RNA-Seq/docker/Dockerfile

   1 FROM debian:10-slim
   2 MAINTAINER Peter Amstutz <peter.amstutz@curii.com>
   3
   4 RUN apt-get update -qy
   5 RUN apt-get install -qy build-essential wget unzip zlib1g-dev
   6
   7 # Install BWA 07.7.17
   8 RUN wget https://github.com/lh3/bwa/archive/v0.7.17.zip && \
   9         unzip v0.7.17 && \
  10         cd bwa-0.7.17 && \
  11         make && \
  12         cp bwa /usr/bin && \
  13         cd .. && \
  14         rm -rf bwa-0.7.17