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[rnaseq-cwl-training.git] / bin / knit_lessons.sh
index ff5443b0b003c00668b791c0ef5a9cb0e8bd90e1..141c136adce04042732d19eb416bc915e57e2717 100755 (executable)
@@ -1,5 +1,8 @@
 #!/usr/bin/env bash
 
-if [ -d "_episodes_rmd" ] ; then
-    Rscript -e "source('bin/generate_md_episodes.R')"
+# Only try running R to translate files if there are some files present.
+# The Makefile passes in the names of files.
+
+if [ $# -eq 2 ] ; then
+    Rscript -e "source('bin/generate_md_episodes.R')" "$@"
 fi