19070: Still trying to fix test_with_arvbox
[arvados.git] / sdk / cwl / test_with_arvbox.sh
index 76aa43d61180f44882409ac3fb513eeb41921661..33686df0d9a52afd912777aaf2dd20d573c5eabc 100755 (executable)
@@ -83,6 +83,8 @@ fi
 
 arvbox start $config $tag
 
+docker cp $(readlink -f $(dirname $0)/tests) $ARVBOX_CONTAINER:/usr/src/arvados/sdk/cwl/tests
+
 arvbox pipe <<EOF
 set -eu -o pipefail
 
@@ -98,7 +100,7 @@ fi
 
 set -x
 
-if [ \$PYCMD = "python3" ]; then
+if [ "\$PYCMD" = "python3" ]; then
     pip3 install cwltest
 else
     pip install cwltest
@@ -118,42 +120,46 @@ elif [[ "$suite" =~ conformance-(.*) ]] ; then
      git clone https://github.com/common-workflow-language/cwl-\${version}.git
    fi
    cd cwl-\${version}
+   git checkout \${version}.0
+elif [[ "$suite" != "integration" ]] ; then
+   echo "ERROR: unknown suite '$suite'"
+   exit 1
 fi
 
-if [[ "$suite" != "integration" ]] ; then
-  git pull
-fi
+#if [[ "$suite" != "integration" ]] ; then
+#  git pull
+#fi
 
 export ARVADOS_API_HOST=localhost:8000
 export ARVADOS_API_HOST_INSECURE=1
-export ARVADOS_API_TOKEN=\$(cat /var/lib/arvados/superuser_token)
+export ARVADOS_API_TOKEN=\$(cat /var/lib/arvados-arvbox/superuser_token)
 
 if test -n "$build" ; then
   /usr/src/arvados/build/build-dev-docker-jobs-image.sh
 elif test "$tag" = "latest" ; then
   arv-keepdocker --pull arvados/jobs $tag
 else
-  jobsimg=\$(curl https://versions.arvados.org/v1/commit/$tag | python -c "import json; import sys; sys.stdout.write(json.load(sys.stdin)['Versions']['Docker']['arvados/jobs'])")
-  arv-keepdocker --pull arvados/jobs \$jobsimg
-  docker tag arvados/jobs:\$jobsimg arvados/jobs:latest
-  arv-keepdocker arvados/jobs latest
-fi
+  set +u
+  export WORKSPACE=/usr/src/arvados
+  . /usr/src/arvados/build/run-library.sh
+  TMPHERE=\$(pwd)
+  cd /usr/src/arvados
 
-cat >/tmp/cwltest/arv-cwl-jobs <<EOF2
-#!/bin/sh
-exec arvados-cwl-runner --api=jobs \\\$@
-EOF2
-chmod +x /tmp/cwltest/arv-cwl-jobs
+  # This defines python_sdk_version and cwl_runner_version with python-style
+  # package suffixes (.dev/rc)
+  calculate_python_sdk_cwl_package_versions
 
-cat >/tmp/cwltest/arv-cwl-containers <<EOF2
-#!/bin/sh
-exec arvados-cwl-runner --api=containers \\\$@
-EOF2
-chmod +x /tmp/cwltest/arv-cwl-containers
+  cd \$TMPHERE
+  set -u
+
+  arv-keepdocker --pull arvados/jobs \$cwl_runner_version
+  docker tag arvados/jobs:\$cwl_runner_version arvados/jobs:latest
+  arv-keepdocker arvados/jobs latest
+fi
 
 EXTRA=--compute-checksum
 
-if [[ $devcwl == 1 ]] ; then
+if [[ $devcwl -eq 1 ]] ; then
    EXTRA="\$EXTRA --enable-dev"
 fi
 
@@ -161,8 +167,12 @@ env
 if [[ "$suite" = "integration" ]] ; then
    cd /usr/src/arvados/sdk/cwl/tests
    exec ./arvados-tests.sh $@
-else
-   exec ./run_test.sh RUNNER=/tmp/cwltest/arv-cwl-${runapi} EXTRA="\$EXTRA" $@
+elif [[ "$suite" = "conformance-v1.2" ]] ; then
+   exec cwltest --tool arvados-cwl-runner --test conformance_tests.yaml -Sdocker_entrypoint,timelimit_invalid_wf -N307 $@ -- \$EXTRA
+elif [[ "$suite" = "conformance-v1.1" ]] ; then
+   exec cwltest --tool arvados-cwl-runner --test conformance_tests.yaml -Sdocker_entrypoint,timelimit_invalid_wf -N199 $@ -- \$EXTRA
+elif [[ "$suite" = "conformance-v1.0" ]] ; then
+   exec cwltest --tool arvados-cwl-runner --test v1.0/conformance_test_v1.0.yaml -Sdocker_entrypoint $@ -- \$EXTRA
 fi
 EOF