked automatically. [END]
97       </div>
98     </div>
99
100
101   </div>
102
103   <!-- Controls -->
104   <a class="left carousel-control" href="#carousel-keyfeatures" role="button" data-slide="prev">
105     <span class="glyphicon glyphicon-chevron-left" aria-hidden="true"></span>
106     <span class="sr-only">Previous</span>
107   </a>
108   <a class="right carousel-control" href="#carousel-keyfeatures" role="button" data-slide="next">
109     <span class="glyphicon glyphicon-chevron-right" aria-hidden="true"></span>
110     <span class="sr-only">Next</span>
111   </a>
112 </div>
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114 Note: Workbench is the web interface to Arvados.
115 Tip: You may need to make your browser window bigger to see full-size images in the gallery above.
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117 h3. Key Features
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119 <ul>
120 <li><strong>Track your methods</strong><br/>
121 We log every compute job: software versions, machine images, input and output data hashes. Rely on a computer, not your memory and your note-taking skills.<br/><br/></li>
122 <li><strong>Share your methods</strong><br/>
123 Show other people what you did. Let them use your workflow on their own data. Publish a permalink to your methods and data, so others can reproduce and build on them easily.<br/><br/></li>
124 <li><strong>Track data origin</strong><br/>
125 Did you really only use fully consented public data in this analysis?<br/><br/></li>
126 <li><strong>Get results sooner</strong><br/>
127 Run your compute jobs faster by using multi-nodes and multi-cores, even if your programs are single-threaded.<br/><br/></li>
128 </ul>