Merge branch 'master' into 7241-azure-blob-volume

Conflicts:
services/keepstore/volume_generic_test.go
services/keepstore/handlers_with_generic_volume_test.go

7241: Use If-Match header to address Delete/Put races.

Merge branch '7330-improved-sso-package'

closes #7330

Merge branch 'master' into 7330-improved-sso-package

refs #7330

More language tweaks.

refs #7330

refs #6859
Added include statement to the script.

7330: 'edit' should be replaced by 'editor' that will go to the default editor of the ditro

refs #7330

7330: making sso install guide similar to workbench and api server

refs #7330

7330: apt-get command had a typo

refs #7330

7330: curl isnt available by default in ubuntu 14.04. added the apt-get

refs #7330

Another tweak for the SSO server installation guide: the PostgreSQL
service needs to be started manually if it was pulled in as a dependency
by arvados-sso-server.

refs #7330

More improvements for the SSO server installation guide.

refs #7330

Update the SSO installation documentation to reflect the new and
improved packages.

refs #7330

6034: added scafolding of the first initscript

refs #6034

7241: Use new CreateBlockBlobFromReader and SetBlobMetadata APIs for Put and Touch.

Ruby 2.1.7 is out, update documentation accordingly.

No issue #

Merge branch 'pr/29'

Closes #7388.

Change ssh public key to 700 after key-sync

7241: Do not bother trying to add a volume if credential args are missing/empty.

7241: Add -azure-storage-replication flag.

7241: Stub Azure API calls

closes #7161
Merge branch '7161-support-all-service-types'

Merge branch '7161-support-all-service-types' of git.curoverse.com:arvados into 7161-support-all-service-types

7161: Use default value of 1 for max_replicas_per_service and set it to None when writable non-disk type services are found.

7161: white space

7161: clarify max_replicas_per_service

7161: Look for all service hints, not just keep proxy. Also, use thread count of 1 when it not a disk.

closes #7162
Merge branch '7162-support-service-types'

7162: Removed the call to get keep_disks when there is an error getting keep_services,
since keep_services has been available since May 2014, #2776 according to Tom.

Merge branch 'master' into 7162-support-service-types

Merge branch '7227-crunch-job-stricter-unmount-wip'

Closes #7227, #7376.

7227: crunch-job only unmounts Keep mounts under $CRUNCH_TMP.

This prevents it from trying to unmount other Keep mounts elsewhere on
the system, and considering the cleanup step failed because of that.

Merge branch '6967-application-yml-without-git-wip'

Closes #6967, #7375.

6967: Extend application.default.yml source_version detection.

* In production, get source_version from our package's
  git-commit.version, assuming it's available.
* When we get source information from Git, suppress errors from the
  user, and only use the information if all queries succeed.

6967: Remove trailing whitespace in Workbench's application.default.yml.

7161: working

Merge branch 'master' into 7161-support-all-service-types

Merge branch 'master' into 7162-support-service-types

7162: updated comment

Merge branch '7181-crunch-missing-git' closes #7181

Merge branch '7228-crunch-dispatch-umask' closes #7228

7162: move replicasPerThread logic outside the for loop.

7181: Check for [Errno 2] in the output and assume that means git is missing.
Remove --quite to get more output if egg_info fails.  Use "warn" instead of
"print" because "print" doesn't seem to actually make it to the logs.

7162: SetServiceRoots keepproxy hints only (revert my update).

7161: white space

7161: clarify max_replicas_per_service

Merge branch 'master' into 7162-support-service-types

7241: Add Delete, IndexTo, Touch, and Mtime.

7241: Add Put() and Check()

closes #7329
Merge branch '7329-empty-block-issue'

7321: arvados/jobs Dockerfile installs python-pip.

This is also for arvados_sdk_version support.  I thought pip was a
dependency of virtualenv, but it's not.  Refs #7321.

7241: Accept command line flags for Azure blob volumes.

Merge branch 'master' into 7329-empty-block-issue

7329: improved TestableVolumeManagerFactory method signature, teardown logic, comments and test file name.

7321: arvados/jobs Dockerfile installs development headers.

These are necessary to build all of the Python SDK's dependencies when
running a job that defines arvados_sdk_version.

Closes #7321.

Merge branch 'master' into 7329-empty-block-issue

7161: Look for all service hints, not just keep proxy. Also, use thread count of 1 when it not a disk.

7228: Set umask to 002 so cache files are created writable other processes with same GID.

Merge branch '7225-collection-hang' closes #7225

7241: Add AzureBlobVolume

7329: since moved functional testing into generic testing, removing now redundant empty block tests from volume_unix_test.go and keepstore_test.go.

7329: add generic volume based keepstore tests to have better functional test coverage.

7225: Better exception handling for unexpected state changes.

7225: Add test to validate fix that 2nd commit call blocks until block is committed
as intended.

7225: Fix typo in _BufferBlock.set_state() that resulted in "wait for pending
block commit" code getting skipped.  Set PUT thread to daemon thread; users
must call save() or flush() or use `with` to guarantee that blocks get written.

Merge branch 'master' into 7329-empty-block-issue

7329: Fix infinite loop in Compare when reading an empty file.

refs #7329

7162: Update code to address the bug "current code forgets to reset Using_proxy to false if the API server stops giving out proxies between one call and the next"

Merge branch 'master' into 7162-support-service-types

7162: Update datamanager code to ask for all non-proxy typed keep services and fail if any non-disk types are found in the returned list.
This needs to be enhanced when we are ready to support keep servers with other service types sub as blob storage.

Merge branch '7309-git-push-default' closes #7309

7309: Push branches explicitly in tests instead of relying on `git config push.default`

7329: Add generic tests for empty block handling.

7329: Fix infinite loop in Compare when reading an empty file (whether
or not the buf we're comparing is also empty).

Merge branch 'master' into 7162-support-service-types

7162: Use replicasPerService to avoid sending redundant replication requests.

API server limits KeepService changes to admins.

Taking the same security policy that applies to disks and applying
them to services as well.  No issue #.

7162: enhance SetServiceRoots to look for all service hints, not just K@ hints.

7329: It appears that UnixVolume -> Compare method is falling in infinite loop due to the fact that EOF is not returned when reading an empty file.
Due to this, PutBlock for an EmptyHash is resulting in infinite loop when an EmptyBlock already exists in Keep.
Added a quick fix in the Compare method for unix volume implementation. We can try to see why EOF is not returned and put in a better fix,
but for the time being this helps with unblocking tests.

Added several tests for empty block. Most importantly, added an keep integration test with UnixVolume so that we have integration tests covering some
of these code paths. More tests are definitely called for in this intergration test for better code coverage.

Also did gofmt and golint updates.

Merge branch 'pr/24'

Closes #7262.

refs #7015
Merge branch '7015-remove-pipeline-instance-from-recursive-arv-copy-doc'

7015: correct typo in copied template uuid

7015: Update arv-copy user guide to use a pipeline template instead of instance in the examples.
In addition, until 7001 is resolved, do not include pipeline instance as one of the object types that can be copied over.

closes #6260
Merge branch '6260-test-datamanager'

6260: update keepproxy test TestPostWithoutHash to match locator+size+Ahint instead of locator+size only.

Merge branch 'master' into 6260-test-datamanager

Conflicts:
services/keepstore/keepstore.go

refs #7179
Merge branch '7179-generic-volume-tests'

7179: more updates to address golint suggestions around the config parameters such as never-delete, blob-signature-ttl etc.

docker builds are failing for compute nodes.

no issue #

7262: blacklists pbr >= 1.7.0

6260: most golint suggestions are addressed.

6260: so many golint complaints!!

6260: golint suggested updates

Merge branch 'master' into 6260-test-datamanager

Conflicts:
services/keepstore/keepstore.go

closes #7179
Merge branch '7179-generic-volume-tests'

6260: golint suggestions incorporated. Also, the earlier commit log message "no longer need the keep.data-manager-token-file" is incorrect. Keepstore still needs this and this file is still generated during testing.

7179: Most of golint suggested updates are made. Some names such as "never_delete" are left alone.
Also suggestions such as "replace errors.New(fmt.Sprintf(...)) with fmt.Errorf(...)" are ignored.

7179: some more golint suggested updates

7179: several golint suggested updates such as "don't use ALL_CAPS in Go names; use CamelCase".
Now keepstore.go and handlers.go are almost lint free; a few such as blob_signature_ttl are not renamed at this time.

7179: handler_test.go is now lint free according to golint.