Fix Python scripts for Windows: UTF-8 encoding (#485)

To avoid problems with various symbols, we have to specify the encoding
when we read files.
The actual codec name is `utf_8` but aliases like `utf8`, `utf-8`, etc
are accepted. Here, I'm using `utf-8` alias.
https://docs.python.org/3.8/library/codecs.html#standard-encodings

This fixes `make lesson-check` when running under 'Git for Windows' for
lessons that have non-cp1252 characters.

Makefile: fix 'lesson-fixme' target for Windows (#486)

Git for Windows doesn't provide fgrep, which is a shortcut
to call `grep -F` on Mac and Linux. Instead, we have to use
full arguments.

OS stripe: adjust line height (#490)

add vendor folder to gitignore and _config.yml

[fix carpentries/styles#477] rewrite travis script

Makefile: don't use /bin/bash shell (#484)

repo_check.py: match https repositories (#483)

Makefile: fix comment in front of `lesson-check` (#481)

Comments prepended with `##` appear in the output of `make commands`.
This commit changes `#` to `##` in front of `lesson-check` so that it
appears in the output of `make commands`.

repo_check.py: allow URLs not ending with .git (#482)

_config.yml: link to Lesson Life Cycle chapter of CDH

To help users of the lesson template understand how to choose/when to update the value of life_cycle

Make links in code tags distinguishable (#478)

add warning blockquote style, carpentries/styles#49 (#475)

Deprecated use of --path when installing bundle (#473)

fix AMY's URL

License is not a copyright. License info ID (#472)

assets/js/lesson.js: use .length instead of .size()

.size() was deprecated in jQuery 3.0 in favor of .length attribute.
https://jquery.com/upgrade-guide/3.0/#breaking-change-deprecated-size-removed

Co-Authored-By: Thomas Green <tomgreen66@hotmail.com>

Upgrade jQuery to 3.5.1 (#469)

```
cd assets/js
wget https://code.jquery.com/jquery-3.5.1.min.js
wget https://code.jquery.com/jquery-3.5.1.min.map
mv -f jquery-3.5.1.min.js jquery.min.js
mv -f jquery-3.5.1.min.map jquery.min.map
```

Fixes carpentries/styles#460

bump ruby version

OS stripe color (#468)

Improve pull request template (#465)

lesson.scss: style tab panels on setup pages (#464)

Improve issue template (#463)

Co-authored-by: Sarah Brown <sarah_m_brown@brown.edu>

Use renv (#462)

Use carpentries/lesson-docker for docker-serve make rule (#461)

_includes/links.md: Update PyYAML link (#457)

Update PyPI link

add warning hook + CSS class for Rmd-based lessons (#455)

specify YAML loader

Co-authored-by: Daniel McCloy <dan.mccloy@gmail.com>c

Update R install in .travis.yml (#430)

* Update R install in .travis.yml

See https://cran.r-project.org/bin/linux/ubuntu/README.html

* update .travis.yml

Makefile: improve commands target and commands categories (#450)

* Makefile: improve commands target and commands categories

* replace 'files' with 'website'

Makefile: use Python to execute repo_check.py

Makefile: Specify shell. Don't include commands.mk

add .bundle to .gitignore

add @maxim-belkin suggestions

refactor use of docker

Co-authored-by: Allen Lee <allen.lee@asu.edu>

install gems locally

use bundler to render lessons

Merge pull request carpentries/styles#446

fix urls in _config.yml

Makefile: fix two more syntax errors in conditionals

Makefile: fix syntax in conditional

Makefile: handle MS Store's Python 3

Makefile: suppress another error message on Windows

These '2>/dev/null' are important on Windows because without them
a mere `make` stalls.

fix typo in lesson_initialize.py

Makefile: suppress error message on Windows

test_lesson_check.py: skip unnecessary steps

Makefile: Windows does not like single quotes

clarify comment on python check block

repo_check.py: enforce utf-8 encoding

... for compatibility with Windows

lesson_check.py: Windows-compatible regular expression pattern

lesson_initialize: windows compatibility

Remove executable bits from Python scripts

We can't use a single shebang:
* on some platforms `python` may mean Python 2, on others - Python 3
* on some platforms `python3` does not exist at all

Therefore, we're removing the shebangs altogether.

Undo optimizations to read_all_markdown

These will be submitted in a separate PR

util.py: remove empty line

Makefile: detect Python 3

Silenced output of PYTHON calls

Fixes encoding problem on Windows systems, with minimal changes to existing code.

Removed shebang lines from Python scripts to avoid cross-OS problems

Reverted variable names

Added PYTHON variable to define executable to run python scripts

Cleaned leftover debug code and old implementations.

Reverted change of permissiveness on lesson_check

Modified shebang to use python, not python3.

Refactored paths to make use of OS agnostic methods

Forced re-encoding of text to UTF-8, to avoid issues on Windows

remove Jekyll command markers from comment block

fix carpentries/lesson-example#281

Enable 'Sponsor' button on GitHub repos

manual_episode_order.html: fix typo in a comment

Use Jekyll to generate the 'all-in-one' page (carpentries/styles#438)

bin/boilerplate/README.md: fix typo

carpentries/styles#441

Switch to Liquid comments

HTML comments end up in the generated HTML pages: they're not displayed by the browsers but they're still present there. Liquid comments do not end up in the generated HTML pages

update survey links

[fix carpentries/workshop-template#513] remove site.title outside

lessons

Manual ordering of episodes and extras

Co-authored-by: stamper <tbyhdgs@gmail.com>

restore lost CSS settings

assets/css/lesson.scss: add proper padding to the top of paragraphs in blockquotes (#425)

Ignore Jekyll 4's cache

See https://jekyllrb.com/news/2019/08/20/jekyll-4-0-0-released/#cache-all-the-things- & https://github.com/jekyll/jekyll/releases/tag/v4.0.0

It appears during `make site` & `make serve`.

specify language based on engine

- fix swcarpentry/r-novice-inflammation#436

Use 1px borders: fix Google Chrome & Edge

See https://github.com/swcarpentry/git-novice/pull/662#issuecomment-499555724

Use darker purple for code blocks

Callout (and other) blocks: proper font size, margins

bump jekyll version to match github pages version

https://pages.github.com/versions/

lesson-check: exclude aio.md, fix read_references

Merge branch 'gh-pages' of github.com:carpentries/styles into gh-pages

[fix #408] remove aio from files that need to be initialized

aio.md: multiple improvements

Pull Request: carpentries/styles#406

* change all-in-one file to have the same 'depth' as episode files

* move the core script of aio.md into _includes/aio-script.md

* include comment to inform maintainers to not edit the file

* move aio.md to the root of styles repository

links.md: include base_path.html

links.md: fix lesson-setup link

Update ISSUE_TEMPLATE.md

Update PULL_REQUEST_TEMPLATE.md

update coc incident reporting link

Merge branch 'gh-pages' of github.com:carpentries/styles into gh-pages

upgrade to bootstrap 3.4.1

use ndash as separator

display it only if both `page.title` and `site.title` are defined.

make title show episode title first

add data-checker-ignore attributes to footer links

add data-checker-ignore attributes to links that only work on GitHub

util.py: hot fix for YAML loader

bin/lesson_check.py: avoid inconsistent grammar

Pull Request: carpentries/styles#396

use xenial on travis