Fix image link
[rnaseq-cwl-training.git] / index.md
1 ---
2 layout: lesson
3 root: .  # Is the only page that doesn't follow the pattern /:path/index.html
4 permalink: index.html  # Is the only page that doesn't follow the pattern /:path/index.html
5 ---
6
7 This training will walk you through the development of a
8 best-practices CWL workflow.  At the conclusion of this training, you
9 should have a grasp of the essential components of a workflow, and
10 have a basis for learning more.
11
12 > ## Prerequisites
13 >
14 > This training assumes some basic familiarity with editing text files,
15 > the Unix command line, and Unix shell scripts.
16 >
17 > Specific knowledge of the biology of RNA-seq is *not* a prerequisite
18 > for these lessons.  Although orignally developed to solve big data
19 > problems in genomics, CWL is not domain specific to bioinformatics,
20 > and is used in a number of other fields including medical imaging,
21 > astronomy, geospatial, and machine learning.  We hope that you will
22 > find this training useful regardless of your area of research.
23 >
24 {: .prereq}
25
26 These lessons are based on [Introduction to RNA-seq using
27 high-performance computing
28 (HPC)](https://github.com/hbctraining/Intro-to-rnaseq-hpc-O2) lessons
29 developed by members of the teaching team at the Harvard Chan
30 Bioinformatics Core (HBC).  The original training, which includes
31 additional lectures about the biology of RNA-seq, can be found at that
32 link.
33
34 {% include links.md %}