15768: removed copy-and-rerun, minor cleanup Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

15768: clipboard works Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

15768: changed collection copy to clipboard copy Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

15768: multimove propagation good to go Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

15768: first stage of multimove propagation up Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

20913: Fix test to check that use profile gets saved

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Peter Amstutz <peter.amstutz@curii.com>

15768: standardized types between identitical functions Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

20899: Add menu item to delete workflow record

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Peter Amstutz <peter.amstutz@curii.com>

15768: multimove collections works Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

15768: multimove processes works Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

15768: clarified naming patterns Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

15768: Revert "15768: fixed select-all inversion Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>" due to breaking a major component Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

This reverts commit 5e732ed46fedff23e619535cef7f04a86e18a9c7.

15768: fixed select-all inversion Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

15768: fixed project multimove filtering Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

15768: project multimove works Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

15768: multi-move works Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

Merge branch '20884-rocky8-copy' refs #20884

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Peter Amstutz <peter.amstutz@curii.com>

20884: Update Makefile copy rule to accommodate rocky8

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Brett Smith <brett.smith@curii.com>

Merge branch '20829-can-manage' refs #20829

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Peter Amstutz <peter.amstutz@curii.com>

15768: initial Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

Merge branch '20890-remove-wb1-switch'  refs #20890

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Peter Amstutz <peter.amstutz@curii.com>

Merge branch '20603-trash-show-all' refs #20603

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Peter Amstutz <peter.amstutz@curii.com>

20884: Add rocky8 to list of build targets

refs #20884

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Peter Amstutz <peter.amstutz@curii.com>

20890: Remove "Switch to workbench 1" menu item

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Peter Amstutz <peter.amstutz@curii.com>

Merge branch '20617-shared-with-me-filtering' into main. Closes #20617

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Stephen Smith <stephen@curii.com>

20829: Check parent for editable status

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Peter Amstutz <peter.amstutz@curii.com>

20829: Migrate to canWrite and canManage for permission checks

Replace use of writableBy with canWrite and canManage, and remove
writableBy from workbench 2 entirely.

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Peter Amstutz <peter.amstutz@curii.com>

20829: Add canWrite and canManage to group and API response dialog

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Peter Amstutz <peter.amstutz@curii.com>

20617: Extend sharing cypress test to check search/filters

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Stephen Smith <stephen@curii.com>

20617: Move shared-with-me filter additions to getParams

Prevents accidentally overriding filters and fixes filters being ignored

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Stephen Smith <stephen@curii.com>

20603: Trash shows all items, not just those owned by user

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Peter Amstutz <peter.amstutz@curii.com>

Merge branch '20882-fix-priority' refs #20882

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Peter Amstutz <peter.amstutz@curii.com>

Merge branch '20845-queued-process-filter' refs #20845

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Peter Amstutz <peter.amstutz@curii.com>

Merge branch '20513-link-cwl-code' refs #20513

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Peter Amstutz <peter.amstutz@curii.com>

Merge branch '19793-collection-back' refs #19793

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Peter Amstutz <peter.amstutz@curii.com>

Merge branch '20454-cost-display' refs #20454

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Peter Amstutz <peter.amstutz@curii.com>

Merge branch '18946-user-profile' refs #18946

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Peter Amstutz <peter.amstutz@curii.com>

Merge branch '20219-log-api' into main. Closes #20219

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Stephen Smith <stephen@curii.com>

Merge branch 'main' of git.arvados.org:arvados-workbench2 into 20219-log-api

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Stephen Smith <stephen@curii.com>

Merge branch '19991-breadcrumbs-missing-bug' into main. Closes #19991

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Stephen Smith <stephen@curii.com>

20219: Suppress error toast when process logs fail to load due to 404

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Stephen Smith <stephen@curii.com>

20219: Add unit tests for log service webdav methods

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Stephen Smith <stephen@curii.com>

20219: Make log service easier to test using interfaces

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Stephen Smith <stephen@curii.com>

20219: Make cypress collection replace files method more specific

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Stephen Smith <stephen@curii.com>

20219: Rename doKeepRequest to doWebDAVRequest for clarity

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Stephen Smith <stephen@curii.com>

19991: Switch localhost for 127.0.0.1 due to wb url change

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Stephen Smith <stephen@curii.com>

19991: Change cypress url from localhost to 127.0.0.1 to match arvados
Solves cords cookie issues when testing inline io panel image previews

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Stephen Smith <stephen@curii.com>

19991: Switch search spec federated test cy.intercept to use 127.0.0.1 instead of localhost.

Also change collection names to make collisions impossible

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Stephen Smith <stephen@curii.com>

18946: Don't navigate away from my-account page on password login

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Peter Amstutz <peter.amstutz@curii.com>

19991: Add small delay to allow open in new tab / copy to clipboard to execute

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Stephen Smith <stephen@curii.com>

19991: Fix for search cypress test

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Stephen Smith <stephen@curii.com>

19991: Fix some cypress tests

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Stephen Smith <stephen@curii.com>

20882: Submit with priority 500, not priority 1

(Priority ought to be editable but that's a different story)

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Peter Amstutz <peter.amstutz@curii.com>

19991: Try to fix tests / elements detached from dom

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Stephen Smith <stephen@curii.com>

19991: Remove usage of side panel tree to generate breadcrumbs, uses ancestor
service instead.

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Stephen Smith <stephen@curii.com>

20219: Try to fix tests on jenkins

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Stephen Smith <stephen@curii.com>

20219: Increase cypress timeouts when appending logs

Waiting on an intercept doesn't work because on fast systems the wait is too late

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Stephen Smith <stephen@curii.com>

20219: Switch log panel requests to use live log endpoint, adjust tests to match

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Stephen Smith <stephen@curii.com>

19793: Make browser back button work on nav to PDH

When navigating to a collection by PDH, if there is only one match, it
the portable data hash page automatically directs the user to the
appropriate collection page.  However, if the user pushes the back
button, they go back to portable data hash page which automatically
takes them to the collection page again.  This effectively breaks the
back button.

This fixes the bug by replacing (instead of "pushing") the top of the
location history with the collection page, so that the back button
from the collection page takes the user to their previous page without
revisiting the portable data hash page (so they are not endlessly
redirected).

This commit message is longer than the actual code fix.

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Peter Amstutz <peter.amstutz@curii.com>

18946: Fix flaky test

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Peter Amstutz <peter.amstutz@curii.com>

18946: Fix unit tests

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Peter Amstutz <peter.amstutz@curii.com>

18946: Add userProfileFormMessage

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Peter Amstutz <peter.amstutz@curii.com>

20845: Fix the "Queued" process status filter

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Peter Amstutz <peter.amstutz@curii.com>

20454: Consolidate cost display to a single 'Cost' field

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Peter Amstutz <peter.amstutz@curii.com>

20513: Add "Workflow code" link to details

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Peter Amstutz <peter.amstutz@curii.com>

Merge branch '20219-log-api' into main. Closes #20219

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Stephen Smith <stephen@curii.com>

20219: Log with level error and with promise rejection reason when polling fails

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Stephen Smith <stephen@curii.com>

20219: Move dev dependencies into devDependencies

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Stephen Smith <stephen@curii.com>

20219: Better variable name

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Stephen Smith <stephen@curii.com>

20219: Pass through promise rejections from getLogFileContents

* No longer returns undefined for failed log fragments
* initProcessLogsPanel added catch to handle errors, on failure it shows a
  toast and initializes the store empty, allowing polling to run and retry if
  the container is running
* Add note to pollProcessLogs error console.log that the promise rejection is
  ignored currently
* loadContainerLogFileContents now handles errors from getLogFileContents
  * Switched from Promise.all to Promise.allSettled, which allows some promises
    to fail and still return a result
  * Replace undefined fragment & subfragment filtering with top level promise
    status filtering, subfragments can no longer have some failures due to
    sub-promises using .all which rejects on any failure
* Add es2020 to typescript lib array for Promise.allSettled

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Stephen Smith <stephen@curii.com>

Merge branch '20688-redirect-urldecode' refs #20688

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Peter Amstutz <peter.amstutz@curii.com>

20219: Start / stop log polling when container is running

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Stephen Smith <stephen@curii.com>

20219: Add console log to process log polling failure since promise rejection
is currently unhandled

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Stephen Smith <stephen@curii.com>

20219: Rearrange non-sortable logs to top of merged all logs view

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Stephen Smith <stephen@curii.com>

20219: Perform log file root path filtering in listLogFiles

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Stephen Smith <stephen@curii.com>

20219: Adjust logFileToLogType argument type to only CollectionFile and adjust
loadContainerLogFileList filter type hint to satisfy type

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Stephen Smith <stephen@curii.com>

20219: Improve useAsyncInterval testability, add unit test

* Combines useRefs for easier mocking
* Wraps callback execution in promise chain to prevent halting on non-async
  callbacks
* Clean up now unused async contexts
* Add explicit promise resolve/reject on PollProcessLogs
  * Add catch block to continue polling on error

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Stephen Smith <stephen@curii.com>

20688: Update test for uri encoding/decoding of PDH

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Peter Amstutz <peter.amstutz@curii.com>

20688: Make sure ARVADOS_DIRECTORY is set when it is needed

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Peter Amstutz <peter.amstutz@curii.com>

15768: restoreFromTrash now properly navigates after multi Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

15768: fixed checkbox disable on empty list Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

20219: Replace API & websocket log loading with webdav polling

* Add apiWebdavClient to log service for making webdav requests to the API and
  differentiate from keepWebdavClient
* Add listLogFiles and getLogFileContents methods to log service, contents can
  be fetched with range request
* Add loadContainerLogFileContents to load logs using webdav range requests
  * Files larger than the chunk limit (128k) are loaded as beginning and end
    in 2 64k fragments, snipline is appended to the last line of the first
    fragment
  * The chunks are all requested in parallel
* Add sorting of timestamped log types in combined log views (Main/All)
  * Lines without timestamps are merged with previous lines with timestamps
    * If no preceding lines of a sortable type exist, the leading lines are
      removed from combined log views - they can still be seen in the single
      log type filter
  * Non-timestamped log types (node-info/contaner) are pushed to the bottom
    with original ordering in All view
  * Merging & sorting is not applied to single log type view
* Remove snipline LogEventType as all sniplines now belong to specific log
  event types
* Update logs panel store and reducer to remember the last log byte requested
* Add polling useAsyncInterval utility function to poll log file sizes
  * Polling awaits for callback to finish to prevent race conditions
* Update process log code snippet style to remove gap between array of loglines
* Remove websocket handling of log events
* Replaced cypress log manipulation commands with webdav log helpers
* Add tests for polling, line sorting, correctly sized/positioned chunks, and
  snipline

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Stephen Smith <stephen@curii.com>

15768: checkbox css Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

15768: fixed restore-from-trash icon, minor cleanup Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

18946: Transitional user profile feature

If UserProfileFormFields is non-empty, and the user's prefs.profile is
empty, wb2 will navigate to the user account page to encourage people
to fill out the profile.  Unlike wb1, filling it out is not mandatory.

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Peter Amstutz <peter.amstutz@curii.com>

15768: all project context menu single actions good Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

15768: project copy-to-clipboard works Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

15768: back to previous multiselect state, but now with arrays Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

15768: changed all context menu actions to take an array of resources  Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

20688: urldecode the redirect path before storing it

Necessary because nginx url rewrites will turn the "+" into a "%2B",
so we need to turn it back.  After more than an hour of messing with
it, it's easier to fix workbench 2 than to fix nginx.

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Peter Amstutz <peter.amstutz@curii.com>

15768: beginning dialog box resolution Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

15768: button filter optimization pass Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

15768: setified filter lists Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

15768: button filtering algo works badly Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

15768: notations for algo revisions Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

15768: ms toolbar now filters duplicate buttons Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

15768: different resource kinds can now do the same operation with the same button Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

15768: Starting differentiation Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

15768: added new filters.ts file to commit Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

15768: made new filters.ts file Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>