17755: Merge branch 'main' into 17755-add-singularity-to-compute-image
[arvados.git] / services / api / db / structure.sql
index a8885f584a4fee3edc7b2c36a3a5fcf06fb96be5..2f7748335694310b09de911104a446ce54885093 100644 (file)
@@ -10,20 +10,6 @@ SET check_function_bodies = false;
 SET xmloption = content;
 SET client_min_messages = warning;
 
---
--- Name: plpgsql; Type: EXTENSION; Schema: -; Owner: -
---
-
-CREATE EXTENSION IF NOT EXISTS plpgsql WITH SCHEMA pg_catalog;
-
-
---
--- Name: EXTENSION plpgsql; Type: COMMENT; Schema: -; Owner: -
---
-
--- COMMENT ON EXTENSION plpgsql IS 'PL/pgSQL procedural language';
-
-
 --
 -- Name: pg_trgm; Type: EXTENSION; Schema: -; Owner: -
 --
@@ -39,10 +25,10 @@ CREATE EXTENSION IF NOT EXISTS pg_trgm WITH SCHEMA public;
 
 
 --
--- Name: compute_permission_subgraph(character varying, character varying, integer); Type: FUNCTION; Schema: public; Owner: -
+-- Name: compute_permission_subgraph(character varying, character varying, integer, character varying); Type: FUNCTION; Schema: public; Owner: -
 --
 
-CREATE FUNCTION public.compute_permission_subgraph(perm_origin_uuid character varying, starting_uuid character varying, starting_perm integer) RETURNS TABLE(user_uuid character varying, target_uuid character varying, val integer, traverse_owned boolean)
+CREATE FUNCTION public.compute_permission_subgraph(perm_origin_uuid character varying, starting_uuid character varying, starting_perm integer, perm_edge_id character varying) RETURNS TABLE(user_uuid character varying, target_uuid character varying, val integer, traverse_owned boolean)
     LANGUAGE sql STABLE
     AS $$
 
@@ -59,6 +45,14 @@ CREATE FUNCTION public.compute_permission_subgraph(perm_origin_uuid character va
                   starting_uuid One of 1, 2, 3 for can_read,
                   can_write, can_manage respectively, or 0 to revoke
                   permissions.
+
+   perm_edge_id: Identifies the permission edge that is being updated.
+                 Changes of ownership, this is starting_uuid.
+                 For links, this is the uuid of the link object.
+                 This is used to override the edge value in the database
+                 with starting_perm.  This is necessary when revoking
+                 permissions because the update happens before edge is
+                 actually removed.
 */
 with
   /* Starting from starting_uuid, determine the set of objects that
@@ -79,15 +73,13 @@ WITH RECURSIVE
           union
             (select traverse_graph.origin_uuid,
                     edges.head_uuid,
-                      least(edges.val,
-                            traverse_graph.val
-                            ,
-                            case (edges.tail_uuid = perm_origin_uuid AND
-                                  edges.head_uuid = starting_uuid)
+                      least(
+case (edges.edge_id = perm_edge_id)
                                when true then starting_perm
-                               else null
+                               else edges.val
                             end
-),
+,
+                            traverse_graph.val),
                     should_traverse_owned(edges.head_uuid, edges.val),
                     false
              from permission_graph_edges as edges, traverse_graph
@@ -123,23 +115,20 @@ WITH RECURSIVE
            should_traverse_owned(edges.head_uuid, edges.val),
            edges.head_uuid like '_____-j7d0g-_______________'
       from permission_graph_edges as edges
-      where (not (edges.tail_uuid = perm_origin_uuid and
-                  edges.head_uuid = starting_uuid)) and
+      where edges.edge_id != perm_edge_id and
             edges.tail_uuid not in (select target_uuid from perm_from_start where target_uuid like '_____-j7d0g-_______________') and
             edges.head_uuid in (select target_uuid from perm_from_start)
 
           union
             (select traverse_graph.origin_uuid,
                     edges.head_uuid,
-                      least(edges.val,
-                            traverse_graph.val
-                            ,
-                            case (edges.tail_uuid = perm_origin_uuid AND
-                                  edges.head_uuid = starting_uuid)
+                      least(
+case (edges.edge_id = perm_edge_id)
                                when true then starting_perm
-                               else null
+                               else edges.val
                             end
-),
+,
+                            traverse_graph.val),
                     should_traverse_owned(edges.head_uuid, edges.val),
                     false
              from permission_graph_edges as edges, traverse_graph
@@ -472,7 +461,8 @@ CREATE TABLE public.container_requests (
     output_name character varying(255) DEFAULT NULL::character varying,
     output_ttl integer DEFAULT 0 NOT NULL,
     secret_mounts jsonb DEFAULT '{}'::jsonb,
-    runtime_token text
+    runtime_token text,
+    output_storage_classes jsonb DEFAULT '["default"]'::jsonb
 );
 
 
@@ -532,7 +522,10 @@ CREATE TABLE public.containers (
     runtime_user_uuid text,
     runtime_auth_scopes jsonb,
     runtime_token text,
-    lock_count integer DEFAULT 0 NOT NULL
+    lock_count integer DEFAULT 0 NOT NULL,
+    gateway_address character varying,
+    interactive_session_started boolean DEFAULT false NOT NULL,
+    output_storage_classes jsonb DEFAULT '["default"]'::jsonb
 );
 
 
@@ -1014,17 +1007,20 @@ CREATE TABLE public.users (
 CREATE VIEW public.permission_graph_edges AS
  SELECT groups.owner_uuid AS tail_uuid,
     groups.uuid AS head_uuid,
-    3 AS val
+    3 AS val,
+    groups.uuid AS edge_id
    FROM public.groups
 UNION ALL
  SELECT users.owner_uuid AS tail_uuid,
     users.uuid AS head_uuid,
-    3 AS val
+    3 AS val,
+    users.uuid AS edge_id
    FROM public.users
 UNION ALL
  SELECT users.uuid AS tail_uuid,
     users.uuid AS head_uuid,
-    3 AS val
+    3 AS val,
+    ''::character varying AS edge_id
    FROM public.users
 UNION ALL
  SELECT links.tail_uuid,
@@ -1035,7 +1031,8 @@ UNION ALL
             WHEN ((links.name)::text = 'can_write'::text) THEN 2
             WHEN ((links.name)::text = 'can_manage'::text) THEN 3
             ELSE 0
-        END AS val
+        END AS val,
+    links.uuid AS edge_id
    FROM public.links
   WHERE ((links.link_class)::text = 'permission'::text);
 
@@ -1725,13 +1722,6 @@ CREATE INDEX authorized_keys_search_index ON public.authorized_keys USING btree
 CREATE INDEX collection_index_on_properties ON public.collections USING gin (properties);
 
 
---
--- Name: collections_full_text_search_idx; Type: INDEX; Schema: public; Owner: -
---
-
-CREATE INDEX collections_full_text_search_idx ON public.collections USING gin (to_tsvector('english'::regconfig, substr((((((((((((((((((COALESCE(owner_uuid, ''::character varying))::text || ' '::text) || (COALESCE(modified_by_client_uuid, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(modified_by_user_uuid, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(portable_data_hash, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(uuid, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(name, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(description, ''::character varying))::text) || ' '::text) || COALESCE((properties)::text, ''::text)) || ' '::text) || COALESCE(file_names, ''::text)), 0, 1000000)));
-
-
 --
 -- Name: collections_search_index; Type: INDEX; Schema: public; Owner: -
 --
@@ -1746,13 +1736,6 @@ CREATE INDEX collections_search_index ON public.collections USING btree (owner_u
 CREATE INDEX collections_trgm_text_search_idx ON public.collections USING gin (((((((((((((((((((COALESCE(owner_uuid, ''::character varying))::text || ' '::text) || (COALESCE(modified_by_client_uuid, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(modified_by_user_uuid, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(portable_data_hash, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(uuid, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(name, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(description, ''::character varying))::text) || ' '::text) || COALESCE((properties)::text, ''::text)) || ' '::text) || COALESCE(file_names, ''::text))) public.gin_trgm_ops);
 
 
---
--- Name: container_requests_full_text_search_idx; Type: INDEX; Schema: public; Owner: -
---
-
-CREATE INDEX container_requests_full_text_search_idx ON public.container_requests USING gin (to_tsvector('english'::regconfig, substr((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((COALESCE(uuid, ''::character varying))::text || ' '::text) || (COALESCE(owner_uuid, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(modified_by_client_uuid, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(modified_by_user_uuid, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(name, ''::character varying))::text) || ' '::text) || COALESCE(description, ''::text)) || ' '::text) || COALESCE((properties)::text, ''::text)) || ' '::text) || (COALESCE(state, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(requesting_container_uuid, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(container_uuid, ''::character varying))::text) || ' '::text) || COALESCE(runtime_constraints, ''::text)) || ' '::text) || (COALESCE(container_image, ''::character varying))::text) || ' '::text) || COALESCE(environment, ''::text)) || ' '::text) || (COALESCE(cwd, ''::character varying))::text) || ' '::text) || COALESCE(command, ''::text)) || ' '::text) || (COALESCE(output_path, ''::character varying))::text) || ' '::text) || COALESCE(filters, ''::text)) || ' '::text) || COALESCE(scheduling_parameters, ''::text)) || ' '::text) || (COALESCE(output_uuid, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(log_uuid, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(output_name, ''::character varying))::text), 0, 1000000)));
-
-
 --
 -- Name: container_requests_index_on_properties; Type: INDEX; Schema: public; Owner: -
 --
@@ -1788,13 +1771,6 @@ CREATE INDEX containers_search_index ON public.containers USING btree (uuid, own
 CREATE INDEX group_index_on_properties ON public.groups USING gin (properties);
 
 
---
--- Name: groups_full_text_search_idx; Type: INDEX; Schema: public; Owner: -
---
-
-CREATE INDEX groups_full_text_search_idx ON public.groups USING gin (to_tsvector('english'::regconfig, substr((((((((((((((((COALESCE(uuid, ''::character varying))::text || ' '::text) || (COALESCE(owner_uuid, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(modified_by_client_uuid, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(modified_by_user_uuid, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(name, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(description, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(group_class, ''::character varying))::text) || ' '::text) || COALESCE((properties)::text, ''::text)), 0, 1000000)));
-
-
 --
 -- Name: groups_search_index; Type: INDEX; Schema: public; Owner: -
 --
@@ -2782,13 +2758,6 @@ CREATE UNIQUE INDEX index_workflows_on_uuid ON public.workflows USING btree (uui
 CREATE INDEX job_tasks_search_index ON public.job_tasks USING btree (uuid, owner_uuid, modified_by_client_uuid, modified_by_user_uuid, job_uuid, created_by_job_task_uuid);
 
 
---
--- Name: jobs_full_text_search_idx; Type: INDEX; Schema: public; Owner: -
---
-
-CREATE INDEX jobs_full_text_search_idx ON public.jobs USING gin (to_tsvector('english'::regconfig, substr((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((COALESCE(uuid, ''::character varying))::text || ' '::text) || (COALESCE(owner_uuid, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(modified_by_client_uuid, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(modified_by_user_uuid, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(submit_id, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(script, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(script_version, ''::character varying))::text) || ' '::text) || COALESCE(script_parameters, ''::text)) || ' '::text) || (COALESCE(cancelled_by_client_uuid, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(cancelled_by_user_uuid, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(output, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(is_locked_by_uuid, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(log, ''::character varying))::text) || ' '::text) || COALESCE(tasks_summary, ''::text)) || ' '::text) || COALESCE(runtime_constraints, ''::text)) || ' '::text) || (COALESCE(repository, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(supplied_script_version, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(docker_image_locator, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(description, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(state, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(arvados_sdk_version, ''::character varying))::text) || ' '::text) || COALESCE(components, ''::text)), 0, 1000000)));
-
-
 --
 -- Name: jobs_search_index; Type: INDEX; Schema: public; Owner: -
 --
@@ -2880,13 +2849,6 @@ CREATE INDEX permission_target ON public.materialized_permissions USING btree (t
 CREATE UNIQUE INDEX permission_user_target ON public.materialized_permissions USING btree (user_uuid, target_uuid);
 
 
---
--- Name: pipeline_instances_full_text_search_idx; Type: INDEX; Schema: public; Owner: -
---
-
-CREATE INDEX pipeline_instances_full_text_search_idx ON public.pipeline_instances USING gin (to_tsvector('english'::regconfig, substr((((((((((((((((((((((COALESCE(uuid, ''::character varying))::text || ' '::text) || (COALESCE(owner_uuid, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(modified_by_client_uuid, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(modified_by_user_uuid, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(pipeline_template_uuid, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(name, ''::character varying))::text) || ' '::text) || COALESCE(components, ''::text)) || ' '::text) || COALESCE(properties, ''::text)) || ' '::text) || (COALESCE(state, ''::character varying))::text) || ' '::text) || COALESCE(components_summary, ''::text)) || ' '::text) || (COALESCE(description, ''::character varying))::text), 0, 1000000)));
-
-
 --
 -- Name: pipeline_instances_search_index; Type: INDEX; Schema: public; Owner: -
 --
@@ -2908,13 +2870,6 @@ CREATE INDEX pipeline_instances_trgm_text_search_idx ON public.pipeline_instance
 CREATE UNIQUE INDEX pipeline_template_owner_uuid_name_unique ON public.pipeline_templates USING btree (owner_uuid, name);
 
 
---
--- Name: pipeline_templates_full_text_search_idx; Type: INDEX; Schema: public; Owner: -
---
-
-CREATE INDEX pipeline_templates_full_text_search_idx ON public.pipeline_templates USING gin (to_tsvector('english'::regconfig, substr((((((((((((((COALESCE(uuid, ''::character varying))::text || ' '::text) || (COALESCE(owner_uuid, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(modified_by_client_uuid, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(modified_by_user_uuid, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(name, ''::character varying))::text) || ' '::text) || COALESCE(components, ''::text)) || ' '::text) || (COALESCE(description, ''::character varying))::text), 0, 1000000)));
-
-
 --
 -- Name: pipeline_templates_search_index; Type: INDEX; Schema: public; Owner: -
 --
@@ -2971,13 +2926,6 @@ CREATE INDEX users_search_index ON public.users USING btree (uuid, owner_uuid, m
 CREATE INDEX virtual_machines_search_index ON public.virtual_machines USING btree (uuid, owner_uuid, modified_by_client_uuid, modified_by_user_uuid, hostname);
 
 
---
--- Name: workflows_full_text_search_idx; Type: INDEX; Schema: public; Owner: -
---
-
-CREATE INDEX workflows_full_text_search_idx ON public.workflows USING gin (to_tsvector('english'::regconfig, substr((((((((((((COALESCE(uuid, ''::character varying))::text || ' '::text) || (COALESCE(owner_uuid, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(modified_by_client_uuid, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(modified_by_user_uuid, ''::character varying))::text) || ' '::text) || (COALESCE(name, ''::character varying))::text) || ' '::text) || COALESCE(description, ''::text)), 0, 1000000)));
-
-
 --
 -- Name: workflows_search_idx; Type: INDEX; Schema: public; Owner: -
 --
@@ -3189,6 +3137,15 @@ INSERT INTO "schema_migrations" (version) VALUES
 ('20190808145904'),
 ('20190809135453'),
 ('20190905151603'),
-('20200501150153');
+('20200501150153'),
+('20200602141328'),
+('20200914203202'),
+('20201103170213'),
+('20201105190435'),
+('20201202174753'),
+('20210108033940'),
+('20210126183521'),
+('20210621204455'),
+('20210816191509');