21720: added spinner to list when loading

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21842: set getSuggestions to trigger on input focus

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21842: removed minsuggestionslength, set limit to 10

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21842: moved tabPanel inside parent component to simplify styling

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21842: fixed scrollbar going past scrollContainer

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21842: merge cleanup, changed ListItem to ListItemButton

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

Merge branch 'main' into 21842-improve-sharing

refs #21842

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21842: removed autofocus and set contents length in labels

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21842: fixed edge case where ENTER would fire with nothing selected

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

Merge branch '21720-material-ui-upgrade'

closes #21720

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21720: changed padding in code-snippet logs

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21720: fixed project test

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21720: fixed flaky process test

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21720: converted groups-panel-middleware-service test

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

Merge branch '21909-r-sdk-3.0'

Refs #21909.

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Brett Smith <brett.smith@curii.com>

21909: Add Brett Smith to R SDK authors list

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Brett Smith <brett.smith@curii.com>

21720: fixed data-explorer-middleware test

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21720: fixed data-explorer.cy spec

* unrecognized char to "-"

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21720: fixed spec in data-explorer.cy.js

* removed an autofocuslistener that didnt matter because it gets covered by popover anyway

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21720: merge cleanup

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

Merge branch 'main' into 21720-material-ui-upgrade

refs #21720

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21720: fixed padding in panel log card lines

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21720: moved search input adornment to fix occlusion with.placeholder text

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21720: removed unnecessary divider

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21720: fixed text color in data explorer

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21720: fixed styling in multi-panel-view

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21720: remobed vestigial info button

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

Merge branch '21893-input-collections-virtual-list' into main. Closes #21893

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Stephen Smith <stephen@curii.com>

21720: refectored listitem icon spacing

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21893: Make linter happy

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Stephen Smith <stephen@curii.com>

Merge branch '17074-optimize-itemsavailable' into main. Closes #17074

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Stephen Smith <stephen@curii.com>

Merge branch '21751-installer-cmk-support'

closes #21751

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lucas Di Pentima <lucas.dipentima@curii.com>

21751: Fixes typo in resource naming.

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lucas Di Pentima <lucas.dipentima@curii.com>

Merge branch '22079-pysdk-reference-bugfixes'

Refs #22079.

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Brett Smith <brett.smith@curii.com>

21893: Add separate custom column width styles for collection input table

Also fix ellipses-ing of collection link

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Stephen Smith <stephen@curii.com>

21751: Adds CMK access policies to compute and dispatcher roles.

When using customer-managed keys, access should be granted explicitly: the
dispatcher needs it to create instances with their EBS volume encrypted
and the compute nodes themselves need it too so that they can start the
ebs-autoscale feature.

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lucas Di Pentima <lucas.dipentima@curii.com>

21893: Implement virtual list for process io card input collections tab

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Stephen Smith <stephen@curii.com>

22126: Improve parsing of default values in PySDK reference

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Brett Smith <brett.smith@curii.com>

22126: Improve formatting of method parameter docstrings

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Brett Smith <brett.smith@curii.com>

22126: Improve whitespace in ArvadosAPIClient reference

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Brett Smith <brett.smith@curii.com>

22126: Add defaults to PySDK methods reference

Resolve the issue in the earlier comment by marking parameters with no
advertised default as Optional[T] with a default value None.

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Brett Smith <brett.smith@curii.com>

22079: Improve PySDK list method reference

* Add a pointer to the iterator wrapper directly to the `list` method
  docstring.
* Accommodate the special case of the computed permissions wrapper.

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Brett Smith <brett.smith@curii.com>

Merge branch '22124-keepstore-put-moved'

refs #22124

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Tom Clegg <tom@curii.com>

Merge branch '21900-groups-panel-toolbar'

closes #21900

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21842: fixed bug where arrow selecting skipped one when wrapping around

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21842: fixed group-manage test

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21842: fixed sharing test

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

22124: Strip trailing slash on keepstore endpoint.

Fixes double-slash in outgoing requests.

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Tom Clegg <tom@curii.com>

Merge branch '22017-instance-type-quotas'

fixes #22017

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Tom Clegg <tom@curii.com>

21842: removed old renderSharing and related code

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21842: added hover

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21842: added notFound condition

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21842: fixed lost reference to this in handleSelect

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21842: fixed onSelect select bug

* highlighted item is now selected on enter press

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21909: Add duplicate name error handling in generateApi.R

Special code for this case was added to collections_create in
de8cd4c6a56cac85dbcf7fe1fcb29abe98fe9f18. This extends the code
generation tool to add the check to all create methods where a name
conflict could occur.

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Brett Smith <brett.smith@curii.com>

21909: Add project permission methods to generateApi.R

This gets generateApi.R to generate the methods that were added in
de8cd4c6a56cac85dbcf7fe1fcb29abe98fe9f18.

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Brett Smith <brett.smith@curii.com>

21909: Add project properties methods to generateApi.R

This gets generateApi.R to generate the methods that were added in
de8cd4c6a56cac85dbcf7fe1fcb29abe98fe9f18.

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Brett Smith <brett.smith@curii.com>

21909: Add project_exists method to generateApi.R

This gets generateApi.R to generate the method added in
de8cd4c6a56cac85dbcf7fe1fcb29abe98fe9f18.

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Brett Smith <brett.smith@curii.com>

21909: Update function and parameter names for compatibility

This gets generateApi.R to generate the same names that were committed
in de8cd4c6a56cac85dbcf7fe1fcb29abe98fe9f18.

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Brett Smith <brett.smith@curii.com>

21842: moved tab handlers to parent component

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21842: moved parsed list contents to component state

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21842: converted tabbedList to take a Record instead of an array of children

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21842: made selectedIndex reset to 0 every time the sugggestions box opens

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21842: autofocused sharing input

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21842: selected items now scroll into view

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21842: list styling

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21842: restricted tab nav to when suggestions are open

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21842: added tab nav between tabs

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

22017: Add interface assertions.

These act as a compile-time unit test for the stub driver.

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Tom Clegg <tom@curii.com>

22017: Rename InstanceFamily to InstanceQuotaGroup.

"Instance family" is an existing AWS term, and each quota group covers
multiple instance families.

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Tom Clegg <tom@curii.com>

21842: restored up/down arrow select

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21909: Update R SDK documentation to use R6 style

This provides a nicer presentation, with the class and all its methods
on a single page.

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Brett Smith <brett.smith@curii.com>

21909: Fix case mismatch between function signature and @param doc

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Brett Smith <brett.smith@curii.com>

21909: Remove unused createDoc.R script

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Brett Smith <brett.smith@curii.com>

21909: Update R SDK Version

This is usually overridden during the build process anyway, but might as
well update it while I'm at it.

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Brett Smith <brett.smith@curii.com>

21909: Add a basic build system to R SDK

The R SDK includes committed code and documentation that are generated
from other sources, mainly the discovery document and inline
documentation. Remove those and introduce a Makefile with recipes to
build them all. This will make it easier to keep the R SDK in sync with
Arvados API changes in the future.

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Brett Smith <brett.smith@curii.com>

21909: Improve R SDK recipe readability

* Use Dir.glob instead of implementing it ourselves
* Use File.basename instead of string slices
* Use system() to avoid a shell and needless output capture

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Brett Smith <brett.smith@curii.com>

21909: Turn autoGenAPI.R into a standalone script

This lets someone run it from source before installing the ArvadosR
package.

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Brett Smith <brett.smith@curii.com>

21909: Add a canonical discovery document to sdk/R

The R SDK uses this to build code and documentation much like the Python
SDK does. We can share infrastructure to keep them in sync.

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Brett Smith <brett.smith@curii.com>

21909: Remove obsolete API filtering

This code is a noop now that these APIs have been removed entirely.

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Brett Smith <brett.smith@curii.com>

21909: Remove unused logo

Unused since 5d9edef1f13b3b9f7abff1bec7d2fda82838a8f0.

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Brett Smith <brett.smith@curii.com>

19929: Configure Roxygen with Markdown support

We need this now that the discovery document descriptions use Markdown.

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Brett Smith <brett.smith@curii.com>

19929: Use NULL for all R default arguments

The default values in the discovery document tend to be stringified for
the benefit of the Java SDK. This means trying to use them verbatim in
R code is likely to yield incorrect results.

Just set them all to NULL and let the API server use its own defaults.

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Brett Smith <brett.smith@curii.com>

19929: Handle multiline descriptions in R code

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Brett Smith <brett.smith@curii.com>

21842: added generic type to tabbedlist

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

Merge branch '21773-keep-service-discovery'

closes #21773

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Tom Clegg <tom@curii.com>

22017: Configurable instance type/family mapping.

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Tom Clegg <tom@curii.com>

21842: stickied the tabs

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21842: basic tabbed autosuggest is up

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21720: fixed flaky project test again

* added cy.waitForDom() after submit button clicks

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21720: fixed flaky project test

* changed cy.go('back') to manually clicking the 'Home Projects' breadcrumb

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21720: removed redundant redirect-to test

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

Merge branch '21297-container-status' refs #21297

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Peter Amstutz <peter.amstutz@curii.com>

Merge branch 'main' into 21297-container-status

refs #21297

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Peter Amstutz <peter.amstutz@curii.com>

21720: removed getClipboardUrl spec made redundant by 21941

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

21720: fixed file-viewer-action test

* the href for the openInNewTab action must be a legitimate address

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>

22017: Separate quotas for spot/demand, add missing families.

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Tom Clegg <tom@curii.com>

19929: Move request class to the top of PySDK reference

Since it is used by every method class, and small, documenting it first
makes better organizational sense. No issue #.

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Brett Smith <brett.smith@curii.com>

19929: Document schemas and their resources together in PySDK reference

Now that all these classes are fully documented, outputting all the
schemas and then all the resources means there's a giant gap between
related classes. Provide nicer organization by sorting by methods,
preceding them with their related schemas. Refs #19929.

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Brett Smith <brett.smith@curii.com>

21720: fixed run-process-panel-actions test

* there is a meaningless console error at the end with navigateTo because the store doesn't exist in this test

Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Lisa Knox <lisa.knox@curii.com>