Merge branch 'master' into 3373-improve-gatk3-snv-pipeline
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-rw-r--r-- 4749 api.py
-rw-r--r-- 18999 collection.py
drwxr-xr-x - commands
-rw-r--r-- 1042 config.py
-rw-r--r-- 730 errors.py
-rw-r--r-- 1332 events.py
-rw-r--r-- 20495 keep.py
-rw-r--r-- 9597 stream.py
-rw-r--r-- 417 timer.py
-rw-r--r-- 12371 util.py