Fix lesson 6
[arvados-vscode-cwl-training.git] / README.md
index 5e954c86744aced87da7e63990437e3b41c8d37f..0b932abe427b56f161d8477bdf1571c1246dc94e 100644 (file)
--- a/README.md
+++ b/README.md
@@ -87,9 +87,13 @@ Code (abbreviated "vscode") to develop CWL workflows on Arvados.
    1. Click `Run process`
    1. This should take you to a panel showing the workflow run status
 1. Workbench: workflow run status panel
-   1. Click on the three vertical dots in the top-right corner
+   1. Wait for the badge in the upper right to say `Completed`
+   1. In the lower panel, double click on the `echo` workflow step
+   1. This will take you to the status panel for the `echo` step
+   1. Click on the three vertical dots in the top-right corner next to `Completed`
    1. Choose `Log`
-   1. Under `event type` choose `stdout`
+   1. This will take you to the log viewer panel
+   1. Under `Event Type` choose `stdout`
    1. You should see your message
 
 ## 4. Working with input and output files
@@ -99,14 +103,15 @@ Code (abbreviated "vscode") to develop CWL workflows on Arvados.
    1. Click `Run Task…`
    1. Select `Register or update CWL workflow on Arvados Workbench`
 1. Go to your desktop
-   1. Using a text editor such as notepad, create a file "message.txt"
-   1. Enter a message like "Hello world" and save
+   1. Right click on the desktop, select `New > Text Document`
+   1. Name the file `message`
+   1. Enter a message like "Hello earth" and save
 1. Workbench: Go to `+NEW` and select `New project`
    1. Enter a name for the project like "Lesson 2"
    1. You should arrive at the panel for the new project
 1. Arvados workbench: With `Lesson 2` project selected
    1. Click on +NEW and select `New collection`
-   1. Call the collection "my message"
+   1. For Collection Name enter "my message"
    1. Drag and drop `message.txt` into the browser
    1. Click `Create a collection`
    1. The file should be uploaded and then you will be on the collection page
@@ -124,13 +129,17 @@ Code (abbreviated "vscode") to develop CWL workflows on Arvados.
    1. Click on the dot menu
    1. Choose `Outputs`
    1. Right click on `reverse.txt`
-   1. Click on `Download`
-   1. Open the downloaded file.  It should have your results.
+   1. Click on `Open in new tab`
+   1. The results should be visible in a new browser tab.
 
 ## 5. Register a workflow with default inputs
 
 The default value for the `message` parameter will taken from the `lesson3/defaults.yaml` file
 
+1. Vscode: Click on the `lesson3/main.cwl` file
+   1. Click on the `Terminal` menu
+   1. Click `Run Task…`
+   1. Select `Register or update CWL workflow on Arvados Workbench`
 1. Workbench: Go to `+NEW` and select `New project`
    1. Enter a name for the project like "Lesson 3"
    1. You should arrive at the panel for the new project
@@ -141,6 +150,8 @@ The default value for the `message` parameter will taken from the `lesson3/defau
    1. The `#main/message` parameter will be pre-filled with your default value.  You can choose to change it or use the default.
    1. Click `Run process`
    1. This should take you to the status page for this workflow
+   1. The greeting will appear in the `Log` of the `echo` task, which
+      can be found the same way as described earlier in section 3.
 
 ## 6. Run a workflow without registering it