Merge pull request #103 from evanwill/accessibility-fix

accessibility fixes.

Merge pull request #104 from evanwill/search-fix

fix search meta tag.

fix search meta tag.

accessibility fixes.
Add label to search box and navigation arrows.

Adding checks for things that commonly go wrong during template conversion.

1. Checking that `index.md` has `root` set to '.'
2. Checking that `_config.yml` has `root` set to '..'

Removing trailing space in Ruby file

Displaying break information in a box

Adding ID attribute to schedule

Changing name of instructor's guide to 'instructor notes'

Adding footnote about syllabus

Navigation links in footer

Switch to relative: setup default root and specific root for index.md

Switch to relative: in episode_title, use page.root + rewrite

Switch to relative: use page.root in most templates

Merge pull request #92 from swcarpentry/twitwi-patch-1

Fix "br" typo causing ugly rendering (epub only)

Fix "br" typo causing ugly rendering (epub only)

</br> instead of <br/> renders fine in the browser but not in an epub

Adding a few more URLs

Updating the lesson initializer's CONTRIBUTING.md

Checking that internally-defined links resolve.

An internally-defined Markdown link has the form [xxx][yyy].  If the
ID 'yyy' doesn't resolve, the text is left as-is, so we check for
that, then subtract those that reference configuration values using
'{{'.  It's a hack, but it'll catch at least a few things.

Checking future print

Moving from __future__ to start of file

Merge pull request #85 from gdevenyi/gh-pages

Import future print in case of python2 environment

Import future print in case of python2 environment

Merge pull request #83 from fmichonneau/check-r-packages

[fix # 82] Check R packages required by the lesson

Loading standard images via HTTPS

Forcing CSS and Javascript to be loaded via HTTPS.

Using `site.github.url` to refer to the repository fails to load resources when the GitHub Pages site is accessed via HTTPS, because `site.github.url` is `http` protocol.  This modifies loads of CSS and Javascript files to always use `https`.

simplify code checking for knitr

check packages required and install them if needed

Ignoring a few more things

Cleaning up sorting of error messages.

Closes #75.

Always checking upstream

Using 00:00 as a start time

Cleaning up prev/next logic

Synchronizing lesson checker with late changes

Lesson initializer

Switching to GitHub-defined variables

Making the code a little more robust

Adding support for MATLAB

Handling anchors by ignoring them

Tighter checks for figures

Checking for links to figures

Starting on tool to check repository settings.

1.  Created `bin/repo_check.py`.
2.  Moved `require()` to `util.py`.
3.  Updated `Makefile` with new target.

Checking more configuration values

Must provide permalinks in pages, not layouts

Checking for .nojekyll file

Images cannot be wider than the page

Merge branch '2016-06' of github.com:swcarpentry/styles into 2016-06

Looking for missing or superfluous images

Merge pull request #73 from fmichonneau/knitr_fig_path

add function knitr_fig_path

Lesson checking parameter handling

add function knitr_fig_path

Checking ends of lines

Merge branch 'move-data' of https://github.com/fmichonneau/styles into fmichonneau-move-data

re-add ./data folder

simplify to single _episodes_rmd/data folder

Merge branch 'styling-workshops' into 2016-06

Merge branch 'markdownify' into 2016-06

Merge branch 'converting-to-reporter' into 2016-06

Merge branch '2016-06' of github.com:swcarpentry/styles into 2016-06

Updating contribution guidelines in boilerplate

Merge pull request #67 from gvwilson/clean-rmd

Only cleaning intermediate R files on demand.

Making pages work for workshops as well as lessons

Styling workshops correctly.

1.  Use site.root for root path if set, otherwise use site.github.url.
2.  Display extra files for workshop-template repo as well as for lessons.

Markdownifying questions, keypoints, etc.

Adding error handling for YAML import.

1.  Moving all YAML library usage into 'util.py' via utility function.
2.  Wrapping 'import yaml' in error handling to report what library to install.

Checking CONTRIBUTING.md (without YAML)

Converting workshop checker to use Reporter class.

1.  Converting error reporting.
2.  Simplifying checking logic.
3.  Refactoring metadata loading.
4.  Modifying lesson checker to reflect refactoring.

Closes #47.

Checking for non-Markdown files.

Closes #55.

Only cleaning intermediate R files on demand.

1.  Splitting commands to clean intermediate R files into separate target.  These files must be committed to the repo, so they shouldn't be deleted under normal circumstances.
2.  Modifying intermediate file generation to create fig/rmd-* rather than fig/swc-rmd-*, since this template is used by other carpentries (not just SWC).

move data/ into _episodes/ and _episodes_rmd/

`generate_md_episodes()` is modified such that datasets storred into
_episodes_rmd/data/ needed to knit the episodes, are copied into
_episodes/data/, and are made available at the root of the site.

Merge pull request #64 from gvwilson/building-r

Only try building R files if there are some

Changing text of auto-generated file

Merge branch '2016-06' into building-r

Updating _config_dev.yml to match changes to root and repo vars

Switching to site.root and site.repo

Only try building R files if there are some

Better display of file groups in Makefile

Merge pull request #62 from fmichonneau/fix-knitr-env

use anonymous function to generate markdown files

use anonymous function to generate markdown files

Checking metadata fields more carefully

Printing error messages in sorted order

Checking that episodes are numbered consecutively

Making line-length checking optional for lessons.

1.  Modify `read_markdown` to return list of (index, line, line_length).
2.  Modify `lesson_check.py` to make line-length checking optional.

Raising exception instead of printing error on bad YAML

Merge pull request #61 from fmichonneau/fix-rmd-formatting

Fix Rmd formatting

remove extra line return in knitr output

use .r instead of .source for code chunks

Directory for R Markdown files

Removing legacy PHONY target lesson-single

Merge pull request #56 from fmichonneau/rmarkdown-tools

add tools to deal with episodes written in Rmd

add tools to deal with episodes written in Rmd

Making nav bar responsive

Tidying up based on first contact with R maintainers.

1.  Renaming Ruby file to use underscore in name (consistent with other `bin` scripts).
2.  Generating `_includes/all_figures.html` for the first time when creating a new lesson.

Preparing for June 2016 release

Fixing typo

CSS cataloguing tool

Merge pull request #30 from twitwi/master

fix #26: updated bundled deck.js, including the fix on browsercast

fix #26: updated bundled deck.js, including the fix on browsercast

this bundle is used also for browsecast-less presentations
and thus browsercast should not unbind the space in this case
and that's solved now

Merge branch 'styles-compatible' into new-style

Merge branch 'style-img-responsive' into new-style