18723: Use setuptools console entrypoints, fix dev-jobs.dockerfile
authorPeter Amstutz <peter.amstutz@curii.com>
Mon, 14 Feb 2022 14:54:26 +0000 (09:54 -0500)
committerPeter Amstutz <peter.amstutz@curii.com>
Mon, 14 Feb 2022 14:54:26 +0000 (09:54 -0500)
Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Peter Amstutz <peter.amstutz@curii.com>

sdk/cwl/arvados_cwl/__init__.py
sdk/dev-jobs.dockerfile

index c3848b2629188c9cf687e8b69f054237b9e5b77e..734945c0f7ccb707258ab60be52107195afff0e0 100644 (file)
@@ -258,7 +258,11 @@ def exit_signal_handler(sigcode, frame):
     logger.error(str(u"Caught signal {}, exiting.").format(sigcode))
     sys.exit(-sigcode)
 
-def main(args, stdout, stderr, api_client=None, keep_client=None,
+def main(args=sys.argv[1:],
+         stdout=sys.stdout,
+         stderr=sys.stderr,
+         api_client=None,
+         keep_client=None,
          install_sig_handlers=True):
     parser = arg_parser()
 
index 1e0068ffd48250375c60b8dc1331668a930fb809..b55b056b2d38339fe4bb42ddd15ba267099975ea 100644 (file)
@@ -23,9 +23,7 @@ ARG pipcmd=pip3
 
 RUN apt-get update -q && apt-get install -qy --no-install-recommends \
     git ${pythoncmd}-pip ${pythoncmd}-virtualenv ${pythoncmd}-dev libcurl4-gnutls-dev \
-    libgnutls28-dev nodejs ${pythoncmd}-pyasn1-modules build-essential
-
-RUN $pipcmd install -U setuptools six requests
+    libgnutls28-dev nodejs ${pythoncmd}-pyasn1-modules build-essential ${pythoncmd}-setuptools
 
 ARG sdk
 ARG runner
@@ -39,7 +37,7 @@ ADD cwl/dist/$runner /tmp/
 
 RUN cd /tmp/arvados-python-client-* && $pipcmd install .
 RUN if test -d /tmp/schema-salad-* ; then cd /tmp/schema-salad-* && $pipcmd install . ; fi
-RUN if test -d /tmp/cwltool-* ; then cd /tmp/cwltool-* && $pipcmd install networkx==2.2 && $pipcmd install . ; fi
+RUN if test -d /tmp/cwltool-* ; then cd /tmp/cwltool-* && $pipcmd install . ; fi
 RUN cd /tmp/arvados-cwl-runner-* && $pipcmd install .
 
 # Install dependencies and set up system.