sdk/python/tests/test_arv_get.py

   1 #!/usr/bin/env python
   2 # -*- coding: utf-8 -*-
   3
   4 import io
   5 import shutil
   6 import tempfile
   7
   8 import arvados
   9 import arvados.collection as collection
  10 import arvados.commands.get as arv_get
  11 import run_test_server
  12
  13 from arvados_testutil import redirected_streams
  14
  15 class ArvadosGetTestCase(run_test_server.TestCaseWithServers):
  16     MAIN_SERVER = {}
  17     KEEP_SERVER = {}
  18
  19     def setUp(self):
  20         super(ArvadosGetTestCase, self).setUp()
  21         self.tempdir = tempfile.mkdtemp()
  22         self.col_loc, self.col_pdh, self.col_manifest = self.write_test_collection()
  23
  24     def tearDown(self):
  25         super(ArvadosGetTestCase, self).tearDown()
  26         shutil.rmtree(self.tempdir)
  27
  28     def write_test_collection(self,
  29                               strip_manifest=False,
  30                               contents = {
  31                                   'foo.txt' : 'foo',
  32                                   'bar.txt' : 'bar',
  33                                   'subdir/baz.txt' : 'baz',
  34                               }):
  35         c = collection.Collection()
  36         for path, data in contents.items():
  37             with c.open(path, 'w') as f:
  38                 f.write(data)
  39         c.save_new()
  40         return (c.manifest_locator(),
  41                 c.portable_data_hash(),
  42                 c.manifest_text(strip=strip_manifest))
  43
  44     def run_get(self, args):
  45         self.stdout = io.BytesIO()
  46         self.stderr = io.BytesIO()
  47         return arv_get.main(args, self.stdout, self.stderr)
  48
  49     def test_version_argument(self):
  50         err = io.BytesIO()
  51         out = io.BytesIO()
  52         with redirected_streams(stdout=out, stderr=err):
  53             with self.assertRaises(SystemExit):
  54                 self.run_get(['--version'])
  55         self.assertEqual(out.getvalue(), '')
  56         self.assertRegexpMatches(err.getvalue(), "[0-9]+\.[0-9]+\.[0-9]+")
  57
  58     def test_get_single_file(self):
  59         # Get the file using the collection's locator
  60         r = self.run_get(["{}/subdir/baz.txt".format(self.col_loc), '-'])
  61         self.assertEqual(0, r)
  62         self.assertEqual('baz', self.stdout.getvalue())
  63         # Then, try by PDH
  64         r = self.run_get(["{}/subdir/baz.txt".format(self.col_pdh), '-'])
  65         self.assertEqual(0, r)
  66         self.assertEqual('baz', self.stdout.getvalue())
  67
  68     def test_get_multiple_files(self):
  69         # Download the entire collection to the temp directory
  70         r = self.run_get(["{}/".format(self.col_loc), self.tempdir])
  71         self.assertEqual(0, r)
  72         with open("{}/foo.txt".format(self.tempdir), "r") as f:
  73             self.assertEqual("foo", f.read())
  74         with open("{}/bar.txt".format(self.tempdir), "r") as f:
  75             self.assertEqual("bar", f.read())
  76         with open("{}/subdir/baz.txt".format(self.tempdir), "r") as f:
  77             self.assertEqual("baz", f.read())
  78
  79     def test_get_collection_unstripped_manifest(self):
  80         # Get the collection manifest by UUID
  81         r = self.run_get([self.col_loc, self.tempdir])
  82         self.assertEqual(0, r)
  83         with open("{}/{}".format(self.tempdir, self.col_loc), "r") as f:
  84             self.assertEqual(self.col_manifest, f.read())
  85         # Get the collection manifest by PDH
  86         r = self.run_get([self.col_pdh, self.tempdir])
  87         self.assertEqual(0, r)
  88         with open("{}/{}".format(self.tempdir, self.col_pdh), "r") as f:
  89             self.assertEqual(self.col_manifest, f.read())
  90
  91     def test_get_collection_stripped_manifest(self):
  92         col_loc, col_pdh, col_manifest = self.write_test_collection(strip_manifest=True)
  93         # Get the collection manifest by UUID
  94         r = self.run_get(['--strip-manifest', col_loc, self.tempdir])
  95         self.assertEqual(0, r)
  96         with open("{}/{}".format(self.tempdir, col_loc), "r") as f:
  97             self.assertEqual(col_manifest, f.read())
  98         # Get the collection manifest by PDH
  99         r = self.run_get(['--strip-manifest', col_pdh, self.tempdir])
 100         self.assertEqual(0, r)
 101         with open("{}/{}".format(self.tempdir, col_pdh), "r") as f:
 102             self.assertEqual(col_manifest, f.read())
 103
 104     def test_invalid_collection(self):
 105         # Asking for an invalid collection should generate an error.
 106         r = self.run_get(['this-uuid-seems-to-be-fake', self.tempdir])
 107         self.assertNotEqual(0, r)
 108
 109     def test_invalid_file_request(self):
 110         # Asking for an inexistant file within a collection should generate an error.
 111         r = self.run_get(["{}/im-not-here.txt".format(self.col_loc), self.tempdir])
 112         self.assertNotEqual(0, r)
 113
 114     def test_invalid_destination(self):
 115         # Asking to place the collection's files on a non existant directory
 116         # should generate an error.
 117         r = self.run_get([self.col_loc, "/fake/subdir/"])
 118         self.assertNotEqual(0, r)
 119
 120     def test_preexistent_destination(self):
 121         # Asking to place a file with the same path as a local one should
 122         # generate an error and avoid overwrites.
 123         with open("{}/foo.txt".format(self.tempdir), "w") as f:
 124             f.write("another foo")
 125         r = self.run_get(["{}/foo.txt".format(self.col_loc), self.tempdir])
 126         self.assertNotEqual(0, r)
 127         with open("{}/foo.txt".format(self.tempdir), "r") as f:
 128             self.assertEqual("another foo", f.read())
 129