4250: update pdh to uuid in keep tutorial

Merge branch 'master' into 4250-doc-updates

Merge branch 'master' into 4156-cli-tests

refs #4194
Merge branch '4194-keep-logging'

Merge branch '4552-collection-unique-name' closes #4552

Conflicts:
services/api/app/models/collection.rb

Merge branch 'master' into 4194-keep-logging

4156: update failing tests in test_arv-put that were expecting pdh instead of uuid.

Merge branch 'master' into 4194-keep-logging

4194: use same log statement for successes as well as errors.

4552: Set permit_unsigned_manifests=false needed for test.

Merge branch '4363-less-filename-munging' closes #4363

4363: Fix flaky test case (race with filterable.js debounce timer).

4194: use go fmt to replace spaces with tabs.

4194: just print data size and never the data

4363: Fix size hints for multi-byte manifests (backported from f78caf9).

4363: Accept manifest_text in a non-UTF-8 encoding that is equal to its UTF-8 encoding.

4363: Specify ASCII encoding in test case.

closes #4194
Merge branch '4194-keep-logging'

Merge branch 'master' into 4194-keep-logging

Merge branch '4027-sdk-constraint-reuse-wip'

Refs #4027.  Closes #4532.

4027: Test updating job's SDK version after it's already set.

4027: API server considers arvados_sdk_version for Job reuse.

* Extend "in git" and "not in git" filters to the arvados_sdk_version
  column.
* When no filters are specified, if the submitted job specifies an
  arvados_sdk_version constraint, require reuse candidates to meet it.
* Document all this.

4363: Merge branch 'master' into 4363-less-filename-munging

4363: Explicit UTF-8 for test string.

4363: Validate utf-8 encoding of manifest_text.

4363: Remove redundant test.

4400: Silence git error messages during package install (we ignore them anyway)

4552: Tidy up ensure_unique_name block.

4552: Use faster database_cleaner strategy.

4552: Fix conflict between ensure_unique_name and signed manifests.

4194: rename wrapper as logging_router

Merge branch 'master' into 4194-keep-logging

4194: MakeLoggingRESTRouter returns a pointer rather than the struct.

4194: rename wrapper

Be a bit smarter about handling the dynamic dns resolver records for
compute nodes on api server startup.

refs #4461

4194: rename RESTRouterWrapper as LoggingRESTRouter

Merge branch 'master' into 4194-keep-logging

4250: update user guide to reflect current code.

3382: test that after editing that an input is editable a second time

closes #4024
Merge branch '4024-pipeline-instances-scroll'

3382: test that an input without a description is still displayed after it has been specified

Merge branch 'master' into 3382-always-show-inputs

Merge branch '4024-pipeline-instances-scroll' of git.curoverse.com:arvados into 4024-pipeline-instances-scroll

4024: Make items_available, result_limit, and result_offset work for empty result sets.

Merge branch '3824-task-work' closes #3824

3824: Check whether there is anything to install before trying to lock $destdir.

Merge branch '4535-configure-api-host-url' closes #4535

Merge branch 'master' into 4024-pipeline-instances-scroll

3824: Create "all users" group in seeds.rb instead of asking a human to do it.

3824: autorestart non-detached services regardless of exit code.

Merge branch '4388-workbench-update' closes #4388

4233: simple but reasonably effective tests

4233: catch and ignore log processing errors

4233: better labelling includes raw interval data and number formatting

4024: update test assert

4024: add test assertion to check no error in page.

Merge branch 'master' into 4024-pipeline-instances-scroll

Merge branch '4024-pipeline-instances-scroll' of git.curoverse.com:arvados into 4024-pipeline-instances-scroll

Merge branch 'master' into 4194-keep-logging

4194: logging writer copies / appends passed in data into its own buffer.

4233: show original data in hover info instead of proportions

Make our dynamic dns update system for compute nodes more generic.

refs #4461

3824: docker issue 3172 is closed, build works without -q.

4233: chart stats for parallel tasks separately
  - this commit also extends the scroll time to 10 minutes

4233: bug fix - rounding errors were causing us to miss maxima scrolling off the chart, and rescaling was not occurring

4233: do not scale the 'cpu' series stats, and divide them by cpu count

4233: only redraw graph a maximum of once every 5 seconds

Fix sdk/go/keepclient test race condition

This closes #4395

4233: will rescale y-axis for a series that scrolls off leaving less than fully scaled data points displaying on the chart

3824: Run build_script (and create *_WORK) inside the container.

4233: remove explicit JS includes for showing Keep histogram now that they are in the general assets

4233: keep graph data array sorted by timestamp

3400: Do not fetch API results just for the sake of looking up resource_class.

4024: @limit override must happen before find_objects_for_index.

3400: Do not fetch_multiple_pages in #index actions.

4024: Merge branch '4388-workbench-update' into 4024-pipeline-instances-scroll

4024: Merge branch 'master' into 4024-pipeline-instances-scroll

4388: Fix typo

4388: Update bundle

4388: Fix javascript errors.

4194: update keepstore and handler_test to make wrapper instance rather than the two step process of creating REST router and then the wrapper.

4233: now the y-axis series will scale to always be between 0 and 1

4233: why pass around global variables?

4233: redraw graph when processing log events
 - still very naive
 - still does not scale y-axis
 - does not try to limit x axis timeline to 20 minutes: just keeps growing
 - seems intolerably inefficient - optimization on several fronts almost certainly still required:
   - initial draw on first page load should do much less client-side processing
   - at accelerated speeds, it cannot keep up, and if we expect so much data throughput we'd want to devise a way to only redraw once in a while to save needless processor work

4194: refactor router wrapper into a separate file.

Merge branch 'master' into 4194-keep-logging

4194: refactor REST Router wrapper into a separate package named keep_utils in keep directory.

Relax activesupport dependency to accommodate 4.x. refs #4388

4194: rename RESTRouterWrapper

4194: remove some more old log statements

4194: since LoggingResponseWriter is doing the logging, remove some of the old log statements that are now covered by the LoggingResponseWriter in keepstore handlers.

4535: Change default to false because ~ indicates "must be filled in".

4535: Add default_url_options to application controller that consults
Rails.configuration.  Added entry with documentation to
application.yml.default.

Merge branch 'master' into 4024-pipeline-instances-scroll

4194: improve logging when large block is retrieved.

4194: Add LoggingResponseWriter and RESTRouter wrapper. Update keepstore and handler_test to use the router wrapper.

4024: Use filterable-control input values (if any) when first loading dynamic content.

closes #3177
Merge branch '3177-collection-choose-files'

3177: use no left padding when collection files preview panel is used in file chooser dialog.

Merge branch 'master' into 3177-collection-choose-files