add util functions, fix up tmp dirs

add output & code notes to job tutorial

remove extra newline

Add piwik support to workbench.

Add whls wrapper. This is a temporary hack. Not proud of it :/

Remove 'pre' from the gem version; otherwise we can't pull them in easily from puppet.

Merge branch 'master' of git.clinicalfuture.com:arvados

Changes for ruby sdk packaging as a gem.

clarify monitoring jobs until success=True

pipeline_templates and pipeline_instances are not admin-only

hide expired and job-specific auth tokens from workbench list

fix nil bugs

extend pgp data tutorial

fix is_locked_by reference

fix is_locked_by reference

use pattern as regexp

update language on job intro page

fix word wrap

quote yaml title

update uuids for pgp data example

remove special group/show stuff

restore uuid column

remove special group/show stuff

update provenance link conventions

show provenance

fix up collections index/show

reword "change api endpoint to suit" reminder

Merge branch 'master' of git.clinicalfuture.com:arvados

Fix versoining number for arvados gem.

update example collection hash

rename more foreign uuid attributes

document adding crunch user

rename more foreign uuid attributes

rename foreign uuid attributes

Add some more detail about arv's dependencies and how to install them.

add identifier link to conventions list

start pgp data tutorial

fix inflections

add repository usage example and doc link

show login names and config instructions on VMs page

restrict visible-because-references-me to permission and resource links

update example configs

fix tutorial bugs

fix doc link

point to doc.arvados.org tutorial if no local tutorials are set up

remove stub pages

add "first job" tutorial

add Data menu

collections does not need to be admin-only

remove "add a new VM" button from non-admin VM index page

more specific info about VMs page

use the same API host for all examples

update running and finished_at attributes at completion

document redis dependency

chdir out of supervise dir when starting job

add pgp-survey-import

add workbench favicon

fix up default site name

add pgp-survey-parse

fixes and docs for testing crunch jobs locally

fix human/humans inflection

add Human resource

add Admin menu with Users and Groups

remove "create new api client authorization" button

update dispatch docs

fix editable + serialized-hash attributes

fix active/admin editables

fix editable User attributes

add trait resource

add util class

fix grammar

notify admin about new users

link JobTasks api page

user#is_active fixes

activate admin users created before is_active flag existed

add user#is_active flag

document passenger streaming setup

add jobs#log_tail_follow

fix permissions and bugs, use decompressed_name in output

add transparent gunzip support, fix string concatenation performance

add transparent bz2 decompression, some tests and fixes

docs and fixes

reader fixes

add missing newline at end of manifest

fix KeyError in os.environ check

fix for bare repos

hash and grep examples for new reader/writer tools

add Reader classes, local storage mode, and basic test suite

use which to find crunch-job instead of hoping sudo preserves PATH

use find_or_create_by instead of rescue RecordNotUnique

update dev job docs

remove some leftovers from subversion support

fix attempts to save dev job status in arvados db

fix dev job id

show full uuid even in uuid column on index pages

add likely job dependencies section

send git-archive from ctl to compute node instead of running git-pull on compute

work around sudo environment sanitizing

update docs

configurable setuid for crunch jobs