Merge branch '5104-ruby-sdk-collections-wip'

Closes #5104, #5423.

5104: Add Collection class to the Ruby SDK.

This provides an interface to do filesystem-like operations on a tree
expressed in a manifest.  It currently supports copy, rename, and
remove operations, and will give us common ground for further work in
Ruby components.

5104: Refactor Ruby SDK test infrastructure into sharable module.

Fix arv-normalize regression.  refs #5145 refs #4823

refs #5145
Merge branch '5145-combine-collections-repeated-filenames'

5145: include manifest text in assert error message to identify the cause of test failure in jenkins.

closes #5145
Merge branch '5145-combine-collections-repeated-filenames'

Merge branch 'master' into 5145-combine-collections-repeated-filenames

closes #4426
Merge branch '4426-search-documentation'

Merge branch 'master' into 4426-search-documentation

4426: Adjust styling for search button on search box

4426: convert the search icon to a button

Add missing re import to PySDK arvfile module.

No issue #.

Merge branch 'master' into 4426-search-documentation

4426: name attribute is needed for google search

Merge branch 'master' into 5145-combine-collections-repeated-filenames

5145: small updates

closes #5304
Merge branch '5304-include-nulls-when-notequal-filter'

Merge branch 'master' into 5304-include-nulls-when-notequal-filter

closes #3761
Merge branch '3761-pull-list-worker'

Merge branch 'master' into 5145-combine-collections-repeated-filenames

3761: Expand DiscoverKeepServers method to return service_roots and use it in test

Merge branch 'master' into 3761-pull-list-worker

3761: add a test with invalid data manager token and expect the item to be rejected.

Merge branch 'master' into 4426-search-documentation

4426: add google search in doc topnav

Merge branch '5182-cors-error-reporting' closes #5182

Merge branch '5073-docker-limitations' closes #5073

Merge branch '5105-ajax-redirect' closes #5105

5182: Tweak error messages.

5105: Clarify "no double-layout" asserts. Remove redundant "not on welcome page" asserts.

5304: include nulls in resutls when filter operator is "!="

5073: Update ruby version to 2.1.5

5073: Document docker limitations. Bring "overview" up to the top of the install section.

5105: Better assertion for tab-loading error display.

5105: Restore previous token in an ensure block.

3761: Working!!!!

5182: Silently skip Angular initialization if injector() returns null.

This happens occasionally during tests, and seems benign (except that
our tests demand an empty debug console).

5182: Improve error reporting in uploader.

Missing CORS headers (and network errors which force the browser to
assume CORS headers are missing) are reported as error==="". In place
of the enigmatic "error:", we show a message hinting at network/CORS
problems and pointing the user to the browser debug console for
further clues.

Mixed-content errors (https://workbench/*.js attempts AJAX request at
http://proxy/*) don't invoke success/fail handlers at all, so we catch
them ahead of time and show an appropriate message.

3761: a little refactoring

Merge branch 'master' into 3761-pull-list-worker

3761: need at least 1 replica

5145: revert back fixture update and instead add a new fixture for test combining of collections.

5145: better pattern matching for manifest text files

Merge branch 'master' into 5145-combine-collections-repeated-filenames

closes #5190
Merge branch '5190-no-hyphens-in-repo-names'

5190: updated tooltip

Merge branch 'master' into 5190-no-hyphens-in-repo-names

closes #5374
Merge branch '5374-hide-collection-checkboxes-anonymous'

Merge branch 'master' into 5374-hide-collection-checkboxes-anonymous

Merge branch 'master' into 5374-hide-collection-checkboxes-anonymous

3761: get keep services

5182: Advise adding CORS headers to proxy error responses.

5319: Include CurrentApiClient in migration model.

Needed to use system_user_uuid.  Refs #5319.

Merge branch '5319-fix-hinted-collection-hashes-wip'

Closes #5319, #5369.

5319: Add API migration for manifests with bad portable data hashes.

Refer to #5319 for background discussion and rationale.  The migration
ensures that collections are still addressable by the bad
portable_data_hash, but the existing collection object has the correct
portable_data_hash.

5319: Fix incorrect portable_data_hash in test fixture.

Merge branch 'master' into 3761-pull-list-worker

Merge branch '5261-project-description' closes #5261

5261: Fix DST transition bug: browser timezone != test suite timezone.

5190: tell user to not use hyphens in tooltip for repository name editable attribute

5261: Merge branch 'master' into 5261-project-description

5261: Change placeholder text from "New group" to "New project"

5374: in collection show page, hide checkboxes for anonymous user view.

3761: integration test WIP

3761: (WIP) add integration test for pull_worker

5105: Include form data with report_issue request.

3761: update GetContent function to use read_content test data info.

3761: move test assertions from teardown method into performTest function for better readability of code.

5261: Rename Summary tab to Description.

5261: Move project name from Summary tab back to heading area.

5105: Skip database reset where we use a mock instead of the real API.

5105: Remove unnecessary self.included/class_eval stuff.

5105: Really call the report_issue action, instead of fetching "/",
when the "send" button is clicked.

5105: Tidy up test case.

5105: Treat not-logged-in AJAX requests as errors, instead of redirecting to login prompts.

5105: Move displaced comment.

5105: Add API stub helpers and basic ArvadosApiClient unit tests.

3761: Improve the tests to RunTestPullWorker for each test and verify the queue is empty at the end of test.
Add a test that puts two items on the queue and verifies that old item is overwritten by the new item.

3761: verify ReadContent and PutContent outputs.

5261: Fix {redirect_to @object} usage.

3761: include names in test data initializations

5261: Redirect to destination project's Collections tab when copying/moving collections.

5261: When redirecting during an AJAX request, send the target URI in
a JSON object {"href":"..."} instead of responding 302.

This lets us use "redirect_to X" to mean "send the user to page X"
regardless of whether the request is an XHR. Without it, client-side
code never sees the 302 at all: the browser handles the redirect
transparently, and the client-side code typically ends up trying to
parse HTML content as JSON.

5261: Update tests.

3761: log errors in RunPullWorker instead of Pull method.

3761: pass keepClient to Pull method

Merge branch 'master' into 3761-pull-list-worker

5145: add tests to verify combine collections with duplicate filenames

Merge branch 'master' into 5145-combine-collections-repeated-filenames

5145: while combining colletions, append an integer for any duplicate files.

5261: Move project name and description into a Summary tab.

Reduce tab font size to reduce chances of word-wrapping tabs.

Merge branch '4956-limit-request-size' refs #4956

4956: Mark monkey patching methods as internal

4956: Refactor http request patching used in Python SDK.
Test_request_too_large uses published size instead of hardcoded size.  Make
note that user must configure upstream web server to set request size limits.

Merge branch '5246-urllib3-workaround' closes #5246

5246: Use pkg_resources.parse_version to test urllib3 version string.  Identify
Debian 8 specifically in comment.

Merge branch '5043-crunchstat-long-lines' closes #5043

5246: Add urllib3 workaround, along with a note why it is necessary.

4956: Add maximum request size checking to http_request patch in api.py.
Raises MediaUploadSizeError if the request is too big.